Luận án nghiên cứu đánh giá sự đa dạng và vai trò của một số module trong cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong dạ cỏ của dee

1 MỞ ĐẦU Vi sinh vật nói chung vi khuẩn nói riêng có ý nghĩa thực tiễn vơ to lớn lồi người thơng qua ứng dụng nhiều lĩnh vực y học, nông nghiệp, công nghiệp, xử lý ô nhiễm môi trường Do đó, nghiên cứu đa dạng trình tự từ vi sinh vật nhằm phát gen để khai thác ứng dụng chúng vào phục vụ sống chủ đề quan trọng nhà sinh học đặc biệt quan tâm Mặc dù vậy, phát gần cho thấy phần lớn (khoảng 99%) lồi vi sinh vật mơi trường chưa nuôi cấy Do vậy, nghiên cứu dựa vào phương pháp nuôi cấy thông thường khai thác tồn nguồn gen có tiềm vi sinh vật Trong giai đoạn gần đây, thông qua kỹ thuật Metagenomics giải trình tự tồn hệ gen tất vi sinh vật thu nhận trực tiếp từ mẫu môi trường, gen từ vi sinh vật, kể vi sinh vật không nuôi cấy nghiên cứu, đánh giá cách tổng thể Tại nước ta, với phát triển ngành nông nghiệp với qui mô sản xuất ngày lớn tập trung nay, phụ phẩm nơng nghiệp mà nguồn sinh khối lignocellulose chiếm phần lớn chủ yếu bị đốt bỏ gây lãng phí ảnh hưởng xấu đến mơi trường Trong đó, nhân loại phải đối mặt với tình trạng suy kiệt nguồn nguyên liệu hóa thạch hệ nghiêm trọng việc tích tụ khí thải nhà kính Việc nghiên cứu sử dụng nguồn lượng carbonhydrate từ nguyên liệu có khả tái tạo với trữ lượng khổng lồ lignocellulose cấp thiết để tạo sản phẩm thay nhiên liệu sản xuất từ nguyên liệu hóa thạch Lignocellulose nói chung hay cellulose nói riêng sinh khối có cấu trúc vững chắc, chuyển hóa theo nhiều bước để tạo thành sản phẩm cuối mà giai đoạn đường hóa đóng vai trị then chốt Trong trình này, cellulase xác định nhân tố định tới hiệu suất chuyển hóa giá thành sản phẩm Do vậy, năm gần giới có nhiều cơng trình nghiên cứu tìm kiếm nguồn cellulase có hoạt tính cao, có lực mạnh với chất để chuyển hóa hiệu cellulose Khác với enzyme khác, phần lớn cellulase có cấu trúc module, có nghĩa ngồi vùng có chức xúc tác, enzyme cịn chứa thêm số module khác có cấu trúc độc lập nghiên cứu, điển module FN3, Ig, CBM Hiện giới, nghiên cứu vai trò module chưa biết chức đến hoạt tính xúc tác cellulase chưa cơng bố nhiều Nhiều giả thiết cho rằng, chúng không tồn vùng nối liên kết vùng hoạt tính mà chúng thể nhiều chức sinh học quan trọng khác ổn định cấu trúc, làm tăng lực enzyme với chất Vì vậy, nghiên cứu làm rõ vai trò sinh học module cấu trúc cellulase có ý nghĩa cho việc lựa chọn thiết kế enzyme để nâng cao hiệu thủy phân nguồn sinh khối cellulose Từ năm 2014 đến năm 2017, nguồn kinh phí Đề tài độc lập cấp Nhà nước (Mã số: ĐTĐLCN.15/14), phòng Kỹ thuật di truyền (Viện CNSH, Viện HLKH&CNVN) giải mã DNA đa hệ gen hệ vi khuẩn cỏ dê chăn thả tự nhiên núi tỉnh Ninh Bình Thanh Hóa Kết quả, từ 8,6 Gb liệu trình tự, đề tài khai thác 816 trình tự mã hóa cho cellulase Trong nghiên cứu này, hướng tới việc đánh giá đa dạng trình tự cellulase có cấu trúc module, tìm cấu trúc module đặc thù cho nghiên cứu vai trò module đến hoạt tính enzyme Do đó, chúng tơi thực Luận án: “Nghiên cứu đánh giá đa dạng vai trò số module cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong cỏ dê” ● Mục tiêu nghiên cứu: - Nghiên cứu đánh giá đa dạng cellulase cellulase có cấu trúc module từ khu hệ vi khuẩn cỏ dê kỹ thuật Metagenomics; - Nghiên cứu vai trò module chưa rõ chức (FN3 Ig) lên hoạt tính cellulase ● Nội dung nghiên cứu: Để đạt mục tiêu đề tài, chúng tơi thực nội dung nghiên cứu sau: Phân tích, đánh giá đa dạng họ GH, nguồn gốc cellulase cellulase có cấu trúc module mã hóa từ khung đọc mở liệu giải trình tự DNA đa hệ gen vi sinh vật cỏ dê Việt Nam Phân tích lựa chọn trình tự có