Ban Giám đốc: Gồm Giám đốc và một phó Giám đốc chịu trách nhiệm điều hành, quản lý mọi hoạt động của chi nhánh, trực tiếp phê duyệt cho vay theo mức cấp phán quyết cho vay tối đa, chịu trách nhiệm trước Tổng Giám đốc Ngân hàng TMCP Đông Nam Á trong mọi hoạt động của chi nhánh.
Phịng Kế Tốn: Đóng vai trị quan trọng trong việc hoạch toán thực hiện báo cáo định kỳ theo quy định của NHNN, Ngân hàng TMCP Đông Nam Á, thực hiện nghiệp vụ điều chuyển vốn giữa chi nhánh và Hội sở.
Tại Ngân hàng TMCP Đông Nam Á – CN Chợ Lớn thì phịng Kế tốn sẽ thực hiện việc giao dịch với KH, với những nhiệm vụ:
- Hướng dẫn làm thủ tục mở và sử dụng tài khoản. - Thực hiện ký quỹ thanh toán L/C, thanh toán Séc. - Thực hiện nghiệp vụ mua bán ngoại tệ.
- Thực hiện nghiệp vụ thanh toán, phát hành thẻ.
- Thực hiện và quản lý các nghiệp vụ mua bán và chiết khấu các loại giấy tờ có giá.
- Thực hiện nghiệp vụ thu chi hộ trong hệ thống Ngân hàng TMCP Đông Nam Á và theo uỷ nhiệm của khách hàng.
- Thực hiện nghiệp vụ chuyển tiền trong và ngoài nước, chi trả kiều hối. - Thực hiện các nghiệp vụ khác.
Phịng Tín Dụng:
- Chiết khấu các loại giấy tờ có giá.
- Cho vay tài trợ theo chương trình, dự án đầu tư. - Thực hiện bảo lãnh Ngân hàng.
Phịng Hành Chính: Thực hiện các cơng tác đảm bảo hoạt động của chi nhánh đúng theo quy định của Ngân hàng TMCP Đông Nam Á. Thực hiện các thủ tục hành chính của chi nhánh đồng thời thực hiện tốt cơng tác văn phịng: quản lý văn phịng phẩm của CN, chấm cơng, …Bộ phận bảo vệ có có nhiệm vụ bảo vệ tài sản của chi nhánh, giữ trật tự an ninh, bảo vệ khách hàng đến giao dịch gửi tiền và rút tiền.