Xây dựng phương án tách dòng gen gmexp1 chịu hạn từ cây đậu tương

BÁO CÁO THÍ NGHIỆM TIN SINH HỌC GVHD: GS TS NGUYỄN VĂN CÁCH XÂY DỰNG PHƯƠNG ÁN TÁCH DÒNG GEN GmEXP1 CHỊU HẠN TỪ CÂY ĐẬU TƯƠNG TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 XÁC ĐỊNH GEN ĐÍCH XÂY DỰNG PHƯƠNG ÁN TÁCH DÒNG GEN VÀ BIỂU HIỆN TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 * Expansin có vai trị quan trọng pha giãn thành tế bào miền sinh trưởng hệ rễ đậu tương * Hai vùng chức (DPBB Pollen allerg) xác định cho protein expansin có khả tác động phá vỡ liên kết phi hoá trị polysaccharide với vi sợi cellulose giúp thành tế bào dễ dàng giãn nở (cả chiều ngang chiều dọc) tác động sức trương nước * Hoạt động gen GmEXP1 (xác định protein expansin) liên quan đến kéo dài rễ đậu tương, làm tăng cường khả chịu hạn đậu tương TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 * Sản phẩm phiên mã gen GmEXP1 có nhiều tế bào biểu bì lớp tế bào miền sinh trưởng rễ cọc rễ bên, vùng trưởng thành Qua thấy vai trị quan trọng expansin việc phát triển kéo dài hệ rễ đậu tương * Expansin chia thành ba phân họ α, β γexpansin dựa mối quan hệ nguồn gốc chúng * Gen expansin (EXP1) từ mARN đậu tương với kích thước 1089bp CÁC BƯỚC TÁCH DỊNG GEN Xác định gen đích tách RNA tổng số Lựa chọn vecto tách dòng Biến nạp vào TB chủ Tạo vecto tách dòng tái tổ hợp Lựa chọn chủng tái tổ hợp TẠO GEN ĐÍCH * Truy cập vào trang NCBI để xác định đoạn gen cần tách: từ đậu tương * Truy cập trang Clustal Omega so sánh tương đồng gen GmEXP1 để tìm vùng bảo thủ * Tạo mồi ảo * Chạy PCR test * Chạy Blast tìm tính trạng tương đồng Truy cập trang web NCBI/ Nucleotide/  Nhập từ khóa​ GmEXP1 Link NCBI:  https://www.ncbi.nl m.nih.gov/ ​ •Truy cập NCBI, đánh tìm kiếm mục Nucleotide tìm GmEXP1 =>Hiện hàng loạt kết   Tìm vùng bảo thủ Tìm bài báo liên quan  (ít nhất là 3 bài) ​ Copy đoạn gen bằng n gơn ngữ FASTA vào ch ương  trình Clustal Omega​ Link:  https://www.ebi.ac.uk/ Tools/msa/clustalo/ ​ ...XÂY DỰNG PHƯƠNG ÁN TÁCH DÒNG GEN GmEXP1 CHỊU HẠN TỪ CÂY ĐẬU TƯƠNG TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 XÁC ĐỊNH GEN ĐÍCH XÂY DỰNG PHƯƠNG ÁN TÁCH DỊNG GEN VÀ BIỂU HIỆN TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 * Expansin... nước * Hoạt động gen GmEXP1 (xác định protein expansin) liên quan đến kéo dài rễ đậu tương, làm tăng cường khả chịu hạn đậu tương TỔNG QUAN VỀ GmEXP1 * Sản phẩm phiên mã gen GmEXP1 có nhiều tế... rễ đậu tương * Expansin chia thành ba phân họ α, β γexpansin dựa mối quan hệ nguồn gốc chúng * Gen expansin (EXP1) từ mARN đậu tương với kích thước 1089bp CÁC BƯỚC TÁCH DỊNG GEN Xác định gen