Năm 2005, do hoạt động kinh doanh của Ngân hàng có nhu cầu cần mở rộng và cần có một trụ sở chính tại Hà Nội để thuận tiện hơn cho hoạt động của Ngân hàng, MSB đã trình hồ sơ lên Giám đốc NHNN xin chuyển trụ sở chính từ Thành phố Hải Phòng về Thành phố Hà Nội tại số nhà 44 Nguyễn Du, Hai Bà Trưng. Đồng thời ngày 1/6/2005, HĐQT Ngân hàng TMCP Hàng hải Việt Nam cũng có quyết định thành lập SGD Ngân hàng TMCP Hàng hải Việt Nam tại số nhà 44 Nguyễn Du, Hai Bà Trưng, Hà Nội. SGD Ngân hàng TMCP Hàng Hải Việt Nam có con dấu, là đơn vị phụ thuộc, có nhiệm vụ thực hiện kinh doanh tiền tệ đúng theo các quy định của pháp luật, của NHNN và của MSB.
Từ đó đến nay SGD luôn xây dựng và phát triển hình ảnh của Ngân hàng cụ thể là:
- Cơ sở vật chất kỹ thuật công nghệ được tăng cường.
- Sản phẩm và dịch vụ ngân hàng phong phú và đa dạng, nhờ đó nguồn vốn huy động của sở đã tăng đáng kể.
- Kinh doanh ngoại hối phát triển.
- Đội ngũ cán bộ nhân viên trẻ, năng động, nhiệt tình, có trình độ, nghiệp vụ chuyên môn cao.
- Đưa văn hóa bán hàng vào môi trường kinh doanh, thúc đẩy các phòng tín dụng của Sở chủ động hơn trong việc tìm kiếm nguồn khách hàng mới, song song với việc chăm sóc khách hàng hiện có.
- Số lượng phòng giao dịch tăng, tính đến nay, trừ trụ sở của Sở đặt tại số nhà 44 Nguyễn Du, thì số phòng giao dịch của sở đã tăng lên là 5 phòng , được phân bố tại Quận Đống Đa, Quận Hoàn Kiếm và Quận Hai Bà Trưng, nhằm phát triển hoạt động thanh toán đồng thời cung cấp các tiện ích ngân hàng cho người dân trên địa bàn các quận, đồng thời nhằm phục vụ tốt hơn những khách hàng sẵn có của SGD.