L ỜI CẢM ƠN
4.2.4. Phân tích mối liên hệ di truyền các chủng aMPV ở miền Bắc
Khi số lượng trình tự gen càng lớn, mối liên hệ di truyền giữa các chủng virus càng chính xác. Do vậy, nghiên cứu này đã phân tích mối liên hệ của 4 chủng aMPV so với 242 chủng aMPV có trình tự mã hóa protein G công bố ở GenBank. Cây phát sinh chủng loại được trình bày ở hình 4.12.
Ghi chú: gốc của cây phát sinh chủng loại được suy diễn dựa vào phương pháp midpoint- root tích hợp trong phần mềm FigTree. Để dễ nhìn, giá trị bootstrap chỉ được hiện thị ở các nhánh chính của cây phát sinh chủng loại. Các nhánh chính của 4 subtype aMPV được đánh dấu tương ứng. Nhánh dẫn tới 3 chủng
aMPV phát hiện được trong nghiên cứu này đã được đánh dấu màu đỏ.
Hình 4.12. Cây phát sinh chủng loại aMPV dựa vào gen mã hóa protein G
Dựa vào đặc điểm phân nhánh (hình 4.12), đã xác định có 4 subtype của aMPV phù hợp với các công bố trên thế giới (Alvarez & cs., 2003; Chacón & cs., 2007). Theo đó, 3 chủng aMPV thuộc về aMPV/B. Đặc điểm phân nhóm của aMPV aMPV/B chứa chủng của Việt Nam được cụ thể hóa ở hình 4.13.
Các kết quả phân tích cây phát sinh chủng loại xác nhận cả 3 chủng virus mà nghiên cứu phát hiện được thuộc aMPV/B của aMPV. Mặc dù cùng thuộc aMPV/B, nhưng 3 chủng này nằm ở 2 nhánh khác nhau của cây phát sinh chủng
loại. Kết quả này gợi ý về nguồn gốc khác nhau của 3 chủng aMPV phát hiện được ở miền Bắc. Virus cùng nhóm với 3 chủng của Việt Nam đã được phát hiện ở nhiều nước thuộc châu Âu, châu Á và châu Mỹ, ví dụ Pháp, Đức, Ý, Nga, Anh, Pakistan, Trung Quốc, Brazil, v.v...
Kết quả phân tích trình tự gen kể trên xác nhận sựlưu hành aMPV/B ở gà nuôi tại miền Bắc Việt Nam. Đặc điểm này là phù hợp, bởi hầu hết các nghiên cứu trước đây về sự lưu hành phát hiện aMPV/B phổ biến hơn trong các trang trại ở hầu hết các lục địa như châu Âu (Naylor C. & cs., 1997a; Bayon-Auboyer & cs., 1999; Hafez & cs., 2000), Nam Mỹ (Chacón & cs., 2007). aMPV/B hiện cũng đang lưu hành tại các nước châu Á, như Trung Quốc ((Yu M. & cs., 2019), Nhật Bản (Mase & cs., 2003), Malaysia (Liml & cs., 2009), Jordan (Roussan & cs., 2008). Song cũng không loại trừ việc có thể tồn tại các subtype khác do 3 subtype được chứng minh lưu hành ở gà là aMPV/A, aMPV/B, và aMPV/C (Wei & cs., 2013). Vì vậy, cần tiếp tục mở rộng nghiên cứu để làm rõ một cách toàn diện về sựlưu hành các subtype aMPV ở Việt Nam...
Ghi chú: Nguồn gốc (quốc gia) của các chủng aMPV được ký hiệu kèm theo. 3 chủng aMPV phát hiện được trong nghiên cứu này đã được đánh dấu màu đỏ.
PHẦN 5. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 5.1. KẾT LUẬN
(1) Về sựlưu hành huyết thanh học kháng thể kháng aMPV
- Kháng thể kháng aMPV tựnhiên đã phát hiện được ởđàn gà nuôi tại 8/10 tỉnh/thành phố miền Bắc, với tỷ lệdương tính trung bình theo mẫu là 36,2%.
- Gà thuộc nhiều giống khác nhau đều dương tính với kháng thể kháng aMPV, trong đó nhóm gà siêu thịt có tỷ lệ thấp nhất (8,2%), tiếp đến là nhóm gà bản địa lai (35,0%) và cao nhất là nhóm gà bản địa (48,8%).
