Dựa trên kết quả phân tích dữ liệu microarray database (http://ricexpro.dna.affrc.go.jp/). DNA microarray (còn gọi là DNA
chip hay gene chip) là một tấm thủy tinh hoặc nhựa trên đó có gắn các đoạn DNA thành các hàng siêu nhỏ. Các nhà nghiên cứu sử dụng các con chip như vậy để sàng lọc các mẫu sinh học nhằm kiểm tra sự có mặt hàng loạt trình tự cùng một lúc. Các đoạn DNA gắn trên chip được gọi là probe (mẫu dò). Trên mỗi điểm của chip có hàng ngàn phân tử probe với trình tự giống nhau. Các biểu hồ sơ Rice cơ sở dữ liệu (RiceXPro) là một kho lưu trữ hồ sơ biểu hiện gen có nguồn gốc từ phân tích microarray mô / cơ quan bao gồm toàn bộ sự phát triển của cây lúa trong điều kiện lĩnh vực tự nhiên, cây lúa được điều trị bằng phytohormones khác nhau, và các loại tế bào chuyên biệt / mô bị cô lập bằng microdissection (LMD). Cơ sở dữ liệu này là một phần của dự án phân tích phiên mã lúa bằng công nghệ microarray nhằm đặc trưng hóa cấu hình biểu hiện của tất cả các gen dự đoán trên cây lúa và cung cấp thông tin tham khảo có thể được sử dụng trong bộ gen chức năng. Tất cả các cấu hình biểu thức được tạo bằng cách sử dụng một nền tảng microarray với các đầu dò dựa trên các mô hình gen được quản lý thủ công trong RAP-DB và thông tin trình tự cDNA có độ dài đầy đủ của lúa trong Cơ sở dữ liệu KOME . Một số cơ sở dữ liệu microarray được quản lý, công khai nhất là: Biểu hiện gen – NCBI bằng công cụ BLAST ( http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
Sử dụng mẫu hạt phấn lúa tiến hành lựa chọn các gene biểu hiện chuyên biệt ở hạt phấn sử dụng cho nghiên cứu. Gen chuyên biệt hạt phấn là những gene biểu hiện duy nhất ở hạt phấn, dựa trên bản đồ nhiệt (heat map) biểu hiện của gen được thể hiện thông qua màu sắc.