Bên cạnh những kết quả đạt được thì công tác đầu tư tín dụng đối với DNV&N tại VPBank còn những tồn tại nhất định. Cụ thể:
- Về thủ tục cho vay: còn quá cứng nhắc, chưa được linh hoạt nhất là các thủ tục về cầm cố thế chấp. Thời gian xét duyệt quyết định cho vay còn kéo dài làm lỡ kế hoạch, cơ hội kinh doanh của doanh nghiệp đó là do tình trạng quá tải đối với cán bộ tín dụng. Một cán bộ tín dụng cần quản lý nhiều khách hàng một lúc.
- Về chất lượng tín dụng: Trong những năm gần đây, tỷ trọng nợ quá hạn có giảm, tuy nhiên tỷ trọng này còn quá cao đó là do hậu quả của việc cấp tín dụng không đảm bảo, bảo lãnh mở L/C cho cổ đông vượt quá hạn mức. Các khoản nợ này phát sinh từ những năm trước nhưng đến nay vẫn chưa thu hồi được. Đây chính là nguyên nhân làm nên tình trạng khó khăn nhất của VPBank. Trong những năm gần đây do kinh nghiệm được rút ra từ bài học này là cho vay có đảm bảo 100% lại dẫn đến tình trạng cứng nhắc trong vấn đề thực hiện quy chế khi cho vay,
tỷ lệ nợ quá hạn được hạn chế rất nhiều chỉ tập trung nhiều vào các khoản cho vay trung và dài hạn trong khi tỷ trọng các khoản cho vay này thấp.
- Về tài sản đảm bảo: Cho vay đối với DNV&N vẫn phát sinh nợ quá hạn và tài sản đảm bảo khó có thể trở thành nguồn thu nợ thứ hai do tài sản có tính thị trường không cao. Trong nợ quá hạn khó đòi phát sinh ở các DNV&N nếu không có tài sản đảm bảo thì không có khả năng thu hồi.
Tài sản đảm bảo là bất động sản thì khó thu hồi phát mại do tính không hợp pháp về giấy tờ, hoặc không muốn xử lý tài sản thế chấp và xin trả dần mà không thực hiện. Tài sản đảm bảo là động sản thì hầu hết là dây chuyền sản xuất cũ, lạc hậu nên việc xử lý gặp nhiều khó khăn, giá trị thu hồi nhỏ. Thậm chí có những dây chuyền không bán được vì đã quá lạc hậu.