Hiện tại KBT đã hoàn thiện các hạng mục đưa vào khai thác sử dụng như: nhà truyền thông - giáo dục cộng đồng, nhà chuyên gia, khu trưng bày mẫu vật, vườn thực vật,...Đây cũng là thuận lợi cho hoạt động tổ chức, quản lý và hoạt động. Tuy nhiên để đảm bảo tương xứng với tiềm năng và lợi thế của KBT, cần có sự đầu tư cơ sở hạ tầng du lịch hơn nữa tại các tuyến, điểm du lịch trong KBT và phải đảm bảo một số nguyên tắc sau:
- Xây dựng cơ sở hạ tầng phải tận dụng những tiềm năng và lợi thế sẵn có về tự nhiên, mơi trường, nâng cấp cải tạo các cơ sở vật chất đã có.
- Việc xây dựng và nâng cấp cơ sở hạ tầng ưu tiên phục vụ công tác quản lý và bảo vệ tài nguyên thiên nhiên, sau đó với kết hợp cho chương trình phát triển DLST của KBT.
* Nội dung xây dựng cơ sở hạ tầng bao gồm:
+ Nâng cấp một số tuyến đường mịn phục vụ cơng tác tuần tra kết hợp với hoạt động phát triển DLST.
+ Xây dựng các chòi quan sát trong rừng, chòi quan sát Voọc, hệ thống các nhà nổi dưới lòng hồ.
+ Xây dựng tuyến cáp treo nội bộ trong KBT và tuyến cáp treo Tràng An – Bái Đính – Vân Long để kết nối các khu du lịch với nhau.
+ Xây dựng Trung tâm DLST và trạm kiểm lâm thuộc BQL KBT. + Trang bị các phương tiện đi lại.
+ Hỗ trợ các thôn vùng lõi trong KBT xây dựng nhà văn hóa và các cơ sở hạ tầng khác để đạt chuẩn Làng sinh thái; hỗ trợ một số hộ dân tham gia loại hình du lịch Homestay cải tạo và tu bổ nhà cổ phục vụ khách du lịch.
- Nâng cấp một số tuyến đường:
+ Nâng cấp tuyến đường ô tô từ khu vực thôn Vườn Thị đến thơn Đá Hàn xã Gia Hịa với chiều dài 5 km vừa kết hợp công tác quản lý bảo vệ rừng và các hoạt động du lịch.
+ Nâng cấp tuyến đường mòn từ chân núi lên đỉnh núi Ba Chon và một số tuyến đường mòn vào các khu vực thung Đầm Bái, Thung Quèn Cả, Thung Giếng, Thung Đá Khép để phục vụ công tác tuần tra bảo vệ rừng kết hợp với hoạt động du lịch sinh thái.
- Xây dựng các chòi quan sát trong rừng, chòi quan sát Voọc, hệ thống các nhà nổi dưới lòng hồ:+ Xây dựng chòi quan sát tại các khu vực Thung Giếng, khu vực Thung Đầm Bái và chòi quan sát Voọc tại khu vực trạm bảo vệ rừng số 6 với mục đích vừa phục vụ công tác quản lý bảo vệ rừng vừa kết hợp ngắm cảnh thiên
hồ Đầm Cút – xã Gia Hưng và khu vực Đầm Vân Long xã Gia Vân để phục vụ khách du lịch có sở thích chiêm ngưỡng vẻ đẹp của sông núi, nước non;
- Xây dựng tuyến cáp treo nội bộ trong KBT và tuyến cáp treo Vân Long - Bái Đính - Tràng An để kết nối các khu du lịch với nhau.
+ Xây dựng tuyến cáp treo nội bộ trong KBT với mục đích thưởng ngoạn cảnh đẹp của núi, sông và đưa du khách tới những điểm du lịch một cách nhanh nhất. Tuyến cáp treo nội bộ trong KBT từ núi Mèo cào đến đỉnh núi Ba Chon với tổng chiều dài ước tính khoảng 3,2 km.
+ Xây dựng tuyến cáp treo kết nối với các khu du lịch nổi tiếng của địa phương để tạo sự thu hút cho du khách đến Vân Long và du khách đến các khu du lịch nổi tiếng đó. Đi trên cáp treo theo tuyến này có thể quan sát tổng thể cảnh quan thiên nhiên của khu vực. Tuyến cáp treo Vân Long - Bái Đính - Tràng An ước tính có chiều dài khoảng 10 km. Tuy nhiên đây là tầm chiến lược của cả ngành du lịch tỉnh Ninh Bình.
