Từ khi ra đời và đi vào hoạt động đến nay các ngân hàng nói chung và hệ thống ngân hàng thương mại nói riêng đã có nhiều đóng góp tích cực cho việc xây dựng và phát triển kinh tế đất nước nhất là việc huy động vốn nhàn rỗi trong dân cư để cho vay các thành phần kinh tế tạo công ăn việc làm, không ngừng nâng cao đời sống của nhân dân. Tuy nhiên, hiệu quả hoạt động của các ngân hàng thương mại tại Việt Nam vẫn còn thấp và một số sản phẩm cịn tiềm ẩn nhiều rủi ro. Nếu khơng được kiểm tra, giám sát kịp thời và thường xun, khơng có những chính sách thận trọng và phù hợp thì có thể dẫn tới sự đổ vỡ dây truyền mang tính hệ thống, làm mất lòng tin đối với người gửi tiền, đe dọa nghiêm trọng tới an ninh tài chính quốc gia, gây nên sự bất ổn đối với nền kinh tế đất nước, thậm chí cịn là ngun nhân của khủng hoảng tài chính khu vực và thế giới. Những cuộc khủng hoảng tài chính diễn ra trong thời gian gần đây đã cho chúng ta nhiều bài học kinh nghiệm, trong đó có vấn đề đảm bảo an toàn cho hoạt động của hệ thống ngân hàng. Trước tình hình đó, ngày 11/9/1999 Chính phủ đã có Quyết định số 218/QĐ-TTg về việc thành lập tổ chức Bảo hiểm tiền gửi Việt Nam. Tháng 7/2000, BHTGVN chính thức khai trương đi vào hoạt động.
Bước đầu đi vào hoạt động BHTGVN gặp khơng ít những khó khăn vướng mắc, nhất là việc xây dựng các định chế và quy chế hoạt động cho bảo hiểm tiền gửi sao cho phù hợp với thực tế hoạt động, do đây là một lĩnh vực hoàn toàn mới tại Việt Nam. Mặc dù là một tổ chức mới được thành lập với vơ vàn những khó khăn ban
đầu, song cùng với nỗ lực của Ban lãnh đạo và tập thể cán bộ công nhân viên, BHTGVN đã từng bước xác định được phương hướng nhiệm vụ của mình, khắc phục khó khăn, dần tạo dựng được nền tảng phát triển. BHTGVN đã thành lập các Ban nghiên cứu như Ban Nghiên cứu đề án giám sát từ xa, Ban Nghiên cứu phí theo mức độ rủi ro, Ban Nghiên cứu Luật bảo hiểm tiền gửi, Ban nghiên cứu Vốn… giúp nghiên cứu, xây dựng và phát triển các nghiệp vụ chủ yếu của bảo hiểm tiền gửi. BHTGVN đã xây dựng được kênh thông tin báo cáo đối với các tổ chức tham gia bảo hiểm tiền gửi và trao đổi thông tin với Ngân hàng nhà nước. BHTGVN thành lập được 6 Chi nhánh khu vực trải đều trên toàn quốc với những chức năng và nhiệm vụ cụ thể, đảm bảo thông suốt giúp BHTGVN triển khai và thực hiện tốt vai trò, chức năng và nhiệm vụ của mình, đồng thời giúp quản lý tốt các đơn vị tham gia bảo hiểm tiền gửi trên địa bàn từng Chi nhánh phụ trách.
Với những kết quả đã đạt được trong thời gian qua đến nay có thể nói BHTGVN đã có những đóng góp đáng kể và quan trọng trong tiến trình đổi mới đất nước nói chung và ngành ngân hàng nói riêng đồng thời cũng đã tự khẳng định được mình, khẳng định được tính đúng đắn của một chủ trương, một quyết định ra đời tổ chức tài chính mới khơng thể thiếu trong hệ thống các định chế tài chính của nền kinh tế đất nước trong cơ chế thị trường và hội nhập kinh tế khu vực, quốc tế giai đoạn tiếp theo.