1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B

155 3 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Nghiên Cứu Đột Biến Và Đa Hình Di Truyền Trên Gen Mã Hóa Yếu Tố IX Ở Bệnh Nhân Hemophilia B
Tác giả Vũ Thị Bích Hường
Người hướng dẫn TS. Dương Quốc Chính, PGS.TS. Đồng Văn Quyền
Trường học Học viện Khoa học và Công nghệ
Chuyên ngành Di truyền học
Thể loại luận án tiến sĩ
Năm xuất bản 2022
Thành phố Hà Nội
Định dạng
Số trang 155
Dung lượng 3,24 MB

Nội dung

Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.Nghiên cứu đột biến và đa hình di truyền trên gen mã hóa yếu tố IX ở bệnh nhân hemophilia B.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CƠNG NGHỆ VŨ THỊ BÍCH HƯỜNG NGHIÊN CỨU ĐỘT BIẾN VÀ ĐA HÌNH DI TRUYỀN TRÊN GEN MÃ HĨA YẾU TỐ IX Ở BỆNH NHÂN HEMOPHILIA B LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC Hà Nội, 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - VŨ THỊ BÍCH HƯỜNG NGHIÊN CỨU ĐỘT BIẾN VÀ ĐA HÌNH DI TRUYỀN TRÊN GEN MÃ HÓA YẾU TỐ IX Ở BỆNH NHÂN HEMOPHILIA B Chuyên ngành : Di truyền học Mã số : 42 01 21 LUẬN ÁN TIẾN SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS DƯƠNG QUỐC CHÍNH Viện Huyết học – Truyền máu TW PGS.TS.ĐỒNG VĂN QUYỀN Viện Công nghệ sinh học iii LỜI CAM ĐOAN Tôi Vũ Thị Bích Hường, nghiên cứu sinh khóa II, năm 2016, chuyên ngành Di truyền học, xin cam đoan: Đây luận án thân trực tiếp thực hướng dẫn hai thầy TS Dương Quốc Chính PGS.TS Đồng Văn Quyền Cơng trình khơng trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam Các số liệu thông tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan, xác nhận chấp thuận sở nơi nghiên cứu Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm trước pháp luật cam kết Hà Nội, ngày tháng năm 2022 Người viết cam đoan NCS Vũ Thị Bích Hường iv LỜI CẢM ƠN Trước hết, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến Đảng Ủy, Ban Lãnh đạo Viện Huyết học – Truyền máu TW cho phép dự tuyển, tham gia khóa đào tạo Tiến sĩ tạo điều kiện thuận lợi cho suốt q trình học tập nghiên cứu Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành sâu sắc đến TS Dương Quốc Chính, Phó trưởng mơn Huyết học – Truyền máu, Trường Đại học Y Dược, Đại học Quốc gia Hà Nội; Trưởng khoa Di truyền & Sinh học phân tử, Viện Huyết học - Truyền máu TW, người Thầy định hướng nghiên cứu, trực tiếp hướng dẫn thực nghiên cứu; hỗ trợ suốt trình học tập tạo điều kiện tốt sở vật chất để thực hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành sâu sắc đến PGS.TS Đồng Văn Quyền, Phó Viện trưởng Viện Cơng nghệ sinh học, Viện Hàn Lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam, người Thầy tận tình hướng dẫn, bảo, truyền đạt cho kiến thức kinh nghiệm quý báu trình học tập nghiên cứu khoa học tạo điều kiện thuận lợi giúp tơi hồn thành luận án Tơi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến TS Nguyễn Thị Mai, Giám đốc Trung tâm hemophilia; bác sỹ, điều dưỡng Trung tâm hemophilia, Viện Huyết học – Truyền máu TW; tập thể cán khoa Tiếp nhận máu hợp tác hỗ trợ trình thu thập mẫu nghiên cứu Tơi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến bệnh nhân hemophilia B, người nhà bệnh nhân người hiến máu giúp đỡ để tơi có số liệu luận án Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến: - Ban giám đốc, Phòng đào tạo Học viện Khoa học Công nghệ; Khoa Công nghệ sinh học, Viện Công nghệ sinh học tạo điều kiện thuận lợi, hỗ trợ giúp đỡ suốt trình học tập thực luận án - Các thầy cô tham gia giảng dạy chuyên ngành Di truyền học, truyền đạt kiến thức quý báu cho tơi q trình học tập v - ThS Bùi Thị Hải Hà, chuyên viên phụ trách đào tạo, Viện Cơng nghệ sinh học tận tình hướng dẫn tơi để hồn thành thủ tục hành suốt q trình học tập Học viện Tơi xin chân thành cảm ơn bạn bè, đồng nghiệp yêu quý Khoa Di truyền & Sinh học phân tử, Viện Huyết học – Truyền máu TW sẵn sàng hỗ trợ, chia sẻ với tơi suốt q trình thực hiên nghiên cứu Cuối cùng, xin chân thành biết ơn gia đình ln bên tơi, cổ vũ, động viên chỗ dựa vững để yên tâm học tập thực luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn! Hà Nội, ngày tháng năm 2022 Người viết cam đoan NCS Vũ Thị Bích Hường v i MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN ii LỜI CẢM ƠN iii MỤC LỤC v DANH MỤC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT .viii DANH MỤC BẢNG ix DANH MỤC HÌNH x DANH MỤC BẢNG ix MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan bệnh hemophilia B 1.1.1 Một số dấu mốc lịch sử phát nghiên cứu bệnh hemophilia B .4 1.1.2 Khái quát bệnh hemophilia B 1.2 Cấu trúc chức yếu tố IX q trình đơng máu 10 1.2.1 Các yếu tố đông máu 10 1.2.2 Vai trò yếu tố IX q trình