B ng 12. M.tuberculosis ki u gen Beijing và tính kháng thu c b t kì trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) m i
Kháng thu c Ki u gen Kháng b t kì Không kháng thu c T ng s OR 95% CI n % n % Beijing 199 43,4 259 56,6 458 2,3 (1,8–3,0) non-Beijing 230 24,7 702 75,3 932 1
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
51
B ng 13. M.tuberculosis ki u gen Beijing và tính kháng đa thu c trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) m i
Kháng thu c
Ki u gen
Kháng đa thu c Không kháng đa thu c
T ng s OR 95% CI n % n % Beijing 23 5,0 435 95,0 458 3,0 (1,6-5,8) non-Beijing 16 1,7 916 98,3 932 1
K t qu cho th y trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) m i,
M.tuberculosis ki u gen Beijing có nguy c kháng thu c b t k và kháng đa thu c cao h n các ki u gen khác: kháng thu c b t k 43,4% ( OR 2,3 v i kho ng tin c y 95% CI t 1,8 t i 3,0 ) và kháng đa thu c 5,0% ( OR 3,0 v i kho ng tin c y 95% CI t 1,6 t i 5,8).
3.3.2. M.tuberculosis ki u gen Beijing và tính kháng thu c lao trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) đã đi u tr .
B ng 14. M.tuberculosis ki u gen Beijing và tính kháng thu c b t kì trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) đã đi u tr
Kháng thu c Ki u gen Kháng b t kì Không kháng thu c T ng s OR 95% CI n % n % Beijing 71 74,0 19 19,8 96 4,0 (2,1–7,4) non-Beijing 37 41,6 52 58,4 89 1
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
52
B ng 15. M.tuberculosis ki u gen Beijing và tính kháng đa thu c trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) đã đi u tr
Kháng thu c Ki u gen Kháng đa thu c Không kháng đa thu c T ng s OR 95% CI n % n % Beijing 25 26,0 71 74,0 96 3,6 (1,5-8,4) non-Beijing 8 9,0 81 91,0 89 1
K t qu cho th y trong nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) đã đi u tr ,
M.tuberculosis ki u gen Beijing có nguy c kháng thu c b t k và kháng đa thu c cao h n các ki u gen khác: kháng thu c b t k 74,0% ( OR 4,0 v i kho ng tin c y 95% CI t 2,1 t i 7,4) và kháng đa thu c 26,0% ( OR 3,6 v i kho ng tin c y 95% CI t 1,5 t i 8,4).
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
53
CH NG IV: BÀN LU N
4.1. PHÂN B CÁC KI U GEN C A M.TUBERCULOSIS
4.1.1. Các ki u gen c a M.tuberculosisđ c phân lo i b ng k thu t Spoligotyping.
Brudey K., Sola C. và c ng s (2006) đã t p h p các k t qu trình t spoligotypes c a 39.295 ch ng M.tuberculosis complex thu th p t các phòng thí nghi m thu c 122 qu c gia (trong đó có Vi t Nam) đ xây d ng c s d li u SpolDB4 phiên b n l n th 4. D li u này cung c p trình t chi ti t c a 1.939 ki u spoligotypes khác nhau cùng v i các thông tin trình t nh phân, th p phân, mi n phân b đ a lý ch y u [18]. Nghiên c u c a chúng tôi đã s d ng c s d li u SpolDB4 đ phân lo i các nhóm ki u gen M.tuberculosis.
K t qu nghiên c u b ng 3 cho th y, trong c hai nhóm b nh nhân lao ph i AFB (+) m i và lao ph i AFB (+) đã đi u tr , M.tuberculosis ki u gen Beijing chi m t l 32,9% và 51,9%, cao h n có ý ngh a (p < 0,01) so v i các ki u gen khác: EAI5 22,2% và 18,4%, H 2,7% và 2,7%, LAM 0,9% và 1,6%.
T i Vi t Nam, các nghiên c u đ u tiên s d ng d u n di truy n đ nh typ spoligotyping và RFLP đ c th c hi n b i Lê.T.K.Tuy n và c ng s (1999) [12] v i 168 ch ng VK lao và ng c Anh và c ng s (2001) [1] v i 563 ch ng VK lao, k t qu cho th y h u h t các ch ng VK lao này thu c 34 týp spoligotypes. Nhóm l n nh t có cùng đ c tính spoligotype là nhóm
M.tuberculosis ki u gen Beijing chi m kho ng 54%. Các nghiên c u này c ng cho th y c u trúc genom đ c tr ng cho các ch ng VK lao thu c nhóm
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
54 (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
Beijing liên quan t i tính kháng thu c và là y u t nguy c cao d n đ n đi u tr th t b i và b nh lao kháng thu c.
