Đánh giá mối liên quan giữa đa hình gen gh indel 50, gh indel 65 với tính trạng sinh trưởng ở gà liên minh (khóa luận tốt nghiệp)

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC ~~~~~***~~~~~ KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: “ĐÁNH GIÁ MỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐA HÌNH GEN GH INDEL 50, GH INDEL 65 VỚI TÍNH TRẠNG SINH TRƯỞNG Ở GÀ LIÊN MINH” HÀ NỘI – 2022 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM KHOA CƠNG NGHỆ SINH HỌC ~~~~~***~~~~~ KHĨA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: “ĐÁNH GIÁ MỐI LIÊN QUAN GIỮA ĐA HÌNH GEN GH INDEL 50, GH INDEL 65 VỚI TÍNH TRẠNG SINH TRƯỞNG Ở GÀ LIÊN MINH” Sinh viên thực : ĐẶNG VĂN ĐẠI Lớp : K63CNSHB Khoa : CÔNG NGHỆ SINH HỌC Giảng viên hướng dẫn : TS TRẦN THỊ BÌNH NGUYÊN HÀ NỘI – 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan kết nghiên cứu Các số liệu, kết khóa luận trung thực chưa dùng để bảo vệ học vị Tôi xin cam đoan thơng tin trích dẫn khóa luận rõ nguồn gốc giúp đỡ cảm ơn Hà Nội, ngày 05 tháng 09 năm 2022 Sinh viên Đặng Văn Đại i LỜI CẢM ƠN Lời xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc tới TS Trần Thị Bình Ngun, giảng viên mơn Cơng nghệ Sinh học Động vật tận tình bảo, dẫn dắt tơi suốt q trình học tập nghiên cứu phịng thí nghiệm mơn sinh học động vật khoa Công nghệ Sinh học Tiếp theo xin cảm ơn Thầy, Cô môn Công nghệ Sinh học Động vật Thầy, Cô khoa Công nghệ Sinh học - Học viện nông nghiệp Việt Nam tạo điều kiện giúp đỡ cho tơi q trình học tập nghiên cứu Trường Tôi xin chân thành cảm ơn cán Trung tâm Ứng dụng Tiến Khoa học Cơng nghệ Hải Phịng Cuối cùng, tơi xin tỏ lịng biết ơn chân thành tới gia đình, bạn bè người thân yêu tin tưởng, ủng hộ, động viên tạo điều kiện tốt vật chất tinh thần để tơi hồn thành tốt khóa luận tốt nghiệp Tơi xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày 05 tháng 09 năm 2022 Sinh viên Đặng Văn Đại ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC BẢNG vi DANH MỤC HÌNH vii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT viii TÓM TẮT ix Phần I MỞ ĐẦU 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Yêu cầu Phần II TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Thông tin loài gà 2.1.1 Khái niệm 2.1.2 Đặc điểm 2.1.3 Đặc điểm ngoại hình gà 2.1.4 Chăn nuôi gà 2.2 Thông tin tổng quát gà Liên Minh 2.3 Sinh trưởng 2.3.1 Khái niệm sinh trưởng 2.3.2 Đánh giá khả sinh trưởng 2.3.3 Các yếu tố ảnh hưởng đến khả sinh trưởng gà 10 2.4 Thông tin đa hình GH indel 65 (GOGLB1), đa hình gen GH indel 50 khả sinh trưởng gà 11 2.4.1 Thông tin hệ gen gà 12 2.4.2 Thông tin tổng quan gen GH indel 65 (GOGLB1) 15 2.4.3 Thông tin tổng quan gen GH indel 50 16 iii 2.4.4 Các cơng trình nghiên cứu đa hình gen liên quan đến khả sinh trưởng gà 17 Phần III VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP 23 3.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 23 3.1.1 Thời gian 23 3.1.2 Địa điểm 23 3.2 Vật liệu nghiên cứu 23 3.3 Hoá chất thiết bị 23 3.3.1 Hoá chất 23 3.3.2 Dụng cụ thiết bị 24 3.4 Nội dung nghiên cứu 25 3.5 Phương pháp nghiên cứu 25 3.5.1 Phương pháp chăm sóc theo dõi đặc tính sinh trưởng đàn gà Liên Minh 25 3.5.2 Tách chiết DNA tổng số từ máu gà Liên Minh 29 3.5.3 Phương pháp điện di gel agarose 30 3.5.4 Phương pháp nhân gen Polymerase Chain Reaction (PCR) 31 3.5.5 Phương pháp sử lý kết 33 Phần IV KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 34 4.1 Kết tách chiết DNA tổng số 34 4.2 Kết định lượng DNA quang phổ kế 34 4.3 Kết phân tích đa hình gen GH indel 50 GH indel 65 phản ứng PCR 36 4.3.1 Kết khuếch đại đoạn gen GH indel 50 phản ứng PCR 36 4.3.2 Kết khuếch đại đoạn gen GH indel 65 phản ứng PCR 36 4.3.3 Kết phân tích tần số kiểu gen/alen 37 4.4 Tốc độ sinh trưởng tương đối gà Liên Minh 38 4.5 