đơng máu 11 1.2.3 Cấu trúc yếu tố IX q trình hoạt hóa yếu tố IX .13 1.2.4 Mối tương tác yếu tố IX với nhân tố hoạt hóa đồng yếu tố .15 1.3 Phân tích di truyền bệnh hemophilia B 18 1.3.1 Vai trị phân tích di truyền bệnh hemophilia B .18 1.3.2 Đặc điểm đột biến gen F9 19 1.3.3 Đặc điểm đa hình nucleotide liên kết với gen F9 27 1.4 Các kỹ thuật phân tích di truyền bệnh hemophilia B 30 1.4.1 Kỹ thuật phân tích đột biến 31 1.4.2 Kỹ thuật phân tích liên kết 36 1.5 Tình hình nghiên cứu biến đổi di truyền gen F9 .38 1.5.1 Tình hình nghiên cứu giới 38 1.5.2 Tình hình nghiên cứu nước 42 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 45 2.1 Đối tượng nghiên cứu 45 2.2 Phương pháp nghiên cứu 46 2.2.1 Thiết kế nghiên cứu 46 v ii 2.2.2 Cơng thức tính cỡ mẫu nghiên cứu đa hình nucleotide .46 2.2.3 Các bước nghiên cứu 46 2.3 Hóa chất thiết bị nghiên cứu 50 2.3.1 Hóa chất 50 2.3.2 Vật tư – Trang thiết bị 51 2.4.1 Thu thập mẫu nghiên cứu 52 2.4.2 Tách chiết ADN 52 2.4.3 Thiết kế trình tự mồi để khuếch đại gen tổng hợp yếu tố IX 52 2.4.4 Khuếch đại phân đoạn a1-a8 kỹ thuật Longrange PCR 53 2.4.5 Tinh sản phẩm Longrange PCR khuếch đại vùng gen F9 54 2.4.7 Khẳng định kết giải trình tự gen F9 NGS 55 2.4.8 Khẳng định đoạn/lặp đoạn gen F9 kỹ thuật MLPA 56 2.4.9 Phân tích đột biến gen từ liệu giải trình tự 56 2.4.10 Phân tích đa hình nucleotide gen F9 từ liệu giải trình tự .58 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 60 3.1 Chuẩn bị mẫu nghiên cứu 60 3.1.2 Chuẩn bị vật liệu nghiên cứu 61 3.2 Xây dựng quy trình giải trình tự gen mã hóa yếu tố IX 62 3.2.1 Thiết kế mồi khuếch đại toàn gen F9 62 3.2.2 Tối ưu quy trình LR- PCR khuếch đại vùng gen F9 63 3.2.3 Chuẩn bị thư viện ADN 67 3.2.4 Giải trình tự với quy trình NGS tối ưu 68 3.2.5 Khẳng định kết giải trình tự NGS 70 3.3 Giải trình tự gen F9 mẫu nghiên cứu 73 3.4 Phân tích đột biến gen 100 bệnh nhân nghiên cứu 76 3.5.1 Kiểu đột biến gen 80 3.5.2 Tác động đột biến đến cấu trúc, hoạt động gen .80 3.5.3 Đánh giá mức độ lặp lại đột biến bệnh nhân nghiên cứu .81 3.6 Tương quan kiểu đột biến gen mức độ bệnh 82 3.7 Lập đồ đột biến gen F9 bệnh nhân hemophilia B Việt Nam 83 3.7.1 Phân bố đột biến gen F9 83 3.7.2 Phân bố đột biến domain phân tử FIX 84 v ii 3.7.3 Bản đồ đột biến gen F9 bệnh nhân hemophilia B Việt Nam 84 3.8 Phân tích đa hình nucleotide gen F9 .1 3.8.1 Khảo sát đa hình nucleotide gen mã hoá yếu tố IX 3.8.2 Tần suất alen đa hình quần thể người bình thường .1 3.8.3 Phân tích liên kết đa hình nucleotide 3.8.4 Lựa chọn đa hình có giá trị thông tin cao 3.8.5 Xác nhận hiệu đa hình gia đình người bệnh CHƯƠNG BÀN LUẬN KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 4.1 Chuẩn bị mẫu nghiên cứu 4.2 Xây dựng quy trình NGS giải trình tự gen mã hóa yếu tố IX 11 4.2.1 Thiết kế mồi khuếch đại gen F9 11 4.2.2 Tối ưu quy trình LR-PCR khuếch đại vùng gen F9 12 4.2.3 Chuẩn bị thư viện ADN 14 4.2.4 Giải trình tự gen F9 với quy trình tối ưu 14 4.2.5 Đánh giá kết giải trình tự NGS 15 4.3 Giải trình tự gen F9 mẫu nghiên cứu 15 4.4 Phân tích đột biến gen 100 bệnh nhân nghiên cứu 16 4.5 Đặc điểm kiểu đột biến gen gặp nghiên cứu .20 4.6 Mối tương quan kiểu đột biến gen mức độ bệnh 21 4.7 Bản đồ đột biến gen F9 bệnh nhân hemophilia B Việt Nam 22 4.7.1 Phân bố đột biến gen F9 22 4.7.2 Phân bố đột biến phân tử protein yếu tố IX 23 4.8 Đa hình di truyền gen F9 26 4.8.1 Khảo sát đa hình nucleotide gen F9 26 4.8.2 Tần suất alen đa hình nghiên cứu 28 4.8.3 Phân tích mối liên kết di truyền đa hình nucleotide .30 4.8.4 Lựa chọn đa hình có giá trị thơng tin cao 31 4.8.5 Khẳng định hiệu đa hình 32 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 36 DANH MỤC CƠNG TRÌNH CỦA TÁC GIẢ ĐÃ CƠNG BỐ .37 CÓ LIÊN QUAN ĐẾN ĐỀ TÀI 37 TÀI LIỆU THAM KHẢO 38 ix DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt FIX Hemophilia B F9 DNA PCR LD-PCR NGS RFLP MLPA Kb SNP VNTR 5’UTR 3’UTR WHO EAHDA UKHCDO CDC HGVS PolyPhen-2 SIFT Tên đầy đủ Factor IX Chú thích Yếu tố IX Bệnh lý rối loạn đơng máu thiếu hụt FIX Gen mã hóa yếu tố IX Deoxyribonucleic Acid Phân tử ADN Polymerase Chain Reaction Phản ứng tổng hợp chuỗi Long Distance PCR Phản ứng tổng hợp chuỗi dài Next Generation Sequencing Giải trình tự hệ Restriction Fragment Length Đa hình chiều dài đoạn cắt giới Polymorphism hạn Multiplex Ligation-dependent Phương pháp multiplex PCR phát Probe Amplification số lượng bất thường Kilo base Đơn vị đo chiều dài ADN Single nucleotide polymorphism Đa hình đơn nucleotide Variable Number Tandem Repeat Các trình tự ADN lặp lại ngắn 5′ Untranslated Region Vùng khơng mã hóa đầu 5’ 3′ Untranslated Region Vùng khơng mã hóa đầu 