M.tuberculosis cho đ n g n đây v n đ c xem nh là m t vi sinh v t có r t ít bi n đ i gen [24].Tuy nhiên, nh ng nghiên c u kh o sát các ch ng
M.tuberculosis t nhi u vùng đa lý b ng cách s d ng các ph ng pháp d ch t h c phân t đã phát hi n ra s phân b nhánh loài theo vùng đ a lý v i s thay đ i đáng k gi a các dòng chính, mà m i dòng liên quan đ n nh ng vùng đa lý riêng bi t [35, 41, 54].
Nghiên c u c a Fan L. và c ng s (2010) [29] t i Th ng H i v i 97 ch ng M.tuberculosis thu th p t b nh nhân lao ph i m i, k t qu t l
M.tuberculosis ki u gen Beijing là 86,6% (84/97), còn l i là các ki u gen khác.
Farnia P. và c ng s (2006) đã nghiên c u 263 ch ng M.tuberclosis phân l p t b nh nhân lao ph i m i s ng t i Iranian and Afghan. K t qu phân lo i b ng k thu t spoligotyping cho th y t l Haarlem I là 33,5%, Beijing 20,5%, Central Asia 12,1% và EAI 8,3% [30].
Mozambique là m t trong nh ng n c có gánh n ng b nh lao cao nh t ti u vùng Sahara châu Phi. Các thông tin v các ki u gen ch y u c a
M.tuberculosis l u hành trong n c là quan tr ng, giúp hi u rõ h n v d ch b nh. Nghiên c u c a Viegas S. và c ng s (2010) đã xác đnh các d ch b nh lao Mozambique đ c gây ra b i s đa d ng c a các nhóm M.tuberculoisis
u th sau: LAM 37,0% (165/445), EAI 29,7% (132/445), T 11,6% (52/445) và Beijing 7,0% (31/445) [65].
Nhìn chung, t l M.tuberculosis ki u gen Beijing là 13,0% và phân b không đ ng đ u t i các vùng khác nhau trên toàn th gi i [28, 53]. B c M
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
55
và vùng Caribbean, t l ki u gen Beijing là kho ng 8%-14%, 45%-56% Nga và 29% Estonia. T l th p n (1%) và Bangladesh là 7%, t l trên 50% nhi u n c ông Nam Á và liên bang Nga [28, 35]
B ng 16. T l b nh nhân m c M.tuberculosis ki u gen Beijing t i các vùng khác nhau trên th gi i [28]. Mi n đa lý B nh nhân các lo i Beijing/t ng s (%) B nh nhân là dân nh p c Beijing/t ng s (%) Tây Âu 272 / 9496 ( 2,9 ) 10 / 353 ( 2,8 )
ông và Trung Âu 4 / 780 ( 0,5 ) 3 / 562 ( 0,5 ) Liên bang Nga 244 / 590 ( 41,4 ) 25 / 106 ( 23,6 ) Trung ông 62 / 1165 ( 5,3 ) 56 / 1084 ( 5,2 ) Nam Phi 30 / 991 ( 3,0 ) 30 / 991 ( 3,0 ) Sa m c Saharan 275 / 6816 ( 4,0 ) 85 / 3881 ( 2,2 ) n 46 / 1291 ( 3,6 ) 38 / 1111 ( 3,4 ) ông Nam Á 711 / 2192 ( 32,5 ) 154 / 811 ( 19,0) ông Á 1032 / 1712 ( 60,3 ) 213 / 370 ( 57,6 ) Châu M Latinh 29 / 1421 ( 2,0 ) 21 / 457 ( 4,6 ) Ca-ri-bê 31 / 320 ( 9,7 ) 5 / 109 ( 4,6 ) Australasia 1 / 4 (25,0 ) 1 / 4 (25,0 ) 4.1.2. K t qu ch s phân lo i c a ph ng pháp Spoligotyping
Ch s phân lo i c a ph ng pháp Spoligotyping trong nghiên c u này
đ c tính theo công th c c a Hunter và Gaston (HGI) [40]: D = 0,803. K t qu này khá cao cho th y spoligotyping là m t ph ng pháp m nh trong vi c phân chia các ch ng M.tuberculosis t i Vi t Nam.
Kristin K và c ng s (2005) đã nghiên c u so sánh ch s phân lo i c a 3 ph ng pháp spoligotyping, IS 6110 RFLP và VNTR trên 69 ch ng VK lao
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
56
phân l p t H ng Kông. K t qu IS 6110 RFLP ch ra 48 nhóm khác nhau v i D=0,997, VNTR là 39 lo i v i D=0,982 và spoligotyping là 5 lo i v i D=0,253. S d spoligotyping có ch s phân lo i th p nh t trên qu n th
M.tuberculosis phân l p t i H ng Kông vì t l M.tuberculosis ki u gen Beijing chi m đ n 74%. ây chính là nh c đi m c a k thu t này khi áp d ng cho phân lo i M.tuberculosis các n c có ki u gen Beijing chi m t l cao nh H ng Kông, Nh t B n và Hàn Qu c [44].
