Chọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABPChọn lọc năng cao tỷ lệ mỡ giắt của lợn Duroc bằng phương pháp BLUP kết hợp gen HFABP
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ NÔNG NGHIỆP VÀ PTNT VIỆN CHĂN NUÔI -🙞🙜🕮🙞🙜 - NGUYỄN VĂN HỢP CHỌN LỌC NÂNG CAO TỶ LỆ MỠ GIẮT CỦA LỢN DUROC BẰNG PHƯƠNG PHÁP BLUP KẾT HỢP GEN H-FABP TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ Ngành: Di truyền chọn giống vật nuôi Mã số: 9.62.01.08 HÀ NỘI, 2023 Cơng trình hồn thành tại: VIỆN CHĂN NI Người hướng dẫn khoa học: TS Nguyễn Hữu Tỉnh PGS.TS Ngô Thị Kim Cúc Phản biện 1: PGS.TS Nguyễn Mạnh Hà Phân hiệu Đại học Thái Nguyên tỉnh Lào Cai Phản biện 2: PGS.TS Đỗ Đức Lực Học viện Nông nghiệp Việt Nam Phản biện 3: TS Phạm Thị Kim Dung Cục Chăn nuôi Luận án bảo vệ trước hội đồng đánh giá luận án cấp Viện họp tại: Viện Chăn nuôi, Thụy Phương, Bắc Từ Liêm, Hà Nội Vào hồi giờ, ngày tháng năm 2023 Có thể tìm hiểu luận án tại: Thư viện Quốc gia Thư viện Viện Chăn nuôi ii CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ Nguyễn Văn Hợp, Nguyễn Hữu Tỉnh, Ngô Thị Kim Cúc Đỗ Thế Anh (2023) Ảnh hưởng di truyền cộng gộp, di truyền trội đa hình gen H-FABP đến tỷ lệ mỡ giắt, dày mỡ lưng, dày thân thịt tuổi đạt khối lượng 100kg giống lợn Duroc Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Chăn nuôi – Hội Chăn nuôi Việt Nam, số 288, tháng năm 2023, trang 12-21 Nguyễn Văn Hợp, Nguyễn Hữu Tỉnh, Ngô Thị Kim Cúc Đỗ Thế Anh (2023) Tiềm di truyền khuynh hướng di truyền tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100kg giống lợn Duroc Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Chăn ni – Hội Chăn nuôi Việt Nam, số 287, tháng năm 2023, trang 21-28 iii MỞ ĐẦU 1.1 Tính cấp thiết Phương pháp thống kê di truyền BLUP sử dụng để cải tiến suất sinh sản, sinh trưởng lợn Tuy nhiên, việc cải tiến suất ảnh hưởng đến hàm lượng mỡ giắt, từ giảm độ mềm, độ mọng nước hay hương vị thịt lợn (Purslow, 2017) Nghiên cứu cho thấy lợn Duroc sử dụng để cải thiện suất lợn thương phẩm mà không ảnh hưởng đến độ cứng thịt giảm mức độ mỡ (Tomović cs., 2016; Diao cs., 2018) Hơn nữa, giống lợn sử dụng cơng thức lai D(LY)/D(YL) nhờ khả thích nghi, chuyển hóa thức ăn tốt chất lượng thịt cao (Diao cs., 2018; Ding cs., 2018) Tỷ lệ mỡ giắt lợn có khả di truyền mức cao có tương quan với tính trạng khác Hệ số di truyền tính trạng từ 0,31-0,69 (Jiao cs., 2014; Ishii cs., 2018; Willson cs., 2020) Tương quan di truyền dương chặt tỷ lệ mỡ giắt với dày mỡ lưng (Solanes cs., 2009; Schwab cs., 2009a) tương quan di truyền âm với tỷ lệ nạc (Ros Freixedes, 2014; Ishii cs., 2018; Mikule, 2020) Do đó, chương trình giống lợn cần xem xét chọn lọc cân tỷ lệ mỡ giắt dày mỡ lưng Gần đây, gen Heart Fatty Acid-Binding Protein (H-FABP) có vị trí đa hình HinfI, MspI HaeIII sử dụng gen ứng viên chọn lọc, nâng cao