3’ World Health Organization Tổ chức Y tế giới European Association for Hiệp hội bệnh hemophilia rối Haemophilia and Allied loạn đông máu Châu Âu Disorders United Kingdom Haemophilia Tổ chức bác sỹ thuộc Trung tâm Centre Doctors’ Organisation hemophilia Vương quốc Anh The Centers for Disease Control Trung tâm kiểm sốt phịng chống and Prevention bệnh dịch Human Genome Variation Hiệp hội biến đổi gen người Society Polymorphism Phenotyping v2 Phần mềm dự đoán tác động biến đổi axit amin đến cấu trúc chức Sorting Intolerant From Tolerant phân tử protein x DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1 Kích thước exon intron gen F9 người 14 Bảng 1.2 Tần suất alen số đa hình quần thể khác 30 Bảng 2.1: Trình tự mồi giải trình tự gen F9 phương pháp Sanger 51 Bảng 3.1 Đặc điểm bệnh nhân nghiên cứu .60 Bảng 3.2 Kết nồng độ độ tinh số mẫu ADN 61 Bảng 3.3 Phân đoạn ADN trình tự mồi thiết kế 62 Bảng 3.4 Thành phần phản ứng LR-PCR khuếch đại đoạn a1-a8 66 Bảng 3.5 Chu trình nhiệt phản ứng LR-PCR cho đoạn a1, a2, a5, a6, a7 .67 Bảng 3.6 Chu trình nhiệt phản ứng LR-PCR cho đoạn a3 a4 67 Bảng 3.7 Chu trình nhiệt độ phản ứng LR-PCR cho đoạn a8 67 Bảng 3.8 Danh sách 16 đột biến 77 Bảng 3.9 Danh sách 58 đột biến phát nghiên cứu .77 Bảng 3.10 Đặc điểm kiểu đột biến gen gặp nghiên cứu .77 Bảng 3.11 Tác động đột biến đến cấu trúc, hoạt động gen .80 Bảng 3.12 Mức độ lặp lại đột biến bệnh nhân nghiên cứu 82 Bảng 3.13 Tương quan kiểu đột biến gen mức độ bệnh 82 Bảng 3.14 Danh sách 12 SNP phát từ liệu giải trình tự 86 Bảng 3.15 Tần suất alen đa hình gặp nghiên cứu 87 Bảng 3.16 : Thống kê đồng biểu đa hình nucleotide .88 Bảng 3.17 Phân nhóm SNP theo mức độ liên kết 92 Bảng 3.18 Bộ SNP có giá trị thông tin 92 Bảng 4.1 Tỷ lệ đột biến số nghiên cứu giới 105 Bảng 4.2 Tần suất alen đa hình số quần thể khác .114 Bảng 4.3 Tần suất alen đa hình MseI quần thể giới 115 Bảng 4.4 Tần suất dị hợp tử số đa hình liên kết với gen F9 quần thể119 114 Potapov, V and J.L Ong, Examining Sources of Error in PCR by SingleMolecule Sequencing PLoS One, 2017 12(1): p e0169774 14 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 Yohe, S., et al., Clinical validation of targeted next-generation sequencing for inherited disorders 2015 139(2): p 204-210 Rehm, H.L., et al., ACMG clinical laboratory standards for nextgeneration sequencing Genet Med, 2013 15(9): p 733-47 Hartman, P., et al., Next generation sequencing for clinical diagnostics: Five year experience of an academic laboratory Mol Genet Metab Rep, 2019 19: p 100464 Zahari, M., et al., Mutational Profiles of F8 and F9 in a Cohort of Haemophilia A and Haemophilia B Patients in the Multi-ethnic Malaysian Population Mediterr J Hematol Infect Dis, 2018 10(1): p e2018056 Bottema, C.D., et al., The pattern of spontaneous germ-line mutation: relative rates of mutation at or near CpG dinucleotides in the factor IX gene Hum Genet, 1993 91(5): p 496-503 Green, P., et al., Haemophilia B mutations in a complete Swedish population sample: a test of new strategy for the genetic counselling of diseases with high mutational heterogeneity 1991 78(3): p 390-397 Gao, W., et al., Characterization of missense mutations in the signal peptide and propeptide of FIX in hemophilia B by a cell-based assay Blood Adv, 2020 4(15): p 3659-3667 Bentley, A., et al., Defective propeptide processing of blood clotting factor IX caused by mutation of arginine to glutamine at position− 1986 45(3): p 343-348 Ware, J., et al., Factor IX San Dimas: Substitution of glutamine for arg− in the propeptide leads to incomplete γ-carboxylation and altered phospholipid binding properties 1989 264(19): p 11401-11406 Lodish, H and S.L.J.B.M.B.E Zipursky, Molecular cell biology 2001 29: p 126-133 Kojima, T., et al., Possible absence of common polymorphisms in coagulation factor IX gene in Japanese subjects 1987 Graham, J., et al., The varying frequencies of five DNA polymorphisms of X- linked coagulant factor IX in eight ethnic groups 1991 49(3): p 537 Driscoll, M.C., et al., A second BamHI DNA polymorphism and haplotype association in the factor IX gene 1988 Winship, P and I.J.B.J.H Peake, A clinically useful RFLP in the 5'flanking region of the factor IX gene 1992 80: p 26a Machado, F.B., et al., Informativeness of a novel multiallelic marker-set comprising an F8 intron 21 and three tightly linked loci for haemophilia A carriership analysis Haemophilia, 2011 17(2): p 257-66 Ljung, R.C.J.B.s.c.h., Prenatal diagnosis of haemophilia 1996 9(2): p 243-257 Shetty, S., et al., Factor VIII and IX gene polymorphisms and carrier analysis in Indian population 1997 