Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh

Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.Nghiên cứu một số đặc điểm cận lâm sàng, kiểu gen của HBV và HCV ở người nghiện ma túy tại trung tâm cai nghiện thành phố Hồ Chí Minh.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y PHẠM HỮU QUỐC NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CẬN LÂM SÀNG, KIỂU GEN CỦA HBV VÀ HCV Ở NGƯỜI NGHIỆN MA TÚY TẠI TRUNG TÂM CAI NGHIỆN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC Hà Nội - 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y PHẠM HỮU QUỐC NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CẬN LÂM SÀNG, KIỂU GEN CỦA HBV VÀ HCV Ở NGƯỜI NGHIỆN MA TÚY TẠI TRUNG TÂM CAI NGHIỆN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH Chuyên ngành: Nội khoa Mã số: 9720107 LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS Trần Việt Tú GS TS Nguyễn Tấn Bỉnh Hà Nội - 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan luận án cơng trình nghiên cứu với hướng dẫn khoa học tập thể cán hướng dẫn Các kết nêu luận án trung thực công bố phần báo khoa học Luận án chưa cơng bố Nếu có điều sai tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm TÁC GIẢ Phạm Hữu Quốc LỜI CẢM ƠN Trong trình học tập, nghiên cứu hồn thành luận án, tơi nhận giúp đỡ tận tình q Thầy, Cơ giáo, nhà Khoa học, anh, chị, em, bạn bè, đồng nghiệp người thân yêu Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành Ban Giám đốc Học viện Quân y Phòng, Ban khác tạo điều kiện thuận lợi cho q trình học tập nghiên cứu Tơi ln biết ơn Bộ mơn Nội tiêu hóa Học viện Qn y dành cho điều kiện tốt để tơi hồn thành chương trình học tập nghiên cứu khoa học Tôi xin trân trọng cảm ơn sâu sắc tới PGS.TS Trần Việt Tú, GS.TS Nguyễn Tấn Bỉnh tận tình giúp đỡ hướng dẫn tơi suốt q trình học tập, nghiên cứu hồn thành luận án Tôi xin cám ơn quý Thầy, Cô giáo tham gia giảng dạy giúp đỡ nhiều thời gian qua Tơi xin tỏ lịng biết ơn kính trọng đến quý Thầy Giáo sư, Tiến sỹ Hội đồng chấm luận án dành nhiều thời gian, công sức dẫn, giúp đỡ q trình hồn thiện bảo vệ thành cơng luận án Tôi chân thành cảm ơn Đảng ủy Chỉ huy Bệnh viện Quận Gò Vấp, Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh tạo điều kiện tốt để học tập nghiên cứu Tôi biết ơn gia đình, người thân, bạn bè đồng nghiệp hỗ trợ, động viên, tạo điều kiện tốt để yên tâm học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án Phạm Hữu Quốc MỤC LỤC Trang Trang phụ bìa Lời cam đoan Mục lục Danh mục chữ viết tắt luận án Danh mục bảng Danh mục biểu đồ Danh mục ảnh ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan chất ma túy 1.1.1.Khái niệm chất ma túy 1.1.2.Các chất ma túy thường gặp Việt Nam 1.1.3.Thực trạng xu hướng sử dụng ma túy 1.2 Đặc điểm dịch tễ học nhiễm HBV, HCV người nghiện ma túy 1.2.1.Trên giới 1.2.2.Ở Việt Nam 11 1.3 Một số đặc điểm vi rút biểu lâm sàng, cận lâm sàng nhiễm HBV, HCV .11 1.3.1.Đặc điểm hình thái cấu trúc vi rút viêm gan B C 11 1.3.2.Đặc điểm kiểu gen vi rút viêm gan B C 13 1.3.3.