Gen ty thể cox1(cytochrome oxidase subunit1)của 2 mẫu sỏn lỏ được thu nhận, qua phõn tớch di truyền và cõy phả hệ cho thấyF. gigantica dạng thuần là FspNB-VN và FspCB-VN (dạng lai của Việt Nam). Kỹ thuật PCR được thực hiện để thu nhận gen cox1 cú độ dài khoảng 1,6 kb.
Kết quả kiểm tra sản phẩm PCR thu nhận gen cox1 của FspNB-VN và FspCB-VN được trỡnh bày ởhỡnh 3.6.
Hỡnh 3.6. Ảnh điện di kiểm tra sản phẩm PCR của gen cox1 với cặp mồi
FSP12F – FGHR2.
M: Thang chỉ thị phõn tử Lamda cắt bằng HindIII. 1. FspNB-VN
2. FspCB-VN
Sản phẩm PCR được điện di kiểm tra trờn agarose 1%; Kết quả PCR cho sản phẩm đỳng với dự kiến (~ 1,6 kb). 23,1 kb 564 bp 2 kb 1,6 kb M 1 2
Bảng 3.3. Cỏc mẫu sỏn lỏ Trematoda trong Ngõn hàng gen cung cấp chuỗi cox1
sử dụng so sỏnh đối chiếu trong nghiờn cứu
Số
TT Tờn mẫu/loài Ký hiệu Quốc gia
Số đăng ký Ngõn hàng gen 1 Sỏn lỏ gan lớn (Fasciolagigantica) dạng thuần
FspNB-VN Việt Nam Nghiờn cứu này 2 Sỏn lỏ gan lớn (Fasciola sp)
dạng lai FspCB-VN Việt Nam Nghiờn cứu này 3
Sỏn lỏ gan lớn
(Fasciolagigantica) dạng thuần
Fgig-ID Indonesia Lờ Thanh Hũa và cs
4 Sỏn lỏ gan nhỏ (Clonorchis
sinensis) Csin-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs
5 Sỏn lỏ gan nhỏ (Opisthorchis
viverrini) Oviv-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs 6 Sỏn lỏ ruột lớn (Fasciolopsis buski) ở người Fbus(human)- VN Việt Nam Lờ Thanh Hũa và cs 7 Sỏn lỏ ruột lớn(Fasciolopsis buski) ở lợn Fbus(swine)- VN Việt Nam Lờ Thanh Hũa và cs 8 Sỏn lỏ ruột nhỏ (Haplorchis
taichui) Htai-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs
9 Sỏn lỏ ruột (Echinochasmus
japonicus) Ejap-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs
10 Sỏn lỏ phổi (Paragonimus
heterotremus) Phet-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs
11 Sỏn lỏ phổi (Paragonimus
ohirai) Pohi-JP Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs 12 Fasciola sp (dạng lai - hybrid) FspGLH-CN Trung Quốc KF543343 13 Fasciola gigantica (dạng thuần) Fgig-CN Trung Quốc KF543342 14 Fasciola hepatica Fhep-AU Australia AF216697 15 Clonorchis sinensis Csin-RU Nga FJ381664 16 Clonorchis sinensis Csin-CN Trung
Quốc JF729303 17 Clonorchis sinensis Csin-KR Hàn Quốc JF729304 18 Opisthorchis viverrini Oviv-LA Lào JF739555 19 Opisthorchis felineus Ofel-RU Nga EU921260 20 Paragonimus westermani (3n) Pwes(2n)-KR Hàn Quốc AF219379 21 Haplorchis taichui Htai-LA Lào KF214770 22 Paragonimus westermani(2n) Pwes(2n)-KR Hàn Quốc AF540958 23 Sỏn lỏ ruột nhỏ
(Stellantchasmus falcatus) Sfal-VN Việt Nam
Lờ Thanh Hũa và cs