tỷ lệ mỡ giắt chất lượng thịt lợn (Gerbens cs., 1997; Lee cs., 2010; Kováčik cs., 2011 Trakovická cs., 2016) Để rút ngắn thời gian chọn lọc nâng cao tỷ lệ mỡ giắt lợn mà không tăng dày mỡ lưng thực đề tài: “Chọn lọc nâng cao tỷ lệ mỡ giắt lợn Duroc phương pháp BLUP kết hợp gen H-FABP” 1.2 Mục tiêu nghiên cứu (1) Đánh giá khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100kg lợn Duroc (2) Xác định tần suất kiểu gen ảnh hưởng kiểu gen H-FABP đến tỷ lệ mỡ giắt, dày mỡ lưng, dày thăn thịt tuổi đạt khối lượng 100kg lợn Duroc (3) Đánh giá chọn lọc nâng cao tỷ lệ mỡ giắt lợn Duroc (4) Đánh giá ảnh hưởng đực giống Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác đến khả sinh trưởng số tiêu chất lượng thịt lợn thương phẩm 1.3 Những đóng góp đề tài Nghiên cứu kết hợp phương pháp chọn lọc BLUP gen HFABP để cải thiện tỷ lệ mỡ giắt không ảnh hưởng đến dày mỡ lưng lợn Duroc Việt Nam; (1) Nghiên cứu đánh giá tương tác kiểu gen vị trí đa hình gen H-FABP (MspI, HaeIII HinfI) từ chọn ba kiểu gen (AADDHH, AaDDHH AADdHH) có ảnh hưởng tích cực đến tỷ lệ mỡ giắt; (2) Đã chọn lọc đàn lợn Duroc Việt Nam có tỷ lệ mỡ giắt cao (3,26±0,32% ), đồng thời cải thiện tuổi đạt khối lượng 100 kg (148,3±16,3 ngày) trì dày mỡ lưng (11,6±1,1 mm) 1.4 Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn 1.4.1 Ý nghĩa khoa học (1) Đánh giá mối tương quan di truyền tỷ lệ mỡ giắt với tính trạng dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100kg, làm sở cho việc lựa chọn phương pháp chọn lọc tốt để nâng cao chất lượng thịt đàn lợn Duroc (2) Nghiên cứu cung cấp số thông tin phân tử ba vị trí đa hình gen H-FABP (MspI, HaeIII HinfI) mối liên kết đa hình chúng với tỷ lệ mỡ giắt, dày mỡ lưng, dày thăn thịt tuổi đạt khối lượng 100 kg, làm sở tham khảo cho nghiên cứu (3) Kết nghiên cứu bổ sung tư liệu cho công tác giảng dạy, nghiên cứu công tác giống lợn Việt Nam 1.4.2 Ý nghĩa thực tiễn (1) Chọn lọc đàn lợn Duroc Việt Nam có tỷ lệ mỡ giắt (3,26±0,32% ), đồng thời cải thiện tuổi đạt khối lượng 100 kg (148,3±16,3 ngày) trì dày mỡ lưng (2) Góp phần nâng cao chất lượng thịt lợn đáp ứng nhu cầu người tiêu dùng CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Cơ sở sinh lý tính trạng mỡ giắt thịt lợn Mỡ giắt (intramuscular fat) chất béo nằm xen kẽ tế bào sợi Phần lớn mỡ giắt tích lũy giai đoạn sau trình sinh trưởng Phospholipid triacylglycerol hai thành phần mỡ giắt (Poklukar cs., 2020) Mỡ giắt thịt lợn có ảnh hưởng đến độ mềm, khả giữ nước, hương vị thịt (Cho cs., 2015; Gong cs., 2019) Hiện nay, bên cạnh tiêu suất sinh sản, sinh trưởng, chất lượng thịt, tỷ lệ mỡ giắt (TLMG) sử dụng chương trình giống lợn Do đó, để tăng hiệu chọn lọc dòng giống lợn có tỷ lệ mỡ giắt cao, nhà chọn giống cần đánh giá khả di truyền tính trạng 1.2 Khả di truyền tính trạng mỡ giắt Từ kết nghiên cứu tổng hợp, thấy