Tốt nhất là ghép thành cặp một ựực và một cái. Tuy nhiên, phải ựảm bảo lồng chuồng ựủ rộng trong quá trình ghép ựơi, ngồi ra phải ựảm bảo chất lượng và số lượng chất lót chuồng.[21]
Các nhà khoa học tại ựại học California cho rằng: với 2 - 4 con cái ghép cùng một con ựực trong 1 lồng cho kết quả sinh sản tốt. Nếu duy trì liên tục một con ựực và một con cái trong 1 cái lồng, chúng có thể sinh sản theo chu kỳ liên tục 18 - 28 ngày.[22]
đối với loài chuột từ khi thành thục về tắnh hoặc sau khi ghép ựôi, chuột ựực thường xảy ra hiện tượng ựánh nhau. Nếu cho tiếp xúc với một cá thể lạ dễ gây ra hiện tượng cắn nhau. Vì thế, khi ghép chuột phải ựúng cách ựể tránh tình trạng cắn nhau. Khi ghép chuột, chuột ựực và chuột cái nên ựược tiếp xúc một khoảng thời gian nhất ựịnh trước khi ghép ựơi thực sự. Có một số con ựực hung hăng sẽ cắn con cái nhưng sẽ khơng có vấn ựề gì xảy ra và trường hợp này thường hiếm gặp. Cũng có khi con cái cắn lại con ựực, ựiều này thường xảy ra hơn vì một số trường hợp con ựực quá hung hăng trong khi
ựó con cái khơng trong chu kỳ ựộng dục, chúng sẽ cắn lại như một phản xạ phòng vệ. điều này thường thấy sau quá trình ghép sinh sản có nhiều tiếng kêu và tiếng ựộng bất thường. Tuy nhiên, nếu chuột vẫn tiếp tục cắn nhau, thì nên tách riêng các cặp sinh sản này, nếu khơng tách riêng có thể chuột sẽ cắn nhau ựến chết. Trong q trình chọn sinh sản khơng nên chọn những con có ựặc tắnh quá hung hăng ựể làm giống.[16; 19;21]
Chu kỳ ựộng dục của con cái khoảng 3 - 5 ngày. Do ựó, một con cái thường mang thai trong vòng 1 - 5 ngày kể từ thời gian ghép ựực. Có thể ựể con ựực và con cái cùng với nhau càng lâu càng tốt ựể tăng hiệu quả thụ thai nhưng không nên ựể quá 16 ngày kể từ ngày ựầu ghép. Một con chuột có thể có con sau sớm nhất là 19 ngày từ ngày ghép và muộn nhất là 24 ngày tắnh ựến ngày ghép cuối cùng.
Việc theo dõi chu kỳ ựộng dục của chuột là rất khó, chuột chỉ chịu ựực trong vòng 12 giờ. Khi cho sinh sản, biết chu kỳ ựộng dục sẽ giúp ta chủ ựộng ựược kết quả sinh sản, nó cũng giúp ta biết ựược chuột có thai. Chuột có thai sẽ khơng ựộng dục cho ựến sau khi sinh. để biết chắc chắn chuột có thai có thể kiểm tra cơ quan sinh dục của con cái. Nếu khơng có thai âm hộ sẽ mở cũng có khi sưng và ựỏ.
Khi một con ựực giao phối với một con cái xong, sẽ tạo thành một màng mỏng chặn ở âm hộ con cái giúp ngăn cản con ựực khác giao phối tiếp theo. Màng mỏng này ban ựầu là dạng nhày trắng sau ựó cứng lại, màng mỏng này có khi nhìn thấy có khi khơng do nó nằm sâu bên trong. Việc quan sát thấy lớp màng mỏng này giúp ta có thể khẳng ựịnh con ựực ựã giao phối với con cái. Tuy nhiên, ựiều này khơng có nghĩa là con cái ựã mang thai mà chỉ giúp khẳng ựịnh con ựực ựã giao phối với con cái tại thời ựiểm ựó.
Có thể sử dụng quy trình kiểm sốt cân nặng của chuột cái ựể ựánh giá chuột mang thai hay khơng nhưng nó khơng ựảm bảo hiệu quả 100%. Con cái sẽ giảm một vài gam trong vòng một hoặc 2 ngày sau khi giao phối, sau ựó
trọng lượng bắt ựầu tăng dần khi chuột mang thai. Một số trường hợp sau khi ghép, chuột tăng trọng nhưng không phải do chuột mang thai (mang thai giả) hoặc ngược lại có một số chuột không tăng trọng nhiều trong suốt thời kỳ mang thai.
Một số chuột có thể ăn con sơ sinh của mình nếu có mùi của con khác. điều này là rất hiếm ựối với chuột nhà. Tuy nhiên, các nghiên cứu cho thấy một con chuột cái có thể tự hủy bỏ và hấp thụ bào thai của mình bất cứ lúc nào sau khi mang thai 2 ngày nếu có mùi của con ựực khác so với con ựực ựã ghép. Nguyên nhân của vấn ựề này là do kắch thắch tố, những kắch thắch tố này gửi tắn hiệu ựến khi có con chuột ựực khác. Trong trường hợp này là do con ựực mới có sức sống mạnh hơn, có khả năng tốt hơn trong việc duy trì nịi giống, con cái có thể hủy bỏ thai ựể chuẩn bị cho một chu kỳ ựộng dục mới.[16;18]