54(4): p 271-275 14 PHỤ LỤC Phụ lục 01: KẾT QUẢ KIỂM TRA NỒNG ĐỘ VÀ ĐỘ TINH SẠCH CỦA CÁC MẪU ADN TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị A260 A280 260/280 260/230 Loại mẫu 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 HB1 HB2 HB3 HB4 HB5 HB6 HB7 HB8 HB9 HB10 HB11 HB12 HB13 HB14 HB15 HB16 HB17 HB18 HB19 HB20 HB21 HB22 HB23 HB24 HB25 HB26 HB27 HB28 HB29 HB30 HB31 108.8 94 150.1 108.1 93 225.6 100.3 183 188.7 138.5 164.9 103 113.6 83.6 125.8 113.4 175.9 178.7 94 116.3 144.1 187.8 188.9 190.8 104.4 138.6 157.8 194.5 85.1 149.8 169.7 ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl 2.176 1.88 3.002 2.162 1.859 4.513 2.006 3.66 3.774 2.77 3.298 2.059 2.273 1.672 2.517 2.267 3.517 3.574 1.881 2.325 2.881 3.757 3.777 3.816 2.087 2.773 3.155 3.889 1.703 2.995 3.395 1.146 0.983 1.569 1.137 0.974 2.399 1.059 1.936 1.986 1.474 1.717 1.082 1.22 0.881 1.337 1.171 1.861 1.898 1.004 1.23 1.531 1.953 2.01 1.997 1.102 1.454 1.671 2.043 0.872 1.594 1.78 1.9 1.91 1.91 1.9 1.91 1.88 1.89 1.89 1.9 1.88 1.92 1.9 1.86 1.9 1.88 1.94 1.89 1.88 1.87 1.89 1.88 1.92 1.88 1.91 1.89 1.91 1.89 1.9 1.95 1.88 1.91 2.52 2.51 2.51 2.5 2.49 2.48 2.46 2.46 2.45 2.44 2.44 2.43 2.43 2.42 2.42 2.41 2.41 2.41 2.4 2.4 2.4 2.4 2.4 2.4 2.39 2.39 2.39 2.39 2.38 2.38 2.38 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị A260 A280 260/280 260/230 Loại mẫu 32 HB32 175.5 ng/µl 3.51 1.824 1.92 2.38 DNA 14 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 HB33 HB34 HB35 HB36 HB37 HB38 HB39 HB40 HB41 HB42 HB43 HB44 HB45 HB46 HB47 HB48 HB49 HB50 HB51 HB52 HB53 HB54 HB55 HB56 HB57 HB58 HB59 HB60 HB61 HB62 HB63 HB64 HB65 HB66 216.8 258.3 178.4 121 132 184.3 329.6 82.4 120 149 165.5 169.4 87 92.6 124.3 169.5 182.1 215.3 252.2 260.1 267 299.8 453.6 89.4 93.3 124.8 177.1 206.6 227.3 747.1 93.2 125.2 159.7 291.9 ng/µl 4.336 2.28 ng/µl 5.167 2.744 ng/µl 3.569 1.859 ng/µl 2.42 1.267 ng/µl 2.639 1.402 ng/µl 3.685 1.942 ng/µl 6.592 3.486 ng/µl 1.647 0.847 ng/µl 2.4 1.27 ng/µl 2.979 1.516 ng/µl 3.309 1.734 ng/µl 3.389 1.784 ng/µl 1.739 0.888 ng/µl 1.852 0.984 ng/µl 2.487 1.314 ng/µl 3.39 1.799 ng/µl 3.642 1.921 ng/µl 4.306 2.248 ng/µl 5.045 2.646 ng/µl 5.202 2.719 ng/µl 5.34 2.816 ng/µl 5.995 3.177 ng/µl 9.072 4.77 ng/µl 1.787 0.953 ng/µl 1.867 0.989 ng/µl 2.496 1.276 ng/µl 3.541 1.83 ng/µl 4.132 2.161 ng/µl 4.546 2.397 ng/µl 14.942 7.939 ng/µl 1.864 0.994 ng/µl 2.504 1.33 ng/µl 3.193 1.7 ng/µl 5.839 3.084 TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị A260 67 68 69 HB67 HB68 HB69 297.4 467.4 138.5 ng/µl ng/µl ng/µl 5.948 9.349 2.77 1.9 1.88 1.92 1.91 1.88 1.9 1.89 1.94 1.89 1.96 1.91 1.9 1.96 1.88 1.89 1.88 1.9 1.91 1.91 1.91 1.9 1.89 1.9 1.88 1.89 1.96 1.93 1.91 1.9 1.88 1.88 1.88 1.88 1.89 2.38 2.38 2.37 2.36 2.36 2.36 2.36 2.35 2.35 2.35 2.35 2.35 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.34 2.33 2.33 2.33 2.33 2.33 2.33 2.33 2.32 2.32 2.32 2.32 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA A280 260/280 260/230 Loại mẫu 3.146 4.945 1.456 1.89 1.89 1.9 2.32 2.32 2.31 DNA DNA DNA 14 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 HB70 HB71 HB72 HB73 HB74 HB75 HB76 HB77 HB78 HB79 HB80 HB81 HB82 HB83 HB84 HB85 HB86 HB87 HB88 HB89 HB90 HB91 HB92 HB93 HB94 HB95 HB96 HB97 HB98 HB99 HB100 NK1 175 214 221.9 244.1 258.1 268.2 275.6 334.8 408.6 506.1 600.5 742.4 93.5 100.4 118.6 119.8 130.8 142.2 151.6 172.4 185.2 189.8 200.4 220.1 242.3 246.3 360.6 409 517.7 747.9 1084.2 90 ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl 3.501 4.28 4.438 4.881 5.161 5.363 5.512 6.697 8.173 10.122 12.011 14.848 1.87 2.008 2.372 2.396 2.617 2.844 3.032 3.447 4.688 3.797 4.009 4.403 4.846 4.926 7.212 8.18 10.355 14.958 21.683 1.8 1.845 2.261 2.337 2.506 2.697 2.81 2.891 3.526 4.259 5.324 6.334 7.862 0.986 1.062 1.231 1.278 1.394 1.506 1.567 1.819 2.456 1.99 2.108 2.342 2.556 2.606 3.767 4.299 5.506 7.953 11.429 0.923 1.9 1.89 1.9 1.95 1.91 1.91 1.91 1.9 1.92 1.9 1.9 1.89 1.9 1.89 1.93 1.87 1.88 1.89 1.93 1.9 1.91 1.91 1.9 1.88 1.9 1.89 1.91 1.9 1.88 1.88 1.9 1.95 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.31 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.29 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.3 2.29 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị A260 A280 260/280 260/230 Loại mẫu 102 103 104 105 106 NK2 NK3 NK4 NK5 NK6 93.6 111.7 119 207.5 207.5 ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl 3.388 2.235 2.38 4.149 4.15 1.75 1.177 1.265 2.179 2.177 1.94 1.9 1.88 1.9 1.91 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 DNA DNA DNA DNA DNA 14 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 