Để đánh giá rủi ro kiểm soát, KTV trong công ty đã sử dụng “ Bảng câu hỏi về HTKSNB”. Thực chất đó là việc KTV đánh giá sự hiện hữu và sự hoạt động có hiệu quả của HTKSNB của khách hàng. Để đánh giá về HTKSNB, KTV lần lượt tìm hiểu các nhân tố có ảnh hưởng đến HTKSNB. Các yếu tố ảnh hưởng đó là: Môi trường kiểm soát; Hệ thống kế toán; Thủ tục kiểm soát và Kiểm toán nội bộ.
Trước hết, Tìm hiểu về môi trường kiểm soát
Thông thường, KTV tìm hiểu các thông tin chung như: Bản chất và loại hình kinh doanh của doanh nghiệp; cơ cấu tổ chức; tổ chức nhân sự; năng lực của BGĐ; môi trường pháp lí của doanh nghiệp; ủy ban kiểm soát;...Để có được các thông tin này, KTV có thể phỏng vấn BGĐ khách hàng, nhân viên kế toán và các thành viên có vai trò quan trọng trong công ty.
Tiếp theo, Tìm hiểu về hệ thống kế toán của khách hàng
Kiểm toán viên tìm hiểu các thông tin: Chế độ kế toán mà doanh nghiệp đang áp dụng; có hay không có sự thay đổi chế độ kế toán mà doanh nghiệp áp dụng trong năm tài chính; số lượng nhân viên kế toán và sự thay đổi (nếu có); hình thức sổ kế toán mà doanh nghiệp đang áp dụng; cơ sở lập BCTC; nguyên tắc hạch toán HTK; nguyên tắc trích khấu hao; nguyên tắc ghi nhận doanh thu;…
Sau đó, Tìm hiểu về các thủ tục kiểm soát mà khách hàng đang áp
dụng
HTKSNB về mặt thiết kế và vận hành, làm cơ sở cho đánh giá rủi ro kiểm soát trên Báo cáo tài chính
Cuối cùng, Tìm hiểu về HTKSNB
KTV dựa vào bảng câu hỏi đánh giá về hệ thống kiểm soát nội bộ đưa ra một loạt các câu hỏi liên quan đến các yếu tố về môi trường kiểm soát, hệ thống kế toán, thủ tục kiểm soát và kiểm toán nội bộ.