Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ

Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM PHAN THỊ TƯƠI ĐA HÌNH MỘT SỐ GEN ỨNG VIÊN VÀ MỐI LIÊN HỆ VỚI TÍNH NĂNG SẢN XUẤT CỦA LỢN Ỉ LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2023 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM PHAN THỊ TƯƠI ĐA HÌNH MỘT SỐ GEN ỨNG VIÊN VÀ MỐI LIÊN HỆ VỚI TÍNH NĂNG SẢN XUẤT CỦA LỢN Ỉ Ngành: Chăn nuôi Mã số: 62 01 05 Người hướng dẫn: PGS.TS Đỗ Đức Lực PGS.TS Nguyễn Hoàng Thịnh HÀ NỘI – 2023 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa dùng để bảo vệ lấy học vị Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn, thông tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày… tháng… năm 2023 Tác giả luận án Phan Thị Tươi i LỜI CẢM ƠN Để hồn thành luận án, tơi xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Đỗ Đức Lực PGS.TS Nguyễn Hồng Thịnh tận tình hướng dẫn, dành nhiều công sức, thời gian tạo điều kiện cho tơi suốt q trình học tập thực đề tài Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành tới Ban Giám đốc, Ban Quản lý đào tạo, Bộ môn Di truyền – Giống gia súc, Khoa Chăn nuôi - Học viện Nông nghiệp Việt Nam, thầy cô giáo, nghiên cứu viên tận tình giúp đỡ tơi q trình học tập, thực đề tài hồn thành luận án Tơi xin chân thành cảm ơn Ban Giám hiệu, Khoa Nông Lâm Ngư nghiệp, Bộ môn Khoa học vật nuôi, Trường Đại học Hồng Đức, chuyên gia lĩnh vực chăn nuôi – thú y, tạo điều kiện, ủng hộ giúp đỡ tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu để hồn thành luận án Tơi xin chân thành cảm ơn tập thể lãnh đạo, cán bộ, kỹ thuật viên nhân viên công ty CP tập đoàn Dabaco, chủ nhiệm nhiệm vụ “Nghiên cứu chọn lọc, khai thác phát triển đánh giá tiềm di truyền nguồn gen lợn Ỉ” hỗ trợ tạo điều kiện cho tơi suốt q trình thực đề tài Xin chân thành cảm ơn gia đình, người thân, bạn bè, đồng nghiệp tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ mặt, động viên khuyến khích tơi hồn thành luận án./ Hà Nội, ngày tháng năm 2023 Tác giả luận án Phan Thị Tươi ii MỤC LỤC Trang Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt vi Danh mục bảng ix Danh mục hình xii Trích yếu luận án xiii Thesis abstract xv Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.2.1 Mục tiêu chung 1.2.2 Mục tiêu cụ thể 1.3 Phạm vi nghiên cứu 1.4 Đóng góp đề tài 1.5 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài 1.5.1 Ý nghĩa khoa học 1.5.2 Ý nghĩa thực tiễn Phần Tổng quan tài liệu 2.1 Tổng quan nghiên cứu 2.1.1 Vai trò thị di truyền chọn lọc giống vật nuôi đặc điểm gen ứng viên 2.1.2 Đặc điểm ngoại hình, trạng cơng tác bảo tồn giống lợn địa Việt Nam 13 2.1.3 Tình hình nghiên cứu suất sinh sản giống lợn địa 25 2.1.4 Tình hình nghiên cứu khả sinh trưởng giống lợn địa 37 2.1.5 Tình hình nghiên cứu suất, chất lượng thịt giống lợn địa 43 iii 2.1.6 Một số nghiên cứu lợn Ỉ công tác bảo tồn giống lợn Ỉ 51 2.2 Kết luận định hướng nghiên cứu 54 Phần Phương pháp nghiên cứu 55 3.1 Địa điểm nghiên cứu 55 3.1.1 Địa điểm bố trí thí nghiệm 55 3.1.2 Địa điểm phân tích mẫu 55 3.2 Thời gian nghiên cứu 55 3.3 Nội dung nghiên cứu 56 3.3.1 Đặc điểm lợn Ỉ nuôi bảo tồn 56 3.3.2 Xác định đa hình gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ 56 3.3.3 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ 56 3.4 Đối tượng nghiên cứu 56 3.4.1 Đặc điểm lợn Ỉ nuôi bảo tồn 56 3.4.2 Xác định đa hình gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ 56 3.4.3 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ 57 3.5 Phương pháp nghiên cứu 58 3.5.1 Đặc điểm lợn Ỉ nuôi bảo tồn 58 3.5.2 Xác định đa hình gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ 58 3.5.3 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ 61 Phần Kết thảo luận 70 4.1 Đặc điểm lợn Ỉ nuôi bảo tồn 70 4.1.1 Kích thước chiều đo lợn Ỉ 70 4.1.2 Ảnh hưởng tính biệt đến chiều đo lợn Ỉ 72 4.2 Đa hình gen ứng viên quần thể lợn Ỉ 74 4.2.1 Tần số kiểu gen alen đa hình gen ứng viên liên quan đến khả sinh sản lợn Ỉ 