cấu trúc module điển hình cho nghiên cứu biểu hiện, xác định vai trò vùng chưa biết chức Nghiên cứu biểu hiện, tinh chế enzyme từ trình tự lựa chọn (SXFn3Egc) gen chứa module (Fn3, XFn3, Egc, Fn3Egc) dạng dung hợp với SUMO Nghiên cứu vai trò module chưa biết chức đến khả phân giải cellulose enzyme Nghiên cứu, đánh giá số tính chất enzyme tái tổ hợp biểu từ trình tự lựa chọn có cấu trúc module ● Những đóng góp Luận án: Từ 816 ORF mã hóa cellulase vi khuẩn cỏ dê Việt Nam, 243 ORF mã hóa cellulase xác định có cấu trúc chứa module chưa rõ chức FN3 Ig Trong số cellulase hoàn thiện chứa module FN3, 99,2% FN3 kèm với module xúc tác betaglucosidase GH3 có FN3 kèm với module xúc tác endoglucanase GH5 Toàn module Ig kèm với module xúc tác endoglucanase GH9 Cấu trúc mã hóa endoglucanase GH5 chứa module FN3 cấu trúc phát nghiên cứu Đã tổng hợp biểu trình tự mã hóa endoglucanase GH5 (XFn3Egc) cấu trúc chứa module khác (Fn3, XFn3, Fn3Egc, Egc) E coli để nghiên cứu vai trò FN3 cấu trúc enzyme Module FN3 xác định có khả làm tăng tính tan ổn định cấu trúc vùng xúc tác, nới lỏng cấu trúc tinh thể bề mặt giấy lọc, giúp enzyme tiếp cận chất tốt Module FN3 làm tăng lực enzyme lên chất tan CMC SXFn3Egc hoạt động tối ưu 40oC, pH Enzyme ổn định bền nhiệt độ 60oC 90 phút Km đạt 1,26 mg/ml Vmax đạt 148,12 µmol/min/ml Hoạt tính enzyme tăng lần sử dụng 40 mM Mn2+ giảm bổ sung ion kim loại (Ca2+, Mg2+, Ni2+, K+, Co2+, Cu2+, Zn2+, Fe3+), loại hóa chất (SDS, urea, 2-mercaptoethanol, EDTA, tween 80, triton X-100) ● Ý nghĩa khoa học thực tiễn Luận án: * Ý nghĩa khoa học: Luận án khai thác nghiên cứu cấu trúc endoglucanase GH5 chứa module FN3 cấu trúc mới, nghiên cứu cơng bố giới Module FN3 cấu trúc chứng minh có khả ổn định cấu trúc vùng xúc tác, nới lỏng cấu trúc tinh thể bề mặt giấy lọc, giúp enzyme tiếp cận chất tốt Module FN3 làm tăng lực enzyme với chất tan CMC * Ý nghĩa thực tiễn: Xác định vai trò module FN3 cấu trúc endoglucanase GH5 sở để thiết kế enzyme chứa module bổ sung enzyme cocktail phù hợp có khả phân giải cellulose hiệu quả, ứng dụng sản xuất nhiên liệu sinh học hệ xử lý ô nhiễm môi trường CHƢƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan cellulose 1.1.1 Thành phần cấu trúc cellulose Cellulose với hemicellulose lignin thành phần cấu thành nên sinh khối lignocellulose (Hình 1.1) Đây thành phần cấu tạo chủ yếu thành tế bào thực vật thân gỗ thực vật khác cỏ, lúa, ngô… Các thành phần lignocellulose lồi thực vật khác thường có tỷ lệ khác cellulose thường chiếm tỷ lệ cao (38-50%) so với hemicellulose (2332%) lignin (15-25%) [1], [2] Đặc biệt, cellulose chiếm tỷ lệ cao số nguyên liệu giấy thải từ bột giấy hoá học (60-70%), giấy (85-99%), sợi cotton (95-97%) [3] Ở thực vật, cellulose tạo thành nhờ trình quang hợp thường phân bố so với thân [4] Cellulose thành phần có vai trị quan trọng để giữ cho cấu trúc thành tế bào thực vật ổn định [5] Bên cạnh đó, cellulose tổng hợp số vi khuẩn động vật ngun sinh có vai trị chủ yếu để tạo màng bảo vệ tế bào Cellulose từ vi khuẩn xác định có cấu trúc siêu mịn, độ tinh khiết khả phân hủy sinh học cao so với cellulose từ nguồn thực vật [6] Cellulose Thành tế bào thực vật VI SỢI Thực vật Liên kết hydro Tế bào thực vật Hình 1.1 Thành tế bào thực vật với thành phần lignocellulose bao gồm cellulose, hemicellulose lignin liên kết chặt chẽ với [7] Cellulose hemicellulose đại phân tử mạch thẳng cấu tạo từ gốc đường khác nhau, lignin polymer dạng vòng tổng hợp từ tiền phenylpropanoid Các thành phần liên kết với chủ yếu liên kết hydro để tạo cấu trúc khối vững lignocellulose [8] Cellulose có công thức cấu tạo (C6H10O5)n hay viết dạng [C6H7O2(OH)3]n (do mắt xích