C: 10 phút Điện di sản phẩm PCR trên gel agarose 1% trong 40ml dung dịch đệm
3.2.4.Phân bố không gian di truyền
Phân tích NJ (Neighbor Joining) trên cơ sở khoảng cách di truyền theo Nei (1972) đã tìm thấy mối quan hệ giữa các nhóm quần thể với nhau cho mỗi lồi nghiên cứu (hình 3.4).
Hình 3.4. Phân tích NJ trên cơ sở khoảng cách di truyền giữa các quần thể
của lồi Thơng đỏ bắc
Qua hình 3.4, ta thấy các quần thể Thơng đỏ bắc hình thành 2 nhóm. Một nhóm bao gồm 2 quần thể Bát Đại Sơn và Hang Kia, và chỉ ra hệ số gen dị hợp tử dao động từ 0,121 đến 0,123, trung bình 0,122. Nhóm thứ hai gồm 4 quần
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn
thể cịn lại. Tuy nhiên, ở nhóm này quần thể Mường Lựm tách riêng với hệ số gen dị hợp tử quan sát cao nhất 0,119.
Phân tích UPGMA (Unweighted Pair Group Method) trên cơ sở ma trận của kiểu gen (genotyp) từ 6 cặp mồi microsetellite cho mỗi cá thể trong loài theo phần mềm Winboot cũng đã chỉ ra mối quan hệ giữa các cá thể trong lồi Thơng nghiên cứu (hình 3.5).
Hình 3.5. Phân tích UPGMA cơ sở khoảng cách di truyền từ 148 cá thể từ
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn
Tất cả các cá thể nghiên cứu được tách thành 7 nhóm khác nhau, hầu hết các cá thể trong mỗi quần thể thường kết hợp với nhau trong cùng một nhóm. Chẳng hạn, nhóm 1 gồm chủ yếu các cá thể của quần thể Thài Phìn Tủng và hình thành 3 nhóm nhỏ. Một nhóm nhỏ gồm 10 cá thể với giá trị bootstrap 80%, trong đó 2 cá thể có quan hệ rất gần với nhau (bootstrap 100%). Hai nhóm cịn lại, một nhóm với 6 cá thể với bootstrap 68% và nhóm khác gồm 8 cá thể với bootstrap 67%. Tương tự, nhóm 3 gồm 3 quần thể và hình thành 3 nhóm nhỏ,
trong đó một nhóm gồm 2 quần thể Bát Đại Sơn và Hoàng Liên.