Ma trận bao gồm 657 nucleotide, trong đó 226 nucleotide mang thơng tin tiến hóa. Khơng có khoảng trống giữa các trình tự so sánh. Phân tích cây MP của bộ dữ liệu phát hiện thấy 7 cây mang thơng tin tiến hóa với 729 lần lặp (CI = 0,5; RI = 0,78). Trong phân tích ML, số điểm Ln của cây tốt nhất là 3,920.996. Cấu trúc xuất phát từ BA là tương tự với Nguyễn và cộng sự (2017) và Brennan và cộng sự (2017). Dựa trên cây quan hê di truyền loài mới là đơn vị phân loại chi em với lồi Cyrtodactylus puhuensis, trong khi đơn vị cịn lại được đặt ở vị trí cơ bản của nhánh bao gồm tất cả các lồi thuộc nhóm lồi C.
wayakonei, ngoại trừ C. cf. bichnganae, C. huongsonensis, C. cf. martini, C. soni, C. sonlaensis, C. taybacensis, và C. wayakonei (hình 3.30).
Về mặt di truyền, đơn vị phân loại mới từ tỉnh Húa Phăn cách biệt khoảng 3,3% so với lồi chị em của nó, C. puhuensis, và đơn vị phân loại từ tỉnh Luông Pha Bang khác với các đơn vị phân loại khác có liên quan ít nhất 11,6% dựa trên đoạn COI. Khoảng cách di truyền theo cặp giữa các lồi khác trong nhóm được cung cấp trong Nguyen et al. (2017).
Thảo luận: Qua nghiên cứu về quan hệ di truyền của giống Thằn lằn
ngón ở Lào được chia thành 3 nhóm (Schneider et al. 2020) như: Nhóm thứ nhất là C. wayakonei phân bố ở miền Bắc gồm có 5 lồi, nhóm thứ hai là C. phongnhakebangensis phân bố ở miền Trung gồm 17 lồi và nhóm 3 là nhóm C. irregularis phân bố ở miền Nam gồm có 3 lồi. Theo nghiên cứu của
(Nazarov et al. 2014) về quan hệ di truyền giữa 21 loài giống Cyrtodactylus ở Lào và Việt Nam. Kết quả được chia thành 3 nhóm: Nhóm A (là nhóm C. phongnhakebangensis); Nhóm B (là nhóm C. wayakonei); Nhóm C (là nhóm C. irregularis). Nghiên cứu của (Luu et al. 2016): Về quan hệ di truyền giữa
29 loài thuộc giống Cyrtodactylus ở Lào và Việt Nam, trong nghiên cứu được chia thành 3 nhóm: Nhóm 1 (là nhóm C. wayakonei) Nhóm 2 (là nhóm C. phongnhakebangensis); Nhóm 3 (là nhóm C. irregularis). Như vậy cả nghiên
cứu trước đây và nghiên cứu này là đồng nhất, trong đó có nhóm C. wayakonei vànhóm C. phongnhakebangensis gồm các lồi thích nghi cao với nơi ở là vách đá của núi đá vơi. Tuy nhiên, C. irregularis thích nghi với nơi ở là cây ở núi đá vôi cũng như núi đất.
3.2.2. Quan hệ di truyền của giống Tắc kè (Gekko)
Trong nghiên cứu kết quả phân tích mẫu vật và tham khảo tài liệu đã ghi nhận 12 loài thuộc giống Tắc kè (Gekko) ở Lào, trong đó số lồi phần lớn là phân bố ở miền Trung của Lào đặc biệt là ở tỉnh Khăm Muôn (bảng 3.3).