cellulose có chứa nhóm –OH) Khối lượng phân tử cellulose lớn (khoảng 1.000.000 – 2.400.000 đvC), tùy thuộc vào giá trị n Giá trị n thể số lượng đơn phân phụ thuộc vào loại nguyên liệu cellulose Thông thường, chuỗi cellulose thành tế bào thực vật nói chung có khoảng 5.000-7.000 đơn phân Ví dụ, gỗ có khoảng 10.000 đơn phân bơng có khoảng 15.000 đơn phân Do đó, khối lượng phân tử trung bình cellulose bơng lên tới khoảng 2.400.000 đvC [9] Các đơn phân β-D-glucose liên kết với liên kết β-1,4-glucoside tạo thành chuỗi thẳng Nhóm hydroxyl chuỗi tạo liên kết hydro với phân tử oxy chuỗi bên cạnh (liên kết hydro liên phân tử) chuỗi (liên kết hydro nội phân tử) hình thành cấu trúc tinh thể chắn, khó bị phân hủy [10], [11], [12] (Hình 1.2) Hình 1.2 Cấu trúc hóa học liên kết phân tử cellulose [12] Từ năm 1913, Nishikawa Ono phát cấu trúc xếp sợi cellulose dựa phương pháp nhiễu xạ tia X [13] Phát cho thấy cellulose riêng lẻ có xu hướng tự xếp theo cách có tổ chức cao dẫn đến trạng thái kết tinh Dựa phát này, nhà khoa học xây dựng mơ hình Fringed fibrillar Trong mơ hình này, sợi cellulose liên kết với tạo thành vùng có cấu trúc khác vùng kết tinh vùng vơ định hình (Hình 1.3) Tại vùng kết tinh, cellulose bền tác động điều kiện ngoại cảnh, không bị công enzyme hóa chất Các mạch cellulose liên kết với nhờ lực Van der Waals liên kết hydro (do nhóm hydroxyl thứ mạch nối với với nhóm hydroxyl mạch khác) Trong vùng vơ định hình, mạch cellulose liên kết với nhờ lực Van der Waals có lực liên kết khơng mạnh nên dễ bị tác động yếu tố bên [14] Ngồi ra, vùng vơ định hình dễ bị công tác nhân thủy phân vùng kết tinh vùng không tạo liên kết hydro thay đổi góc liên kết cộng hóa trị (β-glycoside) làm giảm độ bền nhiệt động liên kết [14] Vùng kết tinh Không gian sợi cellulose Vùng vơ định hình Hình 1.3 Sự liên kết sợi cellulose tạo thành vùng vơ định hình vùng kết tinh [13] Tính chất hóa học khả phản ứng cellulose xác định có mặt ba nhóm hydroxyl (OH) đơn phân glucose (gồm nhóm hai nhóm thứ cấp) Các nhóm hydroxyl đóng vai trò quan trọng cho hòa tan cellulose [13] Cellulose khơng hịa tan nước dung mơi hữu nhóm -OH tạo liên kết hydro nội phân tử phân tử cellulose kề làm cho cấu trúc cellulose bền vững Để phá hủy cellulose, liên kết hydro cần phá vỡ [15] Khi thủy phân cellulose H2SO4 đặc, cellulose chuyển thành glucose; thủy phân cellulose với axit loãng, cellulose tạo thành cellobiose disaccharide bao gồm hai phân tử β-glucose liên kết với liên kết β-1,4-glucoside [16] Nhờ có liên kết hydro lực Van der Waals, chuỗi cellulose liên kết với tạo thành bó vi sợi có cấu trúc vững [17] Người hầu hết lồi động vật khơng tiêu hóa cellulose nhiều lồi động vật ăn cỏ động vật nhai lại (trâu, bị, dê…) có khả tạo cellulase để tiêu hóa nguồn thức ăn Cellulase sản xuất số động vật loài mối (động vật nguyên sinh) nấm đất Do đó, lồi sử dụng cellulose nguồn cung cấp lượng Cellulose xác định có vai trị điều hịa tiêu hóa thức ăn hệ tiêu hóa đa số lồi động vật [10] 1.1.2 Vai trò sinh khối cellulose kinh tế sinh học Cellulose xem nguồn nguyên liệu vô tận cho nhiều ứng dụng công nghiệp thực phẩm, y tế sản xuất nhiên liệu, vật liệu [18] Từ kỷ thứ 19, công nghệ sinh học ứng dụng để sản xuất nhiên liệu sinh học Sau đó, nhiên liệu sinh học dần bị thay nguồn nhiên liệu sẵn có dầu thô, than đá để phục vụ cho nhiều ngành công nghiệp đại [19] Tuy nhiên, nguyên liệu hóa thạch nguồn khơng tái tạo, gây phát sinh khí thải nhà kính, làm biến đổi khí hậu [20], [21] Do đó, cơng nghiệp dựa vào nhiên liệu từ nguồn sinh khối phổ biến cellulose hay lignocellulose xu hướng phát triển bền vững mặt kinh tế môi trường [22] Sinh khối lignocellulose tạo