CHƢƠNG 2 : VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Vật liệu và hóa chất dùng trong nghiên cứu
2.1.1. Vật liệu
Các mẫu nƣớc và bùn lấy ở ven bờ tại các vị trí khác nhau ở các vùng biển Việt Nam, các mẫu đƣợc ký hiệu theo tên từng địa phƣơng lấy mẫu.
Các chủng vi sinh vật kiểm định gồm: Bacillus subtilis ATCC 6633; Bacilus
cereus ATCC 11778; Staphylococcus epidermidis ATCC 12228; Enterobacter aerogenes ATCC 23048; Salmonella typhi IFO 14193; Candida albicans ATCC10, E. coli ATCC 11105, Alcaligenes faecallis, Pseudomonas auroginosa nhận từ bộ
sƣu tập giống của phịng Cơng nghệ lên men, viện Cơng nghệ sinh học.
2.1.2. Hóa chất và thiết bị 2.1.2.1. Hóa chất 2.1.2.1. Hóa chất
Các loại đƣờng gồm: glucose; arabinose; raffinose; fructose; saccarose; xylose; myo-inositol; mannitol; lactose; mannose; galactose; dextrose... (Merck).
Các nguồn nitơ: L-histidinemonohy-drodorid monohydrate; L-phenylalanine; Leucine; L-triptophan; L-asparagine monohydrate; L-arginine monodo; L- isoleucine; L-valine; L-methionine; L-lysine; L-threonine; L-cystein; 2-amino-2 hydroxy-methyl 1,3 prom (Merck).
Các hóa chất khác dùng trong ni cấy và lên men: CaCO3; K2HPO4.3H2O; KH2PO4; FeSO4.7H2O; (NH4)2SO4; NH4Cl; NaCl; bột đậu tƣơng; trypton; pepton; cao ngô; casein thủy phân; agar và một số hóa chất cần thiết khác… là sản phẩm của Việt Nam hoặc nƣớc ngồi có độ tinh khiết cao, đáp ứng yêu cầu nghiên cứu.
Các hóa chất dùng trong sinh học phân tử gồm: Tris-base, EDTA, axit acetic, CTAB, NaCl, propanol, chloroform, phenol, isoamin alcohol, etanol, bromophenol blue, Ethidium bromide, glycerol, dNTP các loại, MgCl2, cặp mồi FC27/RC1492,
kít PureLinkTM - DNA Purification (Invitrogen), DNA Marker (Fermentas), agarose…
Bảng 2.1. Các thiết bị chính sử dụng trong đề tài
Tên thiết bị Nơi sản xuất Tên thiết bị Nơi sản xuất
Cân phân tích ADNHR- 20000
Thụy Sỹ Máy ly tâm Đức
Nồi hấp thanh trùng Nhật Bản Kính hiển vi quang học
Olympus CHD -2
Nhật Bản
Tủ cấy vô trùng Pháp Máy đo pH 320 Toledo Anh
Tủ ấm Trung Quốc Tủ khử trùng khô dụng cụ Trung Quốc
Máy lắc Hàn Quốc Kính hiển vi quét Viện 69, Bộ tƣ lệnh
lăng Chủ tịch HCM Cân điện tử Startorius Đức Máy PCR GeneAmp PCR system 9700 Mĩ Máy điện di DNA
Mupid
Nhật Bản Máy xác định trình tự tự
động ABI PRISM®3100- Avant Genetic
Mĩ