Đường lây truyền HBV, HCV 16 1.3.4.Các dấu ấn sinh học HBV, HCV 18 1.3.5.Biểu lâm sàng nhiễm vi rút viêm gan B C .23 1.3.6.Biểu cận lâm sàng nhiễm vi rút viêm gan B C 25 1.4 Đột biến kháng thuốc DAA vi rút viêm gan C 28 1.4.1.Cơ chế hình thành đột biến kháng thuốc DAA HCV .28 1.4.2.Xét nghiệm tìm đột biến kháng thuốc DAA HCV 30 1.5 Một số nghiên cứu nước 30 1.5.1.Trên giới 30 1.5.2.Tại Việt Nam 32 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 2.1 Đối tượng, địa điểm thời gian nghiên cứu 34 2.1.1.Đối tượng nghiên cứu 34 2.1.2.Địa điểm nghiên cứu 35 2.1.3.Thời gian nghiên cứu 35 2.2 Thiết bị, vật liệu nghiên cứu 35 2.2.1.Thiết bị, hóa chất phục vụ cho xét nghiệm HBsAg, Anti-HCV 35 2.2.2.Thiết bị, hóa chất phục vụ cho xét nghiệm xác định tải lượng vi rút….36 2.2.3.Thiết bị, hóa chất phục vụ cho xét nghiệm xác định enzyme gan 36 2.2.4.Thiết bị, hóa chất phục vụ cho xét nghiệm kiểu gen HBV, HCV kháng thuốc DAA HCV 36 2.3 Phương pháp nghiên cứu .38 2.3.1.Thiết kế nghiên cứu 38 2.3.2.Cỡ mẫu 38 2.3.3.Nội dung nghiên cứu 39 2.4 Nhập xử lý số liệu .48 2.5 Đạo đức nghiên cứu .48 2.6 Sơ đồ nghiên cứu 49 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 51 3.1 Một số đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 51 3.2 Đánh giá tỷ lệ nhiễm HBV, HCV, tải lượng vi rút hoạt độ enzyme gan đối tượng nghiên cứu 52 3.2.1.Tỷ lệ nhiễm HBV, HCV đối tượng nghiên cứu 52 3.2.2.Đặc điểm tải lượng HBV, HCV 55 3.2.3.Đặc điểm hoạt độ enzyme gan đối tượng nghiên cứu .57 3.3 Xác định kiểu gen HBV, HCV đột biến gen liên quan đến kháng thuốc DAA HCV đối tượng nghiên cứu 62 3.3.1.Đặc điểm kiểu gen HBV, HCV 62 3.3.2.Đột biến liên quan đến kháng thuốc DAA HCV 66 CHƯƠNG BÀN LUẬN 78 4.1 Một số đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 78 4.1.1.Đặc điểm giới tuổi 78 4.1.2.Đặc điểm chất gây nghiện, thời gian nghiện, đường sử dụng 80 4.2 Đánh giá tỷ lệ nhiễm HBV, HCV, tải lượng vi rút hoạt độ enzyme gan đối tượng nghiên cứu 83 4.2.1.Tỷ lệ nhiễm HBV, HCV nhóm đối tượng nghiện ma túy 83 4.2.2.Đặc điểm tải lượng vi rút 89 4.2.3.Đặc điểm enzyme gan người nhiễm HBV, HCV 92 4.3 Xác định kiểu gen HBV, HCV đột biến gen liên quan đến kháng thuốc DAA HCV đối tượng nghiên cứu 97 4.3.1.Kiểu gen HBV, HCV 97 4.3.2.Đột biến liên quan đến kháng thuốc DAA HCV 105 KẾT LUẬN 112 KIẾN NGHỊ .114 DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH CƠNG BỐ KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI LUẬN ÁN 115 TÀI LIỆU THAM KHẢO 116 PHỤ LỤC 132 DANH MỤC CÁC CHỮ, KÝ HIỆU VIẾT TẮT TT Phần viết tắt ALT ARV AST ATS BCP BN cccDNA cDNA CIA 10 11 COI DAA 12 13 14 DNA DVS EIA 15 HBcAb 16 17 HBeAb HBeAg 18 HBsAg 19 HBV 20 21 HBV-DNA HBxAg 22 HCC 23 HCV 24 25 HCV-RNA HIV-AIDS Phần viết đầy đủ Alanine aminotransferase Antiretroviral Aspartate aminotransferase Amphetamine Type Stimulants Ma túy tổng hợp dạng Amphetamines Basal-Core Promoter Đột biến vùng Basal-Core Promoter Bệnh nhân covalently closed circular DNA DNA vịng đóng đồng hóa trị complementary DNA DNA bổ trợ Chemiluminescent Immunoassay Kỹ thuật hóa quang miễn dịch Chỉ số ngưỡng Direct-Acting Antiviral Kháng vi rút trực tiếp Deoxyribonucleic acid Dasabuvir Enzyme Immunoassay Kĩ thuật miễn dịch men Hepatitis B core antibody Kháng thể kháng kháng nguyên