thơng qua q trình quang hợp coi nguồn carbon hữu bền vững trái đất dùng cho sản xuất nhiên liệu sinh học hóa chất tinh khiết [23], [24] Nguồn sinh khối tự nhiên có trữ lượng lớn, có mặt hầu hết phế phụ phẩm nông, lâm, công nghiệp (rơm rạ, bã mía, mùn gỗ, vỏ trấu ), có ưu điểm giảm lượng khí thải CO2, có khả tái tạo phân hủy sinh học cao [25], [26] Trong đó, sinh khối cellulose nguồn nguyên liệu phong phú, chiếm tỷ lệ lớn nguồn nguyên liệu giàu lignocellulose tự nhiên [27], [28], [29] Khoảng nửa số carbon hữu sinh diện dạng cellulose, việc nghiên cứu chuyển đổi cellulose thành nhiên liệu hay hóa chất có giá trị trở nên quan trọng [27], [28], [23] Ở nhiều nước giới có Việt Nam, phần phế phụ phẩm nông nghiệp dùng để sản xuất phân bón, giá thể trồng nấm, trồng rau sạch, dùng cho đun nấu ép bánh than hay dùng chăn ni, cịn lại phần lớn nguồn sinh khối từ đồng ruộng bị vứt bỏ đốt gây lãng phí nhiễm mơi trường Theo Hiệp hội Mía đường Việt Nam (VSSA), năm nhà máy sản xuất đường ép 15 triệu mía phát sinh 4,5 triệu bã mía (cellulose chiếm khoảng 40-55% bã mía sấy khơ) Trong đó, bã mía phần lớn mang đốt Theo ước tính đốt bã mía khơ thải 36,32 kg khí CO, 4,54 kg hydrocarbon 3,18 kg bụi tro Các khí thải ngun nhân gây hiệu ứng nhà kính nhiễm môi trường [30], [31] Như vậy, nhiên liệu sinh học sản xuất từ nguồn nguyên liệu nước sinh khối cellulose giúp tăng cường an ninh lượng, mang lại lợi ích mơi trường giúp phát triển kinh tế nhiều lĩnh vực, đặc biệt nơng nghiệp Sinh khối cellulose xác định sử dụng để sản xuất nhanh chóng nhiên liệu sinh học với chi phí thấp so với nguồn sinh khối khác nông nghiệp tinh bột ngơ, đậu nành, đường mía, rẻ đáng kể so với dầu thô [32] Nguồn nhiên liệu từ sinh khối cellulose xác định có khả làm giảm lượng khí thải nhà kính cao tới 60% Hiện nay, sinh khối cellulose nghiên cứu chuyển hóa thành nhiều sản phẩm có giá trị nhiên liệu sinh học dạng lỏng (ethanol, butanol), dạng khí (hydro) hóa chất tinh khiết, [33], [34], [35], [36] Sản xuất nhiên liệu sinh học dạng lỏng giới dự báo từ tới năm 2030 tăng từ 1,9 triệu thùng lên 5,9 triệu thùng ngày [37] Mỹ dự kiến sản xuất nhiên liệu sinh học với lượng khoảng 136 tỷ lít vào năm 2022 ưu tiên tăng dần nhiên liệu có nguồn gốc từ sinh khối cellulose (61 triệu lít) so với nhiên liệu sản xuất từ nguyên liệu thông thường từ nguồn tinh bột nguồn sinh khối khác [38], [39] (Hình 1.4) Phịng Năng lượng (Department of Energy (DOE)) Phịng Nơng nghiệp (Department of Agriculture (USDA)) Mỹ giao kế hoạch đưa vào sử dụng 5% lượng nhiệt, điện, 20% nhiên liệu lỏng cho giao thơng 25% ngun liệu, hóa chất có nguồn gốc từ sinh khối vào năm 2022 [40] 10 Hình 1.4 Lượng nhiên liệu yêu cầu sản xuất từ nguồn sinh khối cellulose tăng dần giai đoạn từ năm 2008 đến năm 2022 Mỹ [39] Mặc dù sinh khối cellulose từ thực vật nguồn tài nguyên sinh học tự nhiên dồi cấu trúc thành tế bào thực vật với thành phần lignocellulose hoạt động hàng rào bảo vệ tự nhiên, khó phân hủy nên thách thức quan trọng cách chuyển đổi nguồn nguyên liệu thành sản phẩm có giá trị [41] Để sử dụng cách hiệu nguồn sinh khối chứa cellulose, nhiều enzyme nghiên cứu để thủy phân cellulose thay cho việc sử dụng hóa chất axit mạnh Phương pháp thủy phân nguồn sinh khối cellulose enzyme có lợi chi phí thiết bị thấp hơn, khơng gây nhiễm môi trường, suất tạo glucose cao mà không làm giảm sản phẩm đường sản phẩm phụ [42] Nhiều loại enzyme phân giải cellulose xác định có nguồn gốc đa dạng, với nhiều dạng cấu trúc chế phân cắt khác [43] 1.2 Cellulase 1.2.1 Khái quát chung celllulase Cellulase (EC 3.2.1.4) ba nhóm enzyme bên cạnh hemicellulase ligninase tham gia thủy phân sinh khối lignocellulose