Loại hình tổ chức của ACFTA hiện nay vẫn đang gây ra nhiều tranh cãi bởi lẽ nếu xây dựng Khu vực mậu dịch tự do kiểu mở cửa thì u đãi mà các nớc thành viên đ- ợc hởng sẽ tơng đối ít. Nếu xây dựng Khu vực mậu dịch tự do kiểu khép kín, cơ chế hóa, chỉ mở cửa và áp dụng chế độ thuế u đãi đối với các nớc thành viên thì sẽ có lợi cho phát triển kinh tế của các nớc thành viên, khiến các nớc này có đợc những lợi ích lớn nhất. Tuy nhiên, hiện nay trình độ phát triển của các nớc trong khu vực còn khác nhau, điều này sẽ tạo nên trở lực từ những chế độ xã hội khác nhau và trình độ phát triển kinh tế xã hội khác nhau, thậm chí có thể hình thành hàng rào mậu dịch mới, đi ngợc lại với xu thế phát triển nhất thể hóa kinh tế toàn cầu.
Trớc thực tế đó, nhiều chuyên gia kinh tế cho rằng thể thức của Khu vực mậu dịch tự do ASEAN - Trung Quốc có thể dựa vào thể thức của khu vực mậu dịch tự do ASEAN (AFTA). Việc thực thi AFTA sẽ đem lại những bài học tham khảo có tính xây
đàm phán trong tất cả các lĩnh vực có liên quan tới việc xây dựng một khu vực mậu dịch tự do cho Đông Nam á, ASEAN đã có nhiều kinh nghiệm trong việc xây dựng các khu vực mậu dịch tự do. Trớc thực tế là ASEAN và Trung Quốc đã nhất trí xây dựng một khu vực mậu dịch tự do thì cách thức đơn giản nhất để hình thành khu vực này là dựa vào các cơ chế hiện hành của AFTA. Điều này sẽ giúp giảm bớt việc đàm phán lại các tiêu chí của khu vực mậu dịch tự do giữa 10 nớc thành viên ASEAN và Trung Quốc. Một số biện pháp cụ thể có thể đợc xem xét lại tuỳ theo nhu cầu của hai bên nhằm tiết kiệm thời gian và chi phí.