Nghiên cứu tình hình đề kháng kháng sinh và sinh enzyme esbl của escherichia coli tại bệnh viện đa khoa trung ương cần thơ năm 2021 2022

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ VÕ THÁI DƯƠNG NGHIÊN CỨU TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH VÀ SINH ENZYME ESBL CỦA ESCHERICHIA COLI TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG ƯƠNG CẦN THƠ NĂM 2021 - 2022 LUẬN VĂN THẠC SĨ CẦN THƠ – 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ VÕ THÁI DƯƠNG NGHIÊN CỨU TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH VÀ SINH ENZYME ESBL CỦA ESCHERICHIA COLI TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG ƯƠNG CẦN THƠ NĂM 2021 - 2022 Chuyên ngành: Kỹ thuật Xét nghiệm Y học Mã số: 8720601 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: TS.BS ĐỖ HỒNG LONG CẦN THƠ – 2022 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu tơi, kết nghiên cứu trình bày luận văn trung thực, khách quan chưa công bố nơi Tác giả luận văn VÕ THÁI DƯƠNG LỜI CẢM ƠN Trong trình học tập hồn thành luận văn này, tơi nhận giúp đỡ hướng dẫn nhiệt tình q thầy cơ, gia đình bạn bè Bằng lịng biết ơn kính trọng, tơi xin chân thành gửi lời cảm ơn đến Ban Giám hiệu, phòng, khoa thuộc Trường Đại học Y Dược Cần Thơ Giáo sư, Phó Giáo sư, Tiến sĩ, Thạc sĩ nhiều thầy nhiệt tình hướng dẫn, giảng dạy tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn Đặc biệt, tơi xin chân thành bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến TS.BS Đỗ Hồng Long – Trưởng mơn Sinh lý bệnh – Miễn dịch, Khoa Y, Trường Đại học Y Dược Cần Thơ - giảng viên trực tiếp hướng dẫn, bảo tận tình, tạo điều kiện thuận lợi suốt q trình học tập hồn thành luận văn Tôi xin gửi lời cảm ơn đến Khoa Vi sinh – Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ hỗ trợ tạo điều kiện thuận lợi để tơi thu thập mẫu, thơng tin bệnh nhân thực trọn vẹn đề tài Bên cạnh đó, xin trân quý gửi lời cảm ơn đến bệnh nhân tham gia nghiên cứu Với trái tim, xin gửi lời thân thương cảm ơn gia đình, bạn bè quý đồng nghiệp tạo thuận cho học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn Xin chân thành cảm ơn Tác giả VÕ THÁI DƯƠNG MỤC LỤC Trang LỜI CAM ĐOAN LỜI CẢM ƠN MỤC LỤC DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH VÀ ĐỒ THỊ MỞ ĐẦU Chương 1: TỔNG QUAN 1.1 Escherichia coli 1.2 ESBL đặc điểm sinh ESBL Escherichia coli 1.3 Kháng sinh đề kháng kháng sinh Escherichia coli 10 1.4 Phương pháp phát ESBL 14 1.5 Tình hình sinh enzyme ESBL Escherichia coli giới Việt Nam 16 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 19 2.1 Đối tượng 19 2.2 Phương pháp nghiên cứu 19 2.3 Đạo đức nghiên cứu 31 Chương 3: KẾT QUẢ 32 3.1 Đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 32 3.2 Tỷ lệ sinh enzyme ESBL Escherichia coli 35 3.3 Đánh giá mức độ đề kháng kháng sinh vi khuẩn Escherichia coli 39 3.4 Xác định giá trị phương pháp đĩa kết hợp máy tự động Phoenix M50 thử nghiệm ESBL 44 Chương 4: BÀN LUẬN 47 4.1 Đặc điểm chung đối tượng Escherichia coli 47 4.2.Tỷ lệ sinh enzyme ESBL Escherichia coli 50 4.3.