NK7 NK8 NK9 NK10 NK11 NK12 NK13 NK14 NK15 NK16 NK17 NK18 NK19 NK20 NK21 NK22 NK23 NK24 NK25 NK26 NK27 NK28 NK29 NK30 NK31 NK32 NK33 NK34 NK35 NK36 234.4 234.9 247.2 247.5 255.6 276.5 303.1 305.7 314.5 363 410.5 629.4 752.9 798.3 158.3 169.4 198.1 268.5 280.7 290.8 324.1 382.4 426.7 451.1 474.3 479.1 99.8 121.8 170.8 336.6 TT Tên mẫu Nồng độ 137 138 139 140 141 142 143 NK37 NK38 NK39 NK40 NK41 NK42 NK43 438.1 453.2 474.9 627.1 898.4 1395.1 84.5 ng/µl 4.688 2.456 ng/µl 4.699 2.473 ng/µl 4.943 2.538 ng/µl 4.95 2.6 ng/µl 5.112 2.669 ng/µl 5.531 2.889 ng/µl 6.063 3.211 ng/µl 6.115 3.179 ng/µl 6.29 3.268 ng/µl 7.261 3.762 ng/µl 8.21 4.274 ng/µl 12.588 6.687 ng/µl 15.057 7.955 ng/µl 15.965 8.403 ng/µl 3.167 1.683 ng/µl 3.388 1.75 ng/µl 3.963 2.095 ng/µl 5.371 2.854 ng/µl 5.613 2.956 ng/µl 5.816 3.082 ng/µl 6.482 3.417 ng/µl 7.648 4.048 ng/µl 8.534 4.552 ng/µl 9.021 4.751 ng/µl 9.486 4.96 ng/µl 9.582 5.041 ng/µl 1.997 1.056 ng/µl 2.436 1.29 ng/µl 3.415 1.805 ng/µl 6.731 3.502 Đơn vị A260 A280 ng/µl 8.763 4.513 ng/µl 9.064 4.778 ng/µl 9.498 4.875 ng/µl 12.542 6.706 ng/µl 17.969 9.575 ng/µl 27.902 14.846 ng/µl 1.691 0.889 1.91 1.9 1.95 1.9 1.92 1.91 1.89 1.92 1.92 1.93 1.92 1.88 1.89 1.9 1.88 1.94 1.89 1.88 1.9 1.89 1.9 1.89 1.87 1.9 1.91 1.9 1.89 1.89 1.89 1.92 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.29 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.28 2.27 2.27 2.27 2.27 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA 260/280 260/230 Loại mẫu 1.94 1.9 1.95 1.87 1.88 1.88 1.9 2.27 2.27 2.27 2.27 2.27 2.27 2.26 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA 14 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 NK44 NK45 NK46 NK47 NK48 NK49 NK50 NK51 NK52 NK53 NK54 NK55 NK56 NK57 NK58 NK59 NK60 NK61 NK62 NK63 NK64 NK65 NK66 NK67 NK68 NK69 NK70 NK71 90.4 96.4 143.1 159.6 186.9 240 321 365.7 586.6 138.9 140.4 152.3 155.1 217.7 224.6 240.4 269.2 317.5 355.4 1231.5 96.2 102.4 124.4 154.8 166.4 172.7 224.8 270.5 ng/µl 1.809 0.949 ng/µl 1.929 0.992 ng/µl 2.861 1.512 ng/µl 3.192 1.666 ng/µl 3.739 1.963 ng/µl 4.801 2.491 ng/µl 6.419 3.393 ng/µl 7.314 3.844 ng/µl 11.732 6.18 ng/µl 2.777 1.48 ng/µl 2.809 1.499 ng/µl 3.046 1.62 ng/µl 3.103 1.633 ng/µl 4.354 2.291 ng/µl 4.493 2.344 ng/µl 4.809 2.409 ng/µl 5.384 2.825 ng/µl 6.35 3.343 ng/µl 7.109 3.651 ng/µl 24.63 12.979 ng/µl 1.924 1.012 ng/µl 2.048 1.042 ng/µl 2.489 1.279 ng/µl 3.095 1.607 ng/µl 3.329 1.655 ng/µl 3.455 1.827 ng/µl 4.495 2.409 ng/µl 5.411 2.839 TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị 172 173 174 175 176 177 178 179 180 NK72 NK73 NK74 NK75 NK76 NK77 NK78 NK79 NK80 271.8 409.6 497.1 642.6 737.1 185.9 364.1 365.2 619.2 A260 A280 ng/µl 5.435 2.889 ng/µl 8.192 4.313 ng/µl 9.942 5.265 ng/µl 12.853 6.788 ng/µl 14.741 7.973 ng/µl 3.717 1.937 ng/µl 7.281 3.836 ng/µl 7.304 3.878 ng/µl 12.383 6.414 1.91 1.94 1.89 1.92 1.9 1.93 1.89 1.9 1.9 1.88 1.87 1.88 1.9 1.9 1.92 1.91 1.9 1.95 1.9 1.9 1.97 1.95 1.93 1.89 1.87 1.91 2.26 2.26 2.26 2.26 2.26 2.26 2.26 2.26 2.26 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.25 2.24 2.24 2.24 2.24 2.24 2.24 2.24 2.24 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA 260/280 260/230 Loại mẫu 1.88 1.9 1.89 1.89 1.85 1.92 1.9 1.88 1.93 2.24 2.24 2.24 2.24 2.24 2.23 2.23 2.23 2.23 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA 14 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 NK81 NK82 NK83 NK84 NK85 NK86 NK87 NK88 NK89 NK90 NK91 NK92 NK93 NK94 NK95 NK96 NK97 NK98 NK99 NK100 MG01 MG02 MG03 MG04 MG05 MG06 921.8 113.2 364 364.4 114.5 156.3 157.4 176.1 331.8 401.1 481.2 699.6 94.1 140.2 155 277.8 89.9 131.1 180.1 204.2 254.5 546.8 110.7 147.3 170.4 287.9 ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl 18.435 2.264 7.279 7.288 2.29 3.126 3.148 3.523 6.636 8.021 9.624 13.991 1.883 2.805 3.099 5.556 1.799 2.623 3.602 4.084 15.965 10.937 2.213 2.947 3.407 5.758 9.887 1.194 3.763 3.82 1.196 1.651 1.674 1.882 3.508 4.245 5.135 7.558 0.998 1.465 1.616 2.965 0.954 1.371 1.895 2.151 8.403 5.634 1.168 1.5 1.798 3.028 1.86 1.9 1.93 1.91 1.92 1.89 1.88 1.87 1.89 1.89 1.87 1.85 1.89 1.91 1.92 1.87 1.89 1.91 1.9 1.9 1.9 1.94 1.9 1.96 1.89 1.9 2.23 2.22 2.22 2.22 2.21 2.21 2.21 2.21 2.21 2.21 2.21 2.21 2.2 2.2 2.2 2.2 2.19 2.19 2.19 2.19 2.19 2.19 2.18 2.18 2.18 2.18 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA TT Tên mẫu Nồng độ Đơn vị A260 A280 260/280 260/230 Loại mẫu 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 MG07 MG08 MG09 MG10 MG11 MG12 MG13 MG14 MG15 MG16 MG17 96.6 235.7 406.4 87.1 110.7 249.5 193.7 479.6 85.8 89.8 140 ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl ng/µl 1.932 4.715 8.128 1.741 2.214 4.99 3.874 9.592 1.716 1.796 2.799 1.014 2.508 4.24 0.917 1.185 2.636 2.06 5.1 0.868 0.935 1.508 1.91 1.88 1.92 1.9 1.87 1.89 1.88 1.88 1.98 1.92 1.86 2.17 2.17 2.17 2.16 2.16 2.16 2.15 2.14 2.13 2.13 2.13 DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA DNA 14 218 219 220 221 222 223 MG18 MG19 MG20 MG21 MG22 MG23 151.5 527.8 563.3 280.2 99 127.6 ng/µl 3.031 1.558 ng/µl 10.556 5.558 ng/µl 11.265 5.998 ng/µl 5.603 2.924 ng/µl 1.981 1.04 ng/µl 2.552 1.371 1.94 1.9 1.88 1.92 1.91 1.86 2.13 2.13 2.13 2.11 2.07 2.07 DNA DNA DNA DNA DNA DNA 14 Phụ lục 02: KẾT QUẢ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN F9 CỦA 100 BỆNH NHÂN HEMOPHILIA B STT Mã BN Năm sinh Giới tính % FIX Mức độ bệnh Có ức chế Biến đổi nucleotide (HGVS cDNA) Biến đổi axit amin (HGVS protein) Loại đột biến Vị trí Domain HB01 1999 Nam Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP HB02 1994 Nam 0.1 Nặng không c.1135C>T p.Arg379* nonsense exon SP HB03 2012 Nam 0.6 Nặng không c.1276A>G p.Thr426Ala missense exon SP HB04 2010 Nam 0,6 Nặng không c.128G>A p.Arg43Gln missense exon PRO HB05 2003 Nam C p.Cys128Arg missense exon EGF1 HB06 2009 Nam T p.Arg226Trp missense exon AP HB07 1981 Nam 0.1 Nặng không c.1135C>T p.Arg379* nonsense exon SP HB08 2005 Nam 0.1 Nặng không c.689G>T p.Gly230Val missense exon SP HB09 2013 Nam A p.Ser430Arg missense exon SP 10 HB10 1983 Nam 0.3 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP 11 HB11 1995 Nam 0.1 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP 12 HB12 1988 Nam 0.1 Nặng không c.127C>T p.Arg43Trp missense exon PRO 13 HB13 1984 Nam 0.1 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP STT Mã BN Năm Giới % Mức Có Biến đổi nucleotide Biến đổi Loại Vị trí Domain 15 sinh tính FIX độ bệnh ức chế (HGVS cDNA) axit amin đột biến (HGVS protein) 14 HB14 2012 Nam 0.4 Nặng không del_exon - large del exon EGF2 15 HB15 1991 Nam 0.1 Nặng không c.677G>A p.Arg226Gln missense exon AP 16 HB16 1985 Nam 0.2 Nặng không c.433T>C p.Cys145Arg missense exon EGF2 17 HB17 2015 Nam 3.2 Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP 18 HB18 1975 Nam 0.2 Nặng không c.470G>T p.Cys157Phe missense exon EGF2 19 HB19 1953 Nam 0,3 Nặng không c.1135C>T p.Arg379* nonsense exon SP 20 HB20 1988 Nữ 2.1 Trung bình khơng c.881G>A (Đồng hợp tử) p.Arg294Gln missense exon SP 21 HB21 1964 Nam Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP 22 HB22 2013 0.4 Nặng không c.874C>T p.Gln292* nonsense exon SP 23 HB23 1984 Nam 0.1 Nặng không c.1243C>A p.His415Asn missense exon SP 24 HB24 1980 Nam 0.1 Nặng không c.344A>G p.Tyr115Cys missense exon EGF1 25 HB25 2000 Nam 0,4 Nặng không c.956T>C p.Leu319Pro missense exon SP 26 HB26 1998 Nam 0,1 Nặng không c.952delC p.Leu318Phefs*8 frameshift exon SP 27 HB27 1981 Nam 0,5 Nặng không c.253-1G>C splice site 28 HB28 1989 Nam 0,2 Nặng không c.755G>C p.Cys252Ser missense exon SP 29 HB29 2012 Nam 0.1 Nặng không c.1069G>C p.Gly357Arg missense exon SP 30 HB30 2013 Nam 0.5 Nặng không c.223C>T p.Arg75* nonsense exon GLA STT Mã BN Năm Giới % Mức Có Biến đổi nucleotide Biến đổi Loại Vị trí Domain Nam splice site intron - 15 sinh tính FIX độ bệnh ức chế (HGVS cDNA) axit amin đột biến (HGVS protein) 31 HB31 1980 Nam 0.2 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP 32 HB32 1998 Nam 0.3 Nặng không c.1369A>T p.Lys457* nonsense exon SP 33 HB33 1985 Nam 0.1 Nặng không c.422G>A p.Cys141Tyr missense exon EGF2 34 HB34 1955 Nam 0.3 Nặng không c.383G>A p.Cys128Tyr missense exon EGF1 35 HB35 1977 Nam 0.5 Nặng không c.1243C>A p.His415Asn missense exon SP 36 HB36 2015 Nam 0.4 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP 37 HB37 2006 Nam 0.5 Nặng không c.206G>A p.Cys69Tyr missense exon GLA 38 HB38 2007 Nam 0.9 Nặng không c.88G>T p.Val30Phe missense exon PRO 39 HB39 2005 Nam 0.4 Nặng không c.761G>A p.Gly254Asp missense exon SP 40 HB40 2005 Nam 0.7 Nặng không c.1136G>A p.Arg379Gln missense exon SP 41 HB41 1980 Nam 0.3 Nặng không c.1135C>T p.Arg379* nonsense exon SP 42 HB42 2015 Nam 0.2 Nặng không c.127C>T p.Arg43Trp missense exon PRO 43 HB43 1980 Nam 0.5 Nặng không c.206G>A p.Cys69Tyr missense exon GLA 44 HB44 1990 Nam 0.3 Nặng không c.278-3A>G Splice site Splice site intron 45 HB45 1992 Nam 0.2 Nặng không c.127C>T p.Arg43Trp missense exon PRO 46 HB46 2010 Nam 0.5 Nặng không c.1331A>G p.Tyr444Cys missense exon SP - 15 STT Mã BN 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 HB47 HB48 HB49 HB50 HB51 HB52 HB53 HB54 HB55 HB56 HB57 HB58 HB59 HB60 HB61 HB62 HB63 HB64 Năm sinh Giới tính % FIX Mức độ bệnh Có ức chế Biến đổi