- Gà ở tất cả các nhóm tuổi đều dương tính huyết thanh học với aMPV. Tỷ lệ dương tính trung bình ở các nhóm tuổi là 23,1% (22- 42 ngày tuổi); 33,2% (43- 90 ngày tuổi); 61,5% (91- 120 ngày tuổi) và 36,4% (> 120 ngày tuổi).
- Gà nuôi ở mọi quy mô và phương thức chăn nuôi đều phơi nhiễm tự nhiên với aMPV. Tỷ lệdương tính theo quy mô chăn nuôi dao động từ 24,8% - 63,1%. Tỷ lệdương tính theo phương thức chăn nuôi dao động từ 8,2% - 41,8%.
(2) Về sựlưu hành aMPV
- Đã phát hiện được aMPV ở gà có triệu chứng/ bệnh tích sưng phù đầu ở 3/38 mẫu, chiếm tỷ lệ 7,9%.
- Kết quả giải mã và phân tích trình tự gen đã khẳng định 3 chủng aMPV phát hiện được tại miền Bắc thuộc subtype B và cùng nhóm với các chủng virus phân bốở châu Âu, châu Mỹ và châu Á.
5.2. KIẾN NGHỊ
Cần tiếp tục nghiên cứu trên quy mô rộng hơn để làm rõ đặc điểm lưu hành của aMPV ở gà nuôi tại miền Bắc về các khía cạnh vùng chăn nuôi, tỷ lệdương tính huyết thanh học.
Kết quả khẳng định sựlưu hành aMPV (huyết thanh học và virus học) trong nghiên cứu này cho thấy cần có đánh giá cụ thể về vai trò của aMPV cũng như nghiên cứu quy trình vacxin phòng bệnh do aMPV gây ra.
TÀI LIỆU THAM KHẢO
A Williams R., E. Savage C. & C Jones R. (1991). Development Of A Live Attenuated Vaccine Against Turkey Rhinotracheitis. Avian Pathol. 20: 45-55.
Abdelmoez N., Shawky M., Abdelhady H., Lebdah M. & Salama S. (2019). Isolation And Identification Of Some Possible Causative Agents Of Swollen Head Syndrome (Shs) In Broiler Chickens In Egypt. Slovenian Veterinary Research.
56(22-Suppl).
Al-Ankari A.-R., Bradbury J. M., Naylor C. J., Worthington K. J., Payne-Johnson C. & Jones R. C. (2001). Avian pneumovirus infection in broiler chicks inoculated with Escherichia coli at different time intervals. Avian Pathology. 30(3): 257-267.
Aleksėjūnienė I., Aleksėjūnas A., Sereika V. & Šilkūnaitė J. (2008). Serological
Monitoring of Avian Pneumovirus in Lithuania. Veterinārmedicīnas Raksti: Starptautiskās zinātniskās konferences RAKSTI, Dzīvnieki. Veselība. Pārtikas higiēna: Jelgava, 2008. gada 14. novembrī 2008= Animals. Health. Food
Hygiene. International Scientific Conference Proceedings: 14th November 2008, Jelgava, Latvia/Latvian University of Agriculture, Faculty of Veterinary Medicine; Editors: V. Antane, M. Parcinska. Jelgava (Latvia): LLU Veterinarmedicinas fakultate, 2008.
Ali M. Z., Park J.-E. & Shin H.-J. (2019). Serological Survey of Avian Metapneumovirus Infection in Chickens in Bangladesh. Journal of Applied Poultry Research. 28(4): 1330-1334.
Alkahalaf A. N., Halvorson D. A. & Saif Y. M. (2002). Comparison of Enzyme-Linked Immunosorbent Assays and Virus Neutralization Test for Detection of Antibodies to Avian Pneumovirus. Avian diseases. 46(3): 700-703.
Alkhalaf A. N., Ward L. A., Dearth R. N. & Saif Y. M. (2002). Pathogenicity, Transmissibility, and Tissue Distribution of Avian Pneumovirus in Turkey Poults. Avian diseases. 46(3): 650-659.
Alvarez R., Lwamba H. M., Kapczynski D. R., Njenga M. K. & Seal B. S. (2003). Nucleotide and predicted amino acid sequence-based analysis of the avian metapneumovirus type C cell attachment glycoprotein gene: phylogenetic analysis and molecular epidemiology of U.S. pneumoviruses. J Clin Microbiol.
41(4): 1730-5.
Andreopoulou M., Franzo G., Tucciarone C. M., Prentza Z., Koutoulis K. C., Cecchinato M. & Chaligianni I. (2019). Molecular epidemiology of infectious bronchitis virus and avian metapneumovirus in Greece. Poult Sci. 98(11): 5374-5384.
