Hệ enzyme thủy phân arabinoxylan rất phong phú và đa dạng, trong đó là endo-1,4-β-xylanase là nhóm enzyme quan trọng nhất, tác động ngẫu nhiên vào mạch chính của khung xylan và giải phóng ra các arabinoxylan oligosacaride như các loại đường D-xylose, xylobiose, L-arabinose, xylotetraose, xylopentose. Nhóm enzyme này dễ dàng được sản xuất từ các chủng vi sinh vật tự nhiên như vi khuẩn, nấm men, nấm sợi và cũng được nghiên cứu sử dụng công nghệ tái tổ hợp để chuyển gene vào các vật chủ thích hợp nhằm chủ động về chủng giống.