Bảng 3.3. Danh sách các loài thuộc giống Tắc kè ghi nhận ở Lào. Stt Tên loài Tác giả và năm công bố Địa điểm ghi nhận Stt Tên loài Tác giả và năm công bố Địa điểm ghi nhận
1 G. aaronbaueri Ngo et al. 2015 Khăm Muôn
2 G. boehmei Luu et al. 2015 Khăm Muôn
3 G. bonkowskii Luu et al. 2015 Khăm Muôn
4 G. gecko Linnaeus 1758 Cả nước (phổ biến)
5 G. kabkaebin Grismer et al. 2019 Bo Li Khăm Xay
6 G. khunkhamensis Sitthivong et al. 2021 Khăm Muôn
7 G. lionotum Annandale 1905 Trung Lào
9 G. petricolus Taylor 1962 Khăm Mn
10 G. scientiadventura Rưsler et al. 2004 Khăm Muôn
11 G. sengchanthavongi Luu et al. 2015 Khăm Muôn
12 G. thakhekensis Luu et al. 2014 Khăm Muôn
Đặc biệt, đã mơ tả một lồi mới cho khoa học trong giống Tắc kè (Gekko) như: Tắc kè Gekko khunkhamensis. Mẫu được thu ở bản Na Hín huyện Khun Khăm tỉnh Khăm Mn. Lồi mới thuộc nhóm Gekko (Japonigekko) japonicus có sự khác biệt về đặc điểm hình thái và dữ liệu phân tử. Về mặt di truyền, loài mới được xếp vào một nhánh, bao gồm G. bonkowskii, G. scienceiaadventura,
G. sengchanthavongi và G. thakhekensis G. nadenensis, và khác với các đồng
loại khác ít nhất 13% về khoảng cách theo cặp dựa trên một đoạn của gen ND2. Các loài thuộc giống Tắc kè (Gekko) phần lớn tập trung phân bố ở các khu rừng núi đá vơi, thường hay gặp ở vách đá, chỉ có lồi tắc kè hoa Gekko gecko sống được ở nhiều nơi cả vách đá, trên cây, khu canh tác có cả ở nhà dân từ Bắc đến Nam. Cần được tiếp tục nghiên cứu đối với giống Gekko ở Lào.
Hình 3.32. Cây quan hệ di truyền của các loài trong giống Gekko. (-) nút chưa được giải quyết, (*) biểu thị giá trị 100%. (-) nút chưa được giải quyết, (*) biểu thị giá trị 100%.
Phân tích cây MP của bộ dữ liệu phát hiện thấy 13 cây mang thông tin tiến hóa với 1.296 lần lặp (CI = 0,45; RI = 0,63). Cấu trúc xuất phát từ BA là tương tự với Nguyễn và cộng sự (2017) và Brennan và cộng sự (2017). Dựa trên cây quan hê di truyền loài mới này là đơn vị phân loại họ hàng với Gekko
scientiadventura và Gekko sengchanthavongi (hình 3.32), mặc dù sự hỗ trợ cho
vị trí này là khơng đáng kể từ tất cả các phân tích. Về sự khác biệt di truyền, lồi mới có quan hệ gần gũi nhất với lồi Gekko scientiadventura với sự sai
khác ít nhất 13,3% theo phân tích dựa trên một đoạn của gen ND2.
Hình 3.33. Bản đồ thể hiện các lồi nhóm Gekko japonicus ở Lào.
Như đẫ nêu ở trên giống Tắc kè (Gekko) ở Lào gồm có 12 lồi và nằm trong 3 nhóm của 7 nhóm trên thể giới. Trong đó nhóm Gekko japonicus là
trong nhóm Gekko japonicus đều được ghi nhận ở miền Trung tỉnh Khăm Muôn Lào, là khu vực có phân bố núi đá vơi nhiều nhất ở Lào (hình 3.33).
Thảo luận: Theo Wood et al. (2021), được phân chia giống Tắc kè
(Gekko) trên thế giới thành 7 nhóm gồm: Nhóm Gekko (Gekko) gecko, nhóm
Gekko (Japonigecko) japonicus, nhóm Gekko (Ptychozoom) homalocephala,
nhóm Gekko (Phacogecko) rhacophorus, nhóm Gekko (Sundagecko) vittatus,
nhóm Gekko (Pseudosundagecko) gulat và nhóm Gekko (Archipelagecko) mindorensis. Trong nghiên cứu này về giống Tắc kè (Gekko) phát hiện được 4
loài, 1 loài mới cho khoa học, nằm trong 3 nhóm gồm: nhóm Gekko (Gekko)
gecko có lồi Gekko gecko, nhóm Gekko (Japonigecko) japonicus có lồi Gekko aaronbaueri và Gekko khunkhamensis, nhóm Gekko (Ptychozoom) homalocephala có lồi Gekko kabkaebin.
3.2.3. Quan hệ di truyền của giống Thằn lằn chân lá (Dixonius)
Theo kết quả phân tích mẫu vật và tham khảo tài liệu đã ghi nhận 3 loài thuộc giống Thằn lằn chân lá (Dixonius) ở Lào, trong đó tất cả các lồi đều phân bố ở miền Trung của Lào (bảng 3.4). Đáng chú ý, đã mơ tả 2 lồi mới cho khoa học trong giống Thằn lằn chân lá (Dixonius) như:
- Thằn lằn chân lá Lào Dixonius lao. Mẫu vật thu được ở Bản Na Ngua,
huyện Tha Khek, tỉnh Khăm Muôn. Theo phân tích phát sinh loài, loài mới được chứng minh là đơn vị phân loại chị em với hai đơn vị phân loại chưa được mô tả từ Thái Lan nhưng khác nhau ít nhất 8,6% về khoảng cách di truyền theo cặp, thứ hai dựa trên trình tự hồn chỉnh của gen ND2 của ty thể.
