Bài viết Nghiên cứu sự lưu hành của Rotavirus gây tiêu chảy ở bò tại Nghệ An và vùng phụ cận được thực hiện nhằm xác định sự có mặt của Rotavirus trong các mẫu phân tiêu chảy của bò nuôi tại Nghệ An và vùng phụ cận.
Vietnam J Agri Sci 2022, Vol 20, No 7: 883-891 Tạp chí Khoa học Nơng nghiệp Việt Nam 2022, 20(7): 883-891 www.vnua.edu.vn Vũ Thị Ngọc1, Huỳnh Thị Mỹ Lệ1, Lê Văn Phan1, Mai Thị Ngân1, Trần Thị Hương Giang1, Nguyễn Văn Giáp1, Đặng Hữu Anh1, Lê Văn Trường1, Bùi Thị Phương Thảo2 Khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam Công ty Cổ phần Xuân Thiện Thanh Hóa * Tác giả liên hệ: vtngoc@vnua.edu.vn Ngày nhận bài: 21.03.2022 Ngày chấp nhận đăng: 27.05.2022 TÓM TẮT Rotavirus bò (Bovine Rotavirus - BRV) coi tác nhân gây bệnh tiêu chảy bị, đặc biệt bê Nghiên cứu thực nhằm xác định có mặt Rotavirus mẫu phân tiêu chảy bị ni Nghệ An vùng phụ cận Kết chẩn đoán phương pháp RT-PCR cho thấy có 29/142 (20,42%) mẫu phân tiêu chảy bê cho kết dương tính với BRV Tỷ lệ dương tính BRV cao nhóm bê 0-1 tháng tuổi (24,75%), sau đến nhóm bê 2-3 tháng tuổi (10,34%) Tỷ lệ nhiễm BRV nhóm bê tháng tuổi thấp với 0,08% Kết giải trình tự gen phân tích trình tự gen VP1 cho thấy chủng Rotavirus nghiên cứu thuộc nhóm di truyền R2, nhóm di truyền với chủng virus vacxin MVS-BRV1 phân lập Mỹ năm 1998 Từ khóa: Rotavirus, tiêu chảy, bị, RT-PCR, gen VP1 Prevalence of Bovine Coronavirus Causing Diarrhea in Cattle in Nghe An and Surrounding Provinces ABSTRACT Bovine Rotavirus is considered a major cause of diarrhea in cattle, especially in calves This study was carried out to find the prevalence of Bovine Rotavirus causing diarrhea in calves in Nghe An and surrounding provinces The detection of the virus using the RT-PCR method showed that 29/142 (20.42%) stool samples of diarrhea calves were positive for Bovine Rotavirus The positive rate of Bovine Rotavirus was the highest in the group of calves under 1-month-old (24.75%), followed by the calf group from to months old (10.34%) The rate of Rotavirus infection in calves over months old was rather low, only 0.08% The VP1 gene sequencing and analysis revealed that the BRV strains isolated in the present study belonged to the R2 group, the same as the US vaccine strain MVS-BRV1 isolated in the US in 1998 Keywords: Bovine Rotavirus, diarrhea, calves, RT-PCT, VP1 gene 883 Nghiên cứu lưu hành Rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận - - µ µ ° µ µ µ µ ° 884 Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn Giáp, Đặng Hữu Anh, Lê Văn Trường, Bùi Thị Phương Thảo ° ° - ° - ° ° ° ° Tỉnh Số mẫu kiểm tra Dương tính Số mẫu Tỷ lệ (%) 12 26,08 Hà Tĩnh 46 Ninh Bình 26 15,38 Nghệ An 51 10 19,06 Thanh Hóa 19 15,79 Tổng 142 29 20,42 885 Nghiên cứu lưu hành Rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận 886 Tháng tuổi Số mẫu kiểm tra 0-1 Dương tính Số mẫu Tỷ lệ (%) 101 25 24,75 2-3 29 10,34 >3 12 0,08 Tổng 142 29 20, 42 Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn Giáp, Đặng Hữu Anh, Lê Văn Trường, Bùi Thị Phương Thảo Chủng 10 11 12 HT59/2021 TH63/2021 100,0 NA2/2021 100,0 LC367314/Human-wt/THA/DB2015-066/2015/G10P[14] 98,6 98,6 KC215476/Vaccine/USA/MVS-BRV1/1998/G1P[5] 94,0 94,0 94,0 94,0 AB853890/Cow-wt/JPN/Tottori-SG/2013/G15P[14] 91,9 91,9 91,9 91,4 EF560615/Cow-tc/USA/WC3/1981/G6P[5] 90,8 90,8 90,8 90,8 91,7 97,0 HM988967/Cow/Korea/KJ-9-1/2006/G6P[7] 91,0 91,0 91,0 91,0 93,3 96,3 AB748574/Cow-tc/JPN/BRV106/1983/G6P[1] 90,5 90,5 90,5 90,1 91,9 97,2 96,5 98,6 JX567760/Human-wt/AUS/V585/2011/G10P[14] 91,4 