Đặc điểm lâm sàng, tổn thương trên hình ảnh học, vi sinh và kết cục ở bệnh nhân melioidosis phổi

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH HỒNG THỊ HỒNG LINH ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, TỔN THƯƠNG TRÊN HÌNH ẢNH HỌC, VI SINH VÀ KẾT CỤC Ở BỆNH NHÂN MELIOIDOSIS PHỔI LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH HỒNG THỊ HỒNG LINH ĐẶC ĐIỂM LÂM SÀNG, TỔN THƯƠNG TRÊN HÌNH ẢNH HỌC, VI SINH VÀ KẾT CỤC Ở BỆNH NHÂN MELIOIDOSIS PHỔI NGÀNH: NỘI KHOA MÃ SỐ: 8720107 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS LÊ THƯỢNG VŨ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH, NĂM 2022 Lời cảm ơn Qua thời gian học tập nghiên cứu, đến tơi hồn thành luận văn tốt nghiệp Thành có nhờ dẫn giúp đỡ tận tình Quý Thầy Cô suốt thời gian qua Tôi xin đặc biệt bày tỏ lòng biết ơn chân thành tri ân sâu sắc đến PGS TS Lê Thượng Vũ người Thầy tận tụy hướng dẫn suốt q trình thực đề tài Tơi xin chân thành cảm ơn giúp đỡ của: - - Ban Giám Hiệu Trường Đại Học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh Quý Thầy Cô Bộ Môn Nội Tổng Quát - Trường Đại Học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh Ban giám đốc Bệnh viện Chợ Rẫy Ban lãnh đạo, bác sĩ, anh chị điều dưỡng, kỹ thuật viên Khoa Nội Hô Hấp, khoa Nội Tiết, khoa Bệnh Nhiệt Đới, khoa Vi Sinh Phòng hồ sơ Bệnh viện Chợ Rẫy Các bệnh nhân người nhà đồng ý tham gia, nhiệt tình hợp tác trình thực nghiên cứu Gia đình, bạn bè, đồng nghiệp người bên cạnh động viên, giúp đỡ hỗ trợ suốt trình học tập thực luận văn Xin gửi đến người lời cảm ơn chân thành nhất! TP Hồ Chí Minh, 05 tháng 10 năm 2022 Hồng Thị Hồng Linh LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan luận văn tốt nghiệp cơng trình nghiên cứu cá nhân Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực Tác giả HOÀNG THỊ HỒNG LINH MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN MỤC LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT i DANH MỤC CÁC BẢNG iii DANH MỤC BIỂU ĐỒ .v DANH MỤC CÁC HÌNH vi DANH MỤC SƠ ĐỒ vii MỞ ĐẦU CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Định nghĩa .4 1.2 Lịch sử vi khuẩn Burkholderia pseudomallei bệnh melioidosis .4 1.3 Dịch tễ học 1.4 Vi khuẩn học 1.5 Sinh bệnh học 1.6 Biểu lâm sàng 1.7 Cận lâm sàng .14 1.8 Điều trị .16 1.9 Dự phòng .19 1.10 Tình hình nghiên cứu melioidosis phổi 19 CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 24 2.1 Thiết kế nghiên cứu .24 2.2 Đối tượng nghiên cứu 24 2.3 Thời gian nghiên cứu 24 2.4 Địa điểm nghiên cứu 24 2.5 Cỡ mẫu 24 2.6 Phương pháp chọn mẫu .25 2.7 Phương pháp định danh vi khuẩn 26 2.8 Định nghĩa biến số nghiên cứu 33 2.9 Sơ đồ nghiên cứu .45 2.10 Phương pháp xử lý số liệu 46 2.11 Đạo đức nghiên cứu 47 CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ 48 3.1 Đặc điểm dịch tễ, lâm sàng bệnh nhân melioidosis phổi .49 3.2 Tình hình đề kháng kháng sinh vi khuẩn Burkholderia pseudomallei 62 3.3 Kết cục yếu tố liên quan đến kết cục bệnh nhân melioidosis phổi 66 CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN 77 4.1 Đặc điểm dịch tễ, lâm sàng 77 4.2 Tình trạng đề kháng kháng sinh vi khuẩn Burkholderia pseudomallei qua năm 91 4.3 Kết cục yếu tố liên quan đến kết cục bệnh nhân melioidosis phổi 98 KẾT LUẬN 107 KIẾN NGHỊ 109 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC BẢNG THU THẬP SỐ LIỆU PHỤ LỤC BẢNG THÔNG TIN DÀNH CHO NGƯỜI THAM GIA NGHIÊN CỨU VÀ CHẤP THUẬN THAM GIA NGHIÊN CỨU PHỤ LỤC LƯU ĐỒ CHẨN ĐOÁN SUY TIM CẤP VÀ MẠN PHỤ LỤC CHẤP THUẬN CỦA HỘI ĐỒNG ĐẠO ĐỨC TRONG NGHIÊN CỨU Y SINH HỌC ĐẠI HỌC Y DƯỢC TP HỒ CHÍ MINH PHỤ LỤC DANH SÁCH BỆNH NHÂN i DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Tên viết tắt Tiếng Anh ALT Alaninie aminotransaminase Amox + clav acid Amoxicillin/ clavulanic acid AST Aspartate aminotransferase ATS American Thoracic Society Hội Lồng Ngực Hoa Kỳ Area Under The ROC Curve Diện tích đường AUC Tiếng Việt cong ROC B cepacia Burkholderia cepacia B mallei Burkholderia mallei BN Bệnh nhân B pseudomallei Burkhoderia pseudomallei B thailandenis Burkholderia thailandenis BUN Blood urea nitrogen BVCR Bệnh Viện Chợ Rẫy Polysaccharide Capsular CPS Burkholderia pseudomallei CRP C- reactive Protetin DNA Deoxyribonucleic Acid Fraction of Inspired Oxygen FiO2 Protein C phản ứng Phân suất oxy khí hít vào ii IDSA IRVS The Infectious Diseases Hội Bệnh Truyền Society of America Nhiễm Hoa Kỳ Intensive Respiratory or Hỗ trợ hô hấp vận Vasopressor Support mạch KTC 95% Khoảng tin cậy 95% KTPV Khoảng tứ phân vị McF McFarland MIC OR PaO2 Minimum Inhibitory Nồng độ ức chế tối Concentration thiểu Odd Ratio Tỷ số chênh Parital pressure of oxygen Phân áp oxy hòa tan máu động mạch PCR Polymerase Chain Reaction PSI Pneumonia Severity Index RNA Axit Ribonucleic ROC Receiver Operating Curve Trimethoprim/ TMP-SMX Sulfamethoxazole iii DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1.1 Hướng dẫn điều trị melioidosis Darwin sửa đổi năm 2020 .16 Bảng 2.1 Cách kết luận nuôi cấy mẫu đàm theo quy trình Bệnh viện Chợ Rẫy .27 Bảng 2.2 Định nghĩa biến số đặc điểm dân số dịch tễ 33 Bảng 2.3 Định nghĩa biến số bệnh .34 Bảng 2.4 Định nghĩa biến số liên quan đến đặc điểm lâm sàng .36 Bảng 2.5 Thang điểm PSI 38 Bảng 2.6 Thang điểm IDSA/ATS 2007 39 Bảng 2.7 Thang điểm CURB- 65 40 Bảng 2.8 Định nghĩa biến số đặc điểm vi sinh 40 Bảng 2.9 Định nghĩa biến số cận lâm sàng .41 Bảng 2.10 Định nghĩa biến số tổn thương X quang ngực 42 Bảng 2.11 Định nghĩa biến kết cục điều trị 44 Bảng 3.1 Phân bố tuổi đối tượng nghiên