nucleotide (HGVS cDNA) Biến đổi axit amin (HGVS protein) Loại đột biến Vị trí Domain 1976 1980 1970 1989 2016 2003 1991 1990 2012 2009 1975 2008 2011 1981 2012 1993 1993 2012 Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam 2.2 0.4 0.9 0.5 0.7 0.3 1.3 0.5 0.1 0.2 4.4 0.3 1.5 2.8 0.9 2.3 Trung bình Nặng Nặng Nặng Nặng Nặng Trung bình Nặng Nặng Trung bình Nặng Trung bình Nặng Trung bình Trung bình Trung bình Nặng Trung bình khơng khơng khơng khơng không không không không không không không không không không không không không không c.881G>A c.223C>T c.947T>C c.1220G>C c.127C>T c348-349insGA c.881G>A c.838+1G>A c.1220G>A c.128G>A c.470G>T c.881G>A c.1024A>C c.881G>A c.127C>T c.881G>A c.128G>A c.137G>T p.Arg294Gln p.Arg75* p.Ile316Thr p.Cys407Ser p.Arg43Trp pGlu116Glufs*15 p.Arg294Gln splice site p.Cys407Tyr p.Arg43Gln p.Cys157Phe p.Arg294Gln p.Thr342Pro p.Arg294Gln p.Arg43Trp p.Arg294Gln p.Arg43Gln p.Arg46Met missense nonsense missense missense missense frameshift missense splice site missense missense missense missense missense missense missense missense missense missense exon exon exon exon exon exon exon intron exon exon exon exon exon exon exon exon exon exon SP GLA SP SP PRO EGF1 SP SP PRO EGF2 SP SP SP PRO SP PRO PRO 15 STT Mã BN Năm Giới % Mức Có sinh tính FIX độ bệnh ức chế Biến đổi Biến đổi nucleotide axit amin (HGVS cDNA) (HGVS protein) Loại đột biến Vị trí Domain 65 HB65 2007 Nam 0,1 Nặng không c.956T>C p.Leu319Pro missense exon SP 66 HB66 1981 Nam 0,2 Nặng không c.1004G>A p.Cys335Tyr missense exon SP 67 HB67 1985 Nam 0,1 Nặng không c.206G>A p.Cys69Tyr missense exon GLA 68 HB68 1950 Nam 1.1 Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP 69 HB69 1998 Nam 10 Nhẹ không c.149G>A p.Gly50Asp missense exon GLA 70 HB70 2015 Nam 0,1 Nặng không c.1238G>A p.Gly413Glu missense exon SP 71 HB71 2011 Nam 0.1 Nặng không c.676C>T p.Arg226Trp missense exon AP 72 HB72 2015 Nam 0.2 Nặng không c.1159-1161del p.Lys387del small del exon SP 73 HB73 2012 Nam 0.1 Nặng không c.1213G>A p.Asp405Asn missense exon SP 74 HB74 2014 Nam A p.Arg226Gln missense exon AP 75 HB75 1997 Nam 0.1 Nặng không c.1369A>T p.Lys457* nonsense exon SP 76 HB76 1948 Nam >5 Nhẹ không c.942T>A p.His314.Gln missense exon SP 77 HB77 2000 Nam 3.6 Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP 78 HB78 2009 Nam 1.2 Trung bình khơng c.881G>A p.Arg294Gln missense exon SP 79 HB79 1992 Nam 0.3 Nặng không c.1060del A p.Ser354Valfs*14 small del exon SP 80 HB80 1973 Nam 0.1 Nặng không c.914A>G p.Tyr305Cys missense exon SP 81 HB81 2004 Nam 4.5 Trung bình khơng c.-21C>T - - promoter - 15 STT Mã BN Năm sinh Giới tính % FIX Mức độ bệnh Có ức chế 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 2008 1998 2017 2012 2017 1980 2004 2006 2017 2006 2011 2014 2014 2014 2002 2011 2017 2018 2012 Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam Nam 0.2 0.2 0.1 0.1 20.6 0.3 0.3 0.1 0.1 T c.349T>A c.718T>C c.278-3A>G c.952delC del_ex1-8 c.192T>G c.149G>A del_exon 4-6 c.1135C>T c.127C>T c.1298A>C Biến đổi axit amin (HGVS protein) p.Glu72Gly p.Met394Lys P.Lys362* p.Gly50Asp p.Cys117Ser p.Lys457* p.Cys117Ser p.Trp240Arg p.Leu318Phefs*7 p.Cys64Trp p.Gly50Asp p.Arg379* p.Arg43Trp p.Glu433Ala Loại đột biến Vị trí Domain missense splice site missense splice site nonsense missense missense nonsense missense missense splice site frameshift large del missense missense large del nonsense missense missense exon intron exon intron exon exon exon exon exon exon intron exon exon exon exon exon exon GLA SP SP GLA EGF1 SP EGF1 SP SP GLA GLA SP PRO SP 15 ... Nam, nghiên cứu sinh thực đề tài ? ?Nghiên cứu đột biến đa hình di truyền gen mã hóa yếu tố IX ở b? ??nh nhân hemophilia B? ?? 1 MỤC TIÊU Mục tiêu 1: Lập đồ đột biến gen mã hóa yếu tố IX b? ??nh nhân hemophilia. .. đột biến gen 100 b? ??nh nhân nghiên cứu 16 4.5 Đặc điểm kiểu đột biến gen gặp nghiên cứu .20 4.6 Mối tương quan kiểu đột biến gen mức độ b? ??nh 21 4.7 B? ??n đồ đột biến gen F9 b? ??nh nhân hemophilia. .. đồ đột biến gen F9 b? ??nh nhân hemophilia B Việt Nam 83 3.7.1 Phân b? ?? đột biến gen F9 83 3.7.2 Phân b? ?? đột biến domain phân tử FIX 84 v ii 3.7.3 B? ??n đồ đột biến gen F9 b? ??nh nhân hemophilia

Ngày đăng: 16/08/2022, 13:26

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
22. Peyvandi, F., T. Kunicki, and D. Lillicrap, Genetic sequence analysis of inherited bleeding diseases. Blood, 2013. 122(20): p. 3423-31 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Genetic sequence analysis ofinherited bleeding diseases
