Ngành thương mại dịch vụ của huyện cũng phát triển nhanh chóng với các hình thức kinh doanh, các mặt hàng phong phú. Năm 2006 huyện có 167 doanh nghiệp hoạt động thương mại dịch vụ, 5,050 hộ kinh doanh, thu hút 9,678 lao động, giá trị sản xuất ước đạt 208,540 triệu đồng, tăng 20% so với năm 2005. Năm 2007 ước đạt 133,720 tăng 23,2% so với cùng kỳ. Năm 2008, thị trường giá cả trong nước không ổn định nên giá trị sản xuất thương mại dịch vụ
của huyện chỉ đạt 174,297 triệu đồng giảm 3,7% so với năm 2007. Năm 2009, Thành phố có biện pháp kích cầu, đồng thời huyện tổ chức hội chợ làng công nghiệp, tiểu thủ công nghiệp lần thứ hai đã thành công, đã đẩy mạnh hoạt động thương mại dịch vụ của huyện. Hơn nữa huyện còn phối hợp với các huyện ngoại thành, các làng nghề quận Hoàng Mai, Thường Tín, Phú Xuyên, Thanh Oai, Trung tâm khuyến nông Hà Nội để quảng bá, giới thiệu sản phẩm tới người tiêu dùng. Mạng lưới chợ trên địa bàn huyện được xây dựng lại bao gồm chợ Đông Mỹ, Tứ Hiệp, Yên Mỹ. Nhờ tất cả các biện pháp tích cực trên, năm 2009, giá trị thương mại của huyện đạt 207,413 triệu đồng, tăng 19% so với cùng kỳ. Giữa năm 2010, toàn huyện có 1002 doanh nghiệp và 5.630 hộ kinh doanh; trung tâm thương mại của huyện được hoàn thành và đưa vào sử dụng, xây dựng 6 chợ mới, tạo điều kiện cho các hộ kinh daonh phát triển…Tính chung trong 5 năm thương mại dịch vụ trên địa bàn huyện tăng bình quân 22,4% và là nhóm ngành có tốc độ tăng trưởng lớn nhất và có cơ cấu GTSX là đứng thứ 2 chiếm 19,8%.