Bên cạnh những kết quả đạt được thì công ty còn có những hạn chế, tồn tại cần khắc phục. Cụ thể là:
Thứ nhất là về doanh thu. Doanh thu nhập khẩu của công ty trong những năm gần đây liên tiếp giảm từ 70258 triệu đồng vào 2008 còn 64094 triệu đồng vào 2011. Nhìn qua có vẻ con số là không lớn nhưng những năm gần đây đồng nội tệ liên tục mất giá nên sự chênh lệch này là rất đáng kể. Tuy nhiên sang năm 2012 đã có sự chuyển biến theo hướng tích cực hơn, mở ra một tương lai mới tốt hơn cho việc kinh doanh nhập khẩu của công ty.
Thứ hai là về nguồn nhân lực. Nguồn nhân lực của công ty có cơ cấu trẻ nên chưa có nhiều kinh nghiệm trong kinh doanh nhập khẩu. Mặc dù đội ngũ nhân viên trẻ rất năng động nhưng do kinh nghiệm còn non yếu nên cũng gặp phải những khó khăn khi tham gia kinh doanh quốc tế.
Thứ ba, về thị trường và mặt hàng nhập khẩu. Công ty chỉ nhập khẩu tập trung ở các thị trường châu Á chủ yếu là dưới hình thức nhập khẩu đại lí của Singapo. Sự phụ thuộc này khiến công ty dễ bị lay động nếu thị trường nhập khẩu có biến đổi. Vì vậy công ty nên tìm kiếm thị trường và mở rộng mặt hàng kinh doanh.
Thứ tư, hoạt động tìm kiếm khách hàng chưa tốt. Khách hàng của công ty chủ yếu là khách hàng truyền thống, thân quen hoặc là do họ tự tìm đến chứ không phải là công ty tìm được. Công ty chưa thực sự năng động trong việc tìm kiếm khách hàng vì công ty thực sự làm việc chưa có hiệu quả.
Thứ năm, hạn chế trong qua trình thực hiện hợp đồng. Hiện nay giai đoạn chuẩn bị phương án trước khi kí kết của công ty chưa được coi trọng và có sự phân công đúng mức, hợp lí. Khi có một phương án kinh doanh mới các cán bộ nghiệp vụ vẫn chưa mang tính hệ thống mà chỉ là trách nhiệm của từng người khi tham gia hợp đồng. Những người này phải chịu trách nhiệm trong tất cả quá trình chuẩn bị, từ việc phân tích khó khăn và thuận lợi của công ty khi thực hiện cho tới khi phân tích đặc điểm sản phẩm có phù hợp với nhu cầu khách hàng hay không,...Do nhiều khâu trong việc chuẩn bị bị lược bỏ dẫn
đến kết quả kinh doanh nhập khẩu không tốt. Ngoài ra còn có những hạn chế trong trong công tác làm thủ tục thanh toán. Hiện nay, công ty chỉ sử dụng phương pháp thanh toán tín dụng chứng từ là chủ yếu, vì vậy công ty cần áp dụng nhiều phương pháp thanh toán với đối tác nhiều hơn nữa để phân bổ những rủi ro. Những thủ tục thanh toán L/C còn rườm rà, trong nhiều trường hợp L/C được mở không đúng như trong hợp đồng làm bên đối tác không chấp nhận, công ty lại phải chỉnh sửa làm tăng chi phí, ảnh hưởng đến tiến độ thực hiện việc nhập khẩu, ảnh hưởng đến hoạt động kinh doanh của công ty.