Kế toán thuế nói chung và kế toán thuế GTGT nói riêng luôn là vấn đề được kế toán viên và ban lãnh đạo công ty quan tâm hàng đầu. Bởi vì thuế là một khỏan thu cho Ngân sách Nhà nước, nếu làm sai công ty có thể bị truy cứu trước pháp luật.
Thuế hiện nay được Nhà nước theo dõi và quan tâm đặc biệt. Điều đó được thể hiện thông qua các quyết định, các thông tư về thuế liên tục thay đổi có sự thay đổi sao cho phù hợp với tình hình kinh tế trong và ngoài nước. Vì thế luôn cập nhật những thông tin nhạy bén, đổi mới tư tưởng, áp dụng khoa học, kĩ thuật là vấn đề tất yếu mà các kế toán viên cần thiết trong thời buổi hiện nay.
Kế toán GTGT đã có những thay đổi rất lớn trong những năm qua. Điều đó yêu cầu không những kế toán viên không những phải cập nhật thông tin kịp thời mà còn phải nhanh chóng hoàn thiện kĩ năng, trình độ, khả năng phản ứng linh hoạt để đáp ứng nhu cầu hiện nay.
Có thể nói từ khi thành lập đến nay, công ty cổ phần mía đường Nông Cống đã có được những bước đi thuận lợi, vững chắc đạt được hiệu quả cao, điều đó được thể hiện ở những thành tích mà công ty đã đóng góp cho xã hội. Hiện nay đóng góp vào Ngân sách Nhà nước của công ty ngày càng tăng và công ty được đánh giá là một trong những doanh nghiệp làm ăn có hiệu quả. Cùng với sự phát triển của công ty, bộ máy kế toán cũng ngày càng hoàn thiện và có những đóng góp rất to lớn về vấn đề tài chính giúp cho công ty đứng vững và có sức cạnh tranh trong nền kinh tế thị trường. công ty luôn áp dụng và thực hiện tốt chế độ kế toán mới do BTC ban hành. Công tác hạch toán kế toán trên cơ sở vận dụng linh hoạt nhưng vẫn tuân thủ nguyên tắc kế toán nhờ đó đảm bảo cung cấp đầy đủ, chính xác và kịp thời nhu cầu thông tin cho quá trình quản lý.
Việc tổ chức bộ máy kế toán tập trung như hiện nay đã đảm bảo cho kế toán phát huy đầy đủ vai trò, chức năng của mình. Bộ máy kế toán của công ty được tổ
chức tương đôi khoa học hợp lý, phù hợp với yêu cầu của công việc và phù hợp với chuyên môn của từng người.
Công ty cổ phần mía đường Nông Cống có bộ máy kế toán tương đối gọn nhẹ, nghiệp vụ phát sinh trong tháng , quý… không nhiều. Tuy nhiên, Công ty vẫn thực hiện đầy đủ các thành phần kế toán theo yêu cầu quản lý của Công ty và BTC. Công ty đã bắt đầu ứng dụng phần mềm kế toán đối với việc quản lý tài chính, tuy vậy việc thực hiện kế toán trên sổ vẫn là chủ yếu, phần mềm kế toán mà công ty sử dụng chỉ như một công cụ hỗ trợ cho việc tính toán. Chính nhờ vậy mà giảm nhẹ được khối lượng công việc và nâng cao hiệu quả công tác kế toán. Công tác kế toán của công ty đều tuân thủ nghiêm ngặt theo đúng những quy định của BTC, đặc biệt là trong kế toán về thuế nói chung và thuế GTGT nói riêng. Công ty đều thực hiện theo đúng thông tư hướng dẫn, khi có bất kỳ một sự sửa đổi nào về luật thuế GTGT, đơn vị đều làm những hướng dẫn mới nhất của cơ quan thuế.