Khi chuyển sang cơ chế thị trường, sở I NHĐT&PTVN thực sự chuyển hướng và kinh doanh có hiệu quả vững chắc và tăng trưởng mạnh qua các năm. Tuy nhiên bên cạnh dó nỗi lo về nợ quá hạn vẫn thường trực vì tỷ lệ nợ quá hạn vẫn chưa ổn định, chưa giảm mặt khác nhiều tiềm ẩn rủi ro vẫn đe doạ hoạt động của sở. Đây là vấn đề bức xúc đối với sở I, vì đầu tư sao cho có hiệu quả, thu hồi vốn nhanh, đủ gốc và lãi, để quay vòng vốn nhanh là mong mỏi của ngân hàng. Đặc trưng của sở I NHĐT&PTVN là ngân hàng phục vu lĩnh vực đầu tư phát triển có tỷ trọng dư nợ tín dụng trung và dài hạn khá lớn, chính điều đó làm cho rủi ro tín dụng, nợ quá hạn, nợ khó đòi là những vấn đề được ngân hàng hết sức quan tâm, tìm cách giải quyết trong cả hiện tại và tương lai.
Trong hoạt động tín dụng, mặc dù sở đã thi hành nhiều biện pháp để nâng cao chất lượng tín dụng nhưng trên thực tế khôg phải lúc nào cũng đạt được những mong muốn. Trong thực tế đã có những trường hợp các khoản cho vay không có hiệu quả dẫn đến rủi ro cho sở như nợ quá hạn, nợ khó đòi.. do nhiều nguyên nhân khách quan như môi trường kinh doanh chưa lành mạnh, môi trường kinh tế phát triển chưa bền vững, thực lực tài chính, năng lực quản lý tài chính của khách vay còn yếu kém .. do vậy dẫn đến tình trạng không muốn cho vay gây ứ đọng vốn của ngân hàng, không phát huy được vai trò của ngân hàng trong phát triển kinh tế.
