Nhìn chung, công tác hạch toán và tính giá thành sản phẩm may gia công của Công ty PHILKO VINA đã được thực hiện đúng với các quy định của chế độ kế toán hiện hành. Tuy nhiên, do mới đi vào hoạt động, bộ máy kế toán nói chung và công tác hạch toán tính giá thành sản phẩm gia công nói riêng vẫn còn bộc lộ những hạn chế nhất định.
Thứ nhất là Công ty nên có mảng kế toán quản trị riêng biệt phục vụ nhu cầu của quản lý. Công tác lập kế hoạch sản xuất, lên kế hoạch cho từng thời kỳ hoạt động, xây dựng định mức tiết kiệm trong các công đoạn...là rất cần thiết. Hiện nay, những công việc này được chia ra riêng rẽ ở các bộ phận như phòng kế hoạch, phòng kế toán,...như vậy thì gây nhiều rắc rối, khó khăn khi cần tập hợp các số liệu, lên các báo cáo nội bộ trong doanh nghiệp.
Thứ hai, theo quy định của chế độ kế toán hiện hành thì trong các khoản trích theo lương được đưa vào chi phí sản xuất trong kỳ có một khoản là Kinh phí công đoàn, tỷ lệ là 2% tính theo lương cơ bản của công nhân viên. Tuy nhiên, từ khi công ty đi vào hoạt động đến nay, Công ty chưa tham gia vào các tổ chức công đoàn của địa phương nên không thực hiện trích KPCĐ theo quy định. Khoản KPCĐ mà công nhân nộp đưa vào quỹ Công đoàn Công ty.
Thứ ba, trong quá trình bàn giao nguyên vật liệu chính từ giai đoạn này sang các giai đoạn khác của quá trình sản xuất, Công ty chưa có biện pháp kiểm soát chặt chẽ. Điều này có thể gây ra những sai sót hoặc gian lận nhất định trong tương lai. Công ty khó có thể kiểm tra được tình hình nguyên vật liệu bị hao hụt.
Thứ tư, kế toán tổng hợp đã hạch toán sai chi phí nhân công trực tiếp và chi phí nhân công gián tiếp. Trong quá trình sản xuất, bộ phận cắt may, đóng gói, hoàn thiện sản phẩm vẫn là những công nhân trực tiếp tham gia vào quá trình sản xuất sản phẩm, lương của họ phải được tính vào chi phí nhân công trực tiếp chứ không phải tính vào chi phí nhân công gián tiếp như kế toán đã làm ( Biểu số 2.8). Bên cạnh đó, chính sách tính lương của Công ty cho toàn bộ cán bộ công nhân viên là cách tính lương theo thời gian. Điều này chưa thực sự phù hợp với một doanh nghiệp sản xuất nói chung và với một doanh nghiệp may nói riêng. Cách tính lương theo thời gian cho toàn bộ công nhân sản xuất không những không kích thích được năng suất lao động mà còn gây ra áp lực cho công nhân khi làm việc, điều này dễ dẫn đến việc đình công nghỉ làm khi công nhân bị áp lực công việc cao hoặc gây lãng phí cho doanh nghiệp khi công nhân không thực sự làm việc đúng với năng suất của họ, không kích thích được năng suất của doanh nghiệp.
Thứ năm, mặc dù bộ phận kế toán đã được trang bị phần mềm kế toán SAS 5.0 nhưng hiện nay phần mềm này đã quá lạc hậu, không còn đáp ứng được các quy định về sổ sách, các mẫu chứng từ ...theo quy định hiện hành của bộ tài chính. Điều này sẽ gây cho kế toán viên rất nhiều khó khăn khi tổng hợp số liệu cuối năm và lập các báo cáo tài chính năm.