Bùn khoáng tại TTDL Suối Khoáng Nóng Tháp Bà là bùn khoáng vô cơ, đây là nguồn dược liệu quý hiếm mà thiên nhiên ban tặng cho Khánh Hoà. Sau khi các viện nghiên cứu có uy tín như Pasteur, B ộ Y Tế và Phân Viện Nguyên Vật Liệu Nha Trang thuộc Trung Tâm Khoa Học Tự Nhiên Quốc Gia nghiên cứu phân tích và kiểm nghiệm, nhận thấy những khoáng chất có trong bùn khoáng rất có lợi cho sức khoẻ của con người, Công ty Sao Mai Thế Kỷ 21 đãđưa nguồn dược liệu quý giá này vào phục vụ du lịch và chăm sóc cho sức khoẻ cộng đồng. Bùn khoáng được lấy trong lòng đất tại một địa phương ở Ninh Hoà, sau khi vận chuyển về Trung tâm và được đưa vào máy ly tâm đ ể loại bỏ các tạp chất nặng (cát, đá, sỏi,...) lọc ra chất bùn nhuyễn mịn nhất và được làm nóng lên bằng chính nhiệt độ ban đầu ở mỏ bùn. Việc xử lý bùn ngâm tắm được tiến hành theo quy trình của Trung tâm y tế dự phòng tỉnh Khánh Hoà. Sau đó, b ằng hệ thống ống dẫn, bùn khoáng nóng được cung cấp cho các bồn tắm bùn.
Với thành phần chính là Carbonat Natri Silic cùng nhiều nguyên tố vi lượng khác nên bùn khoáng ở đây có tính sát khuẩn. Tác dụng của bùn khoáng là tạo nên kích thích tận cùng thần kinh ở da rồi thông qua các trung khu dư ới não và vỏ não tạo nên sự thay đổi có tính chất toàn thân. Tác dụng của bùn khoáng tăng lên rõ rệt khi bùn được hâm nóng ở nhiệt độ 35-370C. Do có độ bám dính cùng tác dụng của các loại khoáng chất trong bùn nên sau khi ngâm trát bùn, làn da của du khách được tẩy sạch các tế bào chết, mao mạch da được hấp thụ các vi lượng khoáng tạo cho da hồng hào, và cảm giác rõ rệt là làn da trơn mịn hơn, tóc mượt hơn, và cảm thấy thoải mái nhẹ nhàng hơn. Bên cạnh đó, bùn khoáng tại TTDL Suối Khoáng Nóng Tháp Bà có hiệu quả rất tốt đối với một số bệnh như bệnh gút, khớp mãn tính, bệnh thống phong, lao xương – lao hạch, thần kinh tọa, vảy nến và các bệnh về da.