Aung Y. H. (2007). Comparison of the pathogenesis and immune responses following avian Metapneumovirus subtype A and B infection in broiler-type chickens,
PhD Thesis, trang.
Aung Y. H., Liman M., Neumann U. & Rautenschlein S. (2008). Reproducibility of swollen sinuses in broilers by experimental infection with avian metapneumovirus subtypes A and B of turkey origin and their comparative pathogenesis. Avian Pathol. 37(1): 65-74.
Banet-Noach C., Simanov L. & Perk S. (2005). Characterization of Israeli avian metapneumovirus strains in turkeys and chickens. Avian Pathology. 34(3): 220-226. Baxter‐Jones C., Grant M., Jones R. C. & Wilding G. P. (1989). A comparison of three methods for detecting antibodies to turkey rhinotracheitis virus. Avian Pathology. 18(1): 91-98.
Bäyon-Auboyer M.-H., Arnauld C., Toquin D. & Eterradossi N. (2000). Nucleotide sequences of the F, L and G protein genes of two non-A/non-B avian pneumoviruses (APV) reveal a novel APV subgroup. Journal of general Virology. 81(11): 2723-2733.
Bayon-Auboyer M. H., Jestin V., Toquin D., Cherbonnel M. & Eterradossi N. (1999). Comparison of F-, G- and N-based RT-PCR protocols with conventional virological procedures for the detection and typing of turkey rhinotracheitis virus. Arch Virol. 144(6): 1091-109.
Bennett R. S., Nezworski J., Velayudhan B. T., Nagaraja K. V., Zeman D. H., Dyer N., Graham T., Lauer D. C., Njenga M. K. & Halvorson D. A. (2004). Evidence of Avian Pneumovirus Spread Beyond Minnesota Among Wild and Domestic Birds in Central North America. Avian diseases. 48(4): 902-908, 7.
Brown P. A. (2007). Towards the development of novel ELISAS for avian pneumovirus (APV) serology, University of Liverpool, trang.
Brown P. A., Allee C., Courtillon C., Szerman N., Lemaitre E., Toquin D., Mangart J. M., Amelot M. & Eterradossi N. (2019). Host specificity of avian metapneumoviruses. Avian Pathol. 48(4): 311-318.
Brown P. A., Lemaitre E., Briand F.-X., Courtillon C., Guionie O., Allée C., Toquin D., Bayon-Auboyer M.-H., Jestin V. & Eterradossi N. (2014). Molecular comparisons of full length metapneumovirus (MPV) genomes, including newly determined French AMPV-C and -D isolates, further supports possible subclassification within the MPV Genus. PLOS ONE. 9(7): e102740-e102740. Buys S. B., Preez J. H. d. & Els H. J. (1989). Swollen head syndrome in chickens: a
preliminary report on the isolation of a possible aetiological agent. Journal of the South African Veterinary Association. 60(4): 221-222.
Cadman H. F., Kelly P. J., Zhou R., Davelaar F. & Mason P. R. (1994). A serosurvey using enzyme-linked immunosorbent assay for antibodies against poultry pathogens in ostriches (Struthio camelus) from Zimbabwe. Avian diseases. 621-625.
Catelli E., Cecchinato M., Cassandro M., Delogu M., De Matteo P., Franciosi C., De Marco M. A. & John Naylor C. (2004). Avian Pneumovirus infection in turkey and broiler farms in Italy: a virological, molecular and serological field survey. Italian Journal of Animal Science. 3(3): 287-292.
Catelli E., Cecchinato M., Savage C. E., Jones R. C. & Naylor C. J. (2006). Demonstration of loss of attenuation and extended field persistence of a live avian metapneumovirus vaccine. Vaccine. 24(42-43): 6476-6482.
Catelli E., Cook J. K. A., Chesher J., Orbell S. J., Woods M. A., Baxendale W. & Huggins M. B. (1998). The use of virus isolation, histopathology and immunoperoxidase techniques to study the dissemination of a chicken isolate of avian pneumovirus in chickens. Avian Pathology. 27(6): 632-640.
Catelli E., Lupini C., Cecchinato M., Ricchizzi E., Brown P. & Naylor C. J. (2010). Field avian metapneumovirus evolution avoiding vaccine induced immunity. Vaccine. 28(4): 916-921.