Trong nhóm enzyme này, cellulase nhóm enzyme quan trọng chúng có khả cắt mối liên kết -1,4-glycoside phân tử cellulose tạo thành sản phẩm cello-oligosaccharide, cellobiose glucose-đường chứa nhiều lượng sử dụng hiệu cho việc lên men chuyển hóa thành sản phẩm có giá trị XVI [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_36154 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_16694 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_33156 [denovogenes]_18633 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 5.08 5.96 6.65 5.82 5.99 6.11 5.48 5.47 5.15 4.65 5.38 4.95 5.09 4.93 5.76 5.83 6.88 6.29 6.02 5.68 5.19 4.70 6.81 7.51 6.22 4.96 6.68 6.52 6.84 6.14 4.87 6.79 5.62 6.09 5.11 5.05 5.91 5.21 5.10 5.99 6.62 4.74 8.31 8.59 5.50 4.95 5.55 74260.67 77468.90 83185.48 83175.09 79404.83 95687.08 85825.64 82751.15 99208.60 30910.80 41923.36 81775.52 82906.14 43024.62 55923.04 87884.68 71817.60 65198.99 92626.36 42614.10 57168.54 40555.67 81393.53 64333.35 46768.00 45187.88 83093.07 55506.80 58873.02 48798.14 35391.76 52881.83 45324.15 77677.68 38733.67 49594.11 83200.29 38196.04 83041.37 48294.92 43163.08 41200.38 53358.43 22516.29 52462.14 18303.59 37908.77 XVII [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 5.10 5.90 9.34 5.10 5.79 9.67 5.02 8.98 5.84 4.81 9.42 5.19 5.10 4.91 5.26 6.40 5.28 5.16 5.39 5.71 5.80 5.73 5.02 4.95 5.79 5.14 5.73 6.13 5.65 5.04 4.99 6.36 9.17 5.97 5.58 5.54 5.97 5.43 5.73 5.68 6.17 5.63 5.58 5.70 7.70 5.69 5.55 18217.50 61106.18 16260.30 16166.20 26000.47 16932.32 23986.75 19219.74 31087.10 51647.25 20713.55 43404.22 74802.97 27822.63 50542.55 34067.60 33284.54 51372.10 62955.36 76793.10 87632.57 87534.45 37669.66 58171.74 46660.75 46565.61 74444.20 27788.41 20854.34 78058.42 46837.81 63146.50 29552.86 59577.76 99306.65 100498.79 93680.17 65931.32 93383.40 97226.04 96391.47 94380.16 92255.69 77067.01 50438.41 100477.95 94821.62 XVIII [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 5.96 5.68 4.70 5.88 5.22 5.70 5.60 5.73 6.24 5.43 5.63 5.57 4.52 5.11 92519.98 79595.83 32772.99 62302.27 61268.43 47681.95 42070.20 80667.80 41515.00 60996.41 52358.19 48976.06 32417.66 76807.38 XIX Phụ lục Ƣớc đoán khả chịu kiềm, axit 243 trình tự mã hóa cellulase có chứa module chƣa biết chức (FN3, Ig) Gene code KEGG Status GH [denovogenes]_3282 [denovogenes]_4109 [denovogenes]_2809 [denovogenes]_3406 [denovogenes]_3382 [denovogenes]_3206 [denovogenes]_3200 [denovogenes]_3366 [denovogenes]_3327 [denovogenes]_3396 [denovogenes]_4170 [denovogenes]_3311 [denovogenes]_11451 [denovogenes]_2709 [denovogenes]_4974 [denovogenes]_5153 [denovogenes]_4133 [denovogenes]_11003 [denovogenes]_4103 [denovogenes]_2859 [denovogenes]_4763 [denovogenes]_4148 [denovogenes]_2574 [denovogenes]_4081 [denovogenes]_4125 [denovogenes]_3894 [denovogenes]_4378 [denovogenes]_2596 [denovogenes]_4110 [denovogenes]_3486 [denovogenes]_2771 [denovogenes]_2942 [denovogenes]_3914 [denovogenes]_2827 [denovogenes]_4879 [denovogenes]_2731 [denovogenes]_4560 [denovogenes]_4712 [denovogenes]_4718 [denovogenes]_2805 [denovogenes]_5080 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 Acid 0.01 0.32 0.16 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 0.38 0.01 0.01 0.68 0.23 0.53 0.39 0.65 0.22 0.01 0.02 0.18 0.43 0.29 0.28 0.17 0.39 0.47 0.31 0.33 0.22 0.70 0.71 0.33 0.53 0.14 0.45 0.81 0.47 0.73 0.22 Alkaline 0.99 0.68 0.84 0.99 0.99 1.00 1.00 0.99 1.00 0.98 0.62 0.99 0.99 0.32 0.77 0.47 0.61 0.35 0.78 0.99 0.98 0.82 0.57 0.71 0.72 0.83 0.61 0.53 0.69 0.67 0.78 0.30 0.29 0.67 0.47 0.86 0.55 0.19 0.53 0.27 0.78 XX [denovogenes]_2801 [denovogenes]_5214 [denovogenes]_5084 [denovogenes]_2679 [denovogenes]_4441 [denovogenes]_2632 [denovogenes]_2703 [denovogenes]_2748 [denovogenes]_4837 [denovogenes]_2683 [denovogenes]_2747 [denovogenes]_2796 [denovogenes]_2623 [denovogenes]_4394 [denovogenes]_4008 [denovogenes]_2658 [denovogenes]_2821 [denovogenes]_2746 [denovogenes]_4396 [denovogenes]_4719 [denovogenes]_4616 [denovogenes]_2878 [denovogenes]_2672 [denovogenes]_9726 [denovogenes]_2761 [denovogenes]_4840 [denovogenes]_39321 [denovogenes]_4524 [denovogenes]_4363 [denovogenes]_5791 [denovogenes]_5628 [denovogenes]_2914 [denovogenes]_4764 [denovogenes]_4506 [denovogenes]_4221 [denovogenes]_4266 [denovogenes]_4252 [denovogenes]_4563 [denovogenes]_5096 [denovogenes]_4222 [denovogenes]_4509 [denovogenes]_4456 [denovogenes]_3916 [denovogenes]_4532 [denovogenes]_4273 [denovogenes]_4309 [denovogenes]_4178 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.73 0.20 0.06 0.44 0.24 0.77 0.40 0.07 0.31 0.95 0.10 0.57 0.67 0.06 0.31 0.93 0.31 0.27 0.02 0.06 0.04 0.19 0.65 0.86 0.31 0.02 0.01 0.00 0.06 0.90 0.33 0.19 0.52 0.16 0.21 0.60 0.10 0.46 0.72 0.09 0.16 0.16 0.08 0.07 0.13 0.08 0.27 0.27 0.80 0.94 0.56 0.76 0.23 0.60 0.93 0.69 0.05 0.90 0.43 0.33 0.94 0.69 0.07 0.69 0.73 0.98 0.94 0.96 0.81 0.35 0.14 0.69 0.98 0.99 1.00 0.94 0.10 0.67 0.81 0.48 0.84 0.79 0.40 0.90 0.54 0.28 0.91 0.84 0.84 0.92 0.93 0.87 0.92 0.73 XXI [denovogenes]_3960 [denovogenes]_3979 [denovogenes]_4240 [denovogenes]_21483 [denovogenes]_4317 [denovogenes]_5120 [denovogenes]_5067 [denovogenes]_4279 [denovogenes]_4750 [denovogenes]_3999 [denovogenes]_4040 [denovogenes]_3920 [denovogenes]_4005 [denovogenes]_2662 [denovogenes]_2535 [denovogenes]_2648 [denovogenes]_2656 [denovogenes]_2610 [denovogenes]_2671 [denovogenes]_13359 [denovogenes]_2639 [denovogenes]_17198 [denovogenes]_7571 [denovogenes]_2426 [denovogenes]_3628 [denovogenes]_5059 [denovogenes]_3678 [denovogenes]_4134 [denovogenes]_4402 [denovogenes]_3708 [denovogenes]_3591 [denovogenes]_3834 [denovogenes]_17221 [denovogenes]_4104 [denovogenes]_3450 [denovogenes]_3618 [denovogenes]_4257 [denovogenes]_68027 [denovogenes]_4224 [denovogenes]_4251 [denovogenes]_4269 [denovogenes]_4277 [denovogenes]_4353 [denovogenes]_4074 [denovogenes]_4151 [denovogenes]_3784 [denovogenes]_38487 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH5 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.05 0.05 0.10 0.06 0.29 0.02 0.07 0.32 0.03 0.57 0.11 0.06 0.17 0.85 0.94 0.94 0.83 0.95 0.80 0.92 0.77 0.78 0.44 0.93 0.22 0.21 0.23 0.19 0.03 0.02 0.04 0.15 0.63 0.02 0.01 0.23 0.76 0.67 0.13 0.07 0.06 0.03 0.08 0.01 0.40 0.33 1.00 0.95 0.95 0.90 0.94 0.71 0.98 0.93 0.68 0.97 0.43 0.89 0.94 0.83 0.15 0.06 0.06 0.17 0.05 0.20 0.08 0.23 0.22 0.56 0.07 0.78 0.79 0.77 0.81 0.97 0.98 0.96 0.85 0.37 0.98 0.99 0.77 0.24 0.33 0.87 0.93 0.94 0.97 0.92 0.99 0.60 0.67 0.00 XXII [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_36154 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_16694 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_33156 [denovogenes]_18633 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 0.00 0.32 0.21 0.19 0.21 0.84 0.00 0.43 0.30 0.70 0.00 0.08 0.01 0.05 0.74 0.14 0.92 0.13 0.22 0.32 0.70 0.59 0.69 0.80 0.93 0.93 0.62 0.19 0.05 0.41 0.06 0.38 0.43 0.33 0.01 0.00 0.13 0.85 0.09 0.20 0.62 0.96 0.01 0.88 0.72 0.92 0.62 1.00 0.68 0.79 0.81 0.79 0.16 1.00 0.57 0.70 0.30 1.00 0.92 0.99 0.95 0.26 0.87 0.08 0.87 0.78 0.68 0.30 0.41 0.31 0.20 0.07 0.07 0.38 0.81 0.95 0.59 0.94 0.62 0.57 0.67 0.99 1.00 0.87 0.15 0.91 0.80 0.38 0.04 1.00 0.12 0.28 0.08 0.38 XXIII [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 