cứu (n=162) 49 Bảng 3.2 Tần số tỷ lệ bệnh nhân phân bố theo dân tộc 50 Bảng 3.3 Phân bố melioidosis phổi theo địa lý 51 Bảng 3.4 Phân bố bệnh nền, yếu tố nguy melioidosis phổi 52 Bảng 3.5 Phân bố thời gian lần mắc melioidosis 53 Bảng 3.6 Phân bố bệnh nhân melioidosis phổi theo lý nhập viện .54 Bảng 3.7 Dấu hiệu sinh tồn lúc nhập viện theo thể bệnh melioidosis phổi có khơng có tổn thương phổi .55 Bảng 3.8 Phân bố triệu chứng phổi theo thể lâm sàng melioidosis phổi cấp tính bán cấp/ mạn tính .56 Bảng 3.9 Đặc điểm huyết học, sinh hóa mối liên quan với melioidosis phổi cấp tính bán cấp/ mạn tính 58 Bảng 3.10 Liên quan số lượng tiểu cầu lúc nhập viện biến chứng melioidosis phổi .59 iv Bảng 3.11 Tổn thương X quang ngực thẳng theo thể melioidosis phổi cấp tính bán cấp/ mạn tính .60 Bảng 3.12 Phân bố vị trí tổn thương X quang ngực thẳng 61 Bảng 3.13 Mối liên quan mức độ tổn thương X quang ngực melioidosis phổi biến chứng 61 Bảng 3.14 Nồng độ ức chế tối thiểu imipenem qua năm .64 Bảng 3.15 Nồng độ ức chế tối thiểu ceftazidime qua năm 65 Bảng 3.16 Nồng độ ức chế tối thiểu amoxicillin/ clavulanic acid qua năm .65 Bảng 3.17 Nồng độ ức chế tối thiểu trimethoprim/ sulfamethoxazole qua năm 66 Bảng 3.18 Phân bố kết cục bệnh nhân melioidosis phổi thời điểm xuất viện 66 Bảng 3.19 Kết cục bệnh nhân melioidosis phổi sau – tháng sau xuất viện 67 Bảng 3.20 Tình hình điều trị kháng sinh trì bệnh nhân tiến cứu (n=20) .68 Bảng 3.21 Tình hình điều trị kháng sinh trì tồn bệnh nhân (n= 54) 68 Bảng 3.22 Tỷ lệ tử vong melioidosis phổi bệnh nhân có bệnh 69 Bảng 3.23 Kết đánh giá thang điểm 70 Bảng 3.24 So sánh thang điểm dự đoán tử vong xuất viện nặng melioidosis phổi .71 Bảng 3.25 So sánh thang điểm dự đoán nhu cầu IRVS melioidosis phổi .73 Bảng 3.26 Liên quan đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng kết cục 75 Bảng 3.27 Liên quan phân bố tổn thương X quang ngực kết cục sau xuất viện 3-6 tháng bệnh nhân melioidosis phổi (n=59) 76 Bảng 4.1 So sánh số lượng tiểu cầu với nghiên cứu 89 Bảng 4.2 So sánh số lượng tiểu cầu bệnh nhân melioidosis phổi với nghiên cứu Úc 103 Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Thời gian kéo dài………… Số lần… /ngày Mơ tả tính chất phân……………… ………………………… 4.12 Ho: Ho khan □ Ho có đàm □ Ho Đàm: Trong □ Đau □ Không □ Co kéo hơ hấp: Có □ 4.14 máu Đục □ 4.13 Khó thở: Có □ SpO2 ………% Khơng □ FiO2……….% ngực: Khơng □ Có □ Mơ tả tính chất đau: 4.15 Suy hơ hấp: Khơng □ SHH có thở máy □ 4.16 Sang thương da: Không □ SHH khơng thở máy □ Có □ 4.17 Mơ tả, vị trí……………………………………………………………………… ……………………………………………………………………………………… ………….