Mối liên quan đa hình nucleotide gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng gà Liên Minh 40 iv 4.6 Mối liên quan đa hình nucleotide gen GH indel 65 với kích thước thể gà Liên Minh 43 Phần V KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 46 5.1 Kết luận 46 5.2 Kiến nghị 46 TÀI LIỆU THAM KHẢO 47 v DANH MỤC BẢNG Bảng 3.1 Các hố chất sử dụng 23 Bảng 3.2 Các dung dịch đệm cần pha nghiên cứu 24 Bảng 3.3 Dụng cụ thiết bị sử dụng nghiên cứu 24 Bảng 3.4 Thông tin mồi sử dụng kĩ thuật PCR 25 Bảng 3.5 Thành phần phản ứng PCR 33 Bảng 3.6 Chu trình nhiệt phản ứng PCR 33 Bảng 4.1 Kết đại diện đo quang phổ DNA tổng số mẫu gà Liên Minh35 Bảng 4.2 Tần số phân bố kiểu gen/alen đoạn gen mã hoá GH indel 65 37 Bảng 4.3 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với khối lượng thể gà trống Liên Minh tuần tuổi 41 Bảng 4.4 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với khối lượng thể gà mái Liên Minh tuần tuổi 42 Bảng 4.5 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với độ dài phận thể gà trống Liên Minh tuần 20 tuổi 43 Bảng 4.6 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với độ dài phận thể gà mái Liên Minh tuần 20 tuổi 44 vi DANH MỤC HÌNH Hình 2.1 Ảnh minh hoạ gà trống Liên Minh Hình 2.2 Ảnh minh hoạ gà mái Liên Minh Hình 2.3 Bản đồ QTL NST gà, NST giới tính ♂ (ZZ), ♀ (WZ) 12 Hình 2.4 QTL cho tính trạng Trọng lượng thể hệ gen gà 13 Hình 2.5 QTL cho tính trạng Trọng lượng thể ngày tuổi gen gà 14 Hình 3.1 Hình minh hoạ trình theo dõi gà Liên Minh 26 Hình 3.2 Hình minh hoạ trình theo dõi lượng thức ăn cho gà 27 Hình 3.3 Hình minh hoạ trình đo gà Liên Minh 27 Hình 3.4 Bộ xương gia cầm 28 Hình 3.5 Ảnh minh hoạ trình lấy máu gà Liên Minh 29 Hình 3.6 Nguyên lý kĩ thuật PCR 32 Hình 4.1 Ảnh đại diện kết điện di DNA tổng số gà Liên Minh 34 Hình 4.2 Ảnh đại diện kết điện sản phẩm PCR đoạn gen mã hoá GH indel 50 36 Hình 4.3 Ảnh đại diện kết điện di sản phẩm PCR chủa đoạn gen mã hoá GH indel 65 37 Hình 4.4 Sơ đồ tốc độ sinh trưởng tương đối gà trống Liên Minh từ tuần tuổi đến 20 tuần tuổi 39 Hình 4.5 Sơ đồ tốc độ sinh trưởng tương đối gà mái Liên Minh từ tuần tuổi đến 20 tuần tuổi 39 vii DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT Nghĩa tiếng anh Từ viết tắt Nghĩa tiếng việt Bp Base pair Cặp bazơ DNA Deoxyribonucleic acid Axit đêơxyribơnuclêic EDTA Ethylene Diamine Tetraacetic Acid F Forward Axít Etylen Diamin Tetra Acetic Xuôi GH indel 50 Growth Hormone indel 50 GH indel 65 Growth Hormone indel 65 GOGLB1 Golgin subfamily B member Kb Kilo base Ki lô bazơ LM Liên Minh OD Optical density Quang phổ PBS Phosphate – buffer saline Nước muối đệm phốt phát PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase QTL Quantitative Trait Loci Vị trí tính trạng số lượng R Reverse Ngược RE Rectriction Enzyme Enzym giới hạn SDS Sodium Dodecyl Sulfate Natri lauryl sulfat SNP single-nucleotide polymorphism Đa hình đơn nucleotide TAE Tris – Acetic acid – EDTA TE Tris – Ethylen Diamin Tetra Acetic Tr BW Trang Khối lượng thể Body weight NXB Nhà xuất viii Từ bảng 4.2 cho thấy: Trong 60 cá thể gà Liên Minh nghiên cứu, kiểu gen DD xuất với tần số cao (0,533), cịn hai kiểu gen II ID có tần số xuất gần 0,2 0,267 Tần số alen I – alen D gà Liên Minh tương ứng 0,333 0,667 Từ phân tích trên, ta kết luận đa hình GH indel 65 có tần số kiểu gen tuân theo định luật Hardy – Weinberg (p>0,05) với tần số alen D cao tần số alen I kiểu gen DD chiếm tỉ lệ cao quần thể Các nghiên cứu giống gà khác cho kết tần số alen khác nhau, cụ thể giống gà ni Trung Quốc có tần số alen I – alen D xuất sau: Quần thể gà địa Văn Xương: 0,37 0,63; quần thể gà Shanhuang: 0,64 0,36; quần thể gà Gushi: 0,68 0,32; quần thể gà Xinghua: 0,63 0,37; quần thể gà Qingyuanma: 0,66 0,34; quần thể gà Lushi: 0,51 0,49; quần