tính trạng MG lợn Duroc có khả di truyền mức cao, hệ số di truyền (HSDT) tính trạng biến động từ 0,31 - 0,69 (Solanes cs., 2009, Ros-Freixedes cs., 2013, Ishii cs., 2018, Willson cs., 2020) Tương quan di truyền TLMG với tỷ lệ mỡ thân thịt xẻ diện tích thăn thịt mức 0,3 -0,34 (Solanes cs., 2009, Ishii cs., 2018) Tương quan chặt TLMG dày mỡ lưng (DML) từ 0,40 - 0,64 (Solanes cs (2009); Reixach Estany, 2010; Schwab cs., 2009b; Ros-Freixedes cs., 2013) Bên cạnh đó, tương quan TLMG với mức độ hao hụt nấu ăn, độ cứng thịt số lượng đốt sống lưng tương quan âm (-0,53; -0,37 -0,61) Các kết cải thiện TLMG làm tăng độ mọng nước độ mềm thịt cách gián tiếp (Ishii cs., 2018; Willson cs., 2020; Mikule,2020) 1.3 Cơ sở phân tử tính trạng mỡ giắt Cùng với phát triển sinh học phân tử vị trí gen liên kết với tính trạng số lượng (QTL) có ảnh hưởng đến hàm lượng mỡ giắt lợn khám phá Một số gen có khả liên kết với thành phần mỡ giắt xác định sử dụng như: H-FABP, A-FABP, ADRP, LERP, MC4R, ADD1 (SREBP1), MYOD Nhiều nghiên cứu cho thấy, vị trí đa hình gen H-FABP sử dụng để nâng cao TLMG giống lợn (Gerbens cs., 1999; Gerbens cs., 2000; Lee cs., 2010; Kováčik cs., 2011 Trakovická cs., 2016) 1.4 Một số hướng tiếp cận cải thiện hàm lượng mỡ giắt lợn 1.4.1 Hướng tiếp cận di truyền số lượng Do HSDT tính trạng MG mức cao (0,31- 0,69), chương trình chọn lọc trực tiếp dựa giá trị kiểu hình tính trạng MG mang lại đáp ứng chọn lọc mong muốn Tuy vậy, tương quan di truyền không mong đợi TLMG với số tính trạng chất lượng thịt khác DML Đây nguyên nhân làm giảm tỷ lệ nạc cá thể lợn có TLMG cao Bên cạnh đó, mức độ xác phương pháp đo lường, xác định TLMG áp dụng cần phải xem xét chương trình chọn lọc 1.4.2 Hướng tiếp cận di truyền phân tử Các gen đánh dấu cung cấp giải pháp việc cải thiện TLMG tính trạng chất lượng thịt lợn (Balnikov cs., 2021; Tinh cs., 2021; Balatsky cs., 2022; Wang cs., 2022) Gen H-FABP thành viên gia đình FABP có vai trị trọng vận chuyển axít béo cách liên kết điều hòa chất béo Ở lợn, gen xác định nằm nhiễm sắc thể số Gen H-FABP có vị trí đa hình HinfI, MspI HaeIII xác định cho nhiều quần thể lợn (Chen cs., 2014) Hiện tại, gen sử dụng gen tuyển chọn để nâng cao tỷ lệ mỡ giắt chất lượng thịt lợn (Gerbens cs., 2000; Kováčik cs., 2011 Trakovická cs., 2016) 1.5 Ảnh hưởng giống đến tính trạng mỡ giắt lợn TLMG thăn thịt phụ thuộc vào nhiều yếu tố khác giống, giới tính, dinh dưỡng phương pháp ni dưỡng, giống đóng vai trị quan trọng (Benítez cs., 2019; Huang cs., 2020; Kim cs., 2020; Mikule, 2020) Trong giống lợn ni theo hướng cơng nghiệp lợn Duroc có TLMG cao ngoại trừ số địa (Casellas cs., 2013, Tomović cs., 2016, Diao cs., 2018, Meadus cs., 2018) Hơn nữa, lợn Duroc sử dụng phổ biến giới khả thích nghi, khả chuyển hóa thức ăn tốt chất lượng thịt cao (Diao cs., 2018) Giống lợn sử dụng làm