91,4 91,4 91,4 92,8 96,7 96,5 95,8 96,7 EF583041/Human-tc/USA/Se584/1998/G6P[9] 92,6 92,6 92,6 92,1 92,6 95,6 94,9 94,7 95,1 DQ870493/Cow-tc/USA/NCDV/1967/G6P[6] 93,1 93,1 93,1 92,6 94,4 96,5 95,4 96,0 96,5 96,0 96,7 X55444/Cow-tc/GBR/UK/1973/G6P[5] 93,7 93,7 93,7 93,7 99,7 93,3 91,7 93,3 91,9 92,6 92,6 94,4 10 11 12 Chủng virus 100,0 98,6 93,3 96,0 95,6 HT59/2021 TH63/2021 100,0 NA2/2021 100,0 100,0 LC367314/Human-wt/THA/DB2015-066/2015/G10P[14] 98,6 98,6 98,6 KC215476/Vaccine/USA/MVS-BRV1/1998/G1P[5] 99,3 99,3 99,3 99,3 AB853890/Cow-wt/JPN/Tottori-SG/2013/G15P[14] 99,3 99,3 99,3 99,3 EF560615/Cow-tc/USA/WC3/1981/G6P[5] 97,2 97,2 97,2 97,2 97,9 97,9 HM988967/Cow/Korea/KJ-9-1/2006/G6P[7] 99,3 99,3 99,3 99,3 100,0 100,0 97,9 AB748574/Cow-tc/JPN/BRV106/1983/G6P[1] 99,3 99,3 99,3 99,3 100,0 100,0 97,9 100,0 JX567760/Human-wt/AUS/V585/2011/G10P[14] 98,6 98,6 98,6 98,6 99,3 99,3 97,2 99,3 EF583041/Human-tc/USA/Se584/1998/G6P[9] 98,6 98,6 98,6 98,6 99,3 99,3 97,2 99,3 99,3 98,6 DQ870493/Cow-tc/USA/NCDV/1967/G6P[6] 99,3 99,3 99,3 99,3 100,0 100,0 97,9 100,0 100,0 99,3 99,3 X55444/Cow-tc/GBR/UK/1973/G6P[5] 98,6 98,6 98,6 98,6 99,3 99,3 97,2 99,3 99,3 98,6 98,6 100,0 99,3 99,3 887 Nghiên cứu lưu hành rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận ↔ ↔ ↔ 888 Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn Giáp, Đặng Hữu Anh, Lê Văn Trường, Bùi Thị Phương Thảo 889 Nghiên cứu lưu hành rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận Alfieri A.A., Parazzi M.E., Takiuchi E., Médici K.C & Alfieri A.F (2006) Frequency of group A Rotavirus in diarrhoeic calves in Brazilian cattle herds, 1998-2002 Tropical Animal Health and Production 38: 7-8 Asano K.M., de Souza S.P., de Barros I.N., Ayres G.R., Silva S.O.S., Richtzenhain L.J & Brandão P.E (2010) Multiplex semi-nested RT-PCR with exogenous internal control for simultaneous detection of bovine coronavirus and group A Rotavirus Journal of virological methods 169(2): 375-379 Badaracco A., Garaicoechea L., Rodríguez D., LougeUriarte E., Odn A., Bilbao G., Galarza R., Abdala A., Fernandez & Parreño V (2012) Bovine Rotavirus strains circulating in beef and dairy herds in Argentina from 2004 to 2010 Veterinary Microbiology 158(3-4): 394-399 Bendali F., Bichet H., Schelcher F & Sanaa M (1999a) Pattern of diarrhoea in newborn beef calves in south-west France Vet Res 30: 61-74 Dodet B., Heseltine E., Mary C & Saliou P (1997) Rotaviruses in human and veterinary medicine Article in French 7(3):195-9 Epérez., Akummeling., Hjanssen M.M., Cjiménez., Ralvarado., Mcaballero., Pdonado & Hdwingera R (1998) Infectious agents associated with diarrhoea of calves in the canton of Tilarán, Costa Rica Preventive Veterinary Medicine 33(1-4): 195-205 Falcone E., Tarantino M., Di Trani L., Cordioli P., Lavazza A & Tollis M (1999) Determination of 890 Bovine Rotavirus G and P Serotypes in Italy by PCR Research Article Journal of Clinical Microbiology logo 37(12): 3879-3882 Hasoksuz H., Armando E.H., Steven C.L., Thomas E.W., Paul R.N & Linda J.S (2002) Detection of respiratory and enteric shedding of bovine coronaviruses in cattle in an Ohio feedlot J Vet Diagn Invest 14(4): 308-313 Hasoksuz H., Lathrop S., Aldubaib M.A., Lewis P & Saif L.G (1999) Antigenic variation among bovine enteric coronaviruses (BECV) and bovine respiratory coronaviruses (BRCV) detected using monoclonal antibodies Arch Virol 144(12): 2441-7 Holland R.E (1990) Some infectious causes of diarrhea in young farm animals Clinical Microbiological Reviews 3: 345-375 