thể gà Mahuang: 0,76 0,24; quần thể gà vàng Tianlu: 0,77 0,23 (Rong Fu cs, 2020) Từ số liệu thống kê ta kết luận từ quần thể gà khác cho tần số alen kiểu gen khác 4.4 Tốc độ sinh trưởng tương đối gà Liên Minh Dựa vào khối lượng trung bình cá thể gà Liên Minh đo, ta xác định tốc độ sinh trưởng tương đối hàng tuần Cơng thức tính tốc độ sinh trưởng tương đối tính theo phương pháp Bùi Hữu Đồn cs (2011), R% = P2 − P1 (P2+P1)/2 ∗ 100 Trong đó: R sinh trưởng tương đối (%) P1 khối lượng thể lần cân trước (g) P2 khối lượng thể lần cân sau (g) Kết tốc độ sinh trưởng tương đối gà Liên Minh thể hình 4.4, 4.5 38 65% 70% 59% 60% 47% 50% 39% 40% 35% 30% 22% 20% 10% 0% 25% 18% 19% 19% 19% 12% 10% 9% 0% 10 12 14 16 18 20 Hình 4.4 Sơ đồ tốc độ sinh trưởng tương đối gà trống Liên Minh từ tuần tuổi đến 20 tuần tuổi Kết theo dõi qua hình 4.4, cho thấy tốc độ sinh trưởng tương đối gà trống Liên Minh tăng mạnh tuần đầu (tuần thứ có tốc độ sinh trưởng cao 65%), giảm dần đến tuần thứ 7, sau có tăng nhẹ khoảng từ tuần thứ đến tuần thứ 10 (từ 18% tăng thành 25%), sau tiếp tục giảm dần đến tuần thứ 20 tốc độ sinh trưởng chậm lại 9% 80% 67% 70% 60% 52% 51% 50% 41% 40% 28% 30% 22% 14% 20% 10% 0% 19% 24% 21% 19% 12% 15% 8% 0% 10 12 14 16 18 20 Hình 4.5 Sơ đồ tốc độ sinh trưởng tương đối gà mái Liên Minh từ tuần tuổi đến 20 tuần tuổi Theo kết hình 4.5, đồ thị tốc độ sinh trưởng tương đối gà mái Liên Minh có hình dạng tương tự gà trống Cụ thể tốc độ sinh trưởng gà mái Liên Minh tăng mạnh đến tuần thứ đạt mức cao 67%, từ tuần thứ đến tuần thứ tốc độ sinh trưởng giảm dần, sau có tăng nhẹ từ tuần đến tuần thứ 10 (từ 14% lên 39 24%), tuần tốc độ sinh trưởng giảm dần tăng nhẹ tuần 18 (từ 12% tuần 16 lên 15% tuần 18) đến tuần thứ 20 tốc độ sinh trưởng chậm lại cịn 8%, tốc độ sinh trưởng tương đối tuần 20 gà mái Liên Minh 1% với tốc độ sinh trưởng gà trống Liên Minh So sánh với tốc độ sinh trưởng cùa gà Liên Minh với gà Tam Hồng, giống gà chun sản xuất thịt tốc độ sinh trưởng tuần thứ gà Liên Minh (47 – 52%) thấp nhiều so với gà Tam Hoàng (83,25%) (Đào Văn Khanh cs, 2002) Tuy nhiên tuần thứ tuần thứ tốc độ tăng trưởng gà mái Liên Minh cao với gà mái Tam Hoàng (65% tuần thứ 2, 59% tuần thứ 3), tương tự gà mái gà trống Liên Minh có tốc độ tăng trưởng tuần tuổi thứ tuần tuổi thứ cao gà trống Tam Hoàng (67% tuần thứ 51% tuần thứ 3) Nếu vào tiêu kinh tế kết thúc giai đoạn ni gà Liên Minh thương phẩm 20 tuần tuổi từ tuần tuôi 20 trở gà lớn tương đối chậm Tuy nhiên, vào giai đoạn nhiều cá thể gà chưa mọc đầy đủ lông cánh chất lượng thịt chưa vậy, thí nghiệm ni gà Liên Minh thương phẩm kết thúc 24 tuần tuổi để hợp với thị hiếu người tiêu dùng 4.5 Mối liên quan đa hình nucleotide gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng gà Liên Minh Sử dụng phần mềm Minitab 16.0 để phân tích tương quan đa hình gen GH indel 65 với khối lượng thể theo tuần gà Liên Minh Kết phân tích thể bảng 4.4 4.5 40 Bảng 4.3 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với khối lượng thể gà trống Liên Minh tuần tuổi Tuần Kiểu gen P II (n=4) ID (n=10) DD (n=14) Mean ± SD (g) Mean ± SD (g) Mean ± SD (g) 34,318 ± 2,157 33,700 ± 2,222 33,970 ± 2,612 0,945 55,613 ± 0,515 54,400 ± 6,449 55,645 ± 6,925 0,327 121,250 ± 10,639 103,000 ± 23,672 108,319 ± 17,293 0,673 209,000 ± 20,869 210,200 ± 63,455 189,589 ± 32,017 0,051 320,000 ± 40,620 286,300 ± 62,696 300,357 ± 41,512 0,512 450,000 ± 58,843 423,000 ± 82,559 418,929 ± 55,458 0,843 548,750 ± 79,559 532,500 ± 117,351 527,500 ± 74,060 0,871 653,750 ± 97,235 630,500 ± 129,778 615,714 ± 100,780 0,801 791,250 ± 101,389 754,000 ± 137,964 756,429 ± 102,494 0,675 10 1011,250 ± 193,209 968,500 ± 147,514 977,857 ± 124,078 0,784 12 1186,250 ± 161,840 1171,000± 171,126 1196,786 ± 149,351 0,860 14 1431,250 ± 