Mỗi tổ chức tài chính vi mơ, chương trình, dự án tài chính vi mơ tự xây dựng và phát triển một hệ thống công hệ thông tin phù hợp với đặc điểm và hoạt động của tổ chức mình. Vì vậy, hệ thống công nghệ thông tin quản lý của các tổ chức TCVM, chương trình dự án tài chính vi mơ khơng đồng nhất và chưa đồng bộ để có thể chia sẻ thông tin lẫn nhau. Đây là một hạn chế lớn dẫn đến khó hình thành trung tâm thơng tin tín dụng giữa các tổ chức TCVM, chương trình, tài chính vi mơ nên khơng khai thác được thơng tin tín dụng của khách hàng để sử dụng vào mục đích thẩm định, đánh giá năng lực trả nợ của người vay, ảnh hưởng đến cơng tác quản lý rủi ro tín dụng, quyết định cho vay của người quản lý.
Việc đầu tư mới và đồng bộ hệ thống phần mềm quản lý sẽ giúp tăng năng suất lao động đồng thời quản lý thơng tin người vay, thơng tin tín dụng,
quản lý cơng tác tài chính kế tốn sẽ nhanh chóng, đầy đủ, thuận tiện hơn. Đầu tư vào hệ thống công nghệ thông tin sẽ giúp cấp quản lý nắm bắt đầy đủ, chính xác thơng tin về tình hình hoạt động của tổ chức để đưa ra các quyết định nhanh chóng, kịp thời. Đặc biệt, tăng tính chuyên nghiệp trong việc tổ chức hoạt động, trao đổi, khai thác thơng tin tín dụng giữa các tổ chức tài chính vi mơ, chương trình, dự án TCVM và phục vụ công tác báo cáo các cơ quan cấp trên, cơ quan quản lý Nhà nước.