đực cuối để tạo lợn thịt thương phẩm DLY/DLY nhờ thể xuất sắc tính trạng sinh trưởng, hiệu chuyển hóa thức ăn (Ding cs., 2018) Do đó, để cải thiện TLMG thịt lợn thương phẩm cần tập trung nghiên cứu giống lợn Duroc CHƯƠNG VẬT LIỆU, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu Nghiên cứu thực từ năm 2016 - 2021 Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn ni heo Bình Thắng Bộ mơn Cơng nghệ Sinh học Vi sinh – Phân viện Chăn nuôi Nam Bộ 2.2 Vật liệu nghiên cứu - Đàn lợn Duroc có nguồn gốc từ Hoa Kỳ, Canada, Đan Mạch, Đài Loan Trung tâm NC & PT Chăn ni Heo Bình Thắng (quy mơ đàn giống 12-15 đực giống 90 - 100 nái sinh sản/năm) - Dữ liệu kiểm tra suất cá thể (KTNSCT) 1779 (693 đực 1086 cái) đàn lợn Duroc từ năm 2011 - 2016 - Đàn hạt nhân chọn lọc gồm 30-32 nái 5-6 đực hệ - Ở hệ 3, chọn đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác phối giống với nái bố mẹ LY/YL tiến hành nuôi kiểm tra suất 90 cá thể thương phẩm 2.3 Nội dung nghiên cứu 2.3.1 Nội dung 1: Đánh giá khả di truyền tương quan di truyền tính trạng mỡ giắt với tuổi đạt khối lượng 100 kg dày mỡ lưng lợn Duroc 2.3.2 Nội dung 2: Phân tích đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, tuổi đạt khối lượng 100 kg, dày mỡ lưng dày thăn thịt lợn Duroc 2.3.3 Nội dung 3: Đánh giá chọn lọc đàn lợn Duroc hạt nhân dựa số dòng cha (TSI) kết hợp với kiểu gen H-FABP 2.3.4 Nội dung 4: Khảo sát suất thịt tỷ lệ mỡ giắt đàn lợn thương phẩm sử dụng đực Duroc có tỷ lệ mỡ giắt khác 2.4 Phương pháp nghiên cứu 2.4.1 Phương pháp thu thập liệu giai đoạn 2011 – 2016 - Thu thập liệu suất cá thể đàn lợn Duroc đực, hậu bị từ năm 2011 - 2016 Tổng số đực giống giai đoạn 96 486 Số cá thể kiểm tra suất 1779 (693 đực 1086 cái) Các liệu thu thập bao gồm: T100, dày thăn (DT), DML TLMG 2.4.2 Phương pháp kiểm tra suất cá thể hậu bị 2.4.2.1 Kiểm tra suất cá thể hậu bị - Ở hệ xuất phát, từ đàn lợn Duroc, ổ đẻ chọn đực để kiểm tra suất cá thể (KTNSCT) Tổng số 1.032 cá thể hậu bị với đầy đủ hệ phả tuyển chọn đưa vào KTNSCT - Ở hệ 1, 3, việc KTNSCT lợn hậu bị thực tương tự hệ xuất phát * Phương pháp kiểm tra suất cá thể: - KTNSCT lợn đực, hậu bị: Theo TCVN 3897-84 có thay đổi số nội dung cho phù hợp với công tác giống lợn - Các tiêu TLMG, DML DT đo thời điểm kết thúc KTNSCT vị trí P2 kỹ thuật siêu âm hình ảnh máy Aloka SSD, TLMG ước tính phần mềm Biosoft Toolbox (Hoa Kỳ) 2.4.2.2 Phương pháp hiệu chỉnh số liệu Tuổi đạt 100 kg (T100) hiệu chỉnh theo khuyến cáo Hội liên hiệp cải tiến giống lợn Hoa Kỳ (NSIF, 2002):T100ĐC = TTT + [(P100 - PTT)(TTT - a)/PTT] 2.4.3 Thu thập mẫu máu phân tích gen H-FABP 2.4.3.1 Phương pháp thu thập mẫu máu Thu thập mẫu máu 704 cá thể 50 mẫu/thế hệ từ hệ 1-3 Mẫu máu đưa vào ống có chất chống đơng bảo quản nhiệt độ -4oC 2.4.3.2 Chiết tách DNA từ mẫu máu Ly trích máu: Tiến hành theo hướng dẫn