108,073 1455,000 ± 172,061 1421,071 ± 99,142 0,104 16 1592,500 ± 56,292 1642,000 ± 147,499 1623,929 ± 86,771 0,282 18 1718,750 ± 99,019 1867,500 ± 196,307 1791,071 ± 95,397 0,180 20 1931,250 ± 126,904 2051,0 ± 244,641 1942,143 ± 129,459 0,269 tuổi Ghi chú: n: tổng số; Mean: Giá trị trung bình; SD: Độ lệch chuẩn Theo kết bảng 4.4, thời điểm 01 ngày tuổi đến 10 tuần tuổi, cá thể gà trống Liên Minh mang kiểu gen II cho khối lượng cao so với cá thể mang hai kiểu gen cịn lại ID DD khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng thể với trị số (P>0,05) Tại thời điểm gà 12 tuần tuổi đến 20 tuần tuổi, cá thể gà mang kiểu gen ID có khối lượng tương đối cao so với cá thể mang kiểu gen II DD khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng thể (P>0,05) Qua số liệu thống kê thể bảng tất tuần tuổi khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng thể gà trống 41 Liên Minh với trị số (P>0,05) Bảng 4.4 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với khối lượng thể gà mái Liên Minh tuần tuổi Tuần Kiểu gen p II (n=8) ID (n=6) DD (n=18) Mean ± SD (g) Mean ± SD (g) Mean ± SD (g) 31,506 ± 1,884 34,408 ± 2,675 32,559 ± 2,857 0,765 52,000 ± 4,842 55,683 ± 2,038 57,431 ± 11,554 0,302 101,037 ± 13,876 102,617 ± 15,606 101,608 ± 12,877 0,955 168,375 ± 16,077 176,667 ± 31,710 172,433 ± 26,494 0,425 255,625 ± 18,781 254,167 ± 36,562 266,556 ± 31,990 0,567 335,000 ± 45,621 337,500 ± 75,595 355,556 ± 51,610 0,429 407,500 ± 45,758 427,500 ± 100,322 443,889 ± 78,961 0,196 501,875 ± 51,048 457,500 ± 55,883 511,389 ± 90,704 0,326 610,625 ± 55,758 555,000 ± 46,368 615,000 ± 81,155 0,241 10 801,875 ± 76,809 737,500 ± 52,738 765,000 ± 74,981 0,577 12 995,625 ± 105,043 918,333 ± 48,448 930,833 ± 90,956 0,388 14 1188,750 ± 142,231 1128,333 ± 182,977 1135,000 ± 104,363 0,609 16 1329,375 ± 138,619 1285,000 ± 184,278 1288,333 ± 126,634 0,764 18 1564,375 ± 160,846 1522,500 ± 134,590 1501,667 ± 172,699 0,910 20 1657,500 ± 126,96 1660,000 ± 127,541 1655,000 ± 151,116 0,850 tuổi Ghi chú: n: Tổng số; Mean: Giá trị trung bình; SD: Độ lệch chuẩn Theo kết bảng 4.5, gà mái Liên Minh cá thể mang kiểu gen DD có khối lượng tương đối cao kiểu gen lại II ID thời điểm 01 ngày tuổi đến tuần tuổi Còn lại từ 10 tuần tuổi đến 20 tuần tuổi thì cá thể mang kiểu gen II có khối lượng tương đối cao so với cá thể mang kiểu gen ID DD Kết số liệu thể bảng 4.5 cho ta thấy tất tuần tuổi khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng thể gà mái Liên Minh ( P>0,05) Trọng lượng thể, đặc điểm ảnh hưởng đến kinh tế quan trọng ngành chăn nuôi gà thịt chứng minh quãng thời gian 42 dài (Liu X cs, 2008) Dựa vào bảng 4.4 4.5 nhận thấy gà có kiểu gen II đa số có khối lượng thể tốt đáng kể so với có kiểu gen ID DD Ta nhận thấy tuần tuổi khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng thể gà Liên Minh với trị số (P>0,05) Ngun nhân số lượng mẫu cịn (28 trống, 32 mái) nên tương lai cần thực thêm thí nghiệm với dung lượng mẫu lớn để có kết tốt 4.6 Mối liên quan đa hình nucleotide gen GH indel 65 với kích thước thể gà Liên Minh Một số quan trọng để đánh giá khả sinh trưởng gà số đo kích thước thể Sử dụng phần mềm Minitab 16.0 để phân tích tương quan đa hình gen GH indel 65 với kích thước thể theo tuần gà Liên Minh theo phương pháp đo Bùi Hữu Đồn cs (2011) Kết phân tích thể bảng 4.6 4.7 Bảng 4.5 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với độ dài phận thể gà trống Liên Minh tuần 20 tuổi Kiểu gen Bộ phận p II (n=4) ID (n=10) DD (n=14) Mean ± SD Mean ± SD Mean ± SD Dài thân (cm) 22,500 ± 2,092 22.100 ± 1,921 21,357 ± 1,493 0,562 Dài lườn (cm) 16,375 ± 1,083 16,000 ± 1,643 15,750 ± 1,590 0,397 Dài bàn chân (cm) 8,125 ± 0,935 8,490 ± 0,796 7,993 ± 0,651 0,785 Dài đùi (cm) 12,500 ± 0,650 13,150 ± 1,141 12,107 ± 