Đánh giá mức độ đề kháng kháng sinh vi khuẩn Escherichia coli 54 4.4 Xác định giá trị phương pháp đĩa kết hợp máy tự động Phoenix M50 thử nghiệm ESBL 60 KẾT LUẬN 63 KIẾN NGHỊ 65 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT Viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt DNA Acid deoxyribo nucleic Phân tử mang thông tin di truyền AMP Ampicillin Kháng sinh Ampicillin ATCC American type culture collection Chủng vi khuẩn quốc tế AST Antibiotic susceptibility Kháng sinh API Analytical profile index Hệ thống định danh sinh hóa BA Blood agar Môi trường BA CA Chocolate agar Môi trường CA CAZ Ceftazidime Kháng sinh CAZ CAZ-C Ceftazidime/acid clavulanic Kháng sinh CAZ-C CFU Clon forming unit Đơn vị hình thành khuẩn lạc CHL Chloramphenicol Kháng sinh CHL CIP Ciprofloxacin Kháng sinh CIP CLA Acid clavulanic Kháng sinh CLA CLSI Clinical, Laboratories Standards Institute Tiểu chuẩn lâm sàng,xét nghiệm CTX Cefotaxim Kháng sinh CTX CTX-C Cefotaxim/acid clavulanic Kháng sinh CTX-C CXM Cefuroxim Kháng sinh CXM E coli Escherichia coli EAEC Enteroaggregative E Coli Gây bệnh đường ruột EHEC Enterohemorrhagic E Coli Gây độc tố ruột EIEC Enteroinvasive E Coli Xâm nhập đường ruột EPEC Enteropathogenic E Coli Gây chảy máu ruột ETEC Enterotoxigenic E Coli Bám dính đường ruột ESBL Extended - spectrum beta-lactamase Enzyme beta-lactamse phổ rộng FOF Fosfomycin Kháng sinh FOF FOX Cefoxitin Kháng sinh FOX ID Identification Định danh GEN Gentamycin Kháng sinh GEN ICU Intersive care unit Hồi sức tích cực H2S Hydro sulfua Khí Hydro sulfua KAN Kanamycin Kháng sinh KAN LIM Lysine - indole – motility Môi trường LIM MC Mac - Conkey agar Môi trường MC MEM Meropenem Kháng sinh MEM MIC Minimum Inhibitor Concentrate Nồng độ ức chế tối thiểu MH Muller Hilton Môi trường MH SMART Study for Monitoring Antimicrobial Nghiên cứu theo dõi xu hướng Resistance Trends program đề kháng kháng sinh STR Streptomycin Kháng sinh STR SXT Trimethoprim/sulfamethoxazole Kháng sinh SXT STEC Shiga toxin - producing Escherichia coli Độc tố Shiga TET Tetracyclin Kháng sinh TET TE Tris-EDTA Kháng sinh TE TSA Trypticase soy agar Môi trường TSA TSI Triple sugar/iron agar Môi trường TSI WHO World Health Organization Tổ chức Y tế Thế giới DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 2.1: Danh sách nhóm kháng sinh thử nghiệm kháng sinh đồ Escherichia coli 21 Bảng 2.2: Giá trị Kappa ý nghĩa 23 Bảng 2.3: Tiêu chuẩn chẩn đoán Escherichia coli 26 Bảng 3.1: Đặc điểm nghề nghiệp bệnh nhân nhiễm Escherichia coli 35 Bảng 3.2: Tỷ lệ sinh ESBL Escherichia coli phương pháp đĩa kết hợp máy tự động Phoenix M50 .35 Bảng 3.3: Sự phân bố vi khuẩn Escherichia coli sinh ESBL theo giớ tính bệnh nhân 36 Bảng 3.4: Sự phân bố vi khuẩn Escherichia coli sinh ESBL theo nhóm tuổi bệnh nhân 36 Bảng 3.5: Sự phân bố vi khuẩn Eshcherichia coli sinh ESBL với loại bệnh phẩm 37 Bảng 3.6: Sự phân bố vi khuẩn Escherichia coli sinh ESBL nghề nghiệp 37 Bảng 3.7: Sự phân bố vi khuẩn Escherichia coli sinh ESBL khoa phòng 38 Bảng 3.8: Tỷ lệ kháng kháng sinh nhóm Escherichia coli sinh ESBL không sinh ESBL 41 Bảng 3.9: Mức độ đề kháng ceftazidime theo khả sinh enzyme ESBL 43 Bảng 3.10: Mức độ đề kháng ceftriaxone theo khả sinh enzyme ESBL 43 Bảng 3.11: Mức độ đề kháng cefazolin theo khả sinh enzyme ESBL 44 Bảng 3.12: Đối chiếu kết thử nghiệm ESBL phương pháp đĩa kết hợp