Điều trị sớm, đúng và đủ liều. Điều trị cắt cơn sốt kết hợp với chống lây lan ở những đối tượng nhiễm KSTSR do P. falciparum và điều trị tiệt căn những đối tượng nhiễm KSTSR do P. vivax, P. ovale. Các trường hợp sốt rét do P. falciparum không được dùng thuốc sốt rét đơn thuần, phải điều trị thuốc sốt rét phối hợp để hạn chế kháng thuốc và tăng hiệu lực điều trị theo hướng dẫn của Bộ Y tế được quy định tại Quyết định số 4845/QĐ-BYT ngày 08/9/2016. Điều trị sốt rét đặc hiệu kết hợp với điều trị hỗ trợ và nâng cao thể trạng. Các trường hợp sốt rét ác tính phải chuyển về đơn vị hồi sức cấp cứu của bệnh viện từ tuyến huyện trở lên, theo dõi chặt chẽ và hồi sức tích cực [36]. Đối với việc cấp thuốc tự điều trị sốt rét theo quy định chỉ áp dụng cho những huyện thuộc vùng sốt rét lưu hành tại miền Trung - Tây Nguyên, Đông Nam Bộ. Cấp cho những đối tượng đi vào vùng SRLH nặng trên 1 tuần, người sống trong vùng SRLH có ngủ rừng, ngủ rẫy hoặc qua lại vùng biên giới. Cán bộ y tế từ tuyến xã trở lên mới được cấp thuốc tự điều trị, hướng dẫn cho người dân biết cách sử dụng thuốc và theo dõi sau khi trở về địa phương. Đối với các cộng đồng di biến động, đặc biệt là các đối tượng thường xuyên đi rừng, ngủ rẫy thì biện pháp điều trị kịp thời bệnh nhân sốt rét là quan trọng nhất, tránh xảy ra ác tính và tử vong. Tuy nhiên, việc cấp thuốc tự điều trị có mặt tích cực như nêu trên, đồng thời có mặt hạn chế như sử dụng không đúng đối tượng, không đủ liều lượng, không đúng phác đồ có thể dẫn đến tình trạng ký sinh trùng lờn thuốc,
kháng thuốc. Hiện nay, Bộ Y tế đã ban hành quyết định hướng dẫn chẩn đoán, điều trị bệnh sốt rét sửa đổi và những vùng KSTSR P. falciparum kháng thuốc arteminsin được thay thế bằng thuốc pyramax [37].