23. Veltkamp, J., et al., Another genetic variant of haemophilia B: haemophilia B Leyden. 1970. 7(2): p. 82-90 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Another genetic variant of haemophilia B: haemophiliaB Leyden
24. Kasper, C.K. and J.C. Lin, Prevalence of sporadic and familial haemophilia.Haemophilia, 2007. 13(1): p. 90-2 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Prevalence of sporadic and familial haemophilia
25. Goodeve, A.C., A. Pavlova, and J. Oldenburg, Genomics of bleeding disorders. Haemophilia, 2014. 20 Suppl 4: p. 50-3 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Genomics of bleedingdisorders
26. Hospital, N.U., Health information. https://www.nuh.com.sg/Health- Information/Diseases-Conditions/Pages/Haemophilia-(Children).aspx Sách, tạp chí
Tiêu đề: Health information
27. WFH and Severity of hemophilia. https://elearning.wfh.org/elearning-centres/introduction-to-hemophilia/#severity_of_hemophilia, 2012 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Severity of hemophilia
28. Chuah, M.K., H. Evens, and T. VandenDriessche, Gene therapy for hemophilia. 2013. 11(s1): p. 99-110 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gene therapy forhemophilia
29. Ohmori, T., Advances in gene therapy for hemophilia: basis, current status, and future perspectives. Int J Hematol, 2020. 111(1): p. 31-41 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Advances in gene therapy for hemophilia: basis, current status,and future perspectives
30. Gilgunn, S., Gene therapy for haemophilia: an update on progress in clinical trials. The Journal of Haemophilia Practice, 2015. 2(1): p. 3-5 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gene therapy for haemophilia: an update on progress in clinical trials
31. Schutgens, R., Gene Therapy in Hemophilia: From Hype to Hope.Hemasphere, 2018. 2(2): p. e37 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Gene Therapy in Hemophilia: From Hype to Hope
32. Perrin, G.Q., R.W. Herzog, and D.M. Markusic, Update on clinical gene therapy for hemophilia. Blood, 2019. 133(5): p. 407-414 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Update on clinical genetherapy for hemophilia
33. Geddes, V.A. and R.T. MacGillivray, The molecular genetics of hemophilia B. Transfus Med Rev, 1987. 1(3): p. 161-70 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The molecular genetics of hemophiliaB
34. Ziedins, K.B. and K.G.J.T.o.H. Mann, Overview of h emostasis. 2010: p. 7- 12 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Overview of h emostasis
35. Schmidt, A.E. and S.P.J.T.i.c.m. Bajaj, Structure–function relationships in factor IX and factor IXa. 2003. 13(1): p. 39-45 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Structure–function relationships in factor IX and factor IXa
36. Callaghan, M. and R.J.T.o.H.n.e.C. Kaufman, UK: Wiley-Blackwell, Cellular processing of factor VIII and factor IX. 2010: p. 13-23 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Cellular processing of factor VIII and factor IX
37. Smith, S.B. and D. Gailani, Update on the physiology and pathology of factor IX activation by factor XIa. Expert Rev Hematol, 2008. 1(1): p. 87-98 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Update on the physiology and pathology of factor IX activation by factor XIa
38. Gomez, K. and P. Chowdary, Hemophilia B: molecular basic, chapter 13.Textbook of Hemophilia. Royal Free Hospital, London, UK, 2014: p. 97- 102 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Hemophilia B: molecular basic, chapter 13.Textbook of Hemophilia
39. Vysotchin, A., L.V. Medved, and K.J.J.o.B.C. Ingham, Domain structure and domain-domain interactions in human coagulation factor IX. 1993.268(12): p. 8436-8446 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Domain structure and domain-domain interactions in human coagulation factor IX
40. Mathur, A. and S.P.J.J.o.B.C. Bajaj, Protease and egf1 domains of factor ixa play distinct roles in binding to factor VIIIa importance of helix 330 (helix 162 in chymotrypsin) of protease domain of factor IXa in its interaction with factoR VIIIa. 1999. 274(26): p. 18477-18486 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Protease and egf1 domains of factor ixaplay distinct roles in binding to factor VIIIa importance of helix 330 (helix 162 in chymotrypsin) of protease domain of factor IXa in its interaction withfactoR VIIIa
41. Schmidt, A.E. and S.P. Bajaj*, Structure–Function Relationships in Factor IX and Factor IXa. Trends Cardiovasc Med, 2003. 13(1) Sách, tạp chí
Tiêu đề: Structure–Function Relationships in FactorIX and Factor IXa

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w