2. Mục tiêu nghiên cứu
3.2.2Các ứng dụng của MIPAV
3.2.2.1 Hiển thị dữ liệu hình ảnh
Mở tập dữ liệu DICOM thu được từ máy siêu âm, MIPAV sẽ hiển thị hình ảnh gồm nhiều khung hình 2D được ghép lại theo trục thời gian. Hình ảnh hiển thị liền mạch giống như trên máy siêu âm. Hình 3.4 mô tả các thông tin có trên phần mềm MIPAV bao gồm: Thanh tiêu đề hiển thị tên của tệp, vị trí của hình ảnh trong tập dữ liệu, tổng số hình ảnh trong tập dữ liệu và mức độ phóng đại
Hình 3.4: Thông tin hiển thị ảnh trên phần mềm MIPAV
Khi chọn chế độ xem hoạt ảnh, phần mềm sẽ tạo một bản sao của tập dữ liệu hình ảnh và tải nó vào cửa sổ hình ảnh hiển thị chế độ xem hoạt ảnh. Ở chế độ xem hình ảnh động, như chếđộ xem một đoạn phim, phần mềm tựđộng chạy liên tục các khung hình 2D theo thời gian thực. Chế độ xem hoạt ảnh cũng cho phép điều chỉnh tốc độ chạy của khung hình và cho phép dừng lại ở bất kì thời điểm nào.
38
Hình 3.5: Chế độ xem hoạt ảnh trên MIPAV
Ngoài ra còn các chế độ hiển thị hình ảnh khác như Light box cho phép hiển thị cùng lúc nhiều lát cắt 2D trong cùng một tệp dữ liệu. Chúng cũng có thể so sánh hai hình ảnh 2D ở hai tệp dữ liệu khác nhau ở chế độ xem Link to another image. Chế độ xem hình ảnh 3D cho phép xem dữ liệu hình ảnh ở mặt cắt dọc, mặt cắt ngang và mặt cắt coronal. Tuy nhiên trong bài nghiên cứu ở thời điểm hiện tại chưa sử dụng đến chếđộ hiển thị này.
3.2.2.2 Phân tích và phân đoạn vùng thể tích quan tâm (Volume of interest – VOI)
Phân đoạn ảnh là phân vùng ảnh thành các vùng rời rạc và đồng nhất với nhau hay nói cách khác là xác định các biên của các vùng ảnh đó. Các vùng ảnh đồng nhất này thông thường sẽ tương ứng với toàn bộ hay từng phần của các đối tượng thật sự bên trong ảnh.
MIPAV cung cấp một số công cụ phân đoạn cho phép xác định thể tích quan tâm (VOI). Một VOI được tạo ra bằng cách vẽ đường viền hoặc bằng cách tạo ảnh
39 mặt nạ. MIPAV cho phép tính toán số liệu thống kê được xác định trước trên VOI được chỉ định.
VOI có thể bao gồm một đường bao đơn hoặc một số cấu trúc đường bao được gán cho một nhóm. MIPAV cung cấp các công cụ giúp có thể tự động, thủ công hoặc tương tác vẽ các đường viền trên bất kỳ hình ảnh nào được hiển thị trong dạng xem mặc định. Có thể sửa đổi hình dạng và kích thước của đường viền và cắt các điểm neo. Trong bài nghiên cứu, tác giả sử dụng công cụ vẽ tay để tạo ảnh mặt nạ.
Hình 3.6: Sử dụng công cụ Draw polygon Voi để vẽ đường bao thất trái
Sau khi đã bao viền xong khu vực VOI, VOI được chuyển thành ảnh mặt nạ. Ảnh mặt nạ này có thể được lưu ở nhiều định dạng khác nhau như .dcm, .gif, .jpg, … Trong bài nghiên cứu, tác giả sử dụng định dạng .jpg cho bước tiếp theo.
40
Hình 3.7: Ảnh mặt nạ được tạo bởi công cụ Voi conversation
3.3 Tính toán phân suất tống máu 3.3.1 Công cụ Google colab