- Thằn lằn chân lá sôm chăn Dixonius somchanhae. Mẫu vật thu được ở
Bản Huaysorn-Huaysua, huyện Na Sai Thong, Viêng Chăn, Lào. Lồi mới có thể được phân biệt với tất cả các lồi khác bằng sự kết hợp của những ký tự. Về mặt di truyền, hai lồi có sự sai khác 9,4% dựa trên gen ND2 của ty thể.
Cịn một lồi chưa xác định được ghi nhân ở tỉnh Viêng Chăn là loài
Bảng 3.4. Danh sách các loài thuộc giống Thằn lằn chân lá ở Lào.
Stt Tên lồi Tác giả và năm cơng bố Địa điểm ghi nhận
1 D. lao Nguyen et al. 2020 Khăm Muôn
2 D. siamensis Boulenger et al. 1899 Sa Văn Na Khêt
3 D. somchanhae Nguyen et al. 2021 Viêng Chăn
Các loài thuộc giống Thằn lằn chân lá (Dixonius) phần lớn tập trung phân bố ở các khu rừng thứ sinh, khu canh tác, gần dân cư có núi đá vơi hoặc các hịn đá to kênh nhau trên mặt đất, hầu hết các loài trong giống này đều sống ở mặt đất hoặc vách đá sát mặt đất. Giống Thằn lằn chân lá (Dixonius) cần được tiếp tục nghiên cứu nhiều hơn nữa ở Lào.
Hình 3.34. Cây quan hệ di truyền của các lồi trong giống Dixonius.
(-) nút chưa được giải quyết, (*) biểu thị giá trị 100%.
Ma trận bao gồm 1.373 nucleotide, trong đó 418 nucleotide mang thơng tin tiến hóa. Khơng có khoảng trống giữa các trình tự so sánh. Phân tích cây MP của bộ dữ liệu tạo một cây duy nhất mang thơng tin tiến hóa với 1.433 lần
lặp (CI = 0,70; RI = 0,65). Trong phân tích ML, số điểm Ln của cây tốt nhất là 3920.996. Cấu trúc xuất phát từ BA là tương tự với Nguyễn và cộng sự (2017) và Brennan và cộng sự (2017). Dữ liệu phân tử của loài D. somchanhae từ Lào, được thể hiện như đơn vị phân loại chị em với D. siamensis từ Lào, Thái Lan và Việt Nam với các giá trị thống kê đáng kể thu được từ MP và phân tích BI (hình 3.34). Tuy nhiên, cá thể mới từ Lào có ít nhất 9,4% khác biệt với các đồng loại khác dựa trên trình tự hồn chỉnh của gen ND2 của ty thể.
Mẫu vật Dixonius lao từ Thakhek, Khăm Muôn, Lào, được hỗ trợ mạnh mẽ trong tất cả các phân tích thống kê như là đơn vị phân loại chị em với hai taxa từ Thái Lan. Tuy nhiên, mẫu vật từ Lào có ít nhất 8,6% sai khác về mặt di truyền với các đồng loại khác dựa trên trình tự hồn chỉnh của gen ND2.
3.3. Đánh giá mức độ tương đồng thành phần loài họ Tắc kè ở KVNC
3.3.1. Giữa các địa điểm nghiên cứu
Dựa vào số liệu khảo sát, các mẫu vật thu thập được và tổng hợp thành phần loài tắc kè ở khu vực nghiên cứu gồm 6 tỉnh như: tỉnh Viêng Chăn, tỉnh Luông Pha Bang, tỉnh Xiêng Khoảng, tỉnh U Đôm Xay, tỉnh Húa Phăn và tỉnh Khăm Mn để đánh giá mức độ tương đồng (hình 3.36).
