Quản lý hoạt động dạy của GV nói chung và GV môn hóa học nói riêng là nhiệm vụ quan trong nhất trong công tác quản lý nhà trường. Hiện nay, các trường đều đã và đang tiến hành đổi mới phương pháp dạy học. Tuy nhiên vấn đề đổi mới phương pháp đang triển khai trong các nhà trường vẫn còn nhiều tồn tại, đặc biệt là đối với bộ môn hóa học Năm học vừa qua, dư luận lại nóng lên về chất lượng môn hóa học. Thực tế điều tra trong trường học cho thấy, đa số học sinh thấy khó khi học môn hóa học. Việc học sinh thấy khó khi học môn hóa học, chất lượng môn hóa học chưa tốt theo tác giả không phải do GV không có trình độ mà do chính GV chưa ứng dụng triệt để phương pháp dạy học tích cực. Do vậy, để nâng cao chất lượng giáo dục môn hóa học, nhà trường cần quán triệt đổi mới phương pháp dạy học tích cực trong toàn bộ đội ngũ giáo viên, đặc biệt là việc ứng dụng CNTT&TT trong dạy học hóa học.
Thực tế ở Trường THPT Mê Linh là nhân viên chuyên trách không có chuyên môn nên không hỗ trợ được cho giáo viên. Do cán bộ quản lý nhà trường có năng lực quản lý chưa cao nên đã có những việc làm ảnh hưởng đến giáo viên. Cụ thể là BGH đã cho học sinh được có quyền được chọn giáo
với giáo viên, hơn nữa học sinh có thói quen đứng núi nọ trông núi kia tư tưởng không tập trung. Còn một số giáo viên chủ nhiệm thì yếu lý và năng lực chủ nhiệm kém nên chỉ vì một ý kiến nhỏ của phụ huynh mà đã đồng tình với phụ huynh về việc thay đổi giáo viên giảng dạy ở lớp. Có giáo viên chủ nhiệm lại còn tự hướng dẫn học sinh của mình làm đơn để đổi giáo viên bộ môn khi bản thân tự cho là tốt hơn mặc dù học sinh lớp mình là lớp cuối của khối. Có khi chỉ là ý kiến thích thú của học sinh khi muốn thay đổi một GV mới. BGH chỉ cần thấy có ý kiến của học sinh, của GV chủ nhiệm hay của phụ huynh nào đó mà chưa bằng các hình thức kiểm tra cụ thể lại GV bộ môn, hay trao đổi trực tiếp với GV bộ môn để nghe phản hồi của GV bộ môn. BGH chưa tìm hiểu cụ thể nguyên nhân của việc học sinh đòi đổi GV bộ môn đã đồng tình với việc làm đó của giáo viên chủ nhiệm và học sinh trong trường mà không lắng nghe ý kiến của GV bộ môn, dẫn đến những khó khăn cho giáo viên môn hóa khi giảng dạy trên lớp. Tạo ra những ức chế cho giáo viên, và sự đố kỵ giữa giáo viên trong tổ, lòng tự trọng của giáo viên đã bị xúc phạm khi bị đổi vì học sinh và vì ý kiến của phụ huynh. Chính vì vậy mà lòng nhiệt tình của giáo viên, niềm say mê với nghề nghiệp đã giảm. Vấn đề quản lý của nhà trường của BGH với bộ môn hóa còn nhiều thiếu sót chưa được đúng mực nên chưa thu được kết quả cao.