lõi vi rút viêm gan B Hepatitis B e antibody Hepatitis B e antigen Kháng nguyên e vi rút viêm gan B Hepatitis B surface antigen Kháng nguyên bề mặt vi rút viêm gan B Hepatitis B virus Vi rút viêm gan B Hepatitis B virus Deoxyribonucleic acid Hepatitis B virus X antigen Kháng nguyên X vi rút viêm gan B HepatoCellular Carcinoma Ung thư biểu mô tế bào gan Hepatitis C virus Vi rút viêm gan C Hepatitis C virus Ribonucleic acid Human immunodeficiency virus infection - acquired immunodeficiency syndrome Hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải người TT Phần viết tắt 26 27 28 29 30 31 IFN IgG IgM KTC LDV LiPA 32 33 34 35 36 37 LSD MA MDA MDEA MDMA MSM 38 39 NMT ORF 40 PC 41 PCR 42 43 PT RAV 44 45 46 47 RNA SOF TPHCM ULN 48 UNODC 49 50 VGC WHO Phần viết đầy đủ HIV Interferon Immunoglobulin G Immunoglobulin M Khoảng tin cậy Ledipasvir Line Probe Assay Xét nghiệm thăm dò dòng Lysergic acid diethylamide MethAmphetamine Methylenedioxyamphetamine Methylenedioxy-N-ethylamphetamine Methylenedioxymethamphetamine Men who have sex with men Quan hệ tình dục đồng giới nam Nghiện ma túy Open reading frames Khung đọc mở Precore Vùng Precore Polymerase Chain Reaction Phản ứng chuỗi polymerase Prothrombin time Resistance-associated Amino acid Variant Biến thể axit amin liên quan đến kháng thuốc Ribonucleic acid Sofosbuvir Thành phố Hồ Chí Minh Upper Limited of Normal Giới hạn giá trị bình thường United Nations Office on Drugs and Crime Văn phòng Liên Hợp Quốc ma túy tội phạm Viêm gan cấp World Health Organization Tổ chức y tế giới DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng Tên bảng Trang 2.1 Cặp mồi đặc hiệu dùng cho nhân dòng đoạn gen S HBV 37 2.2 Cặp mồi đặc hiệu dùng cho nhân dòng đoạn gen C HCV 37 2.3 Cặp mồi đặc hiệu cho nhân dòng đoạn NS5B HCV 38 3.1 Phân bố độ tuổi đối tượng nghiên cứu 51 3.2 Chất gây nghiện, thời gian nghiện đường sử dụng 3.3 Tải lượng vi rút nhóm đối tượng nhiễm HBV 55 3.4 Tải lượng vi rút nhóm đối tượng nhiễm HCV 56 3.5 So sánh tải lượng HBV, HCV đối tượng đơn nhiễm56 3.6 Tải lượng HBV, HCV nhóm đối tượng đồng nhiễm 3.7 Hoạt độ enzyme gan nhóm nhiễm HBV 58 3.8 Hoạt độ enzyme gan nhóm nhiễm HCV 58 3.9 So sánh hoạt độ enzyme gan nhóm đơn nhiễm HBV HCV 59 52 57 3.10 So sánh hoạt độ enzyme gan với tuổi đối tượng nghiên cứu 59 3.11 Đặc điểm kiểu gen HBV 62 3.12 Đặc điểm kiểu gen HCV 63 3.13 So sánh hoạt độ enzyme gan đơn nhiễm HBV đơn nhiễm HCV 66 3.14 Lựa chọn mẫu HCV làm đột biến kháng thuốc DAA 66 3.15 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 1A 67 3.16 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 1B 68 3.17 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 3A 70 3.18 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 3B 70 3.19 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 6A 71 3.20 Phân bố đột biến axit amin gen NS5B liên quan đến kháng thuốc DAA mẫu HCV kiểu gen 6H 71  Lựa chọn Plate manager  Chọn New o o o o o Cài đặt tên Chọn Sequencing analysis Đặt Owner name Đặt Operator name Chọn OK bảng Sequencinganalysis plate editor  Cột Sample name: đặt tên mẫu  Cột Results group: lựa chọn nơi kết lưu