Bộ phận Kê khai kế toán thuế sau khi nhận hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế do bộ phận tiếp nhận hồ sơ chuyển đến thực hiện kiểm tra, phân loại hồ sơ như sau:
a) Kiểm tra tính đầy đủ, hợp pháp, đúng thủ tục của hồ sơ hoàn thuế theo quy định của Luật Quản lý thuế và các văn bản hướng dẫn thi hành Luật. Thời gian thực hiện là ngay trong ngày làm việc hoặc chậm nhất là đầu giờ ngày làm việc tiếp theo kể từ khi nhận được hồ sơ.
Trường hợp hồ sơ hoàn thuế chưa đầy đủ, đúng thủ tục thì lập thông báo hồ sơ chưa đủ thủ tục (theo mẫu ban hành kèm theo Quy trình tuyên truyền và hỗ trợ NNT của Tổng cục Thuế) gửi cho người nộp thuế.Thời gian thực hiện chậm nhất không quá 02 ngày làm việc kể từ ngày nhận được hồ sơ hoàn thuế.
Trường hợp hồ sơ đã đầy đủ, đúng thủ tục hoặc người nộp thuế đã bổ sung đầy đủ, đúng thủ tục hồ sơ hoàn thuế thì thực hiện phân loại hồ sơ hoàn thuế theo điểm b dưới đây.
b) Kiểm tra phân loại hồ sơ hoàn thuế:
- Kiểm tra, đối chiếu với quy định hiện hành để thực hiện phân loại hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau hoặc kiểm tra trước, hoàn thuế sau và các trường hợp hoàn thuế khác.
- Lập Phiếu phân loại hồ sơ hoàn thuế (mẫu số 01/QTr-HT ban hành kèm theo Quy trình này).
- Căn cứ Phiếu phân loại hồ sơ hoàn thuế: Đối với hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước khi hoàn thuế dự thảo Thông báo hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước khi hoàn thuế (mẫu số 02/QTr- HT ban hành kèm theo Quy trình này, trong đó ghi rõ thời hạn giải quyết hồ sơ hoàn thuế) kèm theo hồ sơ, trình thủ trưởng cơ quan thuế duyệt ký Thông báo gửi người nộp thuế và chuyển cho bộ phận kiểm tra để tiếp tục giải quyết hoàn thuế theo quy định.
- Trường hợp trong quá trình kiểm tra, phân loại hồ sơ hoàn thuế phát hiện hồ sơ không thuộc đối tượng được hoàn thuế thì dự thảo Thông báo hồ sơ không được hoàn thuế (mẫu số 06/QTr-HT ban hành kèm theo Quy trình này) kèm theo toàn bộ hồ sơ hoàn thuế trình thủ trưởng cơ quan thuế duyệt ký Thông báo gửi người nộp thuế.
Thời gian thực hiện các công việc nêu tại điểm 2.1.b nêu trên chậm nhất không quá 02 (hai) ngày làm việc kể từ ngày nhận đủ hồ sơ hoàn thuế của NNT do bộ phận tiếp nhận hồ sơ chuyển đến.