Hình 3.36. Sơ đồ phân bố các loài tắc kè ở KVNC
So sánh chỉ số Sorensen-Dice index ở (bảng 3.5), ta thấy tỉnh Xiêng Khoảng và tỉnh U Đôm Xay có mức độ tương đồng về thành phần lồi tắc kè cao nhất với (djk = 0,750), tiếp theo là tỉnh Luông Pha Bang và tỉnh U Đơm Xay có mức độ tương đồng về thành phần lồi tắc kè là (djk = 0,666) do tỉnh U Đôm Xay, tỉnh Luông Pha Bang và tỉnh Xiêng Khoảng đều là thuộc miền Bắc có bên giới giáp nhau giống nhau về mặt địa hình và hệ sinh thái núi đá với núi đá vôi lẫn đất và bao phủ nhiều cây rừng. Mức độ tương đồng thấp nhất là tỉnh Viêng Chăn với tỉnh
Xiêng Khoảng là (djk = 0,222), tiếp đó là tỉnh Xiêng Khoảng với tỉnh Khăm Mn có (djk = 0,266) điều này có thể giải thích là có khoảng cách địa lý xa tỉnh Xiêng Khoảng so với tỉnh Viêng Chăn và tỉnh Khăm Muôn, hơn nữa về độ cao, khí hậu và dạng sinh cảnh núi đá vôi cũng khác nhau.
Bảng 3.5. Chỉ số tương đồng (Sorensen-Dice) về thành phần loài tắc kè giữa các địa điểm nghiên cứu
Địa điểm VC LPB UDX XK HP KM
VC 1 - - - - - LPB 0,454 1 - - - - UDX 0,300 0,666 1 - - - XK 0,222 0,600 0,750 1 - - HP 0,461 0,555 0,500 0,428 1 - KM 0,444 0,421 0,352 0,266 0,521 1
Ghi chú: VC= tỉnh Viêng Chăn, LPB=tỉnh Luông Pha Bang, XK=tỉnh Xiêng
Khoảng, UDX=tỉnh U Đôm Xay, HP=tỉnh Húa Phăn và KM=tỉnh Khăm Mn
Hình 3.37. Phân tích tập hợp nhóm về sự tương đồng thành phần loài giữa các KVNC (giá trị gốc nhánh lặp lại 1.000 lần) giữa các KVNC (giá trị gốc nhánh lặp lại 1.000 lần)
Thảo luận: Trong phân tích tập hợp nhóm về sự tương đồng thành phần
loài ở các khu nghiên cứu cho thấy tỉnh U Đôm Xay, tỉnh Luông Pha Bang và tỉnh Xiêng Khoảng là một nhánh, đây là các khu vực gần nhau về địa lý dẫn đến có sự tương đồng thành phần lồi vì có số lồi bắt gặp đều thấp 3 đến 8 lồi trong khi đó lại có số lồi cùng xuất hiện tương đồng nhau 3 đến 4 loài khoảng 63%-73%. Một nhánh nữa là tỉnh Húa Phăn và tỉnh Khăm Mn có sự tương đồng về phân lồi là 71%, cả hai khu có tổng số lồi là 18 lồi trong đó có 5 lồi cùng xuất hiện cả hai khu và 11 lồi đặc trưng. Cịn tỉnh Viêng Chăn là tỉnh tiếp giáp giữa miền Trung và miền Bắc, giữa đồng bằng và miền núi, có sơng Năm Ngưm chia cắt phía Tây và cách biệt với các khu nghiên cứu khác, với tổng số lồi cao nhất là 14 lồi trong đó có tới 7 lồi đặc trưng (hình 3.37).
3.3.2. Giữa miền Trung và miền Bắc
Kết quả so sánh chỉ số Sorensen-Dice cho thấy mức độ tương đồng về thành phần loài giữa miền Trung và miền Bắc của Lào (djk = 0,400). Các loài ghi nhận phân bố ở cả hai vùng là 7 loài (chiếm 25% tổng số loài) tập trung vào các nhóm lồi phổ biến và phân bố rộng như nhóm Thạch sùng (Hemidactylus), Tắc kè (Gekko) và Thạch sùng cụt (Gehyra). Các loài đặc trưng của từng vùng: Có 21 lồi (chiếm 75% tổng số lồi). Được ghi nhận ở miền Trung thì gồm có 13 lồi (chiếm 46,4% tổng số lồi) trong nhóm Thằn lằn ngón (Cyrtodactylus) là 6 lồi, Thạch sùng lá (Dixonius) là 3 loài, Tắc kè (Gekko) 3 loài và Thạch sùng cụt (Gehyra) là 1 lồi. Cịn ở miền Bắc có ghi nhận 8 lồi đắc trưng (chiếm 28,6% tổng số lồi) nằm trong nhóm Thạch sùng dẹp (Hemiphyllodactylus) 4 lồi, Thằn lằn ngón (Cyrtdactylus) 3 lồi và Thạch sùng cụt (Gehyra) 1 loài.
3.4. Đặc điểm phân bố của các loài tắc kè.
