a.Các dự án quy hoạch
- Quy hoạch chi tiết phát triển nuôi trồng thuỷ sản vùng bãi bồi ven biển huyện Kim Sơn đến năm 2020. (Cả 3 vùng: trong đê BM2; vùng giữa đê BM1 và BM3; vùng ngoài đê BM3 đến Cồn Nổi).
- Quy hoạch phát triển nuôi trồng thuỷ sản các khu ruộng trũng đến năm 2020 ở các huyện: Gia Viễn, Nho Quan, Hoa Lƣ, Yên Mô, Yên Khánh, Thị xã Tam Điệp.
b.Các dự án đầu tƣ cơ sở hạ tầng nghề cá
- Đầu tƣ xây dựng hệ thống cấp thoát nƣớc vùng bãi bồi ven biển huyện Kim Sơn.
- Đầu tƣ hoàn thiện hệ thống cấp, tiêu nƣớc ở vùng chậm lũ: huyện Nho Quan, huyện Gia Viễn phục vụ nuôi thuỷ sản trên các vùng ruộng 1 vụ chiêm của 2 huyện Nho Quan, huyện Gia Viễn.
- Đầu tƣ nâng cấp các trại giống thuỷ sản.
- Đầu tƣ xây dựng trại thực nghiệm sản xuất thuỷ sản vùng bãi bồi ven biển huyện Kim Sơn.
c.Các dự án bảo tồn thủy sản
- Dự án xây dựng khu bảo tồn Cồn Nổi huyện Kim Sơn (Bảo tồn thiên nhiên và bãi đê)
- Dự án bảo tồn cá trầu, cá rô tổng trƣờng, cá bống đen, cá trạch cơm, cá bò vàng (Tam Cốc, Bích Động).
- Dự án bảo tồn khu ngập nƣớc Vân Long (Phục hồi bảo tồn loài cá cuống, cua lông, cá chép việt, cá quả,...).
d.Các dự án phát triển công nghệ
- Chuyển giao quy trình công nghệ sản xuất giống và nuôi thƣơng phẩm về các đối tƣợng thủy sản nƣớc ngọt nhƣ: cá rô đơn tính, cá diêu hồng, cá quả, cá trầu, cá rô đồng, tôm càng xanh.
- Dự án chuyển giao công nghệ sản xuất giống và nuôi thƣơng phẩm các đối tƣợng thủy sản vùng nƣớc lợ nhƣ: tôm sú, tôm chân trắng, tôm rảo, cua xanh, ngao và cá nƣớc lợ...