Căn nguyên vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết và thực trạng kháng kháng sinh tại bệnh viện đa khoa xanh pôn năm 2020 2021

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CÔNG CỘNG VŨ THỊ DIỆP H P CĂN NGUYÊN VI KHUẨN GÂY NHIỄM KHUẨN HUYẾT VÀ THỰC TRẠNG KHÁNG KHÁNG SINH TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA XANH PÔN NĂM 2020-2021 U LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC H MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 8720601 HÀ NỘI – 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CÔNG CỘNG VŨ THỊ DIỆP CĂN NGUYÊN VI KHUẨN GÂY NHIỄM KHUẨN HUYẾT H P VÀ THỰC TRẠNG KHÁNG KHÁNG SINH TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA XANH PÔN NĂM 2020-2021 LUẬN VĂN U THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 7720601 H NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS NGUYỄN VŨ TRUNG HÀ NỘI – 2022 i MỤC LỤC TÓM TẮT NGHIÊN CỨU ix ĐẶT VẤN ĐỀ MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1.Tổng quan nhiễm khuẩn huyết kháng khánh sinh .4 Nhiễm khuẩn huyết Căn nguyên nhiễm khuẩn huyết .5 H P Đường vào nhiễm khuẩn huyết Kết điều trị nhiễm khuẩn huyết Nhiễm khuẩn bệnh viện Kháng sinh 10 Kháng kháng sinh vi khuẩn 10 U 1.2.Các kĩ thuật xác định nguyên gây nhiễm khuẩn huyết kháng kháng sinh 12 H 1.2.1 Quy trình ni cấy phân lập vi khuẩn từ bệnh phẩm máu xác định nguyên gây nhiễm khuẩn huyết 12 1.2.2 Một số kỹ thuật định danh vi khuẩn .17 1.2.3 Quy trình kháng sinh đồ khoanh giấy khuếch tán VITEK 19 1.3 Tình hình dịch tễ học nhiễm khuẩn huyết kháng kháng sinh 21 1.3.1 Tình hình dịch tễ học nhiễm khuẩn huyết kháng kháng sinh giới 21 1.3.2 Tình hình dịch tễ học nhiễm khuẩn huyết kháng kháng sinh Việt Nam 28 1.3.3 Một số yếu tố liên quan đến kháng kháng sinh 31 i ii 1.4 Thông tin chung địa bàn nghiên cứu .33 Chương 2: PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 35 2.1 Đối tượng nghiên cứu .35 b Tiêu chí loại trừ người bệnh 35 2.2 Thời gian địa điểm nghiên cứu 35 2.3 Thiết kế nghiên cứu 36 2.3.1 Thiết kế nghiên cứu 36 2.3.2 Phương pháp chọn mẫu cỡ mẫu .36 H P 2.3.3 Quy trình nghiên cứu 37 2.4 Biến số nghiên cứu 37 2.5 Phương pháp thu thập số liệu .38 2.6 Kỹ thuật sử dụng nghiên cứu 38 U 2.6.1 Kĩ thuật trích xuất số liệu từ phần mềm labconn .38 2.6.2 Kĩ thuật trích xuất số liệu từ phần mềm bệnh án điện tử 39 2.6.3 Kĩ thuật trích xuất số liệu từ phần mềm WHONET .39 H 2.7 Phương pháp xử lý số liệu 41 2.8.Sai số cách khống chế sai số 42 2.9.Đạo đức nghiên cứu 42 Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .44 3.1 Thông tin chung đối tượng nghiên cứu .44 3.2 Xác định nguyên gây nhiễm khuẩn huyết bệnh viện đa khoa Xanh pôn từ 2020-2021 48 3.2.1.Phân bố chủng vi khuẩn nuôi cấy 48 3.2.2 Phân bố chủng vi khuẩn theo đặc điểm 50 ii iii 3.3.Xác định mức độ nhạy cảm với kháng sinh vi khuẩn 53 3.3.1.Tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn phân lập 53 3.3.2 Mức độ kháng kháng sinh số chủng vi khuẩn phân lập 68 3.3.3 Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh điển hình 70 Chương 4: BÀN LUẬN 73 4.1 Các nguyên gây nhiễm khuẩn huyết 73 4.1.1 Đặc điểm chung người bệnh mắc nhiễm khuẩn huyết 73 4.1.2 Đặc điểm nguyên gây nhiễm khuẩn huyết 74 H P 4.2 Tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn hay gặp 77 4.2.1 Tính nhạy/kháng kháng sinh S aureus 77 4.2.2 Tính nhạy/kháng kháng sinh E coli .79 4.2.3 Tính nhạy/kháng kháng sinh K pneumoniae 81 U 4.2.4 Mức độ đề kháng kháng sinh họ Enterobacteriaceae khác 83 4.2.5 Mức độ đề kháng kháng sinh A baumannii 84 H 4.2.6 Mức độ đề kháng kháng sinh Stenotromophonas maltophilia .85 4.3 Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh điển hình 86 4.3 Hạn chế nghiên cứu .87 KẾT LUẬN 88 KHUYẾN NGHỊ .89 TÀI LIỆU THAM KHẢO 90 PHỤ LỤC 1: Quy trình ni cấy phân lập vi khuẩn từ bệnh phẩm máu xác định nguyên gây nhiễm khuẩn huyết kháng sinh đồ 99 PHỤ LỤC : BỘ CÔNG CỤ THU THẬP