Trong giai đoạn người nộp thuế tự khai tự nộp, tự chịu trách nhiệm như hiện nay, việc quản lý thuế của cơ quan thuế ban đâu được giảm bớt tuy nhiên khâu hậu kiểm lại trở nên cực kỳ quan trọng. Bởi chỉ có kiểm tra, thanh tra thì cơ quan thuế mới nắm được thông tin chấp hành pháp luật thuế của người nộp thuế, tránh tình trạng người nộp thuế khai sai, khai không chính xác dẫn tới
100
việc trốn lậu thuế gây thất thoát cho ngân sách nhà nước, tạo cơ hội cho việc buôn bán hóa đơn có cơ hội phát triển làm bất bình đẳng trong chính. Mục tiêu của công tác thanh tra, kiểm tra thuế nhằm phát hiện các hành vi gian lận thuế và các hành vi gian lận trong thương mại để trốn thuế và lậu thuế cũng nhu giảm xuống mức thấp nhất chênh lệch giữa số thuế tự kê khai và số thuế phải nộp theo luật thuế. Để thực hiện tốt công tác này thì chúng ta cần phải khắc phục những hạn chế của nó, cụ thể là:
- Cần phải thực hiện tốt cả hai mặt: thanh tra, kiểm tra đối tượng nộp thuế và thanh tra, kiểm tra nội bộ ngành thuế.
- Tránh tình trạng chồng chéo trong thanh tra, kiểm tra hiện này, cần có quy định pháp luật cụ thể về cơ quan có quyền kiểm tra, thanh tra thuế theo hướng chỉ có cơ quan thuế mới có quyền thanh tra, kiểm tra trong lĩnh vực này. Điều này sẽ giúp bảo vệ tốt hơn quyền, lợi ích của các bên, đồng thời tránh những sai phạm về thuế do yếu về pháp luật thuế do các ngành khác thực hiện.
- Cần phân định ranh giới, giới hạn phạm vi thanh tra, kiểm tra để cuộc thanh tra không làm ảnh hưởng đến quá trình kinh doanh của người nộp thuế.
- Củng cố bộ máy, đội ngũ kiểm tra, thanh tra thuế, nguồn lực phân bổ cho công tác này.
- Thực hiện nghiêm túc quy trình thanh tra, kiểm tra thuế, hạn chế những tiêu cực xảy ra trong quá trình thực hiện
Tăng cường sự phối hợp với các cơ quan có liên quan như: cơ quan Hải quan, cơ quan Công an trong việc giám sát, điều tra xử lý các đối tượng có dấu hiệu vi phạm và vi phạm trong hoàn thuế.