- Xây dựng các biển báo thông tin diễn giải thiên nhiên
Tuyến, điểm tham quan là hiện trường hoạt động chính của du khách. Tại đây, du khách có thể tự khám phá những bí ẩn của thiên nhiên, những điều kỳ thú của tạo hoá, từ đó cảm nhận được những giá trị đích thực của thiên nhiên. Để có thêm thơng tin cho du khách, việc xây dựng các biển thông tin trên các tuyến, điểm tham quan là rất cần thiết.Nội dung của các bảng thông tin được thiết kế với thông tin ngắn gọn, đơn giản, gây sự tò mị và gợi tính tư duy, tạo cho du khách những hứng khởi và sự chú ý trên tuyến tham quan. Chẳng hạn các hình ảnh đẹp và thông tin về sự phân bố và hoạt động của một số loài thú, các lồi động vật và cơn trùng cũng như phân bố một số loài thực vật có giá trị về mặt thẩm mĩ và khoa học. Có thể có những nội dung khuyến cáo những việc du khách được làm và không được làm.Những biển chỉ dẫn đã cung cấp thêm thông tin về thiên nhiên đồng thời gợi lên ý thức trân trọng và gìn giữ thiên nhiên cho du khách; cách làm này có ý nghĩa giáo dục rất cao và hấp dẫn du khách.
Đây là hoạt động quan trọng bảo tồn các loài động, thực vật, bởi đến KBT du khách có thể quan sát các cơng việc của các cán bộ thực hiện nhiệm vụ nghiên cứu khoa học, cứu hộ... sẽ làm tăng lên nhận thức về giá trị của thiên nhiên. Ngoài ra đây cũng là một hoạt động hết sức ý nghĩa về mặt bảo tồn các loài quý hiếm, đứng trước nguy cơ bị tuyệt chủng. Đây thực sự là điểm tham quan hấp dẫn đối với nhiều du khách đến học tập và nghiên cứu vào tất cả các tháng trong năm.Đến tham quan các cơng trình này, du khách được trực tiếp quan sát vẻ đẹp và những tập tính đáng yêu của các loài động vật, chiêm ngưỡng các lồi cây q, qua đó du khách hiểu và trân trọng hơn giá trị của công việc bảo tồn các lồi động, thực vật hoang dã, từ đó tạo cho du khách có được hành vi ứng xử thân thiện và đúng mực với thiên nhiên.
- Xây dựng Trung tâm DLST và Trạm Kiểm lâm thuộc BQL KBT:
Mục tiêu từng bước nâng cao vai trò và đưa công tác quản lý du lịch theo đúng quy định của Nhà nước. Gắn liền công tác quản lý bảo vệ rừng với việc khai thác hoạt động du lịch nhằm tạo nguồn thu và tái đầu tư cho công tác bảo tồn. Trung tâm DLST và trạm Kiểm lâm nằm trong khu dịch vụ hành chính của BQL KBT với diện tích mỗi đơn vị khoảng 200m2 với các bộ phận quản lý, khai thác, xúc tiến đầu tư và quảng bá các sản phẩm du lịch.
- Trang bị các phương tiện đi lại:
Mục tiêu nâng cấp trang thiết bị nhằm: Tăng cường công tác tuần tra bảo vệ trong rừng, phục vụ cho việc vận chuyển đến các trạm bảo vệ rừng và thực hiện các dịch vụ cho du lịch sinh thái.Các loại phương tiện cần mua: Xe đạp địa hình đi tuần tra trong rừng kết hợp với cho khách du lịch thuê đi dã ngoại; Xe ôtô nhỏ; Thuyền cao su và phao cứu sinh; Thuyền sắt.
- Hỗ trợ xây dựng làng sinh thái và các hộ gia đình tham gia loại hình du lịch Homestay.Mục tiêu giảm áp lực tiêu cực đến nguồn tài nguyên của KBT, góp phần đảm bảo đời sống cho người dân sống trong vùng lõi và vùng giáp ranh KBT.
Các thơn vùng lõi bao gồm: Đồi Ngơ, Gọng Vó – xã Gia Hịa và thơn Cọt xã Gia Hưng. Các hộ dân tham gia loại hình du lịch Homestay hiện có tại các thơn Phù Long, Tập Ninh xã Gia Vân, thơn Cầu Vàng xã Gia Hịa.
Nội dung hỗ trợ bao gồm: Nâng cấp, tu bổ đường làng, ngõ xóm xanh sạch đẹp và các cơng trình khác theo tiêu chuẩn làng sinh thái;Hỗ trợcác hộ dân tham gia loại hình du lịch Homestay cải tạo các phịng nghỉ và các cơng trình phụ trợ khác để phục vụ khách du lịch.