phương pháp xác định MIC 44 Bảng 3.13: Đối chiếu kết thử nghiệm ESBL máy tự động Phoenix M50 phương pháp xác định MIC 45 Bảng 3.14: Đánh giá mức độ tương thích phương pháp đĩa kết hợp máy tự động Phoenix M50 thử nghiệm ESBL 45 Bảng 3.15: Độ nhạy độ đặc hiệu phương pháp đĩa kết hợp máy tự động phoenix M50 45 Bảng 4.1: So sánh loại bệnh phẩm bệnh nhân nhiễm Escherichia coli với nghiên cứu khác 49 Bảng 4.2: So sánh tỷ lệ sinh enzyme ESBL với tác giả nghiên cứu có kết tương đồng 51 Bảng 4.3: So sánh tỷ lệ sinh enzyme ESBL với nghiên cứu có kết khơng tương đồng 52 Bảng 4.4: So sánh tỷ lệ Escherichia coli đề kháng kháng sinh 55 Bảng 4.5: So sánh tỷ lệ đề kháng kháng sinh Escherichia coli sinh ESBL 58 Bảng 4.6: So sánh tỷ lệ đề kháng kháng sinh Eshcerichia coli không sinh ESBL .59 CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc Lập – Tự – Hạnh Phúc BẢN GIẢI TRÌNH VỀ VIỆC BỔ SUNG, SỬA CHỮA LUẬN VĂN THEO Ý KIẾN CỦA HỘI ĐỒNG ĐÁNH GIÁ LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP Kính gửi: Ban Giám Hiệu Trường Đại học Y Dược Cần Thơ Họ tên học viên: Võ Thái Dương Tên đề tài luận văn: “Nghiên cứu tình hình đề kháng kháng sinh sinh enzyme ESBL Escherichia coli Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ năm 2021-2022” Chuyên ngành: Kỹ Thuật Xét Nghiệm Y học Mã số: 8720601 Người hướng dẫn: TS.BS Đỗ Hồng Long Sau trình luận văn, học viên sửa chữa bổ sung luận văn theo ý kiến Hội đồng đánh giá luận văn tốt nghiệp năm 2022 cụ thể điểm sau đây: Đã sử lỗi trình bày nội dung số đề mục Đã sửa lỗi tả, cơng thức tính cở mẫu Đổi mục tiêu thành mục tiêu mục tiêu thành mục tiêu Bổ sung chế đề kháng kháng sinh Tôi xin chân thành cảm ơn ý kiến đóng góp quý báu Hội đồng để luận văn hoàn chỉnh Cần Thơ, ngày 10 tháng 11 năm 2022 Người hướng dẫn TS.BS Đỗ Hoàng Long Học viên Võ Thái Dương CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM Độc lập – Tự – Hạnh phúc Cần Thơ, ngày 10 tháng 11 năm 2022 PHIẾU THỎA THUẬN V/v đồng ý cho Thư viện sử dụng khai thác nội dung tài liệu Tôi tên: Võ Thái Dương Là tác giả tài liệu: “Nghiên cứu tình hình đề kháng kháng sinh sinh enzyme ESBL Escherichia coli Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ năm 2021-2022” Tơi hồn tồn đồng ý cho phép Thư viện toàn quyền sử dụng khai thác nội dung tài liệu nhằm mục đích phục vụ cơng tác đào tạo, nghiên cứu khoa học phục vụ cộng đồng Trường Đại học Y Dược Cần Thơ Tôi khiếu nại liên quan đến quyền sử dụng tài liệu Nếu sai tơi hồn tồn chịu trách nhiệm trước pháp luật./ Tác giả (Ký ghi rõ họ tên) Võ Thái Dương ... VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ VÕ THÁI DƯƠNG NGHIÊN CỨU TÌNH HÌNH ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH VÀ SINH ENZYME ESBL CỦA ESCHERICHIA COLI TẠI BỆNH VIỆN ĐA KHOA TRUNG ƯƠNG CẦN THƠ NĂM 2021. .. chọn kháng sinh phù hợp để điều trị cho bệnh nhân Đó lý thúc đẩy tiến hành nghiên cứu đề tài: ? ?Nghiên cứu tình hình đề kháng kháng sinh sinh enzyme ESBL Escherichia coli Bệnh viện Đa khoa Trung ương. .. ương Cần Thơ năm 2021- 2022? ?? với mục tiêu sau: Xác định tỷ lệ sinh enzyme ESBL Escherichia coli yếu tố liên quan Bệnh viện Đa khoa Trung ương Cần Thơ năm 2021- 2022 Đánh giá mức độ đề kháng kháng sinh