0,828 0,879 Dài cẳng chân (cm) 16,625 ± 0,415 16,300 ± 1,364 16,014 ± 0,834 0,332 Sâu ngực (cm) 8,500 ± 0,500 8,300 ± 0,748 8,536 ± 0,611 0,729 Dài cánh (cm) 24,750 ± 0,750 23,750 ± 2,294 23,607 ± 1,173 0,130 Ghi chú: n: tổng số; Mean: Giá trị trung bình; SD: Độ lệch chuẩn Theo kết bảng 4.6, thời điểm tuần 20 tuổi chiều dài thân gà trống Liên Minh có kiểu gen II có kích thước 22,5 cm cao so với kiểu gen ID DD có kích thước 22,1cm 22,357 cm Tương tự chiều dài thân độ dài lườn, độ dài cẳng chân độ dài cánh có kích thước kiểu gen II dài so với kiểu gen lại Chiều dài đùi đo thời điểm 20 tuần tuổi có kiểu gen ID 43 13,15 cm dài so với hai kiểu gen lại Tương tự dài đùi dài bàn chân có kiểu gen ID dài kiểu gen II DD Cuối thông số sâu ngực phận phận có kiểu gen DD dài so với kiểu gen lại Tại thời điểm 20 tuần tuổi ta nhận thấy khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng kích thước thể gà trống Liên Minh với trị số (P>0,05) Bảng 4.6 Kết phân tích mối liên quan đa hình nucleotide với độ dài phận thể gà mái Liên Minh tuần 20 tuổi Kiểu gen Bộ phận p II (n=8) ID (n=6 DD (n=18) Mean ± SD Mean ± SD Mean ± SD Dài thân (cm) 19,813 ± 1,435 20,417 ± 1,239 20,556 ± 1,246 0,787 Dài lườn (cm) 14,438 ± 1,130 14,583 ± 1,133 14,556 ± 1,026 0,995 Dài bàn chân (cm) 7,425 ± 0,655 6,617 ± 0,219 6,867 ± 0,392 0,245 Dài đùi (cm) 11,375 ± 0,545 11,000 ±0,289 10,956 ± 0,663 0,204 Dài cẳng chân (cm) 14,563 ± 1,014 14,333 ± 1,572 14,611 ± 0,859 0,152 Sâu ngực (cm) 7,625 ± 1,053 7,917 ± 0,837 7,889 ± 0,875 0,949 Dài cánh (cm) 20,000 ± 1,871 21,833 ± 1,027 21,417 ± 1,575 0,582 Ghi chú: n: tổng số; Mean: Giá trị trung bình; SD: Độ lệch chuẩn Nhìn vào bảng kết 4.7 thấy được, chiều dài thân gà mái Liên Minh tuần tuổi 20 có số cao kiểu gen DD 20,556 cm cao so với hai kiểu gen lại II ID có số đo 19, 813 cm 20,417 cm Tương tự chiều dài thân chiều dài cẳng chân chiều dài bàn chân có số đo kiểu gen DD cao so với kiểu gen lại Số chiều dài lườn có kiểu gen ID cao so với kiểu gen II DD, tương tự chiều dài lườn sâu ngực dài cánh có kiểu gen ID có chiều dài so với kiểu gen cịn lại Thơng qua bảng kết 4.7 ta nhận thấy khơng tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng kích thước thể gà mái Liên Minh với trị số (P>0,05) Dựa vào bảng 4.5, ta thấy gà trống Liên Minh, phần lớn số đo phận thể cá thể gà mang kiểu gen II cao so so với phận thể cá thể gà kiểu gen ID kiểu gen DD Bảng 4.6 kết cho thấy, gà mái Liên Minh, 44 kích thước phận cá thể gà mang kiểu gen DD cao so kích thước phận thể gà kiểu gen lại Kết bảng cho thấy không tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình gen GH indel 65 với tính trạng kích thước thể gà Liên Minh với trị số (P>0,05) 45 Phần V KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 5.1 Kết luận - Đã tách chiết DNA tổng số từ 60 mẫu máu gà Liên Minh - Đã xác định đa hình gen GH indel 65, kết thu tần số alen/kiểu gen 60 cá thể gà Liên Minh, tần số kiểu gen II (0,2), kiểu gen ID (0,267) kiểu gen DD (0,533) - GH indel 50 khơng xuất đa hình giống gà Liên Minh - Nghiên cứu cho thấy không tìm thấy mối liên quan có ý nghĩa thống kê đa hình nucleotide gen GH indel 65 với tính trạng khối lượng, kích thước thể gà Liên Minh với trị số (P>0,05) 5.2 Kiến nghị Qua trình nghiên cứu tơi có đưa số đề nghị sau: - Cần phân tích quần thể có số lượng cá thể đủ lớn để đánh giá ảnh hưởng đa hình gen GH indel 65 lên tính trạng tốc độ sinh trưởng gà Liên Minh xác - Phân tích thêm số gen ứng cử liên quan tới tính trạng sinh trưởng như: Gen mã hóa: INS, TGF-β2…, qua chọn cá thể có tính trạng tốt hỗ trợ cho cơng tác chọn tạo dịng gà Liên Minh theo hướng tăng trưởng góp phần vào bảo tồn giống gà Liên Minh Hải Phòng 46 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tài liệu tiếng Việt Bùi Hữu Đoàn, Nguyễn