Hoạt động kiểm toán nói chung và kiểm toán nội bộ nói riêng đều quan tâm đến mức độ thỏa mãn của các đối tượng sử dụng kết quả kiểm toán về tính khách quan và độ tin cậy; đồng thời thỏa mãn mong muốn của đơn vị được kiểm toán về những ý kiến đóng góp của kiểm toán viên nhằm nâng cao hiệu quả hoạt động. Vì vậy, công tác kiểm soát đảm bảo chất lượng kiểm toán nội bộ phải được xác định là công việc thường xuyên liên tục đối với cán bộ quản lý, phòng/bộ phận kiểm soát chất lượng kiểm toán và tất cả kiểm soát viên.
- Cán bộ quản lý các cấp trong bộ máy kiểm toán nội bộ phải thường xuyên giám sát công việc của cán bộ dưới quyền. Các chính sách và thủ tục kiểm soát chất lượng hoạt động kiểm toán, phải được cán bộ quản lý phổ biến, hướng dẫn đầy đủ đến tất cả các kiểm toán viên, để giúp họ hiểu và thực hiện đầy đủ các chính sách và thủ tục đó.
- Trong quá trình thực hiện kiểm toán, Trưởng đoàn kiểm toán và các kiểm toán viên phải tuân thủ các nguyên tắc đạo đức nghề nghiệp gồm tính độc lập, khách quan, tính thận trọng, năng lực chuyên môn đồng thời phải đảm bảo công việc kiểm toán đang được thực hiện, theo đúng các quy định. Trưởng đoàn phải giám sát để biết mọi kiểm toán viên đã hiểu rõ nhiệm vụ của mình và có nắm được chuyên môn nghiệp vụ, cũng như kinh nghiệm thuộc lĩnh vực kiểm toán không? Qua giám sát, nếu phát hiện kiểm toán viên
vi phạm đạo đức nghề nghiệp hoặc không đáp ứng được kỹ năng và năng lực chuyên môn cần thiết để thực hiện cuộc kiểm toán thì phải đề nghị người có thẩm quyền có biện pháp xử lý để đảm bảo chất lượng cuộc kiểm toán theo đúng kế hoạch kiểm toán đã đề ra. Đồng thời trong quá trình thực hiện kiểm toán tại đơn vị, mỗi kiểm toán viên phải tự kiểm tra, kiểm soát công việc của chính mình, trước khi công việc đó có sự xem xét, đánh giá của người có trách nhiệm.
- Song song với trách nhiệm tự kiểm soát chất lượng kiểm toán của từng kiểm toán viên thì quá trình kiểm toán phải được tăng cường kiểm soát bởi phòng thẩm định của Vụ Kiểm toán nội bộ. Đây là mắt xích rất quan trọng giúp cho lãnh đạo kiểm toán thực hiện việc giám sát, kiểm soát đối với toàn bộ hoạt động kiểm toán của đơn vị, cũng như đối với từng cuộc kiểm toán. Đối tượng, phạm vi kiểm soát chất lượng kiểm toán rất rộng, bao gồm tất cả các khâu của quy trình kiểm toán, với mục tiêu chung là nâng cao chất lượng của các cuộc kiểm toán. Trong mục tiêu chung mà quá trình kiểm soát chất lượng kiểm toán hướng tới có một số mục tiêu cụ thể như: đảm bảo nội dung kế hoạch của mỗi cuộc kiểm toán phù hợp với kết quả đánh giá rủi ro trong kế hoạch kiểm toán năm và phù hợp với mục tiêu hoạt động của đơn vị được kiểm toán; đảm bảo mọi công việc kiểm toán thực hiện đúng theo chương trình, kế hoạch; đảm bảo tính hợp lý, hợp pháp của những đánh giá, nhận xét, kiến nghị trong dự thảo báo cáo kiểm toán trước khi chính thức được cấp có thẩm quyền ký phát hành.