lại  Cột Instrument protocol 1: chọn BDx_Seq_POP7_Cap50_fast  Cột Analysis protocol: chọn 3130POP7_BDTv3-KB-Denovo-v5.2  Các cột lại bỏ trống  Bấm OK  Lựa chọn Plate view o Chọn Find all o Chọn chương trình cài đặt o Click đúp chuột vào vị trí plate để kết nối o Xuất biểu tượng ►màu xanh o Bấm vào biểu tượng ► màu xanh để bắt đầu chạy  Thu nhận kết giải trình tự nucleotide: Kết chạy sequencing tự động lưu lại thư mục chọn  Trên hình chính, bật phần mềm Sequence Analysis 5.4  Vào thư mục file, nhập kết giải trình tự lưu thư mục máy tính  Bấm vào biểu tượng ►màu xanh để tiến hành xử lý liệu  Vào thư mục file chọn Save để lưu liệu xử lý  Sao chép sữ liệu vào đĩa CD  Bước 8: Phân tích trình tự đoạn gen NS5B HCV  Sử dụng phần mềm ATGC phiên 7.02 (Nhật) để phân tích trình tự nucleotide đoạn gen Core HCV  Cài đặt phần mềm ATGC phiên 7.02 vào máy tính, hình mở phần mềm  Vào thư mục File → New → Add file (nhập hai trình tự nucleotide với mồi PR3 PR4 mẫu HCV) chọn OK  Vào thư mục Analyze → Assemble để tiến hành bắt cặp trình tự chuỗi Sense (có nghĩa) Anti-sense (đối nghĩa)  Vào thư mục View → Wave window để thị bước sóng nucleotide (A màu xanh lá, T màu đỏ, G màu tím, C màu xanh da trời)  Đối chiếu cặp nucleotide đối mã (A – T, G – C) trình tự bước sóng để khẳng định tính xác trình tự nucleotide  Loại bỏ đoạn trình tự nucleotide hai đầu có chất lượng kém, thu nhận đoạn trình trình có chất lượng đọc tốt Lưu trình tự phân tích vào file đặt tên theo mẫu xét nghiệm  Bước 9: Tìm đột biến điểm liên quan đến kháng DAA đoạn gen NS5B  Thu nhận trình tự gốc dạng hoang dã (Wild-type) chủng HCV có kiểu gen (genotype) với mã GenBank tương ứng: 1A (NC_004102), 1B (EU781827), 3A (D17763), 3B (D49374), 6A (Y12083), 6E (KY608690), 6H (KY608700)  Mỗi lần phân tích kiểu gen Mở phần mềm ATGC 7.02, vào thư mục File → New → Add file → OK để nhập trình tự HCV mẫu xét nghiệm trình tự gốc dạng hoang dã kiểu gen  Vào thư mục Analyze → Assemble tìm điểm nucleotide khác biệt chủng HCV mẫu xét nghiệm với chủng HCV tham chiếu  Các điểm đột biến gen NS5B HCV có liên quan đến kháng thuốc DAA bao gồm: o Đột biến kháng Sofosbuvir (SOF) – Nucleotide Inhibitors (NIs): L159, S282, E237, D244, C316, L320, V321 Đột biến kháng Dasabuvir (DVS) – Non-nucleotide Inhibotors (NNIs):N273, D244, Q309, D310, L314, C316, C326, S329, Q330, A333, S368, A395, N411, M414, N444, C445, E446, Y448, C451, A553, G554, S556, G558, D559, Y561, S565 ... DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ QUỐC PHÒNG HỌC VIỆN QUÂN Y PHẠM HỮU QUỐC NGHIÊN CỨU MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CẬN LÂM SÀNG, KIỂU GEN CỦA HBV VÀ HCV Ở NGƯỜI NGHIỆN MA TÚY TẠI TRUNG TÂM CAI NGHIỆN THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH. .. HCV người nghiện ma túy trung tâm cai nghiện Thành phố Hồ Chí Minh (2013-2015) 3 CHƯƠNG TỔNG QUAN 1.1 Tổng quan chất ma túy 1.1.1 Khái niệm chất ma túy Hiểu theo nghĩa thông thường: ma túy số. .. Đánh giá tỷ lệ nhiễm HBV, HCV, tải lượng vi rút hoạt độ enzyme gan người nghiện ma túy trung tâm cai nghiện Thành phố Hồ Chí Minh (2013-2015) Xác định kiểu gen HBV, HCV đột biến gen liên quan đến