Tuy nhiên, ph ng pháp spoligotyping s d ng k thu t PCR nên ch c n m t l ng nh DNA c ng đ cho phát hi n và phân tích. i u ki n th c hi n k thu t đ n gi n, d ti n hành, không đòi h i trang thi t b đ t ti n và có th ti n hành k thu t ngay trên m u b nh ph m ho c t tiêu b n nhu m soi kính mà không c n qua nuôi c y. ây là u đi m n i b t trong ch n đoán và phân lo i ch ng M.tuberculosis v i k t qu nhanh, rõ ràng và d th c hi n.
Trong tr ng h p b nh nhân lao tái phát, b ng ph ng pháp spoligotyping có th ch n đoán nhanh b nh nhân b m c ch ng
M.tuberculosis m i hay b tái phát do ch ng đã m c tr c đó. K t qu này cho phép d đoán b nh nhân b m c b nh lao m i hay do đi u tr không d t. i u này r t có ý ngh a trong tr ng h p ch ng M.tuberculosis mà b nh nhân m c tr c đây đã kháng thu c, đ ng th i cho phép xác đ nh hi u qu c a ph ng pháp đi u tr [58].
Vi c th hi n các k t qu spoligotyping b ng các kí t s r t thu n l i cho vi c phân tích v i s l ng m u l n và so sánh k t qu gi a các phòng thí nghi m. Ki m tra kh n ng lây nhi m phòng thí nghi m [16].
Kristin K. và c ng s t i vi n nghiên c u S c kh e và Môi tr ng Hà Lan –RIVM (2004) đã thi t l p m t mô hình tham chi u nh m so sánh k
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
57
thu t spoligotyping và k thu t RFLP IS6110. T ng s m u là 1.020 ch ng (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
M.tuberculosis đ c l y t c s d li u c a Hà Lan, k t qu cho th y đ
nh y so v i ph ng pháp nuôi c y LJ c a k thu t spoligotyping là 98,1% và
đ đ c hi u là 99,7% [45]. K t qu này c ng đ c tái kh ng đ nh b i Gori A. và c ng s (2005), đánh giá tính h u d ng c a k thu t spoligotyping cho k t qu đ nh y và đ đ c hi u v i m u b nh ph m lâm sàng là 98% và 96% [36].
4.2. PHÂN B M.TUBERCULOSIS KI U GEN BEIJING THEO MI N A LÝ, NHÓM TU I VÀ GI I TÍNH
4.2.1. Phân b M.tuberculosis ki u gen Beijing trên toàn qu c
M.tuberculosis ki u gen Beijing trên toàn qu c chi m t l 35,2% (554/1575). K t qu nghiên c u c ng cho th y s khác bi t có ý ngh a th ng kê v t l ki u gen Beijing gi a ba mi n: cao nh t t i mi n Nam 38,8% (401/1034), mi n B c 29,3% (126/430) và mi n Trung 24,3% (27/111) (p<0,01).
Nghiên c u c a ng c Anh và c ng s (2001) [1] cho th y t l ki u gen B c kinh là 54% (304/563) cao h n k t qu c a chúng tôi. S sai khác có th do nghiên c u này s l ng m u ít h n và thu th p t b nh nhân t i B nh viên Ph i Trung ng và B nh vi n Ph m Ng c Th ch không mang tính đ i di n cho toàn qu c. K t qu nghiên c u c a D ng Duy An và c ng s (2009) cho th y t l M.tuberculosis ki u gen Beijing là 56,0% (61/109) [27]. Nghiên c u có c m u nh nên có nhi u h n ch trong phân tích k t qu .
Theo báo cáo c a Tr n Ng c B u và c ng s t i thành ph H Chí Minh (2010), t l M.tuberculosis ki u gen Beijing là 34,3% (380/1106) [21].
Lu n v n th c s sinh h c Khi u Th Thúy Ng c ---
58
Theo Jou R và c ng s (2005) [43], t i ài Loan t l ki u gen Beijing là 44,4%. Nghiên c u c a Iwamoto T.R. và c ng s (2009) [41] t i Nh t B n cho th y M.tuberculosis ki u gen Beijing chi m t l 78,5% (714/909). Jiao W. và c ng s cho th y Trung Qu c ki u gen Beijing chi m t l 85,1% (103/121)[42]. i u này cho th y M.tuberculosis ki u gen Beijing là nhóm ch ng khá ph bi n t i các qu c gia Châu Á.
4.2.2. T l M.tuberculosis ki u gen Beijing phân l p t b nh nhân lao ph i AFB (+) m i theo nhóm tu i và gi i tính.