Trường Đại học Y Hà Nội thành lập tháng 11 năm 1902, đến nay gần tròn 115 năm tuổi. Đại học Y Hà Nội là trường được thành lập thứ hai sau Văn Miếu Quốc Tử Giám và là trường đại học duy nhất đã hoạt động liên tục từ ngày thành lập đến nay. Trong suốt chiều dài lịch sử của mình, trường đã nhiều lần đổi tên cho phù hợp với sứ mệnh, tầm nhìn của từng thời kỳ phát triển. Đi lên cùng đất nước, Đại học Y Hà Nội đã từng bước vươn lên khẳng định vững chắc vị thế một trường đại học hàng đầu trong khối các trường đại học Việt Nam nói riêng và trong nền giáo dục Việt Nam hiện đại nói chung và đã có không ít “mốc son” đáng tự hào:
- Huân chương Lao động hạng nhất, nhì; Huân chương Độc lập hạng nhất, nhì; Anh hùng Lao động thời kỳ đổi mới; Huân chương Hồ Chí Minh; Anh hùng Lực lượng vũ trang nhân dân; Huân chương Sao vàng;
- Hơn 30 các Giải thưởng Nhà nước, Giải thưởng Hồ Chí Minh về Khoa học công nghệ trao cho các cá nhân giảng viên;
- Sự tôn vinh của nhà nước dành cho gần 50 Nhà giáo Nhân dân, hàng trăm Nhà giáo Ưu tú, gần chục Thầy thuốc Nhân dân, 12 Anh hùng Lao động, 3 Anh hùng Lực lượng vũ trang nhân dân.
Nổi bật trong những trang vàng lịch sử đó là thành tựu lớn mạnh không ngừng của đội ngũ nhà giáo. Có thể khẳng định, trong hệ thống giáo dục đại học Việt Nam, không có nhiều trường có được lợi thế so sánh đặc biệt quý
báu, đó là “sở hữu” nguồn nhân lực với năng lực chuyên môn và trí tuệ sáng tạo vô cùng to lớn như Đại học Y Hà Nội. Đấy là chưa kể đến một lực lượng đông đảo các bác sĩ có trình độ thạc sĩ, tiến sĩ y khoa, chuyên khoa I, chuyên khoa II đang là giảng viên thỉnh giảng tại trường.
Về tổ chức và nhân sự, hiện nay, Đại học Y đang định hướng phát triển theo mô hình trường ba cấp. Đảng ủy là thiết chế lãnh đạo cao nhất và toàn diện mọi hoạt động của nhà trường. Về chính quyền, công tác chỉ đạo, điều hành thuộc thẩm quyền của Ban giám hiệu, có sự tư vấn của Hội đồng khoa học giáo dục cùng các hội đồng tư vấn khác. Trường hiện có 12 Bộ môn y học cơ sở, 23 Bộ môn Y học lâm sàng, 3 Viện đào tạo, 7 Trung tâm, 3 Khoa, 16 Phòng chức năng và một Bệnh viện thực hành. Theo số liệu thống kê mới nhất của Phòng Tổ chức Cán bộ thì Đại học Y Hà Nội hiện ước tính có 767 giảng viên cơ hữu và 359 giảng viên thỉnh giảng.
Nghiên cứu khoa học luôn là một thế mạnh của Đại học Y Hà Nội. Trong những năm qua, trường đã thực hiện thành công 12 đề tài nghiên cứu cấp Nhà nước, 96 đề tài cấp Bộ, 45 đề tài nghiên cứu cơ bản, 18 đề tài nghiên cứu hợp tác quốc tế và gần 500 đề tài nghiên cứu cấp Cơ sở. Trường Đại học Y Hà Nội cũng là trường đầu tiên tổ chức hội nghị khoa học tuổi trẻ ngành y dược toàn quốc. Trong suốt 13 lần tham dự hội nghị, trường đã đạt được 7 giải đặc biệt, 15 giải nhất, 21 giải nhì, 41 giải ba và khuyến khích.
Trong hợp tác quốc tế, trường đã có quan hệ với nhiều tổ chức quốc tế, nhiều trường đại học y và nhiều nhà khoa học nổi tiếng của Anh, Pháp, Hà Lan, Thụy Ðiển, Hoa Kỳ, Nhật Bản, Nga, Ca-na-đa, các tổ chức quốc tế (UN, WHO, ADB...). Nhiều chương trình, dự án hợp tác quốc tế giữa Trường Đại học Y Hà Nội với các tổ chức quốc tế trị giá hàng triệu USD đã được triển khai rất hiệu quả. Thông qua hợp tác quốc tế, trong những năm gần đây, hàng trăm lượt cán bộ của trường đã có điều kiện ra nước ngoài để trao đổi khoa
học, nghiên cứu, học tập nâng cao năng lực chuyên môn, cập nhật được những tiến bộ khoa học trong từng chuyên ngành.
Một điểm khá đặc biệt của Đại học Y Hà Nội so với nhiều trường đại học khác là sự tham gia và phối hợp đào tạo của 60 cơ sở khám chữa bệnh có quan hệ hợp tác đào tạo với Đại học Y Hà Nội. Cùng với đó, sau gần 115 năm phát triển, trường đã có cơ sở thực hành nghề riêng là Bệnh viện Đại học Y Hà Nội, được thành lập năm 2007, với quy mô 300 giường bệnh, bộ máy quản lý hành chính - chuyên môn với hơn 20 khoa và phòng ban, hoạt động theo hướng đạt chuẩn quốc tế hiện đại, đã có thương hiệu về khám chữa bệnh trong hệ thống các cơ sở khám chữa bệnh của Việt Nam. Cho đến thời điểm hiện tại, Bệnh viện Đại học Y Hà Nội đã được khẳng định vị thế và thương hiệu trong thực tiễn, thể hiện một tầm nhìn phát triển khoa học, đào tạo gắn với đời sống, nhận được tín nhiệm ngày càng tăng từ xã hội. Ngoài bệnh viện thực hành thì các Viện và Trung tâm thành viên được hoạt động tự chủ, như Viện Đào tạo Răng Hàm Mặt, Viện Đào tạo Y học dự phòng và Y tế công cộng, Viện Đái tháo đường và Rối loạn chuyển hóa, Trung tâm Nghiên cứu Gen - Protein, Trung tâm Kiểm chuẩn chất lượng xét nghiệm y học…. Từ góc nhìn cấu trúc hệ thống thì mô hình nêu trên đã và đang tạo tiền đề hội nhập và thích ứng sự thay đổi môi trường y tế của Việt Nam. Nhà trường tích cực áp dụng đổi mới phương pháp giảng dạy, nghiên cứu khoa học, tổ chức quản lý. Nói về lịch sử phát triển 115 năm của Nhà trường thì điều tâm đắc và tự hào nhất của các thế hệ thầy và trò Trường Đại học Y Hà Nội từ trước đến nay là sự gắn bó và cống hiến quên mình cho đất nước, cho dân tộc Việt Nam trong mọi giai đoạn. Điều này đã góp phần làm nên một hệ giá trị cốt lõi với sứ mệnh và tầm nhìn phát triển hiện đại của Trường Đại học Y Hà Nội, giai đoạn 2016 - 2020 và những năm tiếp theo.