…………………………………………………………………………… 4.18 Cơ xương khớp: Khơng □ Có □ 4.19 Vị trí tổn thương…………………………… Các triệu chứng khác: Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Cận lâm sàng 5.1 Công thức máu Ngày vào viện WBC (k/µl) Neu Lympho Lympho (%) Hgb (g/dl) Hct (%) PLT 5.2 Chỉ dấu sinh học Ngày vào viện CRP (mg/L) Procalcitonin (ng/ml) 5.3 Sinh hóa máu Ngày vào viện Glucose máu (mg/dl) HbA1C (%) Albumin máu (g/L) Creatinin (mg/l) Bun (mg/dl) ALT (U/L) AST (U/L) Bilirubin toàn phần (mg/dl) Bicarbonate (mmol/l) Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 5.4 X quang ngực Lần Lần Lần Tổn thương phế nang Tổn thương mô kẽ Nốt Khối Mức dịch áp xe phổi Kén hang Tràn khí màng Tự Phổi T phổi Phổi P Khu Phổi T trú Phổi P Tràn dịch màng Tự Phổi T phổi Phổi P Khu Phổi T trú Phổi P Ứ khí phổi Bất thường đường bờ trung thất Xẹp phổi Vị trí Thùy phổi P tổn Thùy phổi P thương Thùy phổi P Thùy phổi T Thùy phổi T Cả phế trường Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Lần Lần Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh 5.5 Vi sinh Loại trừ lao □ Loại trừ covid □ Cấy máu- Kháng sinh đồ Lần 1(kết nhận Lần 2(kết nhận Lần 3(kết nhận được… ngày) được… ngày) được… ngày) (+)/ (-) Nhạy Kháng MIC Nhạy Kháng MIC Nhạy Kháng MIC Amox+ clav acid Ceftazidime Imipenem Meropenem TMP-SMX Cấy bệnh phẩm……………………+ kháng sinh đồ Lần 1(kết nhận Lần 2(kết nhận Lần 3(kết nhận được… ngày) được… ngày) được… ngày) (+)/ (-) Nhạy Kháng MIC Nhạy Kháng MIC Nhạy Kháng MIC Amox+ clav acid Ceftazidime Imipenem Meropenem TMP-SMX Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Tóm tắt 6.1 Tổng kết vị trí ổ nhiễm trùng Có □ Áp xe da, mơ mềm: Có □ Áp xe, viêm khớp: Không □ Áp xe gan: Có □ Khơng □ Áp xe lách: Có □ Khơng □ Có □ Áp xe tiền liệt tuyến: Viêm não: Khơng □ Có □ Viêm màng não mủ: Có □ Khơng □ Khơng □ Áp xe phổi: Có □ Khơng □ Viêm phổi: Có □ Khơng □ Tràn dịch màng phổi: Khơng □ Có □ Khơng □ Tn thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Hệ thống CURB-65 Thang điểm CURB-65 C = Confusion: lú lẫn, định hướng không gian thời gian U= Uremia: Bun >7 mmol/l (20mg/dl) R = Respiratory Rate: Nhịp thở tăng ≥ 30 lần/phút B = Blood Pressure: Huyết áp (HA) tâm thu < 90 mmHg HA tâm trương ≤ 60 mmHg 65 = Tuổi ≥ 65 Tổng ATS/ IDSA 2007 Tiêu chí Suy hơ hấp cần thở máy Sốc nhiễm trùng Tiêu chí phụ Rối loạn tri giác Tần số thở >30/phút Urê máu > mmol/l Giảm bạch cầu Giảm tiểu cầu Giảm thân nhiệt Hạ huyết áp cần bù dịch PaO2/ FiO2 < 250 Tổn thương đa thùy Tuân thủ Luật sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Điểm số Bản quyền tài liệu thuộc Thư viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh Hệ thống PSI Điểm Tuổi Điểm Cận lâm sàng Nam Tuổi Bun ≥ 30 m/dl 20 Nữ Tuổi -10 Natri máu < 130 mmol/L 20 Nhà an dưỡng 10 Bệnh đồng thời Đường máu ≥ 250mg/dl 10 Hct < 30% 10 Ung thư 30 Oxy hóa Bệnh gan mạn 20 pH < 7,35 30 Suy tim sung huyết 10 SpO2