Trình tự mồi cho phản ứng PCR khuếch đại các SNP

Một phần của tài liệu (LUẬN án TIẾN sĩ) xác định tính đa hình của các gen TP53 và gen MDM2 ở bệnh nhân ung thư phổi (Trang 54 - 58)

[94], [95].

STT Đa hình gen Trình tự mồi Sản phẩm PCR (bp) 1 Dup16bp intron 3-

TP53

F: 5′-TGGGACTGACTTTCTGCTCTT-3′

R: 5′-TCAAATCATCCATTGCTTGG–3′ 135 hoặc 119 2 R72P-TP53 F: 5’-CTG GTA AGG ACA AGG GTT GG-3’

R: 5’-ACT GAC CGT GCA AGT CAC AG-3’ 396 3 SNP309-MDM2 F:5’-CGCGGGAGTTCAGGGTAAAG-3’ R:5’-CTGAGTCAACCTGCCCACTG-3’ 157 4 P34P, P36P, P47S (exon 4- TP53) F: 5’-CAACGTTCTGGTAAGGACAA-3’ R: 5’-GCCAGGCATTGAAGTCTCAT-3’ 511 5 V217M- (exon 6- TP53) F: 5’-AGCGCTGCTCAGATAGCGAT -3’ R: 5’-TAAGCAGCAGGAGAAAGCCC -3’ 181 6 G360A- (exon 10- TP53) F: 5’-GCTGTATAGGTACTTGAAGTGC -3’ R: 5’-CTGTGGATACACTGAGG CAAG -3’ 433

2.3. Thời gian và địa điểm nghiên cứu

2.3.1. Địa điểm nghiên cứu

- Bộ mơn Hóa sinh- Trường Đại học Y Hà Nộị

- Trung tâm Hô hấp, Trung tâm Y học hạt nhân và Ung bướu- Bệnh viện Bạch Maị

- Trung tâm Nghiên cứu Gen & Protein, Trường Đại học Y Hà Nộị

2.3.2. Thời gian nghiên cứu

- Từ tháng 10 năm 2013 đến tháng 10 năm 2017.

2.4. Xử lý số liệu

- Số liệu sau khi làm sạch được nhập và máy bằng phần mềm SPSS 20.0.

- Phân tích số liệu bằng phần mềm SPSS 20.0, sử dụng các thuật toán thống kê:

 Kiểm định Khi bình phương được sử dụng trong so sánh 2 tỷ lệ.

 Tỷ suất chênh (OR) và 95% khoảng tin cậy của OR được tính tốn trong phân tích tương quan...

 Mơ hình hồi quy logistic đa biến được áp dụng trong phân tích mối tương quan... nhằm khống chế các yếu tố nhiễụ

 Mức ý nghĩa thống kê p < 0,05 được áp dụng.

2.5. Đạo đức trong nghiên cứu của đề tài

Đề tài đã được thông qua Hội đồng đạo đức của Trường Đại học Y Hà Nội học theo Quyết định số 188/HĐĐĐĐHYHN, ngày 31/1/2013. Bệnh nhân hoàn toàn tự nguyện tham gia vào nghiên cứụ Bệnh nhân có quyền rút lui khỏi nghiên cứu khi không đồng ý tiếp tục tham gia vào nghiên cứụ Các thông tin cá nhân được đảm bảo bí mật.

2.6. Kinh phí thực hiện đề tài

Đề tài được thực hiện với sự hỗ trợ kinh phí của đề tài nhánh cấp nhà nước “Đánh giá sự phân bố kiểu gen của một số gen liên quan đến ung thư

phổi và ung thư gan” thuộc đề tài nhiệm vụ Quỹ gen “Đánh giá đặc điểm di truyền người Việt Nam”.

CHƯƠNG 3

KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

Qua nghiên cứu tính đa hình gen TP53, MDM2 ở 220 bệnh nhân ung thư phổi nguyên phát chẩn đốn tại Trung tâm Hơ hấp, Trung tâm Y học hạt nhân và Ung bướu- Bệnh viện Bạch Mai và 230 đối chứng từ tháng 10 năm 2013 đến tháng 12 năm 2014, chúng tôi thu được những kết quả như sau:

3.1. Đặc điểm của nhóm đối tượng nghiên cứu

3.1.1. Đặc điểm về tuổi của nhóm nghiên cứu

Một phần của tài liệu (LUẬN án TIẾN sĩ) xác định tính đa hình của các gen TP53 và gen MDM2 ở bệnh nhân ung thư phổi (Trang 54 - 58)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(159 trang)