Hoshino Y & Kapikian A.Z (2000) Rotavirus serotypes: classification and importance in epidemiology, immunity, and vaccine development J Health Popul Nutr 18: 5-14 House J.A (1978) Economic impact of Rotavirus and other neonatal disease agents of animals J Am Vet Med Assoc 173(5 Pt 2): 573-576 Jelle M & Marc V.R (2012) Genotype constellation and evolution of group A Rotaviruses infecting humans Curr Opin Virol 2(4): 426-433 Jelle M., Christiaan A.P., Max C., Viviana P., Vito M., Krisztián B., Lorena G., Enzo A.P., Luis N., Mark Z., Serenella A., Giuseppe G., Mustafizur R & Marc V.R (2009) Are human P [14] Rotavirus strains the result of interspecies transmissions from sheep or other ungulates that belong to the mammalian order Artiodactyla Journal of virology 83(7): 2917-2929 Jelle M., Max C., Mustafizur R., Houssam A., Krisztián B., Mary K.E., Jon R.G., Miren I.G., Carl D.K., Vito M., Peter P.C., Osamu N., John T.P., Franco M.R., Linda J.S., Norma S., Andrej S., Koki T., Ulrich D & Marc V.R (2008) Recommendations for the classification of group A Rotaviruses using all 11 genomic RNA segments Archives of virology 153(8): 1621-1629 Junichi S., Hiroshi T., Takeshi M., Goro S., Takashi S & Tohru S (2013) Whole-genome analysis of two bovine Rotavirus C strains: Shintoku and Toyama J Gen Virol 94(1):128-135 Karen M.A., Asano S.P.S., Iracema N.B., Giselle R.A., Sheila O.S.S., Leonardo J.R & Paulo E.B (2010) Multiplex semi-nested RT-PCR with exogenous internal control for simultaneous detection of bovine coronavirus and group A Rotavirus Journal of virological methods 169(2): 375-379 Kindler E., Trojnar E., Heckel G., Otto H.P & Johne R (2013) Analysis of Rotavirus species diversity Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn Giáp, Đặng Hữu Anh, Lê Văn Trường, Bùi Thị Phương Thảo and evolution including the newly determined fulllength genome sequences of Rotavirus F and G Infection Genetics and Evolution 14: 58-67 Kirkness E., McAllen J.K., Halpin R., Fedorova N., Overton L., Stockwell T., Amedeo P., Appalla L., Bishop B., Edworthy P., Gupta N., Hoover J., Katzel D., Li K., Schobel S., Shrivastava S., Thovarai V., Wang S., Hoshino Y., Kapikian A., Rippinger C & Wentworth D.E.a.P.J (2014) National Library of Medicine Retrieved from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC215476.1 on Dec 10, 2021 Lai H.C., Lin S.J & Lin H.R (2005) Phylogenetic analyses of human Rotavirus in central Taiwan in 1996, 2001 and 2002 J Clin Virol 32: 199-217 Lin Y.P., Chang S.Y & Kao C.L (2006) Molecular epidemiology of G9 Rotaviruses in Taiwan between 2000 and 2002 J Clin Microbiol 44: 3686-3694 Madadgar O., Nazaktabar A., Keivanfar H., Salehi T.Z & Zadeh S.L (2015) Genotyping and determining the distribution of prevalent G and P types of group A bovine Rotaviruses between 2010 and 2012 in Iran Veterinary Microbiology 179(3-4): 190-196 Madadgar O., Nazaktabar A., Keivanfar H., Zahraei T & Salehi (2015) Genotyping and determining the distribution of prevalent G and P types of group A bovine Rotaviruses between 2010 and 2012 in Iran Vet Microbiol 179(3): 190-196 Matthijnssens J., Ciarlet M., Heiman E., Arijs I., Delbeke T., McDonald S.M., Palombo E.A., Iturriza-Gómara M., Maes P & Patton J.T (2008a) Full genome-based classification of Rotaviruses reveals a common origin between human Wa-Like and porcine Rotavirus strains and human DS-1-like and bovine Rotavirus strains Journal of virology 82(7): 3204-3219 Mawatari T., Taneichi A., Kawagoe T., Hosokawa M., Togashi K & Tsunemitsu H (2004) Detection of a bovine group C Rotavirus from adult cows with diarrhea and reduced milk production J Vet Med Sci 66: 887-890 Nguyễn Văn Chào, Nguyễn Xuân Hòa, Phan Vũ Hải & Phạm Hoàng Sơn Hưng (2014) Ứng dụng phương pháp ELISA xác định nguyên nhân gây tiêu chảy bê nuôi địa bàn phường ven thành phố Huế Tạp chí Khoa học, Đại học Huế 94(6) Park S.I., Kim H J & Cho K.O (2010) Genotyping of G8 and G6 Korean bovine Rotaviruses reveals multiple reassortments of their genomes from porcine and human Rotaviruses Vet Microbiol 144(3): 274-286 Philip R Dormitzer, Zhen-Yu J Sun, Gerhard Wagner & Stephen C Harrison (2002) The rhesus Rotavirus VP4 sialic acid binding domain has a galectin fold with a novel carbohydrate binding site Embo J 21(5): 885-897 Pisanelli G., Martella V., Pagnini U., DeMartino L., Lorusso E., Iovane G & Buonavoglia C (2005) Distribution of G (VP7) and P (VP4) genotypes in buffalo group A Rotaviruses isolated in Southern Italy Veterinary Microbiology 110: 1-6 Rathi R., Kadian S.K., Khurana B., Grover Y.P & Gulati B.R (2007) Evaluation of immune response to bovine Rotavirus following oral and intraperitoneal inoculation in mice Indian Journal of Experimental Biology 45: 212-216 Reynolds D.J., Debney T.G., Hal G.A., Thomas L.H & Parsons K.R (1985) Studies on the relationship between coronaviruses from the intestinal and respiratory tracts of calves Arch Virol 85(1-2): 71-83 Saif L.J & Smith K.L (1985) Enteric viral infections of calves and passive immunity J Dairy Sci 68(1): 206-28 Snodgrass D.R (1986) Evaluation of a combined Rotavirus and enterotoxigenic Escherichia coli vaccine in cattle Vet Rec 119(2): 39-42 Storz J., Purdy C.W., Lin X., Burell M., Truax R.E., Briggs R.E., Frank G.H & Loan R.W (2000) Isolation of respiratory bovine coronavirus, other cytocidal viruses, and Pasteurella spp from cattle involved in two natural outbreaks of shipping fever J Am Vet Med Assoc 216(10): 1599-604 Tacharoenmuang R., Komoto S., Guntapong R., Ide T., Singchai P., Upachai S., Fukuda S., Yoshida Y., Murata T & Yoshikawa T (2018) Characterization of a G10P [14] Rotavirus strain from a diarrheic child in Thailand: Evidence for bovine-to-human zoonotic transmission Infection, Genetics and Evolution 63: 43-57 Torres M., Alfonso., Schlafer., Donald H., Mebus & Charles A (1985) Rotaviral and Coronaviral Diarrhea Veterinary Clinics of North America: Food Animal Practice 1(3) Umer S.M., Munera A.U & Fufa D.B (2021) Rotavirus in Calves and Its Zoonotic Importance Vet Med Int 2021:6639701 doi: 10.1155/2021/6639701 Wu F.T., Bányai K & Huang J.C (2011) Diverse origin of P [19] Rotaviruses in children with acute diarrhea in Taiwan: Detection of novel lineages of the G3, G5, and G9 VP7 genes J Med Virol 83: 1279-87 Wu F.T., Liang S.Y & Tsao K.C (2009) Hospitalbased surveillance and molecular epidemiology of Rotavirus infection in Taiwan, 2005-2007 Vaccine 27: F50-4 891 ... 887 Nghiên cứu lưu hành rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận ↔ ↔ ↔ 888 Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn Giáp, Đặng Hữu Anh,.. .Nghiên cứu lưu hành Rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận - - µ µ ° µ µ µ µ ° 884 Vũ Thị Ngọc, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Lê Văn Phan, Mai Thị Ngân, Trần Thị Hương Giang, Nguyễn Văn... Phương Thảo 889 Nghiên cứu lưu hành rotavirus gây tiêu chảy bò Nghệ An vùng phụ cận Alfieri A.A., Parazzi M.E., Takiuchi E., Médici K.C & Alfieri A.F (2006) Frequency of group A Rotavirus in diarrhoeic