Cavanagh D. & Barrett T. (1988). Pneumovirus-like characteristics of the mRNA and proteins of turkey rhinotracheitis virus. Virus Research. 11(3): 241-256.
Cavanagh D., Mawditt K., Britton P. & Naylor C. J. (1999). Longitudinal field studies of infectious bronchitis virus and avian pneumovirus in broilers using type- specific polymerase chain reactions. Avian Pathology. 28(6): 593-605.
Cecchinato M., Catelli E., Lupini C., Ricchizzi E., Clubbe J., Battilani M. & Naylor C. J. (2010). Avian metapneumovirus (AMPV) attachment protein involvement in probable virus evolution concurrent with mass live vaccine introduction. Veterinary microbiology. 146(1-2): 24-34.
Cecchinato M., Catelli E., Savage C. E., Jones R. C. & Naylor C. J. (2004). Design, validation, and absolute sensitivity of a novel test for the molecular detection of avian pneumovirus. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 16(6): 582-585. Cecchinato M., Lupini C., Munoz Pogoreltseva O. S., Listorti V., Mondin A., Drigo M.
& Catelli E. (2013). Development of a real-time RT-PCR assay for the simultaneous identification, quantitation and differentiation of avian metapneumovirus subtypes A and B. Avian Pathol. 42(3): 283-9.
Cecchinato M., Lupini C., Ricchizzi E., Falchieri M., Meini A., Jones R. C. & Catelli E. (2012). Italian field survey reveals a high diffusion of avian metapneumovirus subtype B in layers and weaknesses in the vaccination strategy applied. Avian Dis. 56(4): 720-4.
Cecchinato M., Lupini C., Silveira F., Listorti V., Mescolini G., Morandini E., Franzo G. & Catelli E. (2018). Molecular characterization of avian metapneumovirus from Guinea fowls (numida meleagridis). Pakistan Veterinary Journal. 38: 419-423.
Cha R., Khatri M. & Sharma J. (2006). Mucosal immunity in avian metapneumovirus.
ISBN/EAN-BOOK AND CD. 56.
Chacón J. L., Brandão P. E., Buim M., Villarreal L. & Ferreira A. J. (2007). Detection by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and molecular characterization of subtype B avian metapneumovirus isolated in Brazil. Avian Pathol. 36(5): 383-7.
Chacon J. L., Mizuma M., Vejarano M. P., Toquin D., Eterradossi N., Patnayak D. P., Goyal S. M. & Ferreira A. J. (2011). Avian metapneumovirus subtypes circulating in Brazilian vaccinated and nonvaccinated chicken and turkey farms. Avian Dis. 55(1): 82-9.
Chary P., Rautenschlein S., Njenga M. & Sharma J. M. (2002). Pathogenic and immunosuppressive effects of avian pneumovirus in turkeys. Avian diseases.
46(1): 153-161.
Chettle N. & Wyeth P. (1988). Turkey rhinotracheitis: detection of antibodies using an ELISA test. British Veterinary Journal. 144(3): 282-287.
Chiang S., Dar A. M., Goyal S. M., Sheikh M. A., Pedersen J. C., Panigrahy B., Senne D., Halvorson D. A., Nagaraja K. V. & Kapur V. (2000). A modified enzyme- linked immunosorbent assay for the detection of avian pneumovirus antibodies. J Vet Diagn Invest. 12(4): 381-4.
Choi K.-S., Jeon W.-J., Park M.-J., Kwon J.-H. & Lee E.-K. (2009). Isolation and characterization of avian metapneumovirus from broiler breeder chickens in Korea. Journal of Bacteriology and Virology. 39(4): 373-382.
Choi K.-S., Kye S.-J., Kim J.-Y., To T. L., Nguyen D. T., Lee Y.-J., Choi J.-G., Kang H.-M., Kim K.-I. & Song B.-M. (2014). Molecular epidemiology of Newcastle disease viruses in Vietnam. Journal Tropical animal health production. 46(1): 271-277.
Cook J., A. Dolby C., J. Southee D. & Mockett A. P. A. (1988). Demonstration of antibodies to Turkey rhinotracheitis virus in serum from commercially reared flocks of chickens. (17). 403-10 trang trang.
Cook J. K., Ellis M. M. & Huggins M. B. (1991). The pathogenesis of turkey rhinotracheitis virus in turkey poults inoculated with the virus alone or together with two strains of bacteria. Avian Pathology. 20(1): 155-166.
