CHƯƠNG 1 : TỔNG QUAN
1.2. Đột biến gen BRCA1/2 liên quan đến UTBT
1.2.4. Tỉ lệ đột biến BRCA1/2
Theo Cơ sở dữ liệu BRCA Exchange, hiện nay đã ghi nhận hơn 33 684 biến thể trên gen BRCA1, và 32 973 biến thể trên BRCA2 (Biểu đồ 1.5-A).60
Biểu đồ 1.5. Các biến thể gen BRCA1 và BRCA2 phân loại theo chức năng
BRCA Exchange là sản phẩm của dự án BRCA Challenge được tổ chức bởi Liên minh toàn cầu về hệ gen và sức khỏe (Global Alliance for Genomic and Helth) nhằm nâng cao sự hiểu biết về cơ sở di truyền của UT vú, UTBT, UT tụy và các cơ quan khác.60 BRCA Exchange tổng hợp dữ liệu các biến thể di truyền gen BRCA1 và BRCA2 từ các nguồn dữ liệu lớn: 1000 Genome,
BIC, Clinvar, ESP, ExAC, GnomAD, ExUV, LOVD, ENIGMA, và báo cáo Finlay (2018). Theo BRCA Exchange có 4 900 ĐB gây bệnh chiếm 12,2% trong 7 445 biến thể của hai gen đã được khảo sát đánh giá (Biểu đồ 1.5 -B).60
Bảng 1.2. Tỉ lệ đột biến BRCA1/2 ở bệnh nhân UTBT các cộng đồng Cộng đồng/nước Số ca UTBT ĐB BRCA1 ĐB BRCA2 Tổng ĐB Cộng đồng/nước Số ca UTBT ĐB BRCA1 ĐB BRCA2 Tổng ĐB
Do thái 840 182 (21,7%) 64 (7,6%) 246 (29,3%) Hoa kỳ 1915 182 (8,5%) 98 (6,3%) 280 (14,8%) Canada 977 75 (7,7%) 54 (5,5%) 129 (13,2%) Phần Lan 233 11 (4,7%) 2 (0,9%) 13 (5,6%) Thụy Điển 161 12 (7,5%) 1 (0,6%) 13 (8,1%) Đan Mạch 445 22 (4,9%) 4 (0,9%) 26 (5,8%) Ai-xlen 179 2 (1,1%) 10 (5,6%) 12 (6,7%) Ba Lan 309 23 (7,4%) 29 (9,4%) 52 (16,8%) Đức 523 81 (15,5%) 28 (5,4) 109 (20,9%) Ấn độ 239 37 (15,5%) 14 (5,9%) 51 (21,4%) Thổ Nhĩ Kỳ 102 10 (9,8%) 7 (6,9%) 17 (16,7%) Pakistan 120 16 (13,3%) 3 (2,5%) 19 (15,8%) Columbia 100 13 (13,0%) 2 (0,2%) 15 (13,2%) Australia 809 70 (8,7%) 39 (4,8%) 109 (13,5%) Japan 634 63 (9,9%) 30 (4,7%) 93 (14,6%) China 1331 228 (17,1%) 70 (5,3%) 298 (22,4%) Korea 805 106 (13,2%) 51 (6,3%) 157 (19,5%) Tỉ lệ các biến thể có liên quan đến hội chứng UT vú và UTBT di truyền (HBOC) là 66% trên gen BRCA1 và 34% trên gen BRCA2.61 Tần số các ĐB gây bệnh BRCA1/2 trong dân số chung khoảng 1/400-1/800.62 Riêng tỉ lệ mang ĐB BRCA1/2 ở bệnh nhân UTBT khoảng từ 5% đến 30% nhưng rất
Bảng 1.3. Các đột biến “người sáng lập” gen BRCA1/2 tìm thấy ở các quần thể
Quần thể Đột biến BRCA1 Đột biến BRCA2
Người Do Thái
Ashkenazi 185delAG; 5832insC 6174delT
Người Ai – xlen 999del5
Người Na uy 1675delA; 816delGT; 3347delAG; 1135insA
Người Phần Lan IVS11+3A>G 9345+1G>A; C7708T; T8555G
Người Thụy Điển 3171ins5
Người Pháp 3600del11
Người Hà Lan 2804delAA; IVS12-
1643del3835 5579insA, 6503delTT
Người Ý 5083del19 8765delAG
Người Pháp - Canada C4446T; R1443X 8765delAG; 3398delAAAAG Người Tây Ban Nha
(Nam California) S995X; 2552delC Người Tây Ban Nha
(Columbia) 3450delCAAG; A1708E 3034delACAA Người Mỹ Gốc Phi 943ins10; 1832del5; 5296del4 IVS13+1G>A
Người Nam Phi E881X
Người I-rắc Tyr978X
Người Trung Quốc 1081delG
Người Nhật Bản Q934X, L63X 5802delAATT
Người Malaysia 2846insA
Người Philippin 5454delC 4265delCT, 4859delA Người Pakistan S1503X, R1835X
Quần thể người gốc Do Thái có nguy cơ mắc HBOC cao do tần suất mang ĐB BRCA1/2 cao nhưng phần lớn là 3 ĐB được nghiên cứu rất nhiều: 2 ĐB trên BRCA1 (187delAG và 5385insC) và 1 trên BRCA2 (6174delT).
Trong các quần thể khác nhau, các ĐB BRCA1/2, đặc biệt có tần số phát
hiện cao và giới hạn trong các quần thể là hệ quả của hiệu ứng “người sáng lập” (founder effect – trong di truyền quần thể) được gọi là ĐB “người sáng lập” (founder mutation) hay ĐB “đặc trưng” cho quần thể đó (Bảng 1.3).64
Mặc dù phần lớn ĐB BRCA1 được mô tả chỉ bao gồm một vài cặp
nucleotid, trong những nghiên cứu trên quần thể người Hà Lan đã xác định được 3 loại mất đoạn lớn gen BRCA1. Những mất đoạn lớn được phát hiện chiếm tới 36% ĐB ở nhóm bệnh nhân Hà Lan có tiền sử gia đình nguy cơ cao.65