kit Bioline 2.4.3.3 Quy trình PCR-RFLP Thực phản ứng PCR với cặp mồi heo quy trình theo Gerbens cs (1997) để nhân đoạn gen H-FABP Trình tự cặp mồi sau: - HinfI: 5-GGACCCAAGATGCCTACGCCG-3’; 5’-CTGCATCTTTGACCAA GAGG-3’ (Genbank X.98558.1); MspI, HaeIII: 5’-ATTGCTTCGGTGTGTT TG AG-3’; 5’-TCAGGAATGGGAGTTATTGG-3’ (Genbank X.98558.1) Sản phẩm PCR kiểm tra cách điện di quan sát đèn cực tím Sau ủ với enzyme cắt giới hạn MspI, HaeIII, HinfI Sản phẩm cắt đem điện di gel agarose 2% đọc kết 2.4.4 Phương pháp thiết lập đàn hạt nhân Phương pháp thiết lập đàn hạt nhân thực theo sơ đồ sau : Dữ liệu KTNSCT 1779 cá thể hậu bị Duroc từ 96 đực 486 (2011-2016) Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn nuôi Heo Bình Thắng Ước tính giá trị giống, KTNSCT: 1032 Cá thể (423 đực 609 cái), lấy mẫu phân tích kiểu gen H-FABP 704 cá thể Phân tích đa hình gen H-FABP liên kết với tỷ lệ mỡ giắt, dày mỡ lưng, dày thăn tuổi đạt khối lượng 100kg 704 (381 đực 323 cái) Chọn lọc, thiết lập đàn hạt nhân Duroc dựa số TSI (>110) gen H-FABP (AADDHH, AaDDHH AADdHH) gồm đực 30 để nhân giống tạo THXP Chọn lọc ổn định di truyền suất đàn chọn lọc qua hệ: - Thế hệ 1: đực + 32 nái; KTNSCT: 450 cá thể - Thế hệ 2: đực + 30 nái; KTNSCT: 462 cá thể - Thế hệ 3: đực + 30 nái; KTNSCT: 485 cá thể Đánh giá khuynh hướng di truyền qua năm Đánh giá ảnh hưởng đực giống lên lợn thương phẩm 2.4.5 Phương pháp khảo sát lợn thương phẩm 2.4.5.1 Thiết kế thí nghiệm Thí nghiệm thiết kế gồm nghiệm thức (3 nhóm), nhóm gồm đực Duroc có TLMG 3,1; 3,3 3,5% phối giống với nái YL có TLMG trung bình 2,3% (từ 2,2-2,5%) Tiến hành khảo sát 30 lợn thương phẩm/nhóm 2.4.5.2 Chăm sóc ni dưỡng Lợn thương phẩm kiểm tra suất nuôi theo quy trình Trung tâm Nghiên cứu Phát triển Chăn ni Heo Bình Thắng 2.4.5.3 Các tiêu theo dõi - Các tiêu theo dõi bao gồm: T100; DML; DT; TLMG - Tỷ lệ nạc (%) ước tính công thức (Kyriazakis Whittemore, 2006): NAC = 59-0,9xDML+0,2xDT (- 0,9 0,2 hệ số; Dày mỡ lưng điểm P2 (xương sườn thứ 10) tính mm; Dày thăn thịt điểm P2 tính mm) 2.5 Phương pháp xử lý số liệu 2.5.1 Ước tính thơng số di truyền giá trị giống tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg Phân tích thống kê di truyền phương pháp REML để xác định tham số di truyền phương pháp BLUP để ước tính giá trị giống tính trạng từ phần mềm VCE6 (Groeneveld, 2010) PEST (Groeneveld, 2006) Đối với tính trạng T100, DML TLMG, áp dụng mơ hình thống kê di truyền sau: Yijklm = + αi + j + HYSk + al + eijklm (yijklm: Giá trị kiểu hình tính trạng; : Giá trị trung bình kiểu hình đàn giống; αi: Ảnh hưởng kiểu chuồng ni (chuồng kín, hở); j: Ảnh hưởng giới tính cá thể; HYSk: Ảnh hưởng đàn x năm x tháng; al: Ảnh hưởng di truyền cộng gộp cá thể; eijklm: Ảnh hưởng ngoại cảnh ngẫu nhiên) 2.5.2 Đa hình gen H-FABP 2.5.2.1 Xác định tần số kiểu gen H-FABP Tần số xuất kiểu gen