74 4.2.2 Đa hình, tần số kiểu gen alen gen ứng viên liên quan đến khả sinh trưởng quần thể lợn Ỉ 82 iv 4.2.3 Đa hình, tần số kiểu gen alen gen ứng viên liên quan đến suất, chất lượng thịt quần thể lợn Ỉ 90 4.3 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ 98 4.3.1 Mối liên hệ đa hình gen ESR, PRLR FSHB với suất sinh sản lợn Ỉ 98 4.3.2 Mối liên hệ đa hình gen PIT1, H-FABP, CAST/HinfI, PIK3C3 GHRH với khả sinh trưởng lợn Ỉ 117 4.3.3 Mối liên hệ đa hình gen PIT1, H-FABP, PIK3C3 CAST với suất thân thịt chất lượng thịt lợn Ỉ 127 Phần Kết luận kiến nghị 148 5.1 Kết luận 148 5.2 Kiến nghị 148 Danh mục cơng trình cơng bố liên quan đến luận án 149 Tài liệu tham khảo 150 Một số Hình ảnh minh hoạ 172 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt a* ADG b* CAST CP COX2 cs DML DML1 Nghĩa tiếng Anh - Redness - Average daily gain - Yellow - Calpastatin - Prostaglandin-endoperoxide synthase - DML2 - DTT - - Cộng - Dày mỡ lưng - Dày mỡ lưng đo vị trí đốt sống cổ cuối - Dày mỡ lưng đo vị trí đốt sống lưng cuối - Dài thân thịt EGF - Epidermal growth factor - Yếu tố tăng trưởng biểu bì ESR FSHB: - Estrogen receptor - Follicle stimulate hormone Beta Subunit - Fucosyltransferase - Growth hormone releasing hormone - Heart fatty acid binding protein - Hardy – Weinberg - Insulin-like growth factor - Light - Least Square Mean - Thụ thể Estrogen - Hormone kích nỗn bào tố Beta FUT1 GHRH H-FABP HWE IGF2 KCLĐ KL2 KL8 KLCSC KLCSO KLN KLSSO KLSSC L* LSM vi Nghĩa tiếng Việt - Độ đỏ - Tăng khối lượng trung bình/ngày - Độ vàng - Gen Calpastatin - Cổ phần - Gen COX2 - Gen FUT1 - Hormone giải phóng hormone sinh trưởng - Gen H-FABP - Định luận Hardy - Weinberg - Yếu tố tăng trưởng giống Insulin - Khoảng cách lứa đẻ - Khối lượng lúc tháng tuổi - Khối lượng lúc tháng tuổi - Khối lượng cai sữa/con - Khối lượng cai sữa/ổ - Khối lượng thịt nạc - Khối lượng sơ sing/ổ - Khối lượng sơ sinh/con - Độ sáng - Trung bình bình phương bé Chữ viết tắt MC4R M MYOG N NST NT2TT Nghĩa tiếng Anh - Melanocortine receptor - Mean - Myogin - Number of observations - Nghĩa tiếng Việt - Thụ thể Melanocortine - Giá trị trung bình - Gen Myogin - Dung lượng mẫu - Nhiễm sắc thể - Ngày tuổi trung bình lúc tháng tuổi NT8TT - pH45 - pH24 - - Ngày tuổi trung bình lúc tháng tuổi - Giá trị pH thời điểm 45 phút sau giết mổ - Giá trị pH thời điểm 24h sau giết mổ PCR-RFLP: PRLR RBP4 RNF4 SCSS SCSSS SCĐN SCCS TĐLĐ TGCS TKL2 - Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism - Protein kinase AMP-activated non-catalytic Subunit Gamma - Leptin receptor - Pituitary-specific transcription factor - Porcine Phosphoinositide-3kinase, class - Prolactin receptor - Retinol binding protein - Ring finger protein - TKL8 - PRKAG3: LEPR PIT1 PIK3C3 vii - Phản ứng chuỗi trùng hợp: Đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn - Gen PRKAG3 - Thụ thể Leptin - Nhân tố phiên mã chuyên biệt tuyến yên - Gen PIK3C3 - Thụ thể Prolactin - Protein gắn với Retinol - Gen RNF4 - Số sơ sinh/ổ - Số sơ sinh sống/ổ - Số để nuôi/ổ - Số cai sữa/ổ - Tuổi đẻ lứa đầu - Thời gian cai sữa - Tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn sơ sinh đến tháng tuổi - Tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn sơ sinh đến tháng tuổi Chữ viết tắt TPLĐ TLMH TLMNCB TLMNBQ TLTX TNHH VCK Nghĩa tiếng Anh - Nghĩa tiếng Việt - Tuổi phối giống lần đầu - Tỉ lệ móc hàm - Tỉ lệ nước chế biến - Tỉ lệ nước bảo quản - Tỉ lệ thịt xẻ - Trách nhiệm hữu hạn - Vật chất khô viii i/j H_FABP 1HH 2Hh 3hh Dependent Variable: KTS 0.9849 0.9849 0.2169 0.1982 LIPIT LSMEAN 2.20185152 2.68855226 3.21537757 Standard Error 0.83966914 0.57835281 1.04102018 0.2169 0.1982 Pr > |t| 0.0211 0.0005 0.0086 LSMEAN Number Least Squares Means for effect H_FABP Pr > |t| for H0: LSMean(i)=LSMean(j) i/j H_FABP 1HH 2Hh 3hh Dependent Variable: LIPIT 0.8945 0.8945 0.7269 0.8961 Aspartic LSMEAN 8.12999149 7.45753829 7.74270530 Standard Error 0.44853978 0.30894817 0.55609876 0.7269 0.8961 Pr > |t|