Thị Mai, Nguyễn Thanh Sơn Nguyễn Huy Đạt (2011) Một số tiêu thường gặp nghiên cứu khả sinh trưởng sản xuất thịt gia cầm, sách :” Các tiêu dùng nghiên cứu chăn nuôi gia cầm”, Bùi Hữu Đồn (chủ biên) NXB Nơng nghiệp, Hà Nội, tr 31-55 Đào Văn Khanh (2002) Nghiên cứu khả sinh trưởng, suất chất lượng thịt gà giống gà lơng màu Kabir, Lương Phượng, Tam Hồng nuôi bán chăn thả mùa vụ khác Thái Nguyên Luận án tiến sỹ khoa học nông nghiệp, Đại học Nông nghiệp Thái Nguyên, tr: 179 Đỗ Võ Anh Khoa, Nguyễn Minh Thông, Nguyễn Thị Kim Trang, Nguyễn Thị Hồng Anh cs (2014) Ảnh hưởng đa hình di truyền gen hormon sinh trưởng lên tiêu thụ thức ăn hệ số chuyển hoá thức ăn gà Tàu Vàng Tạp chí nước, tr: 123-127 Đỗ Võ Anh Khoa (2012) Ảnh hưởng đột biến điểm C1032T gen IGFBP2 tính trạng suất thịt gà tàu vàng Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ, tr 1-7 Ngô Thị Kim Cúc cs (2016) Báo cáo tổng hợp kết Khoa học công nghệ đề tài: Khai thác phát triển nguồn gen gà Mía gà Móng, ms: 13085 Nguyễn Ân, Hồng Gián, Lê Viết Ly, Nguyễn Văn Thiên (1983) Di truyền học động vật, NXB Nông nghiệp, Hà Nội, tr: 86-185 Nguyễn Kim Đường, Trần Đình Miên, Nguyễn Tiến Văn (1992) Chọn giống nhân giống gia súc NXB Nông nghiệp Hà Nội Nguyễn Mạnh Hùng, Hoàng Thanh, Bùi Hữu Đoàn, Nguyễn Thị Mai (1994) Chăn nuôi gia cầm Nhà xuất Nông nghiệp, tr 104-108 Nguyễn Trọng Tuyển, Phùng Đức Tiến, Ngô Thị Kim Cúc, Lưu Quang Minh cs (2016) Đánh giá tính đa hình kiểu gen cGH vàc GHR giống gà Móng Tiên Phong Tạp trí Khoa học công nghệ, tr: 18-22 Tài liệu tiếng Anh Alvarez C., Garcia-Mata R., Hauri H.-P., Sztul E (2000) Nteracting proteins p115 GM130 and Giantin Involved in Endoplasmic-Golgi Mol Boil Cell, 276: 2693–2700 Bassam G M Al-khatib, Dihya H H Al-Hassani (2016) Effect of G1705A SNP in Growth Hormone Gene on the Productive and Physiological Performance inBroiler Chicken Iraqi J Biot, 15(1): 33-45 47 Birte Sönnichsen., Martin Lowe., Tim Levine., Eija Jämsä., Barbara Dirac-Svejstrup., Graham Warren (1998) A Role for Giantin in Docking COPI Vesicles to Golgi Membranes Journal of Cell Biology, 140 (5): 1013–1021 Boschiero C, Gheyas AA, Ralph H, Eory L, Paton IR, Kuo RI, Fulton JE, Preisinger R, Kaiser P, Burt D (2015) Detection and characterization of small insertion and deletion genetic variants in the modern class of chicken genomes BMC Genom, (16): 562 Brody S cs (1945) Bioenergentic and growth, Reinhold Publishing Corporation – Newyork, P 72 Buyse cs (1999) Thermoregulation in Chicks Originating from Breeder Flocks of Two Different Ages Journal of Applied Poultry Research, p139-145 Buyse cs (1999) The role of the somatotrophic axis in the metabolism of the chicken Domestic Animal Endocrinology, p245-255 Cao X, Ballew N Barlowe C (1998) Initial binding of ER-derived vesicles requires Uso1p and Ypt1p but is independent of the proteins Snare embo J 17: 2156-2165 Chambers J.R cs (1990) Genetic of growth and meat production in chiken R D Cawfoded Elsevier Amsterdam, p 627-628 10 Containing a Cytoplasmic Domain of at Least 350 kDa Molecular Biology of the Cell 4: 679-693 11 Darzi Niarami and Ali Akbar Masoudi, (2014) Association of Single Nucleotide Polymorphism of GHSR and TGFB2 Genes with Growth and Body Composition Traits in Sire and Dam Lines of a Broiler Chicken Animal Biotechnology, Page: 13-22 12 Fang M, Nie Q, Luo C, Zhang D, Zhang X (2007) An 8bp indel in exon of the Ghrelin gene involved in chicken development Leader Cartoon Hormonal, 32: 216–225 13 Godfrey E.F and Joap R.G (1952) Evidence of breed and sex differences in the weight of checkens hatched from eggs similar weight Poultry Science, p31 14 Ira Mellman., Graham Warren., David Sheff., Laurence Pelletier., Christopher B O'Connell (2000) Transferrin receptor recycling in