Hoàn thuế là một thuộc tính ưu việt cuả thuế GTGT, nó tạo điều kiện giúp các doanh nghiệp phát triển sản xuất thuận lợi hơn. Việc tiếp nhận hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế được thực hiện theo quy định của quy chế hướng dẫn, giải đáp vướng mắc về chính sách thuế, quản lý thuế và giải quyết các thủ tục hành chính thuế của người nộp thuế theo cơ chế “một cửa” ban hành kèm theo quyết định số 78/2007/QĐ – BTC. Sau khi tiếp nhận hồ sơ xin hoàn thuế của người nộp thuế, các bộ phận có liên quan tiến hành phân loại, giải quyết hồ sơ, thẩm định pháp chế và đưa ra quyết định hoàn thuế.
Để thực hiện công tác hoàn thuế có hiệu quả cần triển khai kết hợp nhiều biện pháp kiểm tra, giám sát, thẩm định hồ sơ hoàn thuế, tránh trường hợp hoàn thuế không đúng đối tượng, không đúng với số thuế được hoàn. Thời gian qua, công tác hoàn thuế tại Chi cục thuế Chương Mỹ đã đảm bảo đúng đối tượng, trình tự, thủ tục quy định. Trong năm 2012 đã thực hiện hoàn thuế GTGT cho doanh nghiệp gồm 41 lượt hồ sơ, số thuế đã hoàn 54.214 triệu đồng. Trong các lượt hồ sơ được thực hiện hoàn thuế GTGT, hầu hết số thuế đề nghị hoàn của người nộp thuế trùng với số thuế xác định được hoàn của cơ quan thuế. Các doanh nghiệp NQD được hoàn thuế trên địa bàn huyện Chương Mỹ chủ yếu là các doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh xuất khẩu hàng hóa: hàng gia công xuất khẩu, hàng thủ công mỹ nghệ đặc biệt là mây tre đan một ngành hàng thế mạnh của huyện…
Công tác kiểm tra trong việc hoàn thuế
Qua quá trình kiểm tra hồ sơ hoàn thuế GTGT đối với các doanh nghiệp NQD trên địa bàn huyện Chương Mỹ trong những năm qua cho thấy, một số
doanh nghiệp còn vi phạm quy định thủ tục, điều kiện hoàn thuế liên quan đến Luật thuế GTGT và Luật quản lý thuế như: lập hồ sơ đề nghị hoàn thuế chưa đúng đối tượng với kỳ hạn hoàn thuế dài, việc ghi chép trên hóa đơn GTGT đầu vào không đúng kỳ phát sinh hoặc không thực hiện thanh toán qua hệ thống ngân hàng… Đối với công tác kiểm tra tại trụ sở doanh nghiệp, trong năm 2012 Chi cục thuế đã tiến hành truy hoàn thuế GTGT của 4 doanh nghiệp, số tiền truy hoàn là 9 triệu đồng.
Qua công tác kiểm tra cho thấy việc hoàn thuế còn tồn tại những khó khăn do một số doanh nghiệp còn hạn chế về nhận thức chưa nắm rõ các quy định pháp luật khiến cho việc thực hiện còn nhiều sai sót. Bên cạnh đó trên thực tế, về phía các doanh nghiệp cho rằng quy định về việc hoàn thuế GTGT còn rườm rà, một số chính sách thủ tục hoàn thuế GTGT còn chưa phù hợp với điều kiện thực tế sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp như quy định các cơ sở xuất khẩu nhưng có số thuế đầu vào của hàng hóa xuất khẩu phát sinh trong tháng chưa được khấu trừ nhỏ hơn 200 triệu đồng thì không được hoàn thuế theo tháng điều này làm cho vốn của doanh nghiệp bị lưu lại khá lâu và ảnh hưởng đến chu trình sản xuất kinh doanh tiếp theo của họ, bên cạnh đó là các thủ tục rườm rà, sự máy móc của các cán bộ thuế khiến thời gian hoàn thuế chậm cũng gây nhiều bức xúc cho các doanh nghiệp.
Những khó khắn vướng mắc trên cần được khắc phục trong thời gian tới để rút ngắn thời gian hoàn thuế đem lại tác động tích cực đến cả cơ quan thuế cũng như các doanh nghiệp.