Tuy nhiên bên cạnh những ưu điểm trên vẫn còn một số vấn đề tồn tại cần được khắc phục và hồn thiện trong cơng tác kế tốn chi phí sản xuất. Cụ thể:
Công tác cập nhật thông tin và tập hợp luân chuyển chứng từ:
Một số chứng từ hiện nay của công ty như phiếu chi, phiếu xuất kho, phiếu nhập kho...hiện đang cập nhật thiếu thông người nhận tiền, người nhận hàng nên đang gây khó khăn cho q trình theo dõi và đối chiếu nghiệp vụ phát sinh và không thể hiện đầy đủ nội dung trên chứng từ của doanh nghiệp.
Hiện nay, việc cập nhật các chứng từ cho kế toán khi các nghiệp vụ phát sinh bị hạn chế. Thường thì vào cuối mỗi tháng kế tốn mới tập hợp chứng từ phát sinh trong tháng làm cho cơng tác hạch tốn chi phí sản xuất bị chậm, dồn việc và tạo ra sức ép trong cơng việc kế tốn vào cuối tháng. Đồng thời do việc luân chuyển chậm như trên dẫn đến tại thời điểm bất kỳ kế tốn cơng ty khơng nắm được chi phí thực tế phát sinh bao nhiêu tại xưởng sản xuất .
Cơng tác kế tốn chi phí ngun vật liệu trực tiếp: Cơng ty khơng hạch tốn phế
liệu thu hồi là một nhược điểm lớn của cơng ty. Vì phế liệu cịn lại có thể thu hồi có giá trị nhiều lúc rất lớn, việc khơng hạch tốn khoản thu nhập này đã làm cho công ty thiệt hại một khoản chi phí khơng nhỏ để phục vụ sản xuất. Mặt khác, tại một số phân
xưởng, do ý thức người lao động khơng tốt nên thường xảy ra tình trạng mất cắp một số vật tư có giá trị cao như mực in, tem nổi, decal cứng, nhựa meca ... Điều này chủ yếu do cán bộ chưa quản lý chặt chẽ được lượng nguyên vật liệu nên đã dễ thất thốt lớn.
Cơng tác kế tốn chi phí sản xuất chung: Chi phí cơng cụ dụng cụ xuất dùng cho
phịng sản xuất chỉ phân bổ một lần đầu tiên vào xưởng sản xuất cho tất cả các công cụ dụng cụ. Với những cơng cụ dụng cụ có giá trị lớn, thời gian sử dụng tương đối dài nếu như tính ln vào chi phí của một đơn hàng lớn sẽ dẫn đến sự biến động chi phí cho đơn hàng đó ảnh hưởng tới giá thành.
Việc xác định và tập hợp chi phí sản xuất chung của cơng ty cịn mang tính chủ quan, thiếu chặt chẽ. Một số khoản chi phí chung của công ty chỉ khống chế tỷ lệ dựa trên tổng giá trị hợp đồng mà không căn cứ theo định mức kinh tế kỹ thuật hợp lý.