the absence of perinuclear recycling endosomes, 156 (5): 797–804 15 Kerje S, Sharma P, Gunnarsson U, Kim H, Bagchi S, Fredriksson R, Schütz K, Jensen P, Von Heijne G, Okimoto R (2004) The predominant white, Dun and smoke variants in chickens are associated with insertion/deletion polymorphisms in the PMEL17 gene Genetics, 168 : 1507–1518 48 16 Koreishi M, Gniadek TJ, Yu S, Masuda J, Honjo Y Satoh A (2013) The giant golgin tether regulates the secretory pathway by controlling stack organization in the Golgi apparatus PLOS ONE (3): e59821 17 Kushner, K.F (1974) Các sở di truyền học lựa chọn giống gia cầm Tạp chí khoa học kĩ thuật Nông nghiệp, 141:222 – 227 18 Lei M, M Nie, Q Peng, X Zhang & Zhang X Q (2005) Single nucleotide polymorphisms of the chicken insulin-like factor binding protein gene associated with chicken growth and carcass traits Poultry science, 84(8): 1191-1198 19 Li W, Liu D, Tang S, Li D, Han R.-L, Tian Y D, Li H, Li G, Li W, Liu X (2019) A multiallelic indel in the promoter region of the Cyclin-dependent kinase inhibitor gene is significantly associated with body weight and carcass traits in chickens Poult, 98: 556– 565 20 Liang K, Wang X, Tian X, Geng R, Li W, Jing Z, Han R, Tian Y, Liu X, Kang X (2019) Molecular characterization and an 80-bp indel polymorphism within the prolactin receptor (PRLR) gene and its associations with chicken growth and carcass traits Biotech, 9: 296 21 Linstedt AD, Hauri HP (1993) Giantin, a Novel Conserved Golgi Membrane Protein 22 Linstedt Hauri (1993) Giantin, a novel conserved Golgi membrane protein containing a cytoplasmic domain of at least 350 kDa Molecular Biology of the Cell, Vol 4, No 7, p661-765 23 Liu D, Han R, Wang X, Li W, Tang S, Wang Y, Jiang R, Yan F, Wang C, Liu X (2019) A novel 86-bp indel of the motilin receptor gene is significantly associated with growth and carcass traits in Gushi-Anka F2 reciprocal cross chickens Br Poult Sci, 60: 649–658 24 M Lei, C Luo, X Peng, M Fang, Q Nie, D Zhang, G Yang and X Zhang (2007) Polymorphism of Growth-Correlated Genes Associated with Fatness and Muscle Fiber Traits in Chickens Poultry Science, Pages 835-842 25 M Lei, C Luo, X Peng, M Fang, Q Nie, D Zhang, G Yang, and X Zhang (2007) Polymorphism of growth-correlated genes associated with fatness and muscle fiber traits in chickens National Library of Medicine, 86 (5): 835-42 26 Mills RE, Luttig CT, Larkins CE, Beauchamp A, Tsui C, Pittard WS, Devine SE (2006) Initial map of insertion and deletion variation (INDEL) in the human genome The Res Genome, 16: 1182–1190 49 27 Mills RE, Luttig CT, Larkins CE, Beauchamp A, Tsui C, Pittard WS, Devine SE (2006) Initial map of insertion and deletion variation (INDEL) in the human genome The Res genome, 16: 1182–1190 28 Munro (2011) The Golgin Coiled-Coil Proteins of the Golgi Apparatus Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, doi: 10.1101/cshperspect.a005256 29 Muqsita Rahmat, Depison Depison, Eko Wiyanto cs, (2022) Association of growth hormone gene polymorphism with body weight body weight Kampung chicken Livestock and Animal Research, 20(1): 1-10 30 Puthenveedu Linstedt, (2001) Evidence that Golgi structure depends on a p115 activity that is independent of the vesicle tether components giantin and GM130 Journal of Cell Biology, 155 (2): 227–238 31 Qinghua Nie, Meixia Fang, Liang Xie, Min Zhou, Zhangmin Liang, Ziping Luo, Guohuang Wang, Wensen Bi, Canjian Liang, Wei Zhang & Xiquan Zhang (2008) The PIT1 gene polymorphisms were associated with chicken growth traits Part of Springer Nature, Article number: 20 (2008) 32 Qiu F, F Nie, Q H Luo, C L Zhang, D X Lin & Zhang X Q (2006) Association of single nucleotide polymorphisms of the insulin gene with chicken early growth and fat deposition