cá thể khảo sát tính dựa định luật Hardy-Weinberg sau p = (2AA + Aa)/2N: Trong đó; p: tần số alen bình thường (A); q: tần số alen đột biến (a); n: Tổng số cá thể phân tích; AA: Số cá thể có kiểu gen đồng hợp trội; Aa: Số cá thể có kiểu gen dị hợp Kiểm tra phân bố tần số kiểu gen H-FABP có cân theo định luật Hardy-Weinberg trắc nghiệm Chi-square (χ2) - Tần số dị hợp mong đợi (He) tính - Hệ số đa hình (PIC) tính tốn theo tốn theo cơng thức Nei (1978): Botstein cs (1980) n: số lượng alen; pi: tần số alen thứ i 2.5.2.2 Xác định mối liên kết đa hình kiểu gen H-FABP với tính trạng mỡ giắt, dày mỡ lưng tuổi đạt khối lượng 100 kg Xác định mối liên kết đa hình gen H-FABP vị trí enzyme cắt HaeIII, MspI, HinfI đến tính trạng T100, DML, DT MG sau: Mơ hình 1: Xác định mối liên kết vị trí đa hình HaeIII, MspI, HinfI đến tỷ lệ MG, T100, DML DT với mơ hình tuyến tính sau: Yij = μ + Gi + eij pi tần số alen thứ i Trong đó, Yijkl: giá trị kiểu tiêu nghiên cứu (MG, DML, DT T100), μ trung bình trung đàn giống khảo sát, Gi ảnh hưởng kiểu gen H-FABP (với i = AA, Aa, aa với đa hình MspI; i = DD, Dd, dd với đa hình HaeIII; với i = HH, Hh, hh với đa hình HinfI), eij = sai số ngẫu nhiên Mơ hình 2: Xác định mối liên hệ vị trí đa hình kết hợp từ vị trí đa hình HaeIII, MspI, HinfI, bao gồm: HaeIII-MspI, HaeIII-HinfI MspI-HinfI, đến tỷ lệ MG, T100, DML DT với mơ hình tương tự mơ hình Trong Gi ảnh hưởng kết hợp từ vị trí đa hình (i=9) Mơ hình 3: Xác định mối liên hệ vị trí đa hình kết hợp (HaeIII, MspI, HinfI) đến tỷ lệ MG, T100, DML DT với mơ hình tương tự mơ hình 1, Gi ảnh hưởng kết hợp kiểu gen vị trí đa hình (i=16) Kết phân tích PCR-RFLP đa hình gen H-FABP vị trí đa hình HaeIII, MspI, HinfI cho thấy tất kiểu gen DD, Dd, dd; AA, Aa, aa; HH, Hh, hh xuất đàn giống khảo sát (hình 3.1, 3.2 3.3 Đây sở để đánh Hình 3.3: Mẫu đại diện kết phân tích giá ứng dụng công tác PCR-RFLP/MspI gen H-FABP giống lợn gen 3.2.2 Tần số kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI Tần số kiểu gen H-FABP ba vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI đàn lợn Duroc trình bày bảng 3.5, 3.6 3.7 Nhìn chung, phân bố tần số quan sát ba kiểu gen tương ứng vị trí đa hình HaeIII, MspI HinfI đàn giống khảo sát có sai khác giá trị tuyệt đối so với tần số kiểu gen kỳ vọng Về mặt thống kê, giá trị 2 khảo sát cao giá trị 2 lý thuyết (3,84) Như vậy, phân bố tần số kiểu gen H-FABP vị trí đàn lợn khảo sát trạng thái không cân theo định luật Hardy-Weinberg Hay nói cách khác, có yếu tố tác động làm thay đổi cấu trúc di truyền đàn giống kiểu gen H-FABP Bảng 3.5: Tần số kiểu gen tần số alen đa hình gen H-FABP/HaeIII lợn Duroc Đàn giống/ tiêu Số mẫu khảo sát Tần số quan sát Tần số kì vọng Kiểu gen Kiểu alen 2 He PIC P DD Dd dd D d (3,841) 199 376 129 0,283 0,534 0,183 0,550 0,450 0,302 0,495 0,203 0,495 0,373 4,377