3.4.1. Phân bố theo sinh cảnh
Căn cứ hiện trạng rừng núi đá vôi tại KVNC, đã đánh giá phân bố của các loài tắc kè ở 3 dạng sinh cảnh chính gồm: (SC1) Sinh cảnh núi đá vơi thuộc
khu canh tác; (SC2) Sinh cảnh núi đá vôi thuộc rừng thứ sinh; (SC3) Sinh cảnh núi đá vôi thuộc rừng nguyên sinh. Kết quả được thể hiện trên (hình 3.38).
Hình 3.38. Đa dạng giống và các lồi tắc kè theo sinh cảnh tại KVNC.
Sinh cảnh núi đá vôi thuộc khu canh tác (SC1): Bao gồm có các dải núi đá hoặc quả núi độc lập nằm trong và giáp với khu nương rẫy, rừng trồng, vườn hoa màu, vườn cây ăn quả, đồng ruộng và đất nông nghiệp khác. Khu vực này bị tác động nhiều nhất bao gồm các tác động của con người và chăn thả gia súc. Ở dạng sinh cảnh này ghi nhận được 19 loài (chiếm 67,9% của tổng số loài), các loài tắc kè sinh sống ở sinh cảnh này là khá cao, các loài ghi nhận ở sinh cảnh này phần lớn là các loài phổ biến và phân bố rộng như: Giống Thạch sùng (Hemidactylus) gồm có lồi H. bowringii, H. frenatus, H. ganotii và H.
platyurus; giống Thằn lằn chân lá (Dixonius) gồm có D. lao, D. siamensis, D. somchanhae và Dixonius sp.; giống Tắc kè (Gekko) gồm có lồi G. gecko, G. aaronbaueri và G. khunkhamensis; giống Thạch sùng cụt (Gehyra) gồm có G. mutilata, Gehyra sp.1 và Gehyra sp.2; giống Thằn lằn ngón (Cyrtodactylus)
gồm có C. houaphanensis, C. ngoiensis, C. teyniei và C. wayakonei; giống
Thạch sùng dẹp (Hemiphyllodactylus) chỉ có 1 lồi Hemiphyllodactylus kiziriani.
0 5 10 15 20 25 Cyrtodactylus Dixonius Gekko Gehyra Hemidactylus Hemiphyllodactylus
Núi đá vôi thuộc khu canh tác Núi đá vôi thuộc khu rừng thứ sinh Núi đá vôi thuộc khu rừng nguyên sinh
Sinh cảnh núi đá vôi thuộc khu rừng thứ sinh (SC2): Bao gồm các khu có núi đá nằm trong rừng tự nhiên đang phục hồi, rừng hỗn giao, khu vực này ít bị tác động hơn. Ở dạng sinh cảnh này có các lồi tắc kè phân bố nhiều nhất, ghi nhận được 22 lồi (chiếm 78,6% tổng số lồi), có nhiều lồi ít phổ biến hơn phân bố ở sinh cảnh này như: Giống Thằn lằn ngón (Cyrtodactylus) gồm có lồi C. houaphanensis; C. interdigitalis; C. muangfuangensis; C. ngoiensis; C.
pageli; C. teyniei; C. wayakonei; Cyrtodactylus sp.1 và Cyrtodactylus sp.2. Giống Tắc kè (Gekko) gồm có lồi G. gecko; G. aaronbaueri; G. kabkaebin và
G. khunkhamensis. Giống Thạch sùng cụt (Gehyra) gồm có G. mutilata; Gehyra sp.1 và Gehyra sp.2. Giống Thạch sùng (Hemidactylus) gồm có lồi H. ganotii và H. platyurus. Giống Thạch sùng dẹp (Hemiphyllodactylus) H.
kiziriani; H. serpispecus. Một loài Thằn lằn chân lá Dixonius sp.
Sinh cảnh núi đá vôi thuộc rừng nguyên sinh (SC3): Bao gồm các khu núi đá vôi nằm trong rừng tương đối nguyên sinh chưa bị tác động, địa hình hiểm trở, khó tiếp cận nên phạm vi điều tra tương đối hẹp. Sinh cảnh này đã ghi nhận được 14 loài (chiếm 50% tổng số loài), các loài ghi nhận ở sinh cảnh này bao gồm các loài hiếm gặp như: Giống Thằn lằn ngón (Cyrtodactylus) gồm có lồi C. interdigitalis; C. muangfuangensis; C. pageli; C. teyniei; C. wayakonei; Cyrtodactylus sp.1 và Cyrtodactylus sp.2. Giống Tắc kè (Gekko) gồm có lồi G. gecko; G. kabkaebin và G. khunkhamensis. Giống Thạch sùng cụt (Gehyra) gồm