0.91 0.70 0.04 0.97 0.63 0.38 0.85 0.84 0.01 0.71 0.03 0.71 0.22 0.01 0.39 0.28 0.45 0.89 0.03 0.02 0.46 0.30 0.01 0.01 0.91 0.13 0.10 0.01 0.39 0.15 0.76 0.98 0.95 0.94 0.98 0.97 0.98 0.92 0.74 0.18 0.78 0.49 0.96 0.06 0.96 0.95 0.97 0.09 0.30 0.96 0.03 0.37 0.62 0.15 0.16 0.99 0.29 0.97 0.29 0.78 0.99 0.61 0.72 0.55 0.11 0.97 0.98 0.54 0.70 0.99 0.99 0.09 0.87 0.90 0.99 0.61 0.85 0.24 0.02 0.05 0.06 0.02 0.03 0.02 0.08 0.26 0.82 0.22 0.51 0.04 0.94 0.04 0.05 0.03 XXIV [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 0.98 0.84 0.94 0.59 0.65 0.93 0.98 0.71 0.91 0.95 0.94 0.69 1.00 0.84 0.02 0.16 0.06 0.41 0.35 0.07 0.02 0.29 0.09 0.05 0.06 0.31 0.00 0.16 XXV Phụ lục Ƣớc đốn khả bền nhiệt 243 trình tự mã hóa cellulase có chứa module chƣa biết chức (FN3, Ig) Gene code KEGG Status GH Tem [denovogenes]_16694 [denovogenes]_93986 [denovogenes]_130059 [denovogenes]_4109 [denovogenes]_2809 [denovogenes]_2709 [denovogenes]_4103 [denovogenes]_4763 [denovogenes]_4148 [denovogenes]_2574 [denovogenes]_4081 [denovogenes]_3894 [denovogenes]_4110 [denovogenes]_2771 [denovogenes]_3914 [denovogenes]_2827 [denovogenes]_2731 [denovogenes]_2805 [denovogenes]_2801 [denovogenes]_2679 [denovogenes]_2632 [denovogenes]_2703 [denovogenes]_2748 [denovogenes]_2747 [denovogenes]_2796 [denovogenes]_2658 [denovogenes]_2821 [denovogenes]_2746 [denovogenes]_4719 [denovogenes]_4616 [denovogenes]_2672 [denovogenes]_9726 [denovogenes]_5791 [denovogenes]_5628 [denovogenes]_2914 [denovogenes]_4221 [denovogenes]_4266 [denovogenes]_5096 [denovogenes]_4222 [denovogenes]_4509 [denovogenes]_4532 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_5' lack_5' lack_5' complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 XXVI [denovogenes]_4273 [denovogenes]_5120 [denovogenes]_4279 [denovogenes]_4040 [denovogenes]_3920 [denovogenes]_2662 [denovogenes]_2535 [denovogenes]_2648 [denovogenes]_2656 [denovogenes]_2610 [denovogenes]_2671 [denovogenes]_17198 [denovogenes]_3628 [denovogenes]_3678 [denovogenes]_4134 [denovogenes]_4402 [denovogenes]_3708 [denovogenes]_3591 [denovogenes]_3834 [denovogenes]_17221 [denovogenes]_4104 [denovogenes]_3450 [denovogenes]_3618 [denovogenes]_4257 [denovogenes]_4224 [denovogenes]_4251 [denovogenes]_4269 [denovogenes]_4277 [denovogenes]_4353 [denovogenes]_4151 [denovogenes]_3784 [denovogenes]_4807 [denovogenes]_5436 [denovogenes]_60023 [denovogenes]_32327 [denovogenes]_5048 [denovogenes]_4818 [denovogenes]_30752 [denovogenes]_3335 [denovogenes]_32360 [denovogenes]_14698 [denovogenes]_5349 [denovogenes]_27279 [denovogenes]_5940 [denovogenes]_41184 [denovogenes]_23432 [denovogenes]_33156 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 XXVII [denovogenes]_18633 [denovogenes]_18919 [denovogenes]_116021 [denovogenes]_42148 [denovogenes]_117482 [denovogenes]_12182 [denovogenes]_109796 [denovogenes]_20670 [denovogenes]_6951 [denovogenes]_20854 [denovogenes]_4239 [denovogenes]_4238 [denovogenes]_42606 [denovogenes]_24982 [denovogenes]_72186 [denovogenes]_100959 [denovogenes]_6075 [denovogenes]_26233 [denovogenes]_3282 [denovogenes]_3406 [denovogenes]_3382 [denovogenes]_3206 [denovogenes]_3200 [denovogenes]_3366 [denovogenes]_3327 [denovogenes]_3396 [denovogenes]_4170 [denovogenes]_3311 [denovogenes]_11451 [denovogenes]_4974 [denovogenes]_5153 [denovogenes]_4133 [denovogenes]_11003 [denovogenes]_2859 [denovogenes]_4125 [denovogenes]_4378 [denovogenes]_2596 [denovogenes]_3486 [denovogenes]_2942 [denovogenes]_4879 [denovogenes]_4560 [denovogenes]_4712 [denovogenes]_4718 [denovogenes]_5080 [denovogenes]_5214 [denovogenes]_5084 [denovogenes]_4441 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 >65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXVIII [denovogenes]_4837 [denovogenes]_2683 [denovogenes]_2623 [denovogenes]_4394 [denovogenes]_4008 [denovogenes]_4396 [denovogenes]_2878 [denovogenes]_2761 [denovogenes]_4840 [denovogenes]_39321 [denovogenes]_4524 [denovogenes]_4363 [denovogenes]_4764 [denovogenes]_4506 [denovogenes]_4252 [denovogenes]_4563 [denovogenes]_4456 [denovogenes]_3916 [denovogenes]_4309 [denovogenes]_4178 [denovogenes]_3960 [denovogenes]_3979 [denovogenes]_4240 [denovogenes]_21483 [denovogenes]_4317 [denovogenes]_5067 [denovogenes]_4750 [denovogenes]_3999 [denovogenes]_4005 [denovogenes]_2639 [denovogenes]_7571 [denovogenes]_2426 [denovogenes]_5059 [denovogenes]_68027 [denovogenes]_4074 [denovogenes]_38487 [denovogenes]_7073 [denovogenes]_6435 [denovogenes]_4580 [denovogenes]_2866 [denovogenes]_4293 [denovogenes]_4885 [denovogenes]_2534 [denovogenes]_15061 [denovogenes]_3932 [denovogenes]_8137 [denovogenes]_10476 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXIX [denovogenes]_36154 [denovogenes]_11087 [denovogenes]_26350 [denovogenes]_5016 [denovogenes]_14579 [denovogenes]_23320 [denovogenes]_47983 [denovogenes]_19383 [denovogenes]_29919 [denovogenes]_42324 [denovogenes]_21710 [denovogenes]_4566 [denovogenes]_4887 [denovogenes]_31115 [denovogenes]_132699 [denovogenes]_133402 [denovogenes]_74772 [denovogenes]_87400 [denovogenes]_57467 [denovogenes]_106223 [denovogenes]_31495 [denovogenes]_69570 [denovogenes]_21970 [denovogenes]_50207 [denovogenes]_51295 [denovogenes]_11769 [denovogenes]_6569 [denovogenes]_14657 [denovogenes]_26381 [denovogenes]_6729 [denovogenes]_13359 [denovogenes]_22280 [denovogenes]_20773 [denovogenes]_11439 [denovogenes]_63809 [denovogenes]_13202 [denovogenes]_37636 [denovogenes]_2657 [denovogenes]_2493 [denovogenes]_3350 [denovogenes]_10980 [denovogenes]_3161 [denovogenes]_2713 [denovogenes]_2980 [denovogenes]_3057 [denovogenes]_3633 [denovogenes]_6574 beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase beta-glucosidase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both complete complete lack_both complete complete complete lack_both complete complete complete complete complete complete complete complete complete complete GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH3 GH5 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 65 >65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 XXX [denovogenes]_2488 [denovogenes]_3220 [denovogenes]_3579 [denovogenes]_6218 [denovogenes]_55603 [denovogenes]_12315 [denovogenes]_12968 [denovogenes]_26217 [denovogenes]_35572 [denovogenes]_5944 [denovogenes]_13518 [denovogenes]_23999 [denovogenes]_57307 [denovogenes]_6687 endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase endoglucanase complete complete complete lack_3' lack_3' lack_5' lack_5' lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both lack_both GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 GH9 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 55-65 ... giá đa dạng vai trò số module cấu trúc enzyme thủy phân cellulose từ khu hệ vi sinh vật trong cỏ dê” ● Mục tiêu nghiên cứu: - Nghiên cứu đánh giá đa dạng cellulase cellulase có cấu trúc module từ. .. tới vi? ??c đánh giá đa dạng trình tự cellulase có cấu trúc module, tìm cấu trúc module đặc thù cho nghiên cứu vai trị module đến hoạt tính enzyme Do đó, chúng tơi thực Luận án: ? ?Nghiên cứu đánh giá. .. Fn3Egc) dạng dung hợp với SUMO Nghiên cứu vai trò module chưa biết chức đến khả phân giải cellulose enzyme Nghiên cứu, đánh giá số tính chất enzyme tái tổ hợp biểu từ trình tự lựa chọn có cấu trúc module