Tổ chức thẩm định một cách khoa học và hợp lý trong hoạt động thẩm định dự án đầu tư vay vốn sẽ phát huy tối đa được năng lực sáng tạo, sở trường của mỗi cán bộ thẩm định, đồng thời đảm bảo được sự thuận tiện, sự hợp tác giữa các cán bộ và các phòng ban khác nhau trong hệ thống Ngân hàng:
Thẩm định dự án là một khâu quan trọng, vì vậy khâu tổ chức thẩm định phải được thường xuyên theo dõi, đánh giá và rút kinh nghiệm thường xuyên, phải xây dựng được một hệ thống phân cấp, phân quyền cân bằng và hợp lý.
Chi nhánh cần có những đề xuất lên cấp cao hơn để thực hiện chuyên môn hóa đội ngũ thẩm định, không để cho cán bộ thẩm định cùng một lúc thực hiện nhiều công việc. Đối với một chi nhánh thì công tác này tương đối khó thực hiện, nhưng để dần tiến tới mở rộng khâu mở rộng quy mô tín dụng thì chi nhánh cũng cần có những đề xuất việc tách khâu tiếp thị, tìm kiếm khách hàng với khâu thẩm định, cho vay và khâu theo dõi thu hồi nợ.
Để giải quyết tình trạng thiếu cán bộ thẩm định ở giai đoạn tạm thời, chi nhánh cần tận dụng số lượng cán bộ có sẵn tại phòng doanh nghiệp của chi nhánh để cải thiện và đẩy mạnh công tác thẩm định dự án đầu tư vay vốn. Phân công các chuyên viên khách hàng doanh nghiệp tại phòng doanh nghiệp theo ngành nghề nhằm tiến tới việc chuyên môn hóa công tác thẩm định vay vốn theo ngành nghề. Việc phân công gắn liền với quyền hạn, nghĩa vụ thực hiện nhằm mang đến kết quả cao trong công tác thẩm định.
Đối với những dự án lớn, chi nhánh nên tổ chức, điều chuyển và bố trí thêm các cán bộ khác có kinh nghiệm phối hợp thực hiện công tác thẩm định để rút ngắn được thời gian và chi phí thẩm định, đồng thời nâng cao được hiệu quả thẩm định dự án đầu tư.
Thường xuyên tổ chức việc kiểm tra và đánh giá lại trình độ của cán bộ thẩm định của chi nhánh để có được những điều chỉnh hợp lý và kịp thời. Qua đó cũng có những chế độ thưởng phạt công minh đối với những thành tích và khuyết điểm để kích thích hiệu quả và chất lượng của công tác thẩm định.
Hằng năm tổ chức các hội nghị báo cáo tổng kết tình hình, đánh giá và rút kinh nghiệm về công tác thẩm định dự án trong toàn bộ hệ thống giúp cho việc thực hiện được tốt hơn.