Hoạt động kênh phân phối của công ty còn xuất hiện những hạn chế trên là do gặp phải một số những nguyên nhân sau:
+ Cấu trúc kênh phân phối của công ty chưa hoàn thiện. Công ty chủ yếu chỉ thoái thác việc bán hàng cho các đại lý mà chưa quan tâm đến việc bán hàng trực tiếp từ những trụ sở của mình. Công ty cũng chưa tạo dựng cho mình được lực lượng bán hàng chủ chốt bởi vì bán hàng qua các trung gian như đại lý thì đôi khi họ sẽ quan tâm đến vấn đề lợi nhuân của riêng mình mà không ý thức việc quảng bá hình ảnh sản phẩm, thương hiệu của công ty.
+ Các thành viên trong kênh phân phối chưa có sự phối hợp chặt chẽ trong quá trình bao phủ thị trường, cạnh tranh với sản phẩm của các đối thủ, các sản phẩm thay thế, sản phẩm cạnh tranh.
+ Hoạt động nghiên cứu thị trường và nghiên cứu marketing chưa được chú ý do bộ phân chuyên phụ trách vấn đề này của công ty là phòng tiêu thụ chưa có những hoạt động nghiên cứu hay có những hoạt động xúc tiên trên thị trường mà họ gần như chỉ tập trung bán hàng cho các khách hàng lớn, sẵn có của công ty. Đó là một hạn chế lớn của công ty trong việc tìm kiếm khách hàng mới cho mình.
+ Hiện tại việc phân bổ kênh phân phối không đồng đều giữa các khu vực thị trường, có những khu vực thị trường có rất nhiều những cửa hàng, đại lý bán hàng của công ty nhưng lại có những khu vực địa bàn có đông dân cư sinh sống lại không có địa điểm nào bán hàng của công ty. Đây là một trong những thiếu sót trong việc phân bổ sắp xếp của công ty, ảnh hưởng đến hiệu quả hoạt động của kênh phân phối toàn hệ thống.
+ Hệ thống thông tin chưa cập nhật đầy đủ và kịp thời. Các thông tin cập nhật mới nhất về khách hàng, đối thủ cạnh tranh chưa được trao đổi qua lại thường xuyên giữa các thành viên trong hệ thống kênh.
Công ty đã thiết lập một hệ thông kênh phân phối hàng hóa xong đó là việc chỉ dừng lại ở mức xây dựng mà chưa có sự quản lý chặt chẽ. Công ty cũng chưa đưa ra những tiêu chuẩn đủ hợp lý để lựa chọn thành viên kênh một cách hiệu quả và chính xác. Việc này làm ảnh hưởng khá lớn đến việc tìm kiếm thêm khách hàng và quảng bá hình ảnh thương hiệu cho công ty. Bên cạnh đó công ty đã thực hiện chính sách ưu đãi khách hàng, chiết khấu và khuyến khích bán, còn có nhiều những dịch vụ hỗ trợ khác nhưng chưa đạt được hiệu quả cao. Việc đánh giá hoạt động các thành viên kênh do phòng tiêu thụ của công ty thực hiên định ký hàng năm nhưng việc đánh giá chỉ dựa
trên doanh số bán hàng của thành viên kênh đó nên chưa thể đánh giá một cách chính xác hiệu quả hoạt động của kênh trong năm. Ngoài ra thì việc kiểm soát hoạt động kênh ở các chi nhánh còn khá hời hợt. Bởi còn có những thành viên nhỏ trong kênh bán hàng chỉ quan tâm đến lợi ích riêng mình chứ không quan tâm lợi ích cả kênh mà bán phá giá sản phẩm, lấn át địa bàn, bán hàng chưa có ý thức quảng bá hình ảnh cho công ty và quảng cáo sản phẩm công ty. Điều này ảnh hưởng lớn đến hiệu quả hoạt động của kênh vì kênh phân phối là một hệ thống và hoạt động theo dạng chuỗi, nếu một mắt xích gặp vấn đề thì toàn bộ hệ thống kênh sẽ bị ảnh hưởng.