Poultry science, 85(6): 980-985 33 Rao YS, Wang ZF, Chai XW, Wu GZ, Nie QH, Zhang XQ (2010) Indel segregation in introns in the chicken genome is positively correlated with recombination rate Hereditas, 147 : 53–57 34 Ren T, Li W, Liu D, Liang K, Wang X, Li H, Jiang R, Tian Y, Kang X, Li Z (2019) Two insertion/deletion variants in the promoter region of the QPCTL gene are significantly associated with body weight and carcass traits in chickens Anim Genet, 50:279–282 35 Renaville cs (2002) Role of the somatotropic axis in the mammalian metabolism Domestic Animal Endocrinology, p351-360 36 Rong Fu, Tuanhui Ren, Wangyu Li, Jiaying Liang, Guodong Mo, Wen Luo, Danlin He, Shaodong Liang and Xiquan Zhang (2020) A Novel 65-bp Indel in the GOLGB1 Gene Is Associated with Chicken Growth and Carcass Traits National Library of Medicine, 10(3): 475 37 Sapperstein SK, Walter DM, Grosvenor AR, Heuser JE, Waters (1995) MG p115 yếu tố vận chuyển dạng mụn nước nói chung liên quan đến lưới nội chất nấm men với yếu tố vận chuyển Golgi Usolp proc natl acad Khoa học HOA KỲ 92: 522–526 50 38 Shafey Heba, M.D Aboelhassan, Ragaa E Abd El-karim, Karima, F Mahrous (2017) SNP of cGH Gene in Egyptian Chicken Breeds at MspI site Research Gate, 14 (1): 33-41 39 Short cs (2005) Golgins and GTPases, giving identity and structure to the Golgi apparatus Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Molecular Cell Research, Pages 383395 40 Silin Zhong., Je-LEun Joung., Jenny Z Xiang., Ying Shao., Vi Zheng., Zhangjun , Yun-ru Chen., Bao Liu & James J Giovannoni (2011) High-Throughput Illumina StrandSpecific RNA Sequencing Library Preparation Cold Spring Harbor Protocols, doi: 10.1101 41 Tang S, Ou J, Sun D, Xu G, Zhang Y (2011) A novel 62-bp indel mutation in the promoter region of transforming growth factor-beta (TGFB2) gene is associated with body weight in chickens Anim Genet, 42: 108–112 42 Tang S, Sun D, Ou J, Zhang Y, Xu G & Zhang Y (2010) Evaluation of the IGFs (IGF1 and IGF2) genes as candidates for growth, body measurement, carcass, and reproduction traits in Beijing You and Silkie chickens Animal biotechnology, 21(2): 104-113 43 Wang X, Li Z, Guo Y, Wang Y, Sun G, Jiang R, Kang X, Han R L (2018) Identification of a new 43 bp insertion in the heparan sulfate 6-O-sulfotransferase (HS6ST3) gene and its associations with growth and carcass traits in chickens Cartoon Biotechnology, 30 : 1–8 44 Yan Y., Yi G., Sun C., Qu L., Yang N (2014) Genome-wide characterization of insertion and deletion variation in chickens using next-generation sequencing PLOS ONE, 9: e104652 45 Yang S, Shi Z, Ou X, Liu G (2019) Whole-genome sequencing reveals inheritance of feather foot trait in domestic chickens J Genet, 98: 47 46 Yu Lan Y , Nian Zhang., Han Liu., Jingyue Xu., Rulang Jiang., (2016) Golgb1 regulates protein glycosylation and is crucial for mammalian palate development Development For advances in developmental biology and stem cells, 143 (13): 2344–2355 47 Zhang S, Han R, Gao Z, Zhu S, Tian Y, Sun G, Kang X (2014) A novel 31-bp indel in the paired box (PAX7) gene is associated with chicken performance traits Br Poult Sci 55:31–36 Tài liệu điện tử Chicken QTLdb data summary Top QTL/associations in the database Ngày truy cập 24/8/2022 http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/GG/summary 51 Vũ Cơng Q, Hồng Thị Yến, Ngơ Thị Hải Linh, Nguyễn Thị Năm Trương Ngọc Anh (2017) Chọn lọc nhân giống gà Liên Minh, Cổng thông tin điện tử Sở Khoa học Công nghệ Hải Phòng, truy cập ngày 6/8/2022 từ http://www.haiphong.gov.vn/Portal/Detail.aspx?Organization=skhcn&MenuID=857&Cont entID=115897 Gà Liên Minh Cát Bà Trung tâm phát triển Khoa học – Công nghệ đổi sáng tạo Truy cập ngày 6/8/2022 https://isc1.vn/ga-lien-minh-cat-ba-2 52