Cook J. K., Huggins M. B., Orbell S. J. & Senne D. A. (1999). Preliminary antigenic characterization of an avian pneumovirus isolated from commercial turkeys in Colorado, USA. Avian Pathology. 28(6): 607-617.
Cook J. K., Jones B. V., Ellis M. M., Jing L. & Cavanagh D. (1993a). Antigenic differentiation of strains of turkey rhinotracheitis virus using monoclonal antibodies. Avian Pathol. 22(2): 257-73.
Cook J. K. A. (2000). Avian rhinotracheitis. Revue Scientifique et Technique-Office International des Epizooties. 19(2): 602-607.
Cook J. K. A. & Cavanagh D. (2002). Detection and differentiation of avian pneumoviruses (metapneumoviruses). Avian Pathology. 31(2): 117-132.
Cook J. K. A., Kinloch S. & Ellis M. M. (1993b). In vitro and in vivo studies in chickens and turkeys on strains of turkey rhinotracheitis virus isolated from the two species. Avian Pathology. 22(1): 157-170.
Cook J. K. A., Orthel F., Woods M. A., Orbell S. J., Baxendale W. & Huggins M. B. (2000). Avian pneumovirus infection of laying hens: Experimental studies. Avian Pathology. 29(6): 545-556.
Đào Đoan Trang, Cao Thị Bích Phượng, Vũ Thị Ngọc, Nguyễn Văn Giáp & Lệ H. T. M. (2018). Sựlưu hành của virus gây bệnh thiếu máu truyền nhiễm ở gà (ciav) tại Hà Nội và vùng phụ cận. Vietnam J. Agri. Sci. 16(1): 36-45.
Easton A. J., Domachowske J. B. & Rosenberg H. F. (2004). Animal Pneumoviruses: Molecular Genetics and Pathogenesis. Clinical Microbiology Reviews. 17(2): 390.
Eterradossi N., Toquin D., Guittet M. & Bennejean G. (1995). Evaluation of different turkey rhinotracheitis viruses used as antigens for serological testing following live vaccination and challenge. Zentralbl Veterinarmed B. 42(3): 175-86.
Ganapathy K., Bufton A., Pearson A., Lemiere S. & Jones R. C. (2010). Vaccination of commercial broiler chicks against avian metapneumovirus infection: a comparison of drinking-water, spray and oculo-oral delivery methods. Vaccine.
28(23): 3944-3948.
Gharaibeh S. & Shamoun M. (2012). Avian Metapneumovirus Subtype B Experimental Infection and Tissue Distribution in Chickens, Sparrows, and Pigeons. Veterinary Pathology. 49(4): 704-709.
Gharaibeh S. M. & Algharaibeh G. R. (2007). Serological and molecular detection of avian pneumovirus in chickens with respiratory disease in Jordan. Poult Sci.
Gough R., Collins M., Cox W. & Chettle N. (1988). Experimental infection of turkeys, chickens, ducks, geese, guinea fowl, pheasants and pigeons with turkey rhinotracheitis virus. Veterinary Record. 123(2): 58-59.
Govindarajan D., Kim S.-H. & Samal S. K. (2010). Contribution of the Attachment G Glycoprotein to Pathogenicity and Immunogenicity of Avian Metapneumovirus Subgroup C. Avian diseases. 54(1): 59-66.
Goyal S. M., Chiang S.-J., Dar A. M., Nagaraja K. V., Shaw D. P., Halvorson D. A. & Kapur V. (2000). Isolation of avian pneumovirus from an outbreak of respiratory illness in Minnesota turkeys. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation.
12(2): 166-168.
Goyal S. M., Lauer D., Friendshuh K. & Halvorson D. A. (2003). Seroprevalence of avian pneumovirus in Minnesota turkeys. Avian diseases. 47(3): 700-706.
Hafez H. M. (1993). The role of pneumovirus in swollen head syndrome of chickens. Archiv fur Geflugelkunde. 57: 181-181.
Hafez H. M., Hess M., Prusas C., Naylor C. J. & Cavanagh D. (2000). Presence of Avian Pneumovirus Type A in Continental Europe During the 1980s. Journal of Veterinary Medicine, Series B. 47(8): 629-633.
Hảo Đ. T. (2008). Phân lập, xác định một số đặc tính sinh học của Mycoplasma Gallisepticum và chế kháng nguyên, kháng huyết thanh chẩn đoán Luận Án Tiến Sỹ Nông Nghiệp, trang.
Hess M., Huggins M. B. & Heincz U. (2004). Hatchability, serology and virus excretion