Khi kết quả điều tra sơ bộ của điều tra viờn cho thấy cú dấu hiệu của hành vi cạnh tranh khụng lành mạnh, Thủ trưởng Cơ quan quản lý cạnh tranh ra quyết định điều tra chớnh thức. Thời hạn điều tra chớnh thức là 90 ngày và được ra hạn một lần nhưng khụng quỏ 60 ngày theo phờ chuẩn của Thủ trưởng Cơ quan quản lý cạnh tranh. Trong giai đoạn này, Cơ quan quản lý cạnh tranh cú nhiều hoạt động mang tớnh chất tố tụng đặc thự như: Trưng cầu giỏm định, ỏp dụng cỏc biện phỏp ngăn chặn hành chớnh.
Trưng cầu giỏm định do cỏc bờn hoặc điều tra viờn kiến nghị và do Thủ trưởng Cơ quan quản lý cạnh tranh quyết định.
Cỏc biện phỏp ngăn chặn hành chớnh do bờn khiếu nại hoặc điều tra viờn kiến nghị và do Thủ trưởng Cơ quan quản lý cạnh tranh quyết định.
Tại giai đoạn này, mỗi hoạt động của điều tra viờn đều phải được ghi lại rừ ràng dưới hỡnh thức biờn bản. Biờn bản phải nờu đầy đủ cỏc nội dung: Thời gian, địa điểm, người tiến hành điều tra, bờn bị điều tra, nội dung điều tra, khiếu nại, yờu cầu của bờn bị điều tra. Đõy là yếu tố mang tớnh chất đặc thự của tố tụng cạnh tranh khi điều tra viờn khụng chỉ điều tra vụ việc mà cũn lắng nghe và ghi nhận quan điểm của bờn bị điều tra; cú thể hiểu, việc ghi nhận như một hỡnh thức giỏn tiếp của việc phản tố và tranh tụng giữa bờn bị khiếu nại và bờn khiếu nại. Trờn cơ sở cỏc biờn bản điều tra, điều tra viờn cú thể xỏc định một cỏch cú căn cứ rằng bờn bị điều tra cú hay khụng cú đó hoặc đang thực hiện hành vi cạnh tranh khụng lành mạnh.
Trường hợp vụ việc cạnh tranh cú dấu hiệu phạm tội. Hành vi cạnh tranh khụng lành mạnh cú tớnh nguy hiểm cho xó hội, tớnh cú lỗi, tớnh trỏi phỏp luật hỡnh sự và tớnh phải chịu hỡnh phạt, điều tra viờn kiến nghị với Thủ trưởng Cơ quan quản lý cạnh tranh xem xột chuyển hồ sơ đến cơ quan cú thẩm quyền. Và trong trường hợp, cơ quan cú thẩm quyền khi thấy khụng cú căn cứ để khởi tố vụ ỏn hỡnh sự thỡ phải trả lại cho Cơ quan quản lý cạnh tranh tiếp tục điều tra. Thời hạn điều tra trong trường hợp này được tớnh lại từ ngày nhận lại hồ sơ.
Khi kết thỳc quỏ trỡnh điều tra, Luật Cạnh tranh khụng cú điều khoản quy định về việc bỏo cỏo đối với vụ việc cạnh tranh khụng lành mạnh, tuy nhiờn cú thể hiểu theo quy định của cơ quan hành chớnh, điều tra viờn phải chuyển bỏo cỏo cựng toàn bộ hồ sơ vụ việc lờn Cục trưởng Cục quản lý cạnh tranh. Bỏo cỏo bao gồm: Túm tắt vụ việc, cỏc tỡnh tiết và chứng cứ được xỏc minh, đề xuất biện phỏp xử lý.