THÔNG TIN 114 PHỤ LỤC 3: THANG ĐIỂM VÀ SOFA .119 iii iv PHỤ LỤC 4: TIÊU CHUẨN VÀ CÁC KỸ THUẬT SỬ DỤNG 120 PHỤ LỤC 5: Bảng danh mục kháng sinh đặt cho chủng vi khuẩn nhiễm khuẩn huyết 126 PHỤ LỤC 6: Biến số nghiên cứu 130 H P U H iv v DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT ADN : Acid deoxyribonucleic ARN : Acid ribonucleic ATTC : BVĐK : Bệnh viện đa khoa CI : Confidence Interval (khoảng tin cậy) CLSI : KKS : Kháng kháng sinh KSĐ : Kháng sinh đồ MHA : Mueller Hinton Agar MIC : MRSA : NKBV : NKH : OR : PBP : American Type Culture Collection (Đơn vị thu thập, phân phối, bảo quản mẫu sinh học Mỹ) Clinical and Laboratory Standards Institute (Viện H P tiêu chuẩn lâm sàng xét nghiệm) U Minimal Inhibited Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (Tụ cầu H vàng kháng methicillin) Nhiễm khuẩn bệnh viện Nhiễm khuẩn huyết Odds Ratio (Tỷ suất chênh) Penicilin Binding Protein (Các protein penicillin) qSOFA : Quick SOFA (Thang điểm SOFA-nhanh) R : Resistance (đề kháng) S : Susceptibility (nhạy cảm) v gắn vi Systemicin flammatory response syndrome (Hội SIRS : SOFA : Thang điểm SOFA TTXN : Trung tâm xét nghiệm WHO : Word Health Organization (Tổ chức Y tế giới) chứng đáp viêm toàn thân) H P U H vi vii DANH MỤC BẢNG Bảng 1: Đặc điểm tuổi đối tượng nghiên cứu .44 Bảng 2: Phân bố khoa điều trị ĐTNC 44 Bảng 3: Chẩn đoán ban đầu đối tượng nghiên cứu 45 Bảng 4: Đặc điểm số ngày điều trị ĐTNC .46 Bảng 5: Phân bố chủng vi khuẩn nuôi cấy 48 Bảng 6: Phân bố chủng vi khuẩn theo men ESBL (n=115) 49 Bảng 7: Phân bố chủng vi khuẩn nuôi cấy theo nhóm tuổi (n=328) 50 Bảng 8: Phân bố chủng vi khuẩn ni cấy theo giới tính 51 H P Bảng 10: Phân bố chủng vi khuẩn nuôi cấy theo thời gian 52 Bảng 11: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn A baumannii 68 Bảng 12: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn B cepacia 68 Bảng 13: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn E cloacae 69 Bảng 14: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn E coli 69 Bảng 15: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn S aurreus .69 U Bảng 16: Mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn khác .70 Bảng 17: Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh Ampicilin H E.Coli .70 Bảng 18: Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh ciprofloxacin E.Coli 71 Bảng 19: Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh ciprofloxacin Klebsiella pneumoniae .71 Bảng 20: Một số yếu tố liên quan tới tính nhạy/kháng kháng sinh ciprofloxacin S aureus .72 viii DANH MỤC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 1: Tỉ lệ nhiễm khuẩn bệnh viện đối tượng nghiên cứu 47 Biểu đồ Phân bố loại vi khuẩn nuôi cấy (n=328) 49 Biểu đồ 3 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn A baumannii (n=7) 53 Biểu đồ Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn B cepacia (n=43) 54 Biểu đồ Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn E cloacae H P (n=8) 55 Biểu đồ Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn E coli (n=52) 57 Biểu đồ Tính nhạy/kháng chủng E coli sinh men ESBL với kháng sinh (n=23) 59 Biểu đồ Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn K U pneumoniae (n=76) 60 Biểu đồ Tính nhạy/kháng chủng K pneumoniae sinh men ESBL với H kháng sinh (n=20) .61 Biểu đồ 10 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn P aeruginosa (n=9) 62 Biểu đồ 11 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn S aureus (n=70) 63 Biểu đồ 12 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn S epidermidis (n=7) 64 Biểu đồ 13 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn S maltophilia (n=8) 65 Biểu đồ 14 Xác định tính nhạy/kháng kháng sinh chủng vi khuẩn S maltophilia (n=8) 66 141 H P H U 142 H P H U 143 H P H U 144 H P H U 145 H P H U 146 H P H U 147 H P H U 148 H P H U 149 H P H U 150 H P H U 151 H P H U 152 H P H U 153 H P H U 154 H P H U 155 H P H U