*Ban giám đốc: Bao gồm giám đốc và phó giám đốc.
Giám đốc: chịu trách nhiệm điều hành chung về mọi mặt hoạt động của chi nhánh, đảm bảo chi nhánh hoạt động an toàn, hiệu quả, hoàn thành kế hoạch kinh doanh được Tổng giám đốc giao, xây dựng chiến lược phát triển Chi nhánh Hoàn Kiếm, trình lãnh đạo và triển khai thực hiện kế hoạch hoạt động đã được Tổng giám đốc phê duyệt.
Chỉ đạo công tác thu hồi nợ xấu, chịu trách nhiệm về công tác chất lượng tín dụng chung toàn chi nhánh.
Chịu trách nhiệm về chất lượng lực lượng Cán bộ QHKH. Phụ trách công tác tổ chức, nhân sự, quan hệ đối ngoại.
Trực tiếp chỉ đạo và phụ trách các đơn vị: Phòng QHKH, các Phòng giao dịch trực thuộc, Phòng QLTD, hành chính tổng hợp.
Phó giám đốc:
Trực tiếp chỉ đạo công tác kế toán của chi nhánh Hoàn Kiếm và các phòng giao dịch trực thuộc theo quy trình nghiệp vụ.
Trực tiếp chỉ đạo, phụ trách các đơn vị, phòng kế toán và DVKH.
Phụ trách, chỉ đạo hoạt động chi tiêu tài chính nội bộ và trang bị, quản lý tài sản của chi nhánh.
Khối quan hệ khách hàng:
Nhiệm vụ của khối QHKH là tìm kiếm khách hàng mới cả về huy động và cho vay, giới thiệu kết hợp với tư vấn đến khách hàng các sản phẩm dịch vụ của chi nhánh nói riêng và Ngân hàng TMCP Quân Đội nói chung. Ngoài ra còn có nhiệm vụ quản lý một cách có hệ thống các khách hàng để tiện cho việc chăm sóc và xứ lý những nghiệp vụ phát sinh.
*Phòng khách hàng cá nhân:
Thực hiện các hoạt động huy động vốn từ các khách hàng cá nhân như tiết kiệm tích lũy, tiết kiệm trả lãi trước, tiết kiệm trả lãi sau...
Cung cấp cho khách hàng các dịch vụ về chi trả kiều hối, tư vấn tài chính, ngân hàng...
*Phòng khách hàng doanh nghiệp:
Thực hiện hoạt động cho vay vốn sản xuất kinh doanh, cho vay lưu động, cho vay vốn tăng cường năng lực tài sản và đầu tư dự án đối với khách hàng doanh nghiệp, nghiệp vụ bảo lãnh.
Thực hiện nghiệp vụ bảo lãnh, thánh toán xuất nhập khẩu và các nghiệp vụ kinh tế khác. Thực hiện nghiệp vụ tín dụng đối với cá nhân như thẻ tín dụng, cho vay thế chấp, cho vay cán bộ quản lý có thu nhập cao, ổn định, tín dụng hộ gia đình...
*Phòng quản lý tín dụng.
Nhiệm vụ chính của phòng quản lý tín dụng là: thẩm định, tái thẩm định các hồ sơ vay vốn của khách hàng, các phương án đề xuất cấp hạn mức của cán bộ tín dụng; đánh giá giá trị các tài sản đảm bảo; tiến hành xếp hạng tín dụng nội bộ, đánh giá, quản lý rủi ro theo chỉ đạo của Ngân hàng TMCP Quân Đội, đề xuất xử lý nợ, quản lý nợ quá hạn, thu hồi, thanh lý tài sản đảm bảo đối với các khoản nợ quá hạn đã được xử lý.. Nhiệm vụ tham mưu cho ban giám đốc về công tác quản trị rủi ro của chi nhánh nói chung.
*Phòng Hành chính – Tổng hợp :chịu trách nhiệm về công tác lễ tân, hậu cần, tổ chức thực hiện và quản lý công văn đi và đến theo đúng quy định của công tác văn thư, bảo mật, lưu trữ. Tổng hợp, thống kê, báo cáo theo quy định
*Phòng Kế toán – DVKH:
Bộ phận kế toán: Thực hiện nghiệp vụ kế toán ngân hàng. Đảm bảo hoạt động của chi nhánh theo đúng quy chế tài chính của Ngân hàng.
Bộ phận dịch vụ khách hàng: Cung cấp dịch vụ thanh toán, tài khoản cho khách hàng.
Bộ phận quỹ: Quản lý